Jump to content

IRF6

IRF6
Идентификаторы
Псевдонимы IRF6 , LPS, OFC6, PIT, PPS, PPS1, VWS, VWS1, регуляторный фактор интерферона 6
Внешние идентификаторы Опустить : 607199 ; МГИ : 1859211 ; Гомологен : 4479 ; Генные карты : IRF6 ; ОМА : IRF6 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_006147
НМ_001206696

НМ_016851
НМ_178083

RefSeq (белок)

НП_001193625
НП_006138

НП_058547

Местоположение (UCSC) Chr 1: 209,79 – 209,81 Мб Chr 1: 192,84 – 192,85 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 6, также известный как IRF6, представляет собой белок , который у человека кодируется IRF6 геном . [5]

Этот ген кодирует члена семейства регуляторных транскрипционных факторов интерферона (IRF). Члены семьи имеют общий N-концевой ДНК-связывающий домен «спираль-поворот-спираль» и менее консервативный С-концевой белок-связывающий домен. [6] Функция IRF6 связана с формированием соединительной ткани , например, неба . [7] Этот ген кодирует члена семейства регуляторных транскрипционных факторов интерферона (IRF). Кроме того, было замечено, что ген IRF6 находится под эпигенетической регуляцией посредством метилирования промотора . [8]

Патология

[ редактировать ]

Мутация гена IRF6 . может привести к аутосомно-доминантному синдрому Ван дер Вуда (СВВ) [9] или связанный с ним синдром подколенного птеригиума (PPS). [10] Синдром Ван дер Вуда может включать в себя расщелину губы и неба, а также зубные аномалии и губные свищи. Кроме того, общие аллели в IRF6 также были связаны с несиндромальными случаями расщелины губы и/или неба посредством полногеномных ассоциативных исследований и во многих исследованиях генов-кандидатов. [11] Эти расстройства вызваны мутациями гена IRF6, а некоторая фенотипическая гетерогенность обусловлена ​​различными типами мутаций IRF6. [5] Одно из объяснений этих фенотипических различий между синдромами основано на различном влиянии на структуру димеризованных мутантных белков. Мутации VWS, по-видимому, приводят к гаплонедостаточности , тогда как мутации PPS могут иметь доминантно-негативный характер. [12] Недавно был обобщен спектр мутаций VWS и PPS. [13] Было показано, что IRF6 играет решающую роль в развитии кератиноцитов. [14] [15] роль IRF6 в распространенных формах расщелины губы и неба. Также была продемонстрирована [16] и может объяснить только ~ 20% случаев заячьей губы. [17] В ходе многочисленных исследований были получены убедительные доказательства связи вариантов IRF6 с синдромальной расщелиной и/или неба. Исследование Бирнбаума и его коллег в 2009 году подтвердило влияние этого гена на этиологию расщелины губы и/или неба, а исследование GENEVA Cleft Consortium, в котором изучались семьи из разных популяций, подтвердило выводы о том, что мутации IRF6 тесно связаны с расщелиной губы. и/или небо. Роль IRF6 в возникновении расщелины губы и/или неба дополнительно подтверждается анализом мышей, мутантных по IRF6, у которых наблюдается гиперпролиферативный эпидермис, который не подвергается терминальной дифференцировке, что приводит к множественным эпителиальным спайкам, которые могут закупорить полость рта и привести к расщелине. небо. Исследования на животных моделях показывают, что IRF6 определяет пролиферацию кератиноцитов, а также играет ключевую роль в формировании перидермы полости рта. Недавно с помощью генетики мышей, анализа экспрессии генов, исследований иммунопреципитации хроматина и репортерных анализов люциферазы было показано, что IRF6 является непосредственной мишенью для p63, который лежит в основе нескольких синдромов пороков развития, включающих признаки расщелины, а p63 активирует транскрипцию IRF6 через Элемент-энхансер IRF6. Вариация энхансерного элемента увеличивает восприимчивость только к расщелине губы. Оба расщелина губы или без нее, с расщелиной неба а также признаки только расщелины неба наблюдались в семьях с мутацией IRF6. Кроме того, в пределах одной семьи могут выделяться разные типы расщелин. [11]

Эпигенетика

[ редактировать ]

аберрантное гиперметилирование ДНК Наблюдалось промотора IRF6, связанное с возникновением/прогрессированием рака. Действительно, этот неправильный эпигенетический феномен наблюдался у женщин, страдающих плоскоклеточным раком вульвы, возникшим из склеротического лишая вульвы . [18] Метилирование промотора IRF6 может быть маркером риска рака у пациентов, страдающих этим заболеванием. [8]

Ген IRF6 постепенно подавлялся в вирус папилломы человека , положительных на неопластических кератиноцитах шейки матки , полученных из предопухолевых поражений на разных уровнях злокачественности. [19] По этой причине этот ген, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером прогрессирования предопухолевых поражений шейки матки . [19] Аналогично, было обнаружено, что IRF6 генетически и эпигенетически не регулируется при раке вульвы . [8]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117595 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026638 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б Кондо С., Шутте БК, Ричардсон Р.Дж., Бьорк БК, Найт А.С., Ватанабе Ю., Ховард Э., де Лима Р.Л., Даак-Хирш С., Сандер А., Макдональд-Макгинн Д.М., Закай Э.Х., Ламмер Э.Дж., Эйлсворт А.С., Ардингер Х.Х., Лидраль А.С., Побер Б.Р., Морено Л., Аркос-Бургос М., Валенсия С., Удайер С., Бауау М., Моретти-Феррейра Д., Ричиери-Коста А., Диксон М.Дж., Мюррей Дж.К. (октябрь 2002 г.). «Мутации в IRF6 вызывают синдромы Ван дер Вуда и подколенного птеригиума» . Нат. Жене . 32 (2): 285–9. дои : 10.1038/ng985 . ПМК   3169431 . ПМИД   12219090 .
  6. ^ «Энтрез Ген: IRF6» .
  7. ^ Блэнтон С.Х., Кортес А., Стал С., Малликен Дж.Б., Финнелл Р.Х., Хехт Дж.Т. (сентябрь 2005 г.). «Вариации IRF6 способствуют несиндромальной расщелине губы и неба» . Являюсь. Дж. Мед. Жене. А. 137А (3): 259–62. doi : 10.1002/ajmg.a.30887 . ПМИД   16096995 . S2CID   25084563 .
  8. ^ Jump up to: а б с Ротондо Х.К., Борги А., Селватичи Р., Магри Е., Бьянкини Е., Монтинари Е., Корацца М., Виргили А., Тоньон М., Мартини Ф. (2016). «Вызванная гиперметилированием инактивация гена IRF6 как возможное раннее событие прогрессирования плоскоклеточного рака вульвы, связанного со склероатрофическим лишаем». JAMA Дерматология . 152 (8): 928–33. дои : 10.1001/jamadermatol.2016.1336 . ПМИД   27223861 .
  9. ^ Ван дер Вауде, А. (июнь 1954 г.). «Врожденный свищ нижней губы и его связь с расщелиной губы и неба» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 6 (2): 244–56. ПМК   1716548 . ПМИД   13158329 .
  10. ^ Горлин Р.Дж., Седано Х.О., Червенка Дж. (февраль 1968 г.). «Синдром подколенного птеригиума. Синдром, включающий расщелину губы, подколенный и межножковый птеригий, пальцевые и генитальные аномалии». Педиатрия . 41 (2): 503–9. дои : 10.1542/педс.41.2.503 . ПМИД   4384166 . S2CID   245138568 .
  11. ^ Jump up to: а б Диксон М.Дж., Маразита М.Л., Бити Т.Х., Мюррей Дж.К. (март 2011 г.). «Расщелина губы и неба: понимание генетических и экологических влияний» . Нат. Преподобный Жене . 12 (3): 167–78. дои : 10.1038/nrg2933 . ПМК   3086810 . ПМИД   21331089 .
  12. ^ Литтл Х.Дж., Рорик Н.К., Су Л.И., Бэлдок С., Малхотра С., Джоуитт Т., Гахар Л., Субраманиан Р., Шутте БК, Диксон М.Дж., Шор П. (ноябрь 2008 г.). «Миссенс-мутации, которые вызывают синдром Ван дер Вуда и синдром подколенного птеригиума, влияют на функции связывания ДНК и активации транскрипции IRF6» . Хм. Мол. Жене . 18 (3): 535–45. дои : 10.1093/hmg/ddn381 . ПМЦ   2638798 . ПМИД   19036739 .
  13. ^ де Лима Р.Л., Хопер С.А., Гасибе М. и др. (апрель 2009 г.). «Распространенность и неслучайное распределение экзонических мутаций в регуляторном факторе интерферона 6 (IRF6) в 307 семьях с синдромом Ван дер Вуда и 37 семьях с синдромом подколенного птеригиума» . Жене. Мед . 11 (4): 241–7. дои : 10.1097/GIM.0b013e318197a49a . ПМЦ   2789395 . ПМИД   19282774 .
  14. ^ Ричардсон Р.Дж., Диксон Дж., Малхотра С., Хардман М.Дж., Ноулз Л., Бут-Хэндфорд Р.П., Шор П., Уитмарш А., Диксон М.Дж. (ноябрь 2006 г.). «Irf6 является ключевым фактором, определяющим переключатель пролиферации-дифференцировки кератиноцитов». Нат. Жене . 38 (11): 1329–34. дои : 10.1038/ng1894 . ПМИД   17041603 . S2CID   13102953 .
  15. ^ Ингрэм Ч.Р., Киношита А., Кондо С., Ян Б., Саджан С., Траут К.Дж., Малик М.И., Даннвальд М., Гауди С.Л., Ловетт М., Мюррей Дж.К., Шутте BC (ноябрь 2006 г.). «Аномальный морфогенез кожи, конечностей и черепно-лицевой области у мышей с дефицитом регуляторного фактора интерферона 6 (Irf6)» . Нат. Жене . 38 (11): 1335–40. дои : 10.1038/ng1903 . ПМК   2082114 . ПМИД   17041601 .
  16. ^ Зукчеро Т.М., Купер М.Э., Махер Б.С., Даак-Хирш С., Непомучено Б., Рибейро Л., Капрау Д., Кристенсен К., Сузуки Ю., Мачида Дж., Нацуме Н., Йошиура К., Виейра А.Р., Ориоли И.М., Кастилья Э.Э., Морено Л., Аркос-Бургос М., Лидрал А.С., Филд Л.Л., Лю Й.Е., Рэй А., Гольдштейн Т.Х., Шульц Р.Э., Ши М., Джонсон М.К., Кондо С., Шутте Б.С., Маразита М.Л., Мюррей Дж.К. (август 2004 г.). «Варианты гена регуляторного фактора интерферона 6 (IRF6) и риск изолированной расщелины губы или неба» (PDF) . Н. англ. Дж. Мед . 351 (8): 769–80. doi : 10.1056/NEJMoa032909 . ПМИД   15317890 .
  17. ^ Рахимов Ф., Маразита М.Л., Висел А., Купер М.Э., Хитчлер М.Дж., Рубини М., Доманн Ф.Е., Говил М., Кристенсен К., Билле С., Мелби М., Жугессур А., Лий Р.Т., Уилкокс А.Дж., Фитцпатрик Д.Р., Грин Э.Д., Мосси П.А. , Литтл Дж., Стигерс-Теуниссен Р.П., Пеннаккио Л.А. , Шютте БК, Мюррей Дж.К. (ноябрь 2008 г.). «Нарушение сайта связывания AP-2α в энхансере IRF6 тесно связано с заячьей губой» . Нат. Жене . 40 (11): 1341–7. дои : 10.1038/ng.242 . ПМК   2691688 . ПМИД   18836445 .
  18. ^ Ротондо Х.К., Борги А., Селватичи Р., Магри Е., Бьянкини Е., Монтинари Е., Корацца М., Виргили А., Тоньон М., Мартини Ф. (2016). «Вызванная гиперметилированием инактивация гена IRF6 как возможное раннее событие прогрессирования плоскоклеточного рака вульвы, связанного со склероатрофическим лишаем». JAMA Дерматология . 152 (8): 928–33. дои : 10.1001/jamadermatol.2016.1336 . ПМИД   27223861 .
  19. ^ Jump up to: а б Ротондо Х.К., Боси С., Басси К., Феррацин М., Ланца Г., Гафа Р., Магри Э., Селватичи Р., Торресани С., Марси Р., Гарутти П., Негрини М., Тоньон М., Мартини Ф (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа цервикальных неопластических кератиноцитов». J Клеточная Физиол . 230 (4): 802–812. дои : 10.1002/jcp.24808 . hdl : 11392/2066612 . ПМИД   25205602 . S2CID   24986454 .
[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 339525d4024332e2db0e8052b10dad0f__1675030860
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/33/0f/339525d4024332e2db0e8052b10dad0f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
IRF6 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)