Малая ядрышковая РНК Z107/R87
Малая ядрышковая РНК Z107/R87 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snoZ107_R87 | |
Идентификаторы | |
Символ | snoZ107_R87 |
Рфам | RF00360 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК RZ107/R87 относится к группе родственных молекул некодирующей РНК (нкРНК), которые участвуют в биогенезе других малых ядерных РНК (мяРНК). Эти малые ядрышковые РНК (мякРНК) являются модифицирующими РНК и обычно расположены в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК.
Эти две мякРНК R87 и Z107 были идентифицированы у растения Arabidopsis thaliana. [ 1 ] и рис Oryza sativa [ 2 ] соответственно. Предполагается, что эти родственные мякРНК принадлежат к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Барнеш Ф., Гаспин С., Гайо Р., Эчеверрия М. (2001). «Идентификация 66-боксовых мякРНК C/D у Arabidopsis thaliana: обширные дупликации генов привели к образованию множества изоформ, предсказывающих новые сайты 2'-O-метилирования рибосомальной РНК». Дж. Мол. Биол . 311 (1): 57–73. дои : 10.1006/jmbi.2001.4851 . ПМИД 11469857 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]