Гомеобоксный белок CDX-1

CDX1
Идентификаторы
Псевдонимы	CDX1 , гомеобокс 1 каудального типа, белок гомеобокса CDX-1
Внешние идентификаторы	Опустить : 600746 ; МГИ : 88360 ; Гомологен : 1366 ; Генные карты : CDX1 ; ОМА : CDX1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	150,184,558 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	61,169,271 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of transverse colon; ; rectum; ; mucosa of ileum; ; mucosa of sigmoid colon; ; duodenum; ; gonad; ; jejunal mucosa; ; testicle; ; epithelium of colon; ; appendix;
	Top expressed in
	left colon; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; ileum; ; primitive streak; ; Ileal epithelium; ; duodenum; ; Paneth cell; ; jejunum; ; embryo; ; migratory enteric neural crest cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; methyl-CpG binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleus;
Biological process	animal organ morphogenesis; multicellular organism development; pattern specification process; bone morphogenesis; cell differentiation; anterior/posterior axis specification; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of somitogenesis; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; anterior/posterior pattern specification; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1044
	12590
	ENSG00000113722
	ENSMUSG00000024619
	P47902
	P18111
	НМ_001804
	НМ_009880
	НП_001795
	НП_034010
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок CDX-1 представляет собой белок человека, кодируемый CDX1 геном . ^[5]^[6] CDX-1 экспрессируется в развивающейся энтодерме и сохраняется в кишечнике на протяжении всего взрослого возраста. ^[7] Экспрессия белка CDX-1 варьируется в кишечнике, с высокой экспрессией в криптах кишечника и снижением экспрессии в ворсинках кишечника. ^[8]

Функция

Этот ген является членом семейства каудальному родственного гомеобокса, транскрипционных факторов каналу . Кодируемый ДНК-связывающий белок регулирует экспрессию генов, специфичную для кишечника, и дифференцировку энтероцитов. Было показано, что он индуцирует экспрессию гена кишечной щелочной фосфатазы и ингибирует транскрипционную активность бета-катенина/фактора Т-клеток. ^[6]

Также было показано, что CDX1 играет важную роль в эмбриональном эпикардиальном развитии. Было продемонстрировано, что белки CDX подавляют сердечную дифференцировку как в эмбриональных стволовых клетках рыбок данио, так и в мышиных, но общий механизм того, как это происходит, плохо изучен. ^[9] Однако было показано, что CDX1 временно экспрессируется в сердце эмбриона через 11,5 дней после коитума (dpc). Считается, что эта временная экспрессия индуцирует эпикардиально-эпителиально-мезенхимальный переход и, таким образом, правильное формирование сердечно-сосудистой системы. Было показано, что индукция CDX1 низкими дозами вызывала усиленную миграцию и дифференцировку клеток эпикарда в гладкие мышцы сосудов, тогда как продолжающаяся индукция CDX1 высокими дозами или дефицит CDX1 уменьшали способность этих клеток мигрировать и дифференцироваться в гладкие мышцы путем действия TGF-β1. Более того, индукция CDX1 также изменила экспрессию транскриптов генов, связанных с клеточной адгезией, ответственной за ЕМТ и ангиогенез. ^[10] Следовательно, наряду с известной ролью в формировании и дифференцировке кишечника, CDX1 также важен для развития эпикарда.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000113722 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024619 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Боннер Калифорния, Лофтус С.К., Васмут Дж.Дж. (июль 1995 г.). «Выделение, характеристика и точная физическая локализация человеческого CDX1, гомеобоксного гена каудального типа». Геномика . 28 (2): 206–11. дои : 10.1006/geno.1995.1132 . ПМИД 8530027 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: транскрипционный фактор 1 гомеобокса CDX1 каудального типа» .
^ Грейнджер С., Гринюк А., Лонес Д. (2013). «Cdx1 и Cdx2 проявляют транскрипционную специфичность в кишечнике» . ПЛОС ОДИН . 8 (1): e54757. Бибкод : 2013PLoSO...854757G . дои : 10.1371/journal.pone.0054757 . ПМЦ 3559873 . ПМИД 23382958 .
^ Баркер Н., ван Эс Дж.Х., Койперс Дж., Куджала П., ван ден Борн М., Козейнсен М., Хегебарт А., Корвинг Дж., Бегтел Х., Петерс П.Дж., Клеверс Х. (октябрь 2007 г.). «Идентификация стволовых клеток в тонкой и толстой кишке по маркерному гену Lgr5». Природа . 449 (7165): 1003–7. Бибкод : 2007Natur.449.1003B . дои : 10.1038/nature06196 . ПМИД 17934449 . S2CID 4349637 .
^ Ленгерке С., Вингерт Р., Берец М., Грауэр М., Шмидт А.Г., Конанц М., Дейли GQ, Дэвидсон А.Дж. (июнь 2011 г.). «Взаимодействие между генами Cdx и ретиноевой кислотой модулируют ранний кардиогенез» . Биология развития . 354 (1): 134–42. дои : 10.1016/j.ydbio.2011.03.027 . ПМК 3502019 . ПМИД 21466798 .
^ Чу М, Ван Л, Ван Х, Шен Т, Ян Й, Сунь Й, Тан Н, Ни Т, Чжу Дж, Mailman РБ, Ван Й (2014). «Новая роль CDX1 в эмбриональном эпикардиальном развитии» . ПЛОС ОДИН . 9 (7): e103271. Бибкод : 2014PLoSO...9j3271C . дои : 10.1371/journal.pone.0103271 . ПМЦ 4113346 . ПМИД 25068460 .

Дальнейшее чтение

Синдром Тричера Коллинза Колла; Диксон, Джилл; Эдвардс, Сара Дж.; Гладвин, Аманда Дж.; Диксон, Майкл Дж.; Лофтус, Стейси К.; Боннер, Синтия А.; Копривникар, Кэтрин; Васмут, Джон Дж. (февраль 1996 г.). «Позиционное клонирование гена, участвующего в патогенезе синдрома Тричера Коллинза. Совместная группа по синдрому Тричера Коллинза». Природная генетика . 12 (2): 130–6. дои : 10.1038/ng0296-130 . ПМИД 8563749 . S2CID 34312227 .
Малло Г.В., Рекреш Х., Фригерио Дж.М., Роча Д., Цвайбаум А., Лакаса М., Джордан Б.Р., Дузетти Н.Дж., Дагорн Дж.К., Йованна Дж.Л. (февраль 1997 г.). «Молекулярное клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК, кодирующей гомеобокс Cdx1 и Cdx2 человека. Снижение экспрессии мРНК Cdx1 и Cdx2 во время колоректального канцерогенеза» . Международный журнал рака . 74 (1): 35–44. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19970220)74:1<35::AID-IJC7>3.0.CO;2-1 . ПМИД 9036867 .
Мизошита Т, Инада К, Цукамото Т, Кодера Ю, Ямамура Ю, Хираи Т, Като Т, Джо Т, Ито М, Татемацу М (2002). «Экспрессия мРНК Cdx1 и Cdx2 и значимость этой экспрессии для дифференцировки слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта человека - с особым акцентом на участие в кишечной метаплазии желудка человека» . Рак желудка . 4 (4): 185–91. дои : 10.1007/PL00011741 . ПМИД 11846061 .
Сух Э.Р., Ха К.С., Рэнкин Э.Б., Тойота М., Трабер П.Г. (сентябрь 2002 г.). «Метилирование ДНК снижает экспрессию гена CDX1 в клеточных линиях колоректального рака» . Журнал биологической химии . 277 (39): 35795–800. дои : 10.1074/jbc.M205567200 . ПМИД 12124393 .
Домон-Делл С, Шнайдер А, Мукадель В, Герен Е, Гено Д, Агийон С, Дюлюк I, Мартин Е, Йованна Дж, Лоне Ж. Ф., Дюкло Б, Шенар М. П., Мейер С, Уде П., Кедингер М., Гауб М. П., Фройнд Дж. Н. (сентябрь 2003 г.). «Гомеобоксный ген Cdx1 во время прогрессирования рака толстой кишки человека» . Онкоген . 22 (39): 7913–21. дои : 10.1038/sj.onc.1206756 . ПМИД 12970739 .
Вонг Н.А., Бриттон, член парламента, Чой Г.С., Стэнтон Т.К., Бикнелл, округ Колумбия, Уайлдинг Дж.Л., Бодмер В.Ф. (январь 2004 г.). «Потеря экспрессии CDX1 при колоректальной карциноме: метилирование промотора, мутация и потеря анализа гетерозиготности 37 клеточных линий» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (2): 574–9. Бибкод : 2004PNAS..101..574W . дои : 10.1073/pnas.0307190101 . ПМК 327189 . ПМИД 14704280 .
Рэнкин Э.Б., Сюй В., Силберг Д.Г., Су Э. (май 2004 г.). «Предположительные кишечно-специфичные энхансеры, расположенные в 5'-последовательности гена CDX1, регулируют экспрессию CDX1 в кишечнике» (PDF) . Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени . 286 (5): G872–80. дои : 10.1152/ajpgi.00326.2003 . ПМИД 14715525 . S2CID 18376885 . Архивировано из оригинала (PDF) 7 марта 2019 г.
Беланд М., Пилон Н., Уль М., О К., Сильвестр-младший, Принос П., Лонес Д. (июнь 2004 г.). «Ауторегуляция Cdx1 регулируется новым транскрипционным комплексом Cdx1-LEF1» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (11): 5028–38. дои : 10.1128/MCB.24.11.5028-5038.2004 . ПМК 416402 . ПМИД 15143193 .
Го Р.Дж., Хуан Э., Эзаки Т., Патель Н., Синклер К., Ву Дж., Кляйн П., Су Э.Р., Линч Дж.П. (август 2004 г.). «Cdx1 ингибирует пролиферацию клеток рака толстой кишки человека за счет снижения транскрипционной активности бета-катенина/Т-клеточного фактора» . Журнал биологической химии . 279 (35): 36865–75. дои : 10.1074/jbc.M405213200 . ПМИД 15215241 .
Алхури Ф., Мало М.С., Мозумдер М., Мостафа Г., Ходин Р.А. (август 2005 г.). «Дифференциальная регуляция экспрессии генов кишечной щелочной фосфатазы с помощью Cdx1 и Cdx2» (PDF) . Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени . 289 (2): G285–90. дои : 10.1152/ajpgi.00037.2005 . ПМИД 15774940 . S2CID 1066204 . Архивировано из оригинала (PDF) 02 марта 2019 г.
Вонг Н.А., Уилдинг Дж., Бартлетт С., Лю Ю., Уоррен Б.Ф., Пирис Дж., Мейнард Н., Маршалл Р., Бодмер В.Ф. (май 2005 г.). «CDX1 является важным молекулярным медиатором метаплазии Барретта» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (21): 7565–70. Бибкод : 2005PNAS..102.7565W . дои : 10.1073/pnas.0502031102 . ПМК 1140438 . ПМИД 15894614 .

Внешние ссылки

человека CDX1 Расположение генома и страница сведений о гене CDX1 в браузере генома UCSC .
CDX1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000113722 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024619 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8530027-5] Боннер Калифорния, Лофтус С.К., Васмут Дж.Дж. (июль 1995 г.). «Выделение, характеристика и точная физическая локализация человеческого CDX1, гомеобоксного гена каудального типа». Геномика . 28 (2): 206–11. дои : 10.1006/geno.1995.1132 . ПМИД 8530027 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: транскрипционный фактор 1 гомеобокса CDX1 каудального типа» .

[pmid23382958-7] Грейнджер С., Гринюк А., Лонес Д. (2013). «Cdx1 и Cdx2 проявляют транскрипционную специфичность в кишечнике» . ПЛОС ОДИН . 8 (1): e54757. Бибкод : 2013PLoSO...854757G . дои : 10.1371/journal.pone.0054757 . ПМЦ 3559873 . ПМИД 23382958 .

[pmid17934449-8] Баркер Н., ван Эс Дж.Х., Койперс Дж., Куджала П., ван ден Борн М., Козейнсен М., Хегебарт А., Корвинг Дж., Бегтел Х., Петерс П.Дж., Клеверс Х. (октябрь 2007 г.). «Идентификация стволовых клеток в тонкой и толстой кишке по маркерному гену Lgr5». Природа . 449 (7165): 1003–7. Бибкод : 2007Natur.449.1003B . дои : 10.1038/nature06196 . ПМИД 17934449 . S2CID 4349637 .

[pmid21466798-9] Ленгерке С., Вингерт Р., Берец М., Грауэр М., Шмидт А.Г., Конанц М., Дейли GQ, Дэвидсон А.Дж. (июнь 2011 г.). «Взаимодействие между генами Cdx и ретиноевой кислотой модулируют ранний кардиогенез» . Биология развития . 354 (1): 134–42. дои : 10.1016/j.ydbio.2011.03.027 . ПМК 3502019 . ПМИД 21466798 .

[pmid25068460-10] Чу М, Ван Л, Ван Х, Шен Т, Ян Й, Сунь Й, Тан Н, Ни Т, Чжу Дж, Mailman РБ, Ван Й (2014). «Новая роль CDX1 в эмбриональном эпикардиальном развитии» . ПЛОС ОДИН . 9 (7): e103271. Бибкод : 2014PLoSO...9j3271C . дои : 10.1371/journal.pone.0103271 . ПМЦ 4113346 . ПМИД 25068460 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]