КИФ3Б

КИФ3Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3B6U
Идентификаторы
Псевдонимы	KIF3B , FLA8, HH0048, KLP-11, член семейства кинезинов 3B, RP89
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603754 ; МГИ : 107688 ; Гомологен : 55849 ; Генные карты : KIF3B ; ОМА : KIF3B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	32,335,011 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	153,175,310 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; islet of Langerhans; ; sperm; ; bronchial epithelial cell; ; renal medulla; ; jejunal mucosa; ; secondary oocyte; ; Brodmann area 23; ; parietal lobe; ; superior frontal gyrus;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; spermatid; ; seminiferous tubule; ; granulocyte; ; neural layer of retina; ; lumbar spinal ganglion; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; retinal pigment epithelium; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; microtubule binding; protein binding; plus-end-directed microtubule motor activity; ATP binding; microtubule motor activity; ATPase activity; intraciliary transport particle B binding;
Cellular component	cytoplasm; intraciliary transport particle; cytosol; membrane; microtubule cytoskeleton; spindle; plus-end kinesin complex; midbody; ciliary tip; spindle microtubule; extracellular exosome; cytoskeleton; microtubule; axon cytoplasm; centrosome; kinesin II complex; cell projection; axon; cilium; kinesin complex;
Biological process	plus-end-directed vesicle transport along microtubule; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; mitotic spindle organization; anterograde axonal transport; positive regulation of cytokinesis; mitotic spindle assembly; determination of left/right symmetry; mitotic centrosome separation; retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; microtubule-based movement; intraciliary transport involved in cilium assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9371
	16569
	ENSG00000101350
	ENSMUSG00000027475
	О15066
	Q61771
	НМ_004798
	НМ_008444
	НП_004789
	НП_032470
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кинезинподобный белок KIF3B — белок , который у человека кодируется KIF3B геном . ^[5]^[6] KIF3B представляет собой белок N-типа, который образует комплексы с двумя другими белками-кинезинами, образуя двухголовые антероградные моторы. ^[7] Во-первых, KIF3B образует гетеродимер с KIF3A ( кинезинподобный белок KIF3A ); (KIF3A/3B), который связан с мембраной и обладает АТФазной активностью. Затем KIFAP3 (KAP3, белок-3, ассоциированный с суперсемейством кинезинов) связывается с хвостовым доменом, образуя гетеротримерный мотор. ^[7] , направленной на плюс-концы Этот двигатель обладает активностью скольжения микротрубочек , со скоростью ~ 0,3 мкм / с a. ^[8] имеется 14 семейств белков кинезинов В суперсемействе кинезинов , и KIF3B является частью семейства кинезинов-2, кинезинов, которые все могут образовывать гетеротримерные комплексы. ^[9] Экспрессия трех моторных субъединиц наблюдается повсеместно. Двигатели KIG3A/3B/KAP3 могут транспортировать органеллы диаметром от 90 до 160 нм. ^[7]

Существует много ортологичных генов KIF3B, которые экспрессируются у дрозофилы , морского ежа , Bos taurus , Canis familiris , Equus caballus , Felis catus , Macaca mulatta , Mus musculus , Pan troglodytes и Rattus norvegicus .

Функция

Гетеротримерный двигательный механизм KIF3B/KIF3A/KAP3 участвует во внутриклеточном транспорте множества различных молекул, таких как β-катенин и MT1-MMP. ^[10]^[11] Активность KIF3B вовлечена в различные клеточные процессы, такие как внутриклеточное перемещение органелл , внутрижгутиковый транспорт , движение хромосом во время митоза и мейоза , а также клеточное взаимодействие с внеклеточным матриксом. ^[6]^[12]^[13]

KIF3B также регулирует взаимодействие раковых клеток с внеклеточным матриксом (ECM), в частности, транспорт MT1-MMP к фронту раковых клеток важен для перестройки и деградации матрикса коллагеновых волокон. ^[14]^[15]

Взаимодействия

Было показано, что KIF3B взаимодействует с SMC3 субъединицей комплекса когезина и с RAB4A . ^[16]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101350 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027475 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н. и др. (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: член семейства кинезинов KIF3B 3B» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хирокава Н. (январь 1998 г.). «Белки суперсемейства кинезинов и динеинов и механизм транспорта органелл». Наука . 279 (5350): 519–26. Бибкод : 1998Sci...279..519H . дои : 10.1126/science.279.5350.519 . ПМИД 9438838 .
^ Хирокава Н. (январь 1998 г.). «Белки суперсемейства кинезинов и динеинов и механизм транспорта органелл». Наука . 279 (5350): 519–26. Бибкод : 1998Sci...279..519H . дои : 10.1126/science.279.5350.519 . ПМИД 9438838 .
^ Лоуренс С.Дж., Доу Р.К., Кристи К.Р., Кливленд Д.В., Доусон С.К., Эндоу С.А. и др. (октябрь 2004 г.). «Стандартная номенклатура кинезинов» . Журнал клеточной биологии . 167 (1): 19–22. дои : 10.1083/jcb.200408113 . ПМК 2041940 . ПМИД 15479732 .
^ Джимбо Т., Кавасаки Ю., Кояма Р., Сато Р., Такада С., Харагути К., Акияма Т. (апрель 2002 г.). «Идентификация связи между опухолевым супрессором APC и суперсемейством кинезинов». Природная клеточная биология . 4 (4): 323–7. дои : 10.1038/ncb779 . ПМИД 11912492 . S2CID 10745049 .
^ Виснер С., Фэйкс Дж., Химмель М., Бензиен Ф., Линдер С. (сентябрь 2010 г.). «Кинезины KIF5B и KIF3A/KIF3B вызывают воздействие на поверхность MT1-MMP, выделение CD44 и деградацию внеклеточного матрикса в первичных макрофагах» . Кровь . 116 (9): 1559–69. дои : 10.1182/кровь-2009-12-257089 . ПМИД 20505159 .
^ Шоли Дж. М. (апрель 1996 г.). «Кинезин-II, двигатель мембранного движения в аксонах, аксонемах и веретенах» . Журнал клеточной биологии . 133 (1): 1–4. дои : 10.1083/jcb.133.1.1 . ПМК 2120781 . ПМИД 8601599 .
^ Лоуренс С.Дж., Доу Р.К., Кристи К.Р., Кливленд Д.В., Доусон С.К., Эндоу С.А. и др. (октябрь 2004 г.). «Стандартная номенклатура кинезинов» . Журнал клеточной биологии . 167 (1): 19–22. дои : 10.1083/jcb.200408113 . ПМК 2041940 . ПМИД 15479732 .
^ Кравцов О, Хартли К.П., Комперат ЕМ, Ичковский К.А. (2019). «Потеря экспрессии белка KIF3B коррелирует с метастатической способностью рака простаты» . Американский журнал клинической и экспериментальной урологии . 7 (3): 178–181. ПМК 6627541 . ПМИД 31317057 .
^ Столетов К., Уиллеттс Л., Папроски Р.Дж., Бонд Дж.Д., Раха С., Джовел Дж. и др. (июнь 2018 г.). «Количественный скрининг подвижности всего генома in vivo выявил новые терапевтические мишени для блокирования метастазов рака» . Природные коммуникации . 9 (1): 2343. Бибкод : 2018NatCo...9.2343S . дои : 10.1038/s41467-018-04743-2 . ПМК 6002534 . ПМИД 29904055 .
^ Имамура Т., Хуан Дж., Усуи И., Сато Х., Бевер Дж., Олефски Дж. М. (июль 2003 г.). «Инсулин-индуцированная транслокация GLUT4 включает опосредованное протеинкиназой C-лямбда функциональное соединение между Rab4 и моторным белком кинезином» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 4892–900. дои : 10.1128/MCB.23.14.4892-4900.2003 . ПМК 162221 . ПМИД 12832475 .

Дальнейшее чтение

Ямадзаки Х., Наката Т., Окада Ю., Хирокава Н. (сентябрь 1995 г.). «KIF3A/B: гетеродимерный белок суперсемейства кинезинов, который действует как микротрубочка плюс направленный на конец мотор для транспорта мембранных органелл» . Журнал клеточной биологии . 130 (6): 1387–99. дои : 10.1083/jcb.130.6.1387 . ПМК 2120571 . ПМИД 7559760 .
Нагата К., Пульс А., Футтер С., Аспенстрем П., Шефер Э., Наката Т. и др. (январь 1998 г.). «Киназа MLK2 киназы MAP локализуется вместе с активированной JNK вдоль микротрубочек и связывается с мотором KIF3 суперсемейства кинезинов» . Журнал ЭМБО . 17 (1): 149–58. дои : 10.1093/emboj/17.1.149 . ПМК 1170366 . ПМИД 9427749 .
Симидзу К., Ширатаки Х., Хонда Т., Минами С., Такай Ю. (март 1998 г.). «Комплексное образование SMAP/KAP3, белка, связанного с мотором АТФазы KIF3A/B, с полипептидом, связанным с хромосомой человека» . Журнал биологической химии . 273 (12): 6591–4. дои : 10.1074/jbc.273.12.6591 . ПМИД 9506951 .
Нонака С., Танака Ю., Окада Ю., Такеда С., Харада А., Канаи Ю. и др. (декабрь 1998 г.). «Рандомизация лево-правой асимметрии из-за потери узловых ресничек, генерирующих поток экстраэмбриональной жидкости влево у мышей, лишенных моторного белка KIF3B» . Клетка . 95 (6): 829–37. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81705-5 . ПМИД 9865700 . S2CID 62805329 .
Наварро Э., Эспиноза Л., Аделл Т., Тора М., Беррозпе Дж., Real FX (июль 1999 г.). «Фенотипирование экспрессируемых последовательностей (EST) клеток HT-29: клонирование протеинкиназы ser/thr EMK1, кинезина KIF3B и транскриптов, которые включают повторяющиеся элементы Alu». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1450 (3): 254–64. дои : 10.1016/S0167-4889(99)00051-8 . ПМИД 10395937 .
Уайтхед Дж.Л., Ван С.Ю., Бост-Усингер Л., Хоанг Э., Фрейзер К.А., Бернсайд Б. (ноябрь 1999 г.). «Фоторецепторная локализация субъединиц KIF3A и KIF3B гетеротримерного моторного кинезина II микротрубочек в сетчатке позвоночных». Экспериментальное исследование глаз . 69 (5): 491–503. дои : 10.1006/exer.1999.0724 . ПМИД 10548469 .
Джимбо Т., Кавасаки Ю., Кояма Р., Сато Р., Такада С., Харагути К., Акияма Т. (апрель 2002 г.). «Идентификация связи между опухолевым супрессором APC и суперсемейством кинезинов». Природная клеточная биология . 4 (4): 323–7. дои : 10.1038/ncb779 . ПМИД 11912492 . S2CID 10745049 .
Бейкер С.А., Фриман К., Луби-Фелпс К., Пасур Г.Дж., Бешарс Дж.К. (сентябрь 2003 г.). «IFT20 связывает кинезин II с внутрижгутиковым транспортным комплексом млекопитающих, который консервативен в подвижных жгутиках и сенсорных ресничках» . Журнал биологической химии . 278 (36): 34211–8. дои : 10.1074/jbc.M300156200 . ПМИД 12821668 .
Имамура Т., Хуан Дж., Усуи И., Сато Х., Бевер Дж., Олефски Дж. М. (июль 2003 г.). «Инсулин-индуцированная транслокация GLUT4 включает опосредованное протеинкиназой C-лямбда функциональное соединение между Rab4 и моторным белком кинезином» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 4892–900. дои : 10.1128/MCB.23.14.4892-4900.2003 . ПМК 162221 . ПМИД 12832475 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А. и др. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Харагути К., Хаяси Т., Джимбо Т., Ямамото Т., Акияма Т. (февраль 2006 г.). «Роль белка семейства кинезина-2, KIF3, во время митоза» . Журнал биологической химии . 281 (7): 4094–9. дои : 10.1074/jbc.M507028200 . ПМИД 16298999 .
Ву Ю, Дай XQ, Ли Q, Чен CX, Май В, Хуссейн З и др. (ноябрь 2006 г.). «Кинезин-2 опосредует физические и функциональные взаимодействия между полицистином-2 и фиброцистином» . Молекулярная генетика человека . 15 (22): 3280–92. дои : 10.1093/hmg/ddl404 . ПМИД 17008358 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101350 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027475 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9205841-5] Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н. и др. (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: член семейства кинезинов KIF3B 3B» .

[Hirokawa_519–526-7] Jump up to: ^а ^б ^с Хирокава Н. (январь 1998 г.). «Белки суперсемейства кинезинов и динеинов и механизм транспорта органелл». Наука . 279 (5350): 519–26. Бибкод : 1998Sci...279..519H . дои : 10.1126/science.279.5350.519 . ПМИД 9438838 .

[8] Хирокава Н. (январь 1998 г.). «Белки суперсемейства кинезинов и динеинов и механизм транспорта органелл». Наука . 279 (5350): 519–26. Бибкод : 1998Sci...279..519H . дои : 10.1126/science.279.5350.519 . ПМИД 9438838 .

[9] Лоуренс С.Дж., Доу Р.К., Кристи К.Р., Кливленд Д.В., Доусон С.К., Эндоу С.А. и др. (октябрь 2004 г.). «Стандартная номенклатура кинезинов» . Журнал клеточной биологии . 167 (1): 19–22. дои : 10.1083/jcb.200408113 . ПМК 2041940 . ПМИД 15479732 .

[10] Джимбо Т., Кавасаки Ю., Кояма Р., Сато Р., Такада С., Харагути К., Акияма Т. (апрель 2002 г.). «Идентификация связи между опухолевым супрессором APC и суперсемейством кинезинов». Природная клеточная биология . 4 (4): 323–7. дои : 10.1038/ncb779 . ПМИД 11912492 . S2CID 10745049 .

[11] Виснер С., Фэйкс Дж., Химмель М., Бензиен Ф., Линдер С. (сентябрь 2010 г.). «Кинезины KIF5B и KIF3A/KIF3B вызывают воздействие на поверхность MT1-MMP, выделение CD44 и деградацию внеклеточного матрикса в первичных макрофагах» . Кровь . 116 (9): 1559–69. дои : 10.1182/кровь-2009-12-257089 . ПМИД 20505159 .

[pmid8601599-12] Шоли Дж. М. (апрель 1996 г.). «Кинезин-II, двигатель мембранного движения в аксонах, аксонемах и веретенах» . Журнал клеточной биологии . 133 (1): 1–4. дои : 10.1083/jcb.133.1.1 . ПМК 2120781 . ПМИД 8601599 .

[13] Лоуренс С.Дж., Доу Р.К., Кристи К.Р., Кливленд Д.В., Доусон С.К., Эндоу С.А. и др. (октябрь 2004 г.). «Стандартная номенклатура кинезинов» . Журнал клеточной биологии . 167 (1): 19–22. дои : 10.1083/jcb.200408113 . ПМК 2041940 . ПМИД 15479732 .

[14] Кравцов О, Хартли К.П., Комперат ЕМ, Ичковский К.А. (2019). «Потеря экспрессии белка KIF3B коррелирует с метастатической способностью рака простаты» . Американский журнал клинической и экспериментальной урологии . 7 (3): 178–181. ПМК 6627541 . ПМИД 31317057 .

[15] Столетов К., Уиллеттс Л., Папроски Р.Дж., Бонд Дж.Д., Раха С., Джовел Дж. и др. (июнь 2018 г.). «Количественный скрининг подвижности всего генома in vivo выявил новые терапевтические мишени для блокирования метастазов рака» . Природные коммуникации . 9 (1): 2343. Бибкод : 2018NatCo...9.2343S . дои : 10.1038/s41467-018-04743-2 . ПМК 6002534 . ПМИД 29904055 .

[pmid12832475-16] Имамура Т., Хуан Дж., Усуи И., Сато Х., Бевер Дж., Олефски Дж. М. (июль 2003 г.). «Инсулин-индуцированная транслокация GLUT4 включает опосредованное протеинкиназой C-лямбда функциональное соединение между Rab4 и моторным белком кинезином» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (14): 4892–900. дои : 10.1128/MCB.23.14.4892-4900.2003 . ПМК 162221 . ПМИД 12832475 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]