Полинуклеотид-аденилилтрансфераза
| полинуклеотид-аденилилтрансфераза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.7.7.19 | ||
| Номер CAS. | 9026-30-6 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| ЭксПАСи | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии полинуклеотидаденилилтрансфераза 2.7.7.19 ( КФ , ) — фермент катализирующий реакцию химическую .
- АТФ + РНК-3’ОН пирофосфат + РНКпА-3'ОН
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и РНК , тогда как двумя его продуктами являются пирофосфат и РНК с дополнительным аденозиновым нуклеотидом на 3'-конце.
Гены человека с такой активностью включают TUT1 , MTPAP , PAPOLA , PAPOLB , PAPOLG , TENT2 , TENT4A , TENT4B , TENT5C , TENT5D .
Функция
[ редактировать ]Этот фермент отвечает за добавление 3'- полиаденинового хвоста к вновь синтезированной молекуле пре- мессенджерной РНК (пре-мРНК) в процессе транскрипции гена . Этот белок является последним дополнением к большому белковому комплексу , который также содержит более мелкие сборки, известные как фактор специфичности расщепления и полиаденилирования (CPSF) и фактор стимуляции расщепления (CtSF), и его связывание является необходимой предпосылкой для расщепления 3'-конца белка. пре-мРНК. После расщепления 3'-сигнальной области, которая управляет сборкой комплекса, полиаденилат-полимераза (PAP) добавляет полиадениновый хвост к новому 3'-концу.
Скорость, с которой PAP добавляет адениновые нуклеотиды , зависит от присутствия другого регуляторного белка, PABPII (полиаденинсвязывающий белок II). Первые несколько нуклеотидов, добавляемых PAP, добавляются очень медленно, но затем короткий полиадениновый хвост связывается с PABPII, что ускоряет скорость добавления аденина с помощью PAP. Последний хвост у млекопитающих имеет длину около 200-250 адениновых нуклеотидов.
PAP фосфорилируется фактором , способствующим митозу , ключевым регулятором клеточного цикла . Высокие уровни фосфорилирования снижают активность PAP.
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 27 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1AV6 , 1B42 , 1BKY , 1EAM , 1EQA , 1F5A , 1FA0 , 1JSZ , 1JTE , 1JTF , 1P39 , 1Q78 , 1Q79 . 1V39 , 1VFG , 1VP3 , 1VP9 , 1VPT , 2GA9 , 2GAF , 2HHP , 2O1P , 2Q66 , 2VP3 , 3MAG , 3MCT и 4DCG .
Ссылки
[ редактировать ]- Август Дж. Т., Ортис П. Дж., Гурвиц Дж. (декабрь 1962 г.). «Рибонуклеиновая кислота-зависимое включение рибонуклеотидов. I. Очистка и свойства фермента» . Ж. Биол. Хим . 237 (12): 3786–93. дои : 10.1016/S0021-9258(19)84523-4 . ПМИД 13965521 .
- Эдмондс, Мэри ; Абрамс, Ричард (апрель 1960 г.). «Биосинтез полинуклеотидов: образование последовательности аденилатных единиц из аденозинтрифосфата ферментом из ядер тимуса» . Журнал биологической химии . 235 (4): 1142–1149. дои : 10.1016/S0021-9258(18)69494-3 .
- Готтесман М.Е., Канеллакис Э.С. (1966). «Концевые нуклеотидилтрансферазы ядер тимуса теленка» . Ж. Биол. Хим . 241 (19): 4339–52. дои : 10.1016/S0021-9258(18)99727-9 . ПМИД 4288534 .
- Краков Дж.С.; Куцогеоргопулос С; Канеллакис Э.С. (1962). «Исследования по включению дезоксирибонуклеиновой кислоты». Биохим. Биофиз. Акта . 55 (5): 639–50. дои : 10.1016/0006-3002(62)90842-9 . ПМИД 14459258 .
- Манс Р.Дж., Уолтер Т.Дж. (1971). «Синтез олигоаденилата с использованием транспортной РНК в проростках кукурузы. II. Специфика праймера, субстрата и металлов, а также размер продукта». Биохим. Биофиз. Акта . 247 (1): 113–21. дои : 10.1016/0005-2787(71)90814-8 . ПМИД 4946277 .
- Шелдон Р., Джурале С., Кейтс Дж. (1972). «Обнаружение последовательностей полиадениловой кислоты в вирусной и эукариотической РНК (полу(U)-целлюлозные колонки-поли(U)-фильтры-стекловолокно-клетки HeLa-бактериофаг Т4)» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 69 (2): 417–21. дои : 10.1073/pnas.69.2.417 . ПМК 426470 . ПМИД 4501121 .
- Колган Д.Ф., Мерти К.Г., Привес К., Мэнли Дж.Л. (ноябрь 1996 г.). «Регуляция поли(А)-полимеразы путем фосфорилирования, связанная с клеточным циклом». Природа . 384 (6606): 282–5. Бибкод : 1996Natur.384..282C . дои : 10.1038/384282a0 . ПМИД 8918882 . S2CID 4304275 .
