Сантисома
Сантисома — это единица длины, определяемая как один процент длины конкретной хромосомы . [ 1 ] Эту единицу физической длины ДНК начали использовать на ранних этапах исследования геномов с помощью молекулярной биологии еще до того, как стало возможным разрешение последовательностей нуклеиновых кислот хромосом.
Одним из основных применений этой единицы было описание локуса гена путем указания расстояния в сансомах от контрольной точки на хромосоме. Например, когда в 1997 году был наконец завершен полный геном бактерии Escherichia coli , он был представлен в масштабе, выраженном в сансомах (а также в килобазах ). [ 2 ] Поскольку бактериальные хромосомы имеют кольцевую форму , контрольной точкой не может быть конец молекулы ДНК, а должна быть какая-то точка, имеющая некоторые легко определяемые уникальные характеристики. Часто эта точка является началом репликации , хотя для E. coli она является началом переноса при конъюгации . [ 3 ] Следовательно, ориентир для позиций сантисом — это просто условность, установленная для каждого отдельного вида организма.
По большей части современная научная литература использует слово «сантисома» как сокращенное обозначение определенной интересующей области на хромосоме определенных организмов. Например, много исследований было проведено в области «Сентисома 63» хромосом видов Salmonella . [ 4 ] [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Питер Д. Карп; Моника Райли (11 января 2009 г.), Представления о метаболических знаниях (PDF)
- ^ Блаттнер, Франция; Планкетт Дж., 3-й; Блох, Калифорния; Перна, Северная Каролина; Берланд, В.; Райли, М; Кольядо-Видес, Дж; Гласнер, доктор юридических наук; Роде, СК; Мэйхью, ГФ; Грегор, Дж; Дэвис, Северо-Запад; Киркпатрик, ХА; Гёден, Массачусетс; Роуз, диджей; Мау, Б; Шао, Ю. (5 сентября 1997 г.). «Полная последовательность генома Escherichia coli K-12». Наука . 277 (5331): 1453–62. дои : 10.1126/science.277.5331.1453 . ПМИД 9278503 .
{{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ «Escherichia coli K-12 субстр. MG1655 oriC» . biocyc.org . ЭкоЦик . Проверено 4 апреля 2021 г.
По историческим причинам нумерация кольцевых хромосом E. coli начинается не с начала репликации, а с начала переноса во время конъюгации.
- ^ Галан, JE (апрель 1996 г.). «Молекулярно-генетические основы проникновения сальмонелл в клетки хозяина». Молекулярная микробиология . 20 (2): 263–71. дои : 10.1111/j.1365-2958.1996.tb02615.x . ПМИД 8733226 . S2CID 8677354 .
- ^ «Google Scholar ищет 'Centisome 63' » . ученый.google.com .
 | Эта по молекулярной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |