Исследовательский кампус Джанелии

Исследовательский кампус Джанелии
Учредил	6 сентября 2006 г.
Тип исследования	нейробиология
Бюджет	300 миллионов долларов
Директор	Рональд Вейл
Персонал	424
Расположение	Эшберн , Вирджиния
Кампус	689 акров (2,79 км²) 2 )
Операционное агентство	Медицинский институт Говарда Хьюза
Нобелевские лауреаты	Эрик Бетциг
Веб-сайт	www .джанелия .org

Исследовательский кампус Джанелия — научно-исследовательский кампус Медицинского института Говарда Хьюза , открывшийся в октябре 2006 года. ^{[ 1 ]} Кампус расположен в округе Лаудон, штат Вирджиния , недалеко от города Эшберн . Он известен своими научными исследованиями и современной архитектурой. Нынешним исполнительным директором лаборатории является Рональд Вейл , который также является вице-президентом HHMI. Он сменил Джеральда М. Рубина в 2020 году. ^{[ 2 ]} До 2014 года кампус был известен как «Исследовательский кампус фермы Джанелия». ^{[ 3 ]}

Исследовать

Большинство исследований, финансируемых HHMI, поддерживают исследователей, работающих в своих учреждениях. ^{[ 4 ]} Однако некоторые междисциплинарные проблемы трудно решить в существующих исследовательских условиях, и Джанелия была создана как отдельное учреждение для решения таких проблем в нейробиологии . ^{[ 5 ]} По состоянию на ноябрь 2011 года в нем работало 424 сотрудника и еще 150 мест. ^{[ 6 ]} Они конкретно посвящены выявлению общих принципов, управляющих обработкой информации нейронными цепями , а также развитию технологий визуализации и вычислительных методов анализа изображений . В 2017 году компания объявила о новом направлении исследований — механистической когнитивной нейробиологии. ^{[ 7 ]}

В любой момент времени Джанелия поддерживает несколько крупных совместных проектов, направленных на удовлетворение потребностей в данных и методах, представляющих интерес для широкого научного сообщества. ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} По состоянию на 2021 год они включали разработку крупномасштабных нейроанатомических данных по дрозофиле (на уровне световой и электронной микроскопии), соответствующей карты уровней освещенности мозга мыши, совершенствование технологии генетически кодированных флуоресцентных датчиков и ряда более мелких проектов. проекты. Результаты включают значительно улучшенные флуоресцентные датчики кальция и первое изображение всего мозга дрозофилы с разрешением нейронов. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Центр был спроектирован так, чтобы имитировать неограниченную среду сотрудничества в лабораториях AT&T Bell и Кембриджской лаборатории молекулярной биологии . Исследователи заключают шестилетние контракты и полностью финансируются за счет собственных средств, независимо от традиционного финансирования исследовательских грантов . ^{[ 11 ]}

Джеральд М. Рубин был первым исполнительным директором Janelia и видел ее от концепции до строительства и эксплуатации. Рональд Вейл занял пост директора в начале 2020 года. Около пятидесяти исследовательских лабораторий возглавляют старшие исследователи, в том числе Дженнифер Липпинкотт-Шварц , Джерри Рубин , Эрик Бетциг , Карел Свобода и Барри Диксон . ^{[ 12 ]} Предыдущими руководителями лаборатории были Шон Эдди , Тамир Гонен , Линн Риддифорд , Джеймс Трумэн и Роберт Тиан .

Кампус

Оригинальный дом на ферме Джанелия внесен в Национальный реестр исторических мест . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} и собственность была куплена HHMI у голландского производителя программного обеспечения Baan Companies в декабре 2000 года. ^{[ 15 ]} 281 акр (1,14 км²) ²) В главном кампусе есть лаборатория дугообразной формы длиной 900 футов (270 м), известная как Ландшафтное здание. ^{[ 16 ]} Здание шириной 270 футов (82 м) на первом этаже, спроектированное Рафаэлем Виньоли , построено на холме и предназначено для использования в качестве основного исследовательского центра. Отель на 96 номеров для участников конференции выходит на пруд и соединяется с Ландшафтным зданием туннелем под Хеликс-драйв. Остров Селден , 408 акров (1,65 км²). ²) бывшая дерновая ферма на реке Потомак была пристроена к кампусу в 2004 году и пользуется популярностью среди сотрудников для пробежек и отдыха. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}

Многие сотрудники живут на территории кампуса. В здании три многоквартирных дома общей численностью 240 квартир: 34 односемейных таунхауса и 21 квартира-студия, в которых проживает более четверти персонала. ^{[ 19 ]}^{[ 18 ]} Остальные сотрудники добираются до Арлингтона на маршрутном автобусе, предоставляемом HHMI. ^{[ 20 ]} В отеле имеется обширный фитнес-центр, в том числе студия йоги, тренажерный зал для боулдеринга, теннисные корты и футбольное поле. ^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}

Проектирование территории и ландшафта было завершено компанией Dewberry в 2006 году и включает более четырех акров зеленых луговых насаждений на крыше, которые сливают здание с окружающей территорией. В 2006 году институт нанял фирму ландшафтной архитектуры Lewis Scully Gionet, Inc., чтобы переделать некоторые из предыдущих ландшафтных работ, которые были завершены осенью 2008 года (и получили почетную награду от отделений Американского общества ландшафтных архитекторов в Мэриленде и Потомаке). . Эта работа включает в себя архитектурный водный объект, расширенную сеть дорожек и размещение нескольких произведений искусства, а также комплексные дополнения к озеленению. Дополнительное улучшение ландшафта на территории кампуса, разработанное LSG Landscape Architecture, продолжалось до сих пор.

Исследовательские центры

Вычислительная инфраструктура

Требования современной нейронауки к хранению и вычислениям могут быть чрезвычайно высокими. Некоторые двухфотонные микроскопы могут генерировать данные со скоростью более 5 ГБ/с. ^{[ 23 ]} электронной микроскопии Коннектомика может быть особенно требовательной. Один только набор данных FlyEM представляет собой 64-битное изображение размером 400 ТБ, 34431 x 39743 x 41407. ^{[ 24 ]} Анализ аналогичного набора данных занял почти 7000 часов работы графического процессора. ^{[ 25 ]}

Вычислительная инфраструктура, доступная исследователям Джанелии, включает высокопроизводительный кластер на 7000 ядер , 5 петабайт хранилища и внешний центр обработки данных, где каждую ночь создается резервная копия данных. ^{[ 26 ]}

Удобства для животных

В аккредитованном виварии содержатся лабораторные животные, в том числе рыбки данио, мыши и крысы. Вспомогательный персонал помогает с обычным уходом, разведением и операциями. ^{[ 27 ]} Регулярному уходу способствует автоматизация. Несколько роботов, переворачивающих мух, помогают поддерживать запасы дрозофилы , перекладывая их во флаконы со свежими продуктами. ^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} Два робота-манипулятора помогают в санитарной обработке клеток для мышей. Одна рука достает из стопки грязные клетки и помещает их в автоклав, другая достает продезинфицированные клетки и складывает их штабелями. ^{[ 30 ]}

Центр передовой визуализации

Ученые со всего мира могут подать заявку на проведение своих экспериментов на микроскопах, разработанных Джанелией, в Центре перспективной визуализации. ^{[ 31 ]}

Участие сообщества

Совместно с Лаудонской академией наук , ^{[ 32 ]} HHMI ежегодно жертвует около 1 миллиона долларов на поддержку естественнонаучного образования в государственных школах округа Лаудоун. ^{[ 33 ]}^{[ 34 ]} Джанелия также ежеквартально проводит серию лекций для общественности. ^{[ 35 ]}

См. также

Ссылки

^ Кэри, Мак (9 февраля 2011 г.). «О дивный новый мир» . Жизнь Вирджинии . Издательство Кейп-Фир . Проверено 27 июня 2016 г.
^ «Рон Вейл назначен следующим исполнительным директором исследовательского кампуса Джанелия и вице-президентом HHMI» .
^ «История» . Исследовательский кампус Джанелия . Проверено 23 июня 2015 г.
^ «О HHMI: Введение» .
^ Jump up to: ^а ^б «Философия Джанелии» .
^ М. Митчелл Уолдроп (17 ноября 2011 г.). «Исследования в Джанелии: жизнь на ферме. Пять лет спустя высокий эксперимент в области междисциплинарных исследований окупился» . Природа . 479 (7373): 284–286. дои : 10.1038/479284a . ПМИД 22094670 .
^ «Что такое механистическая когнитивная нейронаука? | Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 12 апреля 2018 г.
^ «Проектные группы — Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.
^ «В ходе «тур де силы» исследователи изобразили весь мозг мухи в мельчайших деталях» . Наука | АААС . 18 июля 2018 г. Проверено 16 октября 2018 г.
^ Чжэн, Чжихао; Лауритцен, Дж. Скотт; Перлман, Эрик; Робинсон, Камензинд Г.; Николс, Мэтью; Милки, Дэниел; Торренс, Омар; Прайс, Джон; Фишер, Кори Б. (19 июля 2018 г.). «Полный объем электронной микроскопии мозга взрослой Drosophila melanogaster» . Клетка . 174 (3): 730–743.e22. дои : 10.1016/j.cell.2018.06.019 . ISSN 0092-8674 . ПМК 6063995 . ПМИД 30033368 .
^ Юдхиджит Бхаттачарджи (8 декабря 2006 г.). «Нейробиология на ферме» . Наука . 314 (5805): 1530–1532. дои : 10.1126/science.314.5805.1530 . PMID 17158300 . S2CID 109680345 .
^ «Жанелия.орг» .
^ «Национальная регистрационная информационная система» . Национальный реестр исторических мест . Служба национальных парков . 9 июля 2010 г.
^ «Медицинский институт Говарда Хьюза закладывает основу для исследовательского кампуса на ферме Джанелия» . Медицинский институт Говарда Хьюза. 5 мая 2003 года . Проверено 2 января 2019 г.
^ «Хутор Джанелия» . Бюллетень HHMI . 14 (3). Медицинский институт Говарда Хьюза : 10–15. Июль 2001 г. Архивировано из оригинала 4 июля 2012 г. Проверено 3 июня 2011 г.
^ «Проект кампуса, призванный вдохновить на новаторскую науку» (PDF) . Журнал НИОКР. 13 ноября 2007 г. Архивировано из оригинала (PDF) 3 марта 2016 г.
^ «Биомедицинский институт заработал 4,5 миллиона долларов на захват земли в Лаудуне» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ Jump up to: ^а ^б Рубин, Джеральд ; О'Ши, Эрин (7 февраля 2019 г.). «Точка зрения: оглядываясь назад и с нетерпением жду Джанелии» . электронная жизнь . 8 : е44826. doi : 10.7554/eLife.44826 . ПМК 6374070 . ПМИД 30730292 .
^ «О студенческом общежитии» . Медицинский институт Говарда Хьюза . Проверено 20 марта 2022 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Удобства кампуса» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ Брэнсон, Кристин [@KristinMBranson] (07.03.2022). «Новый зал для боулдеринга Джанелия! https://t.co/aG09Ubny1x» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .
^ «Зона отдыха Джанелия» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ «Томографический 2-фотонный микроскоп с килогерцовой частотой кадров» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ «Выпуск полумозга FlyEM» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ Янушевский, Михал; Корнфельд, Йорген; Ли, Питер Х.; Папа, Искусство; Блейкли, Тим; Линдси, Ларри; Майтин-Шепард, Джереми; Тыка, Майк; Денк, Винфрид; Джайн, Вирен (16 июня 2018 г.). «Высокоточная автоматизированная реконструкция нейронов с сетями заполнения» (PDF) . Природные методы . 15 (8): 605–610. дои : 10.1038/s41592-018-0049-4 . ПМИД 30013046 . S2CID 49863171 .
^ «Группы поддержки / Научно-вычислительные системы» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ «Команды поддержки/Виварий» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ «Команды поддержки / Ресурсы дрозофилы» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ ЧИЧМ | Джанелия [@HHMIJanelia] (24 сентября 2015 г.). «Это один из трех наших роботов, переворачивающих мухи. Они могут менять 2700–3600 акций в день и сообщать нам по электронной почте, если возникнут проблемы! https://t.co/7Zf7WyRb4g» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .
^ Сегар, Адриан [@ASegar] (10 июня 2014 г.). «Робот, чистящий мышиные клетки! (виден во время экскурсии по исследовательскому кампусу фермы Джанелия) http://t.co/kigM78uRtu» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .
^ «Центр открытой науки/передовой визуализации» . Проверено 20 марта 2022 г.
^ Майкл Элисон Чендлер (30 мая 2014 г.). «Академия наук округа Лаудоун демонстрирует первые набеги подростков на исследования» . Вашингтон Пост .
^ «Школы округа Лаудоун и Медицинский институт Говарда Хьюза объявляют об инновационном партнерстве в области научного образования - HHMI.org» . HHMI.org . Проверено 23 июня 2015 г.
^ «Джанелия в сообществе - Исследовательский кампус Джанелии» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.
^ «Диалоги открытий - Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.

Дальнейшее чтение

Джеральд М. Рубин: Создание нового исследовательского института: исследовательского кампуса Джанелия Фарм Медицинского института Говарда Хьюза. в: Перспективы исследований - Определение и реализация тем исследований организациями - Симпозиум Рингберга 2006 (Max-Planck-Forum 7) Max-Planck-Gesellschaft (Hrsg.), Мюнхен 2007, ISSN 1438-8715

39 ° 04'18 ″ с.ш. 77 ° 27'53 ″ з.д. / 39,0716 ° с.ш. 77,4648 ° з.д. / 39,0716; -77,4648

[1] Кэри, Мак (9 февраля 2011 г.). «О дивный новый мир» . Жизнь Вирджинии . Издательство Кейп-Фир . Проверено 27 июня 2016 г.

[2] «Рон Вейл назначен следующим исполнительным директором исследовательского кампуса Джанелия и вице-президентом HHMI» .

[3] «История» . Исследовательский кампус Джанелия . Проверено 23 июня 2015 г.

[4] «О HHMI: Введение» .

[Philosophy-5] Jump up to: ^а ^б «Философия Джанелии» .

[6] М. Митчелл Уолдроп (17 ноября 2011 г.). «Исследования в Джанелии: жизнь на ферме. Пять лет спустя высокий эксперимент в области междисциплинарных исследований окупился» . Природа . 479 (7373): 284–286. дои : 10.1038/479284a . ПМИД 22094670 .

[7] «Что такое механистическая когнитивная нейронаука? | Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 12 апреля 2018 г.

[8] «Проектные группы — Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.

[9] «В ходе «тур де силы» исследователи изобразили весь мозг мухи в мельчайших деталях» . Наука | АААС . 18 июля 2018 г. Проверено 16 октября 2018 г.

[10] Чжэн, Чжихао; Лауритцен, Дж. Скотт; Перлман, Эрик; Робинсон, Камензинд Г.; Николс, Мэтью; Милки, Дэниел; Торренс, Омар; Прайс, Джон; Фишер, Кори Б. (19 июля 2018 г.). «Полный объем электронной микроскопии мозга взрослой Drosophila melanogaster» . Клетка . 174 (3): 730–743.e22. дои : 10.1016/j.cell.2018.06.019 . ISSN 0092-8674 . ПМК 6063995 . ПМИД 30033368 .

[11] Юдхиджит Бхаттачарджи (8 декабря 2006 г.). «Нейробиология на ферме» . Наука . 314 (5805): 1530–1532. дои : 10.1126/science.314.5805.1530 . PMID 17158300 . S2CID 109680345 .

[12] «Жанелия.орг» .

[nris-13] «Национальная регистрационная информационная система» . Национальный реестр исторических мест . Служба национальных парков . 9 июля 2010 г.

[hhmi1-14] «Медицинский институт Говарда Хьюза закладывает основу для исследовательского кампуса на ферме Джанелия» . Медицинский институт Говарда Хьюза. 5 мая 2003 года . Проверено 2 января 2019 г.

[15] «Хутор Джанелия» . Бюллетень HHMI . 14 (3). Медицинский институт Говарда Хьюза : 10–15. Июль 2001 г. Архивировано из оригинала 4 июля 2012 г. Проверено 3 июня 2011 г.

[16] «Проект кампуса, призванный вдохновить на новаторскую науку» (PDF) . Журнал НИОКР. 13 ноября 2007 г. Архивировано из оригинала (PDF) 3 марта 2016 г.

[selden-17] «Биомедицинский институт заработал 4,5 миллиона долларов на захват земли в Лаудуне» . Проверено 20 марта 2022 г.

[janelia_review-18] Jump up to: ^а ^б Рубин, Джеральд ; О'Ши, Эрин (7 февраля 2019 г.). «Точка зрения: оглядываясь назад и с нетерпением жду Джанелии» . электронная жизнь . 8 : е44826. doi : 10.7554/eLife.44826 . ПМК 6374070 . ПМИД 30730292 .

[19] «О студенческом общежитии» . Медицинский институт Говарда Хьюза . Проверено 20 марта 2022 г.

[amenities-20] Jump up to: ^а ^б «Удобства кампуса» . Проверено 20 марта 2022 г.

[21] Брэнсон, Кристин [@KristinMBranson] (07.03.2022). «Новый зал для боулдеринга Джанелия! https://t.co/aG09Ubny1x» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .

[22] «Зона отдыха Джанелия» . Проверено 20 марта 2022 г.

[slapmi-23] «Томографический 2-фотонный микроскоп с килогерцовой частотой кадров» . Проверено 20 марта 2022 г.

[24] «Выпуск полумозга FlyEM» . Проверено 20 марта 2022 г.

[25] Янушевский, Михал; Корнфельд, Йорген; Ли, Питер Х.; Папа, Искусство; Блейкли, Тим; Линдси, Ларри; Майтин-Шепард, Джереми; Тыка, Майк; Денк, Винфрид; Джайн, Вирен (16 июня 2018 г.). «Высокоточная автоматизированная реконструкция нейронов с сетями заполнения» (PDF) . Природные методы . 15 (8): 605–610. дои : 10.1038/s41592-018-0049-4 . ПМИД 30013046 . S2CID 49863171 .

[26] «Группы поддержки / Научно-вычислительные системы» . Проверено 20 марта 2022 г.

[27] «Команды поддержки/Виварий» . Проверено 20 марта 2022 г.

[28] «Команды поддержки / Ресурсы дрозофилы» . Проверено 20 марта 2022 г.

[29] ЧИЧМ | Джанелия [@HHMIJanelia] (24 сентября 2015 г.). «Это один из трех наших роботов, переворачивающих мухи. Они могут менять 2700–3600 акций в день и сообщать нам по электронной почте, если возникнут проблемы! https://t.co/7Zf7WyRb4g» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .

[30] Сегар, Адриан [@ASegar] (10 июня 2014 г.). «Робот, чистящий мышиные клетки! (виден во время экскурсии по исследовательскому кампусу фермы Джанелия) http://t.co/kigM78uRtu» ( твит ). Архивировано из оригинала 20 марта 2022 г. Проверено 21 декабря 2022 г. - через Twitter .

[31] «Центр открытой науки/передовой визуализации» . Проверено 20 марта 2022 г.

[32] Майкл Элисон Чендлер (30 мая 2014 г.). «Академия наук округа Лаудоун демонстрирует первые набеги подростков на исследования» . Вашингтон Пост .

[33] «Школы округа Лаудоун и Медицинский институт Говарда Хьюза объявляют об инновационном партнерстве в области научного образования - HHMI.org» . HHMI.org . Проверено 23 июня 2015 г.

[34] «Джанелия в сообществе - Исследовательский кампус Джанелии» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.

[35] «Диалоги открытий - Исследовательский кампус Джанелия» . www.janelia.org . Проверено 24 января 2018 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]