ССХ2

SSX2B
Идентификаторы
Псевдонимы	SSX2B , CT5.2, CT5.2b, HOM-MEL-40, SSX, синовиальная саркома, точка разрыва X 2B, член семейства SSX 2B
Внешние идентификаторы	Гомологен : 133226 ; Генные карты : SSX2B ; OMA : SSX2B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	52,790,305 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; testicle; ; right testis; ; left testis; ; sural nerve; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; blood; ; renal cortex; ; human musculoskeletal system;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; transcription corepressor activity; nucleic acid binding;
Cellular component	intracellular anatomical structure; nucleus;
Biological process	negative regulation of nucleic acid-templated transcription; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	727837
	н/д
	ENSG00000268447
	н/д
	Q16385
	н/д
	НМ_001278702 ; НМ_001164417 ; НМ_001278701
	н/д
	НП_001157889 ; НП_001265630 ; НП_001265631
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Белок SSX2 — это белок , который у человека кодируется SSX2 геном . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Продукт этого гена принадлежит к семейству высоко гомологичных белков синовиальной саркомы X (SSX) . Эти белки могут действовать как репрессоры транскрипции . Они также способны вызывать спонтанные гуморальные и клеточные иммунные реакции у больных раком и являются потенциально полезными мишенями в иммунотерапии на основе противораковых вакцин . Гены SSX1 , SSX2 и SSX4 участвуют в хромосомной транслокации t(X;18), характерной для всех синовиальных сарком . Эта транслокация приводит к слиянию гена транслокации синовиальной саркомы на хромосоме 18 с одним из генов SSX на хромосоме X. Кодируемые гибридные белки, вероятно, несут ответственность за трансформирующую активность. два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена были идентифицированы ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000268447 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Туречи О, Шахин У, Шоберт И, Козловски М, Скмитт Х, Шильд Х.Дж., Стеннер Ф., Зейтц Г., Раммензее Х.Г., Пфройндшу М. (ноябрь 1996 г.). «Ген SSX-2, который участвует в транслокации t(X;18) синовиальных сарком, кодирует опухолевый антиген человека HOM-MEL-40». Рак Рез . 56 (20): 4766–72. ПМИД 8840996 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: синовиальная саркома SSX2, точка разрыва X 2» .

Дальнейшее чтение

Ву LQ, Лу Y, Ван XF и др. (2006). «Экспрессия рако-тестикулярного антигена (СТА) в опухолевых тканях и периферической крови китайских пациентов с гепатоцеллюлярной карциномой». Наука о жизни . 79 (8): 744–8. дои : 10.1016/j.lfs.2006.02.024 . ПМИД 16546222 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Фернебро Дж., Фрэнсис П., Иден П. и др. (2006). «Профили экспрессии генов относятся к типу слияния SS18/SSX при синовиальной саркоме» . Межд. Дж. Рак . 118 (5): 1165–72. дои : 10.1002/ijc.21475 . ПМИД 16152617 .
Росс М.Т., Графэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека» . Природа . 434 (7031): 325–37. Бибкод : 2005Natur.434..325R . дои : 10.1038/nature03440 . ПМЦ 2665286 . ПМИД 15772651 .
Тврдик Д., Повысил С., Сватосова Ю., Дундр П. (2005). «Молекулярная диагностика синовиальной саркомы: RT-PCR обнаружение транскриптов слияния SYT-SSX1/2 в парафиновой ткани». Медь. наук. Быстрый . 11 (3): МТ1–7. ПМИД 15735574 .
Айюб М., Мерло А., Хесдорфер К.С. и др. (2005). «Отличные, но перекрывающиеся Т-хелперные эпитопы в области 37-58 SSX-2». Клин. Иммунол . 114 (1): 70–8. дои : 10.1016/j.clim.2004.08.014 . ПМИД 15596411 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Гюре А.О., Вэй И.Дж., Олд Л.Дж., Чен Ю.Т. (2002). «Семейство генов SSX: характеристика 9 полных генов» . Межд. Дж. Рак . 101 (5): 448–53. дои : 10.1002/ijc.10634 . ПМИД 12216073 . S2CID 21174312 .
Ян К., Луи В.О., Се Ю. и др. (2002). «Сосуществование слияний SYT-SSX1 и SYT-SSX2 при синовиальных саркомах». Онкоген . 21 (26): 4181–90. дои : 10.1038/sj.onc.1205569 . ПМИД 12037676 . S2CID 33515965 .
де Брёйн Д.Р., Дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Э. и др. (2002). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного взаимодействия GTPase, RAB3IP, и новым ядерным белком, SSX2IP». Гены Хромосомы Рак . 34 (3): 285–98. дои : 10.1002/gcc.10073 . ПМИД 12007189 . S2CID 11734893 .
Бродин Б., Хаслам К., Ян К. и др. (2001). «Клонирование и характеристика сплайсированных вариантов слитых транскриптов синовиальной саркомы: SYT/SSX4, SYT/SSX4v и SYT/SSX2v. Возможная регуляторная роль продукта слитого гена в экспрессии SYT дикого типа». Джин . 268 (1–2): 173–82. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00412-7 . ПМИД 11368913 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
дос Сантос Н.Р., Торенсма Р., де Врис Т.Дж. и др. (2000). «Гетерогенная экспрессия антигенов рака/яичка SSX в поражениях меланомы человека и клеточных линиях». Рак Рез . 60 (6): 1654–62. ПМИД 10749136 .
дос Сантос Н.Р., де Брёйн Д.Р., Балеманс М. и др. (1998). «Ядерная локализация SYT, SSX и слитых белков SYT-SSX, связанных с синовиальной саркомой» . Хм. Мол. Жене . 6 (9): 1549–58. дои : 10.1093/hmg/6.9.1549 . ПМИД 9285793 .
Шипли Дж.М., Кларк Дж., Крю А.Дж. и др. (1994). «Транслокация t(X;18)(p11.2;q11.2), обнаруженная в синовиальных саркомах человека, включает два различных локуса на Х-хромосоме». Онкоген . 9 (5): 1447–53. ПМИД 8152806 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000268447 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8840996-3] Туречи О, Шахин У, Шоберт И, Козловски М, Скмитт Х, Шильд Х.Дж., Стеннер Ф., Зейтц Г., Раммензее Х.Г., Пфройндшу М. (ноябрь 1996 г.). «Ген SSX-2, который участвует в транслокации t(X;18) синовиальных сарком, кодирует опухолевый антиген человека HOM-MEL-40». Рак Рез . 56 (20): 4766–72. ПМИД 8840996 .

[entrez-4] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: синовиальная саркома SSX2, точка разрыва X 2» .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]