ТЕРФ2ИП

ТЕРФ2ИП
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1FEX, 3K6G, 4RQI
Идентификаторы
Псевдонимы	TERF2IP , DRIP5, RAP1, белок, взаимодействующий с TERF2
Внешние идентификаторы	Опустить : 605061 ; МГИ : 1929871 ; Гомологен : 10357 ; Генные карты : TERF2IP ; ОМА : TERF2IP — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	75,761,872 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	112,747,160 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; Brodmann area 23; ; Pars compacta; ; pars reticulata; ; superior vestibular nucleus; ; pons; ; internal globus pallidus; ; lateral nuclear group of thalamus; ; Brodmann area 9; ; superior frontal gyrus;
	Top expressed in
	ventromedial nucleus; ; supraoptic nucleus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; lateral hypothalamus; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; ventral tegmental area; ; arcuate nucleus; ; dorsal tegmental nucleus; ; mammillary body;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; telomeric DNA binding; protein binding; G-rich strand telomeric DNA binding; phosphatase binding;
Cellular component	nuclear telomere cap complex; nuclear envelope; chromosome; shelterin complex; telomere; nuclear chromosome; Mre11 complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol; nuclear body; cytoplasm;
Biological process	negative regulation of DNA recombination at telomere; telomere maintenance via telomerase; protection from non-homologous end joining at telomere; regulation of double-strand break repair via homologous recombination; transcription, DNA-templated; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; protein localization to chromosome, telomeric region; positive regulation of protein acetylation; telomere maintenance via telomere lengthening; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; telomere maintenance; telomere capping; negative regulation of protein phosphorylation; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of telomere maintenance; negative regulation of telomere maintenance; positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54386
	57321
	ENSG00000166848
	ENSMUSG00000033430
	Q9NYB0
	Q91VL8
	НМ_018975
	НМ_020584
	НП_061848
	НП_065609
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, взаимодействующий с теломерным повтором-связывающим фактором 2, также известный как белок 1-репрессор-активатор (Rap1), представляет собой белок , который у людей кодируется TERF2IP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TERF2IP взаимодействует с Ku80 , ^{[ 7 ]} Рад50 ^{[ 7 ]} и ТЕРФ2 . ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Было показано, что при взаимодействии комплекс TERF2IP/TERF2 связывается с сайтами теломерных соединений с более высоким сродством. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166848 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033430 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ли Б., Острайх С., де Ланге Т. (май 2000 г.). «Идентификация человеческого Rap1: последствия для эволюции теломер» . Клетка . 101 (5): 471–83. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80858-2 . ПМИД 10850490 . S2CID 7956545 .
^ «Ген Энтрез: фактор связывания теломерного повтора TERF2IP 2, взаимодействующий белок» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с О'Коннор М.С., Сафари А., Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс Rap1 человека и модуляция длины теломер» . Журнал биологической химии . 279 (27): 28585–91. дои : 10.1074/jbc.M312913200 . ПМИД 15100233 .
^ Чжу XD, Кюстер Б, Манн М, Петрини Дж. Х., де Ланге Т (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50/MRE11/NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природная генетика . 25 (3): 347–52. дои : 10.1038/77139 . PMID 10888888 . S2CID 6689794 .
^ Арат НЁ, Гриффит Дж. Д. (декабрь 2012 г.). «Человеческий Rap1 напрямую взаимодействует с теломерной ДНК и регулирует локализацию TRF2 на теломерах» . Журнал биологической химии . 287 (50): 41583–94. дои : 10.1074/jbc.M112.415984 . ПМК 3516710 . ПМИД 23086976 .

Дальнейшее чтение

Чжу XD, Кюстер Б, Манн М, Петрини Дж. Х., де Ланге Т (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50/MRE11/NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природная генетика . 25 (3): 347–52. дои : 10.1038/77139 . PMID 10888888 . S2CID 6689794 .
Ханаока С., Нагадой А., Ёсимура С., Аймото С., Ли Б., де Ланге Т., Нишимура Ю. (сентябрь 2001 г.). «ЯМР-структура мотива Myb hRap1 обнаруживает канонический трехспиральный пучок, лишенный положительного поверхностного заряда, типичного для ДНК-связывающих доменов Myb». Журнал молекулярной биологии . 312 (1): 167–75. дои : 10.1006/jmbi.2001.4924 . ПМИД 11545594 .
Лоайса Д., Де Ланге Т. (июнь 2003 г.). «POT1 как терминальный преобразователь контроля длины теломер TRF1». Природа . 423 (6943): 1013–8. Бибкод : 2003Natur.423.1013L . дои : 10.1038/nature01688 . ПМИД 12768206 . S2CID 4370276 .
Ли Б, де Ланге Т (декабрь 2003 г.). «Rap1 влияет на длину и неоднородность теломер человека» . Молекулярная биология клетки . 14 (12): 5060–8. doi : 10.1091/mbc.E03-06-0403 . ПМЦ 284807 . ПМИД 14565979 .
Чжу XD, Нидернхофер Л., Кастер Б., Манн М., Хоймейкерс Дж.Х., де Ланге Т. (декабрь 2003 г.). «ERCC1/XPF удаляет 3'-выступ из непокрытых теломер и подавляет образование теломерной ДНК, содержащей двухминутные хромосомы» . Молекулярная клетка . 12 (6): 1489–98. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00478-7 . ПМИД 14690602 .
О'Коннор М.С., Сафари А., Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс Rap1 человека и модуляция длины теломер» . Журнал биологической химии . 279 (27): 28585–91. дои : 10.1074/jbc.M312913200 . ПМИД 15100233 .
Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Легелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию на теломерах». Природная клеточная биология . 6 (7): 673–80. дои : 10.1038/ncb1142 . ПМИД 15181449 . S2CID 11543383 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Йе Дж.З., Донигиан Дж.Р., ван Овербек М., Лоайза Д., Луо Й., Крутчинский А.Н., Хаит Б.Т., де Ланге Т. (ноябрь 2004 г.). «TIN2 одновременно связывает TRF1 и TRF2 и стабилизирует комплекс TRF2 на теломерах» . Журнал биологической химии . 279 (45): 47264–71. дои : 10.1074/jbc.M409047200 . ПМИД 15316005 .
Лю Д., О'Коннор М.С., Цинь Дж., Сунъян З. (декабрь 2004 г.). «Телосома, комплекс, связанный с теломерами млекопитающих, образованный множеством теломерных белков» . Журнал биологической химии . 279 (49): 51338–42. дои : 10.1074/jbc.M409293200 . ПМИД 15383534 .
Ван Д, Гун Ю, Цинь В, Чжан П, Ли Дж, Вэй Л, Чжоу Икс, Ли Х, Цю Икс, Чжун Ф, Хэ Л, Юй Дж, Яо Г, Цзян Х, Цянь Л, Ю Ю, Шу Х , Чен X, Сюй Х, Го М, Пань Z, Чэнь Ю, Гэ С, Ян С, Гу Дж (ноябрь 2004 г.). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (44): 15724–9. Бибкод : 2004PNAS..10115724W . дои : 10.1073/pnas.0404089101 . ПМК 524842 . ПМИД 15498874 .
Антуан К., Фербус Д., Колахгар Г., Проспери М.Т., Губен Г. (июль 2005 г.). «Белок цинковых пальцев, сверхэкспрессированный при карциноме толстой кишки, взаимодействует с теломерным белком hRap1». Журнал клеточной биохимии . 95 (4): 763–8. дои : 10.1002/jcb.20487 . ПМИД 15838871 . S2CID 10264323 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Ву Ю, Закал, Нью-Джерси, Рэйнбоу Эй Джей, Чжу XD (февраль 2007 г.). «XPF с мутациями в консервативном домене нуклеазы дефектен в репарации ДНК, но действует в TRF2-опосредованном укорочении теломер». Восстановление ДНК . 6 (2): 157–66. дои : 10.1016/j.dnarep.2006.09.005 . ПМИД 17055345 .
Бэ Н.С., Бауманн П. (май 2007 г.). «Комплекс RAP1/TRF2 ингибирует негомологичное соединение концов на концах теломерной ДНК человека» . Молекулярная клетка . 26 (3): 323–34. doi : 10.1016/j.molcel.2007.03.023 . ПМИД 17499040 .
Цай Ю, Кандула В, Косуру Р., Йе Х, Ирвин М.Г., Ся Зи (октябрь 2017 г.). «Расшифровка теломерного белка Rap1: его теломерные и нетеломерные функции и потенциальные последствия при диабетической кардиомиопатии» . Клеточный цикл . 16 (19): 1765–1773. дои : 10.1080/15384101.2017.1371886 . ПМЦ 5628636 . ПМИД 28853973 .
Цай Ю, Лю Х, Сун Е, Ван Л, Сюй Дж, Хэ Ю, Ся Цзи (март 2021 г.). «Дефицит связанного с теломерами белка-активатора-репрессора 1 ускоряет старение сердца у мышей посредством передачи сигналов p53/PPARα» . Тераностика . 11 (10): 4710–4727. дои : 10.7150/thno.51739 . ПМЦ 7978321 . ПМИД 33754023 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166848 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033430 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10850490-5] Перейти обратно: ^а ^б Ли Б., Острайх С., де Ланге Т. (май 2000 г.). «Идентификация человеческого Rap1: последствия для эволюции теломер» . Клетка . 101 (5): 471–83. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80858-2 . ПМИД 10850490 . S2CID 7956545 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: фактор связывания теломерного повтора TERF2IP 2, взаимодействующий белок» .

[pmid15100233-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с О'Коннор М.С., Сафари А., Лю Д., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «Белковый комплекс Rap1 человека и модуляция длины теломер» . Журнал биологической химии . 279 (27): 28585–91. дои : 10.1074/jbc.M312913200 . ПМИД 15100233 .

[pmid10888888-8] Чжу XD, Кюстер Б, Манн М, Петрини Дж. Х., де Ланге Т (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50/MRE11/NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природная генетика . 25 (3): 347–52. дои : 10.1038/77139 . PMID 10888888 . S2CID 6689794 .

[9] Арат НЁ, Гриффит Дж. Д. (декабрь 2012 г.). «Человеческий Rap1 напрямую взаимодействует с теломерной ДНК и регулирует локализацию TRF2 на теломерах» . Журнал биологической химии . 287 (50): 41583–94. дои : 10.1074/jbc.M112.415984 . ПМК 3516710 . ПМИД 23086976 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]