WDR75
( См. также: Список белков в организме человека ) WDR75 — человеческий белок, кодируемый геном WDR75. [ 1 ] содержащий домен суперсемейства WD40. [ 2 ] Домен WD40 обнаружен во многих типах эукариотических клеток и, как известно, участвует в функциях клеточного регулятора, таких как процессинг пре-мРНК и сборка цитоскелета. [ 3 ] Функция белка WDR75 не определена научным сообществом .
| Инвентарные номера | Расположение | Идентификаторы | МВт | пи |
|---|---|---|---|---|
| НМ_032186, НП_115544.1 | 2q32.2 | ФЛДЖ12519, ДКФЗп781Н2144 [ 1 ] | 94,5 кДа | 5.56 |
Белковая последовательность
[ редактировать ]состоит Аминокислотная последовательность из 830 остатков и содержит кислый хвост. [ 4 ]
1 MVEEENIRVV RCGGSELNFR RAVFSADSKY IFCVSGDFVK VYSTVTEECV HILHGHRNLV 61 TGIQLNPNNH LQLYSCSLDG TIKLWDYIDG ILIKTFIVGC KLHALFTLAQ AEDSVFVIVN 121 KEKPDIFQLV SVKLPKSSSQ EVEAKELSFV LDYINQSPKC IAFGNEGVYV AAVREFYLSV 181 YFFKKKTTSR FTLSSSRNKK HAKNNFTCVA CHPTEDCIAS GHMDGKIRLW RNFYDDKKYT 241 YTCLHWHHDM VMDLAFSVTG TSLLSGGRES VLVEWRDATE KNKEFLPRLG ATIEHISVSP 301 AGDLFCTSHS DNKIIIIHRN LEASAVIQGL VKDRSIFTGL MIDPRTKALV LNGKPGHLQF 361 YSLQSDKQLY NLDIIQQEYI NDYGLIQIEL TKAAFGCFGN WLATVEQRQE KETELELQMK 421 LWMYNKKTQG FILNTKINMP HEDCITALCF CNAEKSEQPT LVTASKDGYF KVWILTDDSD 481 IYKKAVGWTC DFVGSYHKYQ ATNCCFSEDG SLLAVSFEEI VTIWDSVTWE LKCTFCQRAG 541 KIRHLCFGRL TCSKYLLGAT ENGILCCWNL LSCALEWNAK LNVRVMEPDP NSENIAAISQ 601 SSVGSDLFVF KPSEPRPLYI QKGISREKVQ WGVFVPRDVP ESFTSEAYQW LNRSQFYFLT 661 KSQSLLTFST KSPEEKLTPT SKQLLAEESL PTTPFYFILG KHRQQQDEKL NETLENELVQ 721 LPLTENIPAI SELLHTPAHV LPSAAFLCSM FVNSLLLSKE TKSAKEIPED VDMEEEKESE 781 DSDEENDFTE KVQDTSNTGL GEDIIHQLSK SEEKELRKFR KIDYSWIAAL
Вторичная структура
[ редактировать ]структура Вторичная прогнозируется [ 4 ] содержать чередующиеся наборы альфа-спиралей и бета-цепей. Никаких спираль-поворот-спираль областей (HTH) не было предсказано.
Гомология
[ редактировать ]не существует известных паралогов Для человеческого гена . Для коровьих, мышиных или крысиных ортологов WDR75 не обнаружено паралогов. [ 5 ] Консервативность ортологов человеческого гена среди млекопитающих была сильной, с минимальной идентичностью среди ортологов на уровне 76%. В следующей таблице приведены некоторые ортологи позвоночных и беспозвоночных. Консервативность специфических аминокислот в положениях 340–390, 430–450 и 515–530 коррелирует с предсказанными альфа-спиралями. [ 4 ]
| Организм | Инвентарный номер | % идентичности человеческому гену |
|---|---|---|
| Лесной Телец | НП_001095532.1 [ 6 ] | 91.7 |
| Мышиная мышца | НП_082875.1 [ 7 ] | 84.9 |
| Пан-троглодиты | XP_001164827.1 [ 8 ] | 99.5 |
| Раттус норвегикус | НП_001041354.1 [ 9 ] | 84.3 |
| Семейная собака | XP_545565 [ 10 ] | 90.7 |
| Ксенопус Лаэвис | НП_001086564.1 [ 11 ] | 61.0 |
| Петух есть петух | XP_001233408.1 [ 12 ] | 60.8 |
| Шизосахаромицеты помбе | НП_594798 [ 13 ] | 19.9 |
| Анофелес гамбийский | XP_317524 [ 14 ] | 22.7 |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: WDR75, повторный домен WD 75» . Проверено 3 мая 2009 г.
- ^ "ВЗРЫВ" . Проверено 6 мая 2009 г.
- ^ «CDD: база данных консервативных доменов и классификации белков» .
- ^ Jump up to: а б с SDSC Biology Workbench 2.0
- ^ «БЛАТ Поиск Генома» . Проверено 7 мая 2009 г.
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Bos taurus] - Белок - NCBI» .
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Mus musculus] - Белок - NCBI» .
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Pan troglodytes] - Белок - NCBI» .
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Rattus norvegicus] - Белок - NCBI» .
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Canis lupus familis] - Белок - NCBI» .
- ^ «Белок 75, содержащий повторы WD [Xenopus laevis] - Белок - NCBI» .
- ^ «ПРОГДАНО: белок 75, содержащий повторы WD [Gallus Gallus] — белок — NCBI» .
- ^ «U3-snoRNP-ассоциированный белок Nan1 [Schizosaccharomyces pombe 972h-] - Белок - NCBI» .
- ^ «AGAP007948-PA, частичный [Anopheles gambiae STR. PEST] — Белок — NCBI» .