Онтология растений
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Онтология растений |
| Типы данных захвачен | Анатомия и развитие растений |
| Организмы | Зеленые растения |
| Контакт | |
| Первичное цитирование | Уоллс и др. (2012) [1] |
| Дата выпуска | 2002 [2] |
| Доступ | |
| Формат данных | ОБО и СОВА |
| Веб-сайт | http://plantontology.org |
| URL-адрес загрузки | http://purl.obolibrary.org/obo/po.owl |
| Sparql Конечная точка | http://sparql.hegroup.org/sparql |
| Разнообразный | |
| Лицензия | CC BY 4.0 |
Онтология растений (PO) — это набор онтологий, разработанных Консорциумом онтологии растений. Эти онтологии описывают анатомические структуры, а также стадии роста и развития Viridiplantae . [2] [3] [4] [5] [6] [7] PO предназначен для множества приложений, включая генетику , геномику , феномику и развитие , таксономию и систематику , семантические приложения и образование. [1] [8]
Участники проекта
[ редактировать ]- Государственный университет Орегона
- Нью-Йоркский ботанический сад
- Сад Л. Х. Бейли в Корнельском университете
- Вместе
- Соевая база
- ССВАП
- СГН
- Грамен
- Информационный ресурс арабидопсиса (TAIR)
- ЧастыйGDB
- Университет Миссури в Сент-Луисе
- Ботанический сад Миссури
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Уоллс, РЛ; Атрея, Б.; Купер, Л.; Эльзер, Дж.; Гандольфо, Массачусетс; Джайсвал, П.; Мунгалл, CJ; Прис, Дж.; Ренсинг, С.; Смит, Б.; Стивенсон, Д.В. (2012). «Онтологии как интегративные инструменты науки о растениях» . Американский журнал ботаники . 99 (8): 1263–1275. дои : 10.3732/ajb.1200222 . ПМЦ 3492881 . ПМИД 22847540 .
- ^ Jump up to: а б Консорциум онтологии растений, К. (2002). «Консорциум Plant Ontology™ и онтологии растений» . Сравнительная и функциональная геномика . 3 (2): 137–142. дои : 10.1002/cfg.154 . ПМЦ 2447263 . ПМИД 18628842 .
- ^ Илич, Катица (2008). Альберт, Бургер (ред.). Онтология структуры растений (PSO) — морфологическая и анатомическая онтология цветковых растений . Спрингер. стр. 27–42 . Проверено 22 августа 2012 г.
- ^ Авраам, С.; Тунг, К.-В.; Илич, К.; Джайсвал, П.; Келлог, Э.А.; Маккоуч, С .; Пуджар, А.; Райзер, Л.; Ри, Ю.Ю.; Сакс, ММ; Шеффер, М.; Штейн, Л.; Стивенс, П.; Винсент, Л.; Сапата, Ф.; Уэр, Д. (2007). «База данных онтологии растений: ресурс сообщества, содержащий контролируемую лексику и аннотации по структуре и стадиям развития растений» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (Проблема с базой данных): D449–D454. дои : 10.1093/нар/gkm908 . ПМК 2238838 . ПМИД 18194960 .
- ^ Илич, К.; Келлог, Э.А.; Джайсвал, П.; Сапата, Ф.; Стивенс, ПФ; Винсент, LP; Авраам, С.; Райзер, Л.; Пуджар, А.; Сакс, ММ; Уитмен, Северная Каролина; Маккоуч, СР; Шеффер, МЛ; Уэр, ДХ; Штейн, Л.Д.; Ри, С.Ю. (2006). «Онтология структуры растения, единый словарь анатомии и морфологии цветкового растения» . Физиология растений . 143 (2): 587–599. дои : 10.1104/стр.106.092825 . ПМК 1803752 . ПМИД 17142475 .
- ^ Пуджар, А.; Джайсвал, П.; Келлог, Э.А.; Илич, К.; Винсент, Л.; Авраам, С.; Стивенс, П.; Сапата, Ф.; Райзер, Л.; Ри, С.Ю.; Сакс, ММ; Шеффер, М.; Штейн, Л.; Уэр, Д.; МакКоуч, С. (2006). «Онтология стадии роста всего растения покрытосеменных растений и ее применение в биологии растений» . Физиология растений . 142 (2): 414–428. дои : 10.1104/стр.106.085720 . ПМК 1586063 . ПМИД 16905665 .
- ^ Джайсвал, П.; Авраам, С.; Илич, К.; Келлог, Э.А.; Маккоуч, С.; Пуджар, А.; Райзер, Л.; Ри, С.Ю.; Сакс, ММ; Шеффер, М.; Штейн, Л.; Стивенс, П.; Винсент, Л.; Уэр, Д.; Сапата, Ф. (2005). «Онтология растений (ПО): контролируемый словарь структур растений и стадий роста» . Сравнительная и функциональная геномика . 6 (7–8): 388–397. дои : 10.1002/cfg.496 . ПМК 2447502 . ПМИД 18629207 .
- ^ «Информационная перегрузка в эпоху «больших данных» » . Наука Дейли . Проверено 23 августа 2012 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта о ботанике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |