Эббе Нильсен Челлендж

Ebbe Nielsen Challenge — это международный научный конкурс, проводимый ежегодно с 2015 года Глобальным информационным фондом по биоразнообразию (GBIF) с набором денежных призов, которые признают вклады исследователей в создание программного обеспечения или подходов, успешно решающих проблемы, выданные GBIF. проблемы в области информатики биоразнообразия . Он является преемником премии Эббе Нильсена , которая ежегодно присуждалась GBIF в период с 2002 по 2014 год. Название конкурса чтит память выдающегося энтомолога и сторонника информатики биоразнообразия Эббе Нильсена , который умер от сердечного приступа в США по пути на конкурс 2001 года. Заседание управляющего совета GBIF.

История

В 2001 году GBIF учредил премию Эббе Нильсена в честь недавно скончавшегося датско-австралийского энтомолога Эббе Нильсена , который был активным сторонником как GBIF, так и дисциплины информатики биоразнообразия. ^{[ 1 ]} Эта премия присуждалась глобальному исследователю или исследовательской группе за их ретроспективный вклад в область информатики биоразнообразия в соответствии с критериями, установленными GBIF в условиях премии. Начиная с 2015 года, GBIF возобновил процесс награждения как конкурс между отдельными людьми или группами исследователей со всего мира для создания нового программного обеспечения или подходов к использованию данных о биоразнообразии в соответствии с темой, объявляемой ежегодно для каждого раунда конкурса, а также для разделения премии. деньги среди нескольких групп, а не одного победителя, как в начальную эпоху Премии. ^{[ 2 ]} Приглашения к участию в конкурсе, который теперь называется «Ebbe Nielsen Challenge», раздаются ежегодно с 2015 года по настоящее время, причем победители объявляются посредством конкурсного процесса во все годы, за исключением 2017 года, когда было получено недостаточное количество заявок. ^{[ 3 ]}

Список победителей с 2015 г.

2015

Задача: «Наилучшим образом использовать данные, предоставленные GBIF, таким образом, чтобы обеспечить новое представление или понимание. количество проблем или процессов, включая (но не ограничиваясь) анализ или визуализацию данных, рабочие процессы с данными, загрузку или аннотации». ^{[ 4 ]}

Список финалистов конкурса 2015 года доступен здесь. ^{[ 5 ]}

Обладатель первой премии:

« Метрики набора данных GBIF » – Питер Десмет, Барт Элтерман и Николя Ноэ (Бельгия) ^{[ 6 ]}

Лауреат второй премии:

« BioGUID.org » – Ричард Пайл (США) ^{[ 7 ]}

Подробности доступны на веб-сайте GBIF здесь. ^{[ 8 ]}

2016

Задача: «В 2016 году задача будет сосредоточена на вопросе пробелов и полноты данных, поиске инструментов, методов и механизмов, которые помогут проанализировать пригодность к использованию данных, предоставленных GBIF, и/или определить приоритеты для мобилизации данных о биоразнообразии. Мы ожидаем, что как пользователи данных, так и держатели данных выиграют от акцента в этом году на пробелах и полноте». ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Обладатель первой премии:

« Исследование невежества в пространстве и времени » – Алехандро Руэте (Аргентина) ^{[ 11 ]}

Лауреаты совместной второй премии:

« Сампбиас » — Александр Жижка, Александр Антонелли и Даниэле Сильвестро (Швеция) ^{[ 12 ]}
« Инструменты оценки покрытия GBIF » - Уолтер Джетц, Джереми Мальчик, Карстен Мейер, Мишель Дуонг, Аджай Ранипета и Луис Дж. Вильянуэва (США, Южная Африка и Германия) ^{[ 13 ]}

Подробности доступны на веб-сайте GBIF здесь. ^{[ 14 ]}

2017

Задача: «Конкурс GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2017 года предполагает подачу заявок, которые перепрофилируют эти наборы данных [в общедоступных репозиториях с открытым доступом] и адаптируют их в формат Darwin Core Archive (DwC-A), совместимый и допускающий повторное использование стандарт, который обеспечивает публикацию почти 800 миллионов записей о встречаемости видов из почти 1000 организаций по всему миру, которые сейчас действуют в сети GBIF. В рамках конкурса Ebbe Nielsen Challenge 2017 разработчикам и специалистам по обработке данных будет поручено создать веб-приложения, сценарии или другие инструменты, которые автоматизируют обнаружение и извлечение соответствующих данных о биоразнообразии из открытых данных. репозитории». ^{[ 15 ]}

Победители не были объявлены, что указывает на то, что призовые деньги 2017 года не были присуждены ни одной работе.

2018

Задача: «Конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018 намеренно открыт, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые продвигают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, предоставляемых GBIF. Конкурсные материалы могут представлять собой новые приложения. , методы визуализации, рабочие процессы или анализ, или они основываются на существующих инструментах и функциях и расширяют их». ^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}

Обладатели совместной первой премии:

« Рецепт контрольного списка: шаблон для воспроизводимой стандартизации данных контрольного списка видов » - Лиен Рейзерхове, Дамиано Олдони и Питер Десмет (Бельгия) ^{[ 18 ]}
« Озимандиас: график знаний о биоразнообразии » – Родерик Д.М. Пейдж (Великобритания) ^{[ 19 ]}

Лауреаты совместной второй премии:

« The bdverse » — Томер Гуэта, Йохай Кармель, Виджай Барве, Тилошон Нагараджа, Повилас Гибас, Ашвин Агравал (Израиль, США, Шри-Ланка, Литва и Индия) ^{[ 20 ]}
« Исследователь проблем GBIF » — Луис Дж. Вильянуэва (США) ^{[ 21 ]}
« Умная ловушка для комаров в трубопроводе DwC » – Коннор Ховингтон и Сэмюэл Рунд (США) ^{[ 22 ]}
« Редактор дерева таксономии » — Ашиш Сингх Томар (Испания) ^{[ 23 ]}

Подробности доступны на веб-сайте GBIF здесь. ^{[ 24 ]}

2019

Задача: «Конкурс Эббе Нильсена 2019 года намеренно открыт, поэтому участники имеют широкие полномочия по созданию инструментов и методов, которые продвигают открытую науку и улучшают доступ, полезность или качество данных, предоставляемых GBIF. Конкурсные материалы могут представлять собой новые приложения. Ожидается, что успешные заявки обеспечат практические, прагматичные решения для сети GBIF, одновременно продвигая информатику о биоразнообразии и управление данными о биоразнообразии в соответствии с миссией и стратегией GBIF. план." ^{[ 25 ]}

Обладатель первой премии:

« WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования несходства » - Хорхе Веласкес-Тибата (Колумбия) ^{[ 26 ]}

Лауреаты совместной второй премии:

« occCite: Инструменты для комплексного цитирования данных о биоразнообразии » - Ханна Л. Оуэнс, Кори Мероу, Брайан С. Мейтнер, Виджей В. Барве и Роберт Гуралник (Дания, США) ^{[ 27 ]}
« Органелла » — Андреа Бидерманн, Диана Герт, Димитар Ружев и Пауль Рёдер (Германия) ^{[ 28 ]}
« Быстрая наименьшая озабоченность: автоматизированная оценка растений с низким риском для включения в Красный список угрожаемых видов МСОП (Красный список) » - Стивен Бахман, Барнаби Уокер и Джастин Моут (Великобритания) ^{[ 29 ]}

Обладатели совместной третьей премии:

" Agile GBIF Publishing " - Evgeniy Meyke (Finland) ^{[ 30 ]}
« Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R » – Дебора Арльт, Алехандро Рюте и Антон Хаммарстрем (Швеция) ^{[ 31 ]}
« GB Sifter: фильтр данных GBIF для GenBank » – Луис Альенде (США) ^{[ 32 ]}
« naturaList » – Артур Винисиус Родригес и Габриэль Накамура (Бразилия) ^{[ 33 ]}
« Атлас GeoNature: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF вашего региона » - Джордан Селлис, Амандин Саль (Франция) ^{[ 34 ]}

Подробности доступны на веб-сайте GBIF здесь. ^{[ 35 ]}

Ссылки

^ Кристенсен, Нильс П. (2001). «Эббе Шмидт Нильсен, 7 июня 1950 г. - 6 марта 2001 г.». Nota Lepidopterologica . 24 (3): 3–9.
^ «Вызов GBIF Эббе Нильсена» . GBIF Эббе Нильсен Челлендж .
^ «Вызов GBIF Ebbe Nielsen 2018 открыт» . iphylo.blogspot.com .
^ «Названы победители первого конкурса GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . www.gbif.org .
^ «Финалисты GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . dna-barcoding.blogspot.com .
^ «Метрики набора данных GBIF» . chrome.google.com .
^ «BioGUID.org - Связывание данных по всей вселенной биоразнообразия посредством использования уникальных идентификаторов и связанных объектов данных» . devpost.com .
^ «Вызов GBIF Эббе Нильсена: воплотить в жизнь информацию о биоразнообразии» . www.gbif.org .
^ «Вызов Эббе Нильсена GBIF 2016: анализ и устранение пробелов и ошибок в первичных данных о биоразнообразии» . www.gbif.org .
^ «Вызов Эббе Нильсена GBIF 2016» . www.biodiv.be .
^ «Ученый SLU получил приз за «Картирование невежества» » . www.slu.se.
^ «sampbias - Оценка смещений географической выборки в наборах данных о распространении видов» . devpost.com .
^ «Инструменты оценки охвата GBIF — онлайн-инструменты для выявления и отслеживания пробелов в данных, предоставляемых GBIF, для характеристики распределения видов в пространстве и времени» . devpost.com .
^ «Запись о «картировании невежества» данных выиграла конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2016» . www.gbif.org .
^ «Освобождение записей о видах из хранилищ открытых данных для научных открытий и повторного использования» . www.gbif.org .
^ «GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2018 ищет инновации в области открытых данных для биоразнообразия» . www.gbif.org .
^ «Вызов GBIF Эббе Нильсена 2018» . www.europeandataportal.eu .
^ «Рецепт контрольного списка — как мы создали шаблон для стандартизации данных о видах» . www.ropensci.org .
^ «Профессор Родерик Пейдж выигрывает премию Эббе Нильсена» . Университет Глазго .
^ «bdverse: Механизм очистки данных о биоразнообразии» . www.researchgate.net .
^ «Офис программы оцифровки Смитсоновского института выиграл приз на конкурсе GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge» . dpo.si.edu .
^ «Члены команды VectorBase среди шести победителей Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.vectorbase.org .
^ «ПОСТ В БЛОГЕ: Визуальное исследование таксономических, филогеномических данных и данных о биоразнообразии» . big4-project.eu .
^ «Шесть победителей возглавили конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.gbif.org .
^ «GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2019 ищет инновации в области открытых данных для биоразнообразия» . www.gbif.org .
^ «WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования различий» . rpubs.com .
^ «ocCite: Инструменты для комплексного цитирования данных о биоразнообразии» . github.com .
^ «Органелла» . netlify.com .
^ «Быстрое наименьшее беспокойство: автоматизированная оценка растений с низким уровнем риска для Красного списка видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список) МСОП» . Shinyapps.io .
^ «Издательство Agile GBIF» . Earthcape.com/ .
^ «Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R» . github.com .
^ «GB Sifter: фильтр данных GBIF для GenBank» . youtube.com .
^ «НатураЛист» . Shinyapps.io .
^ «GeoNature-атлас: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF вашего региона» . ecrins-parcnational.com .
^ «WhereNext выигрывает GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2019» . www.gbif.org .

[1] Кристенсен, Нильс П. (2001). «Эббе Шмидт Нильсен, 7 июня 1950 г. - 6 марта 2001 г.». Nota Lepidopterologica . 24 (3): 3–9.

[2] «Вызов GBIF Эббе Нильсена» . GBIF Эббе Нильсен Челлендж .

[iphylo-2018-05-3] «Вызов GBIF Ebbe Nielsen 2018 открыт» . iphylo.blogspot.com .

[4] «Названы победители первого конкурса GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . www.gbif.org .

[5] «Финалисты GBIF Ebbe Nielsen Challenge» . dna-barcoding.blogspot.com .

[6] «Метрики набора данных GBIF» . chrome.google.com .

[7] «BioGUID.org - Связывание данных по всей вселенной биоразнообразия посредством использования уникальных идентификаторов и связанных объектов данных» . devpost.com .

[8] «Вызов GBIF Эббе Нильсена: воплотить в жизнь информацию о биоразнообразии» . www.gbif.org .

[9] «Вызов Эббе Нильсена GBIF 2016: анализ и устранение пробелов и ошибок в первичных данных о биоразнообразии» . www.gbif.org .

[10] «Вызов Эббе Нильсена GBIF 2016» . www.biodiv.be .

[11] «Ученый SLU получил приз за «Картирование невежества» » . www.slu.se.

[12] «sampbias - Оценка смещений географической выборки в наборах данных о распространении видов» . devpost.com .

[13] «Инструменты оценки охвата GBIF — онлайн-инструменты для выявления и отслеживания пробелов в данных, предоставляемых GBIF, для характеристики распределения видов в пространстве и времени» . devpost.com .

[14] «Запись о «картировании невежества» данных выиграла конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2016» . www.gbif.org .

[15] «Освобождение записей о видах из хранилищ открытых данных для научных открытий и повторного использования» . www.gbif.org .

[16] «GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2018 ищет инновации в области открытых данных для биоразнообразия» . www.gbif.org .

[17] «Вызов GBIF Эббе Нильсена 2018» . www.europeandataportal.eu .

[18] «Рецепт контрольного списка — как мы создали шаблон для стандартизации данных о видах» . www.ropensci.org .

[19] «Профессор Родерик Пейдж выигрывает премию Эббе Нильсена» . Университет Глазго .

[20] «bdverse: Механизм очистки данных о биоразнообразии» . www.researchgate.net .

[21] «Офис программы оцифровки Смитсоновского института выиграл приз на конкурсе GBIF 2018 Ebbe Nielsen Challenge» . dpo.si.edu .

[22] «Члены команды VectorBase среди шести победителей Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.vectorbase.org .

[23] «ПОСТ В БЛОГЕ: Визуальное исследование таксономических, филогеномических данных и данных о биоразнообразии» . big4-project.eu .

[24] «Шесть победителей возглавили конкурс Ebbe Nielsen Challenge 2018» . www.gbif.org .

[25] «GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2019 ищет инновации в области открытых данных для биоразнообразия» . www.gbif.org .

[26] «WhereNext: рекомендательная система для определения приоритетов выборки на основе обобщенного моделирования различий» . rpubs.com .

[27] «ocCite: Инструменты для комплексного цитирования данных о биоразнообразии» . github.com .

[28] «Органелла» . netlify.com .

[29] «Быстрое наименьшее беспокойство: автоматизированная оценка растений с низким уровнем риска для Красного списка видов, находящихся под угрозой исчезновения (Красный список) МСОП» . Shinyapps.io .

[30] «Издательство Agile GBIF» . Earthcape.com/ .

[31] «Обзор информации о биоразнообразии и поддержка принятия решений: пакет BIRDS для R» . github.com .

[32] «GB Sifter: фильтр данных GBIF для GenBank» . youtube.com .

[33] «НатураЛист» . Shinyapps.io .

[34] «GeoNature-атлас: опубликуйте онлайн-атлас биоразнообразия с данными GBIF вашего региона» . ecrins-parcnational.com .

[35] «WhereNext выигрывает GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2019» . www.gbif.org .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]