Язык модульного химического дескриптора

Модульный язык химического дескриптора (MCDL) - это метод представления молекулярных структур и соответствующей молекулярной информации с использованием линейных дескрипторов. Файлы MCDL предназначены для кроссплатформенного переноса и манипуляции с химическими данными, специфичными для соединений. Они состоят из наборов уникальной информации (фрагментов, соединений) и неаникальной информации (координаты, идентификационные номера, спектры, физические химические свойства). Неоникальная часть дескриптора может быть настроена, обеспечивая таким образом гибкость конечного пользователя. ^{[ 1 ]} Уникальное представление стереохимии атомов и двойной связи придумывается как отдельные модули. ^{[ 2 ]}

Реализация программного обеспечения

Язык модульного химического дескриптора в настоящее время реализован в нескольких программных пакетах. Редактор MCDL на базе Java с интеллектуальной генерацией 2D-координат доступен в качестве программного обеспечения с открытым исходным кодом в GPL. ^{[ 3 ]} Переводчик MCDL также включен в Open Babel, начиная с версии 2.3.1. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Смотрите также

Химический формат файла

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Модульный химический язык дескриптор (MCDL): композиция, связь и Дополнительные модули, AA Gakh, Mn Burnett, J. Chem. Инф. Вычислительный Sci., 2001, 41 (6), 1494-1499. Два : 10.1021/ci000108y
^ Модульный химический язык дескриптор (MCDL): стереохимические модули, AA Gakh, MN Burnett, SV Trepalin, et al, J. Cheminform., 2011, 3, 5. doi : 10.1186/1758-2946-3-5
^ Редактор химической структуры Java, поддерживающий язык модульного химического дескриптора (MCDL), SV Trepalin, Av Yarkov, IV Pletnev, et al, Molecules, 2006, 11, 219-231. doi : 10.3390/11040219
^ Нм О'Бойл, М. Банк, Калифорния Джеймс и др. Открытый вавильс: открытый химический набор инструментов. J Cheminform 2011, 3, 33. doi : 10.1186/1758-2946-3-33
^ Куззокраа, Альфредо; Киттл, Кристиан; Simos, DiMitris E.; Вейппл, Эдгар; Сюй, Лида (2013-08-19). Доступность, надежность и безопасность в информационных системах и HCI: IFIP WG 8.4, 8.9, TC 5 Международная междоменная конференция, CD-ARES 2013, Регенсбург, Германия, 2-6 сентября 2013 г., Материалы . Спрингер. ISBN 9783642405112 Полем Получено 2020-12-11 . {{cite book}}: |website= игнорируется ( помощь )

Эта статья о химическом программном обеспечении является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[MCDL1-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Модульный химический язык дескриптор (MCDL): композиция, связь и Дополнительные модули, AA Gakh, Mn Burnett, J. Chem. Инф. Вычислительный Sci., 2001, 41 (6), 1494-1499. Два : 10.1021/ci000108y

[MCDL2-2] Модульный химический язык дескриптор (MCDL): стереохимические модули, AA Gakh, MN Burnett, SV Trepalin, et al, J. Cheminform., 2011, 3, 5. doi : 10.1186/1758-2946-3-5

[Trepalin-3] Редактор химической структуры Java, поддерживающий язык модульного химического дескриптора (MCDL), SV Trepalin, Av Yarkov, IV Pletnev, et al, Molecules, 2006, 11, 219-231. doi : 10.3390/11040219

[O'Boyle-4] Нм О'Бойл, М. Банк, Калифорния Джеймс и др. Открытый вавильс: открытый химический набор инструментов. J Cheminform 2011, 3, 33. doi : 10.1186/1758-2946-3-33

[5] Куззокраа, Альфредо; Киттл, Кристиан; Simos, DiMitris E.; Вейппл, Эдгар; Сюй, Лида (2013-08-19). Доступность, надежность и безопасность в информационных системах и HCI: IFIP WG 8.4, 8.9, TC 5 Международная междоменная конференция, CD-ARES 2013, Регенсбург, Германия, 2-6 сентября 2013 г., Материалы . Спрингер. ISBN 9783642405112 Полем Получено 2020-12-11 . {{cite book}}: |website= игнорируется ( помощь )

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]