Мадагаскар (программное обеспечение)

Мадагаскар
Первоначальный выпуск	12 июня 2006 г.
Стабильная версия	4.0 / 7 марта 2023 г .; 16 месяцев назад
Предварительный выпуск	Через Гитхаб
Репозиторий	github .с /являюсь /источник ;
Написано в	С , С++ , Питон
Операционная система	Посикс
Тип	Геофизическое программное обеспечение
Лицензия	Стандартная общественная лицензия GNU
Веб-сайт	ahay.org

Мадагаскар — это программный пакет для многомерного анализа данных и воспроизводимых вычислительных экспериментов.

Технологии, разработанные с использованием системы управления проектами Мадагаскара, передаются в виде записанных историй обработки, которые становятся «вычислительными рецептами», подлежащими проверке, обмену и модификации пользователями системы.

Функции

Окружающая среда Мадагаскара состоит из:

Автономные программы для внешнего анализа данных;
Автономные программы для обработки и построения геофизических данных;
Комплект разработки для C, C++, Java, Fortran-77, Fortran-90, Python, Matlab и Octave;
Структура для воспроизводимых численных экспериментов, основанная на SCons ;
Фреймворк для научных публикаций на основе SCons и LaTeX ;
Коллекция воспроизводимых научных статей, также используемых в качестве примеров использования и регрессионных тестов для автономных программ;
Коллекция наборов данных, используемых в качестве входных данных для воспроизводимых численных экспериментов.

Пример скрипта

Пример Файл SConstruct показан ниже. ^[1]

from rsf.proj import *

Fetch('wz.35.H','wz')

Flow('wind','wz.35.H','dd form=native | window n1=400 j1=2 | smooth rect1=3')
Plot('wind','pow pow1=2 | grey')

Flow('mute','wind','mutter v0=0.31 half=n')
Plot('mute','pow pow1=2 | grey')

Result('denmark','wind mute','SideBySideAniso')

End()

Обратите внимание, что SConstruct сам по себе не выполняет никакой работы, кроме установки правил для построения различных целей. Цели создаются при выполнении scons в командной строке. ^[2] Бег Сконс производит

bash$ scons
scons: Reading SConscript files ...
scons: done reading SConscript files.
scons: Building targets ...
retrieve(["wz.35.H"], [])
< wz.35.H /RSF/bin/sfdd form=native | /RSF/bin/sfwindow n1=400 j1=2 | /RSF/bin/sfsmooth rect1=3 > wind.rsf
< wind.rsf /RSF/bin/sfpow pow1=2 | /RSF/bin/sfgrey > wind.vpl
< wind.rsf /RSF/bin/sfmutter v0=0.31 half=n > mute.rsf
< mute.rsf /RSF/bin/sfpow pow1=2 | /RSF/bin/sfgrey > mute.vpl
/RSF/bin/vppen yscale=2 vpstyle=n gridnum=2,1 wind.vpl mute.vpl > Fig/denmark.vpl
scons: done building targets.

Лицензия

Мадагаскар является свободным программным обеспечением и распространяется под лицензией GPL .

История

Мадагаскар был впервые публично представлен на семинаре EAGE в Вене в июне 2006 года. Работу над пакетом (ранее называвшимся RSF) начал Сергей Фомель в 2003 году. С тех пор в него внесли свой вклад многие люди. ^[3]

Хотя Мадагаскар написан в основном с нуля, он заимствует идеи из дизайна SEPlib, пакета с открытым исходным кодом, поддерживаемого Бобом Клэппом в Стэнфордском исследовательском проекте (SEP). Поколения студентов и исследователей SEP внесли свой вклад в SEPlib. Самый важный вклад внесли Роб Клейтон, Джон Клербаут , Дэйв Хейл, Стью Левин, Рик Оттолини, Джо Деллинджер, Стив Коул, Дэйв Николс, Мартин Карренбах, Биондо Бионди и Боб Клэпп.

Мадагаскар также заимствует идеи из Seismic Unix (SU), пакета, поддерживаемого Джоном Стоквеллом в Центре волновых явлений (CWP) Горной школы Колорадо (Stockwell, 1997; ^[4] Стоквелл, 1999 г. ^[5]). Основными сотрудниками SU были Эйнар Кьяртанссон, Шуки Ронен, Джек Коэн, Крис Лайнер, Дэйв Хейл и Джон Стоквелл. SU принял лицензию в стиле BSD с открытым исходным кодом, начиная с версии 40 (10 апреля 2007 г.).

См. также

Воспроизводимость

Ссылки

^ bei/sg/денмарка пример https://github.com/ahay/src/blob/master/book/bei/sg/denmark/SConstruct
^ С. Фомель и Г. Хенненфент, 2007, Воспроизводимые вычислительные эксперименты с использованием SCons: 32-я Международная конференция по акустике, речи и обработке сигналов (ICASSP), IV/1257-1260.
^ Файл AUTHORS.txt https://github.com/ahay/src/blob/master/AUTHORS.txt.
^ Стоквелл, Дж. У., 1997, Бесплатное программное обеспечение в образовании: пример CWP/SU: Seismic Unix: The Leading Edge, 16 , 1045–1049.
^ --------, 1999, CWP/SU: Пакет Seismic Un*x: Computers and Geosciences, 25 , 415--419.

Внешние ссылки

Презентации на научной конференции о Мадагаскаре
Для воспроизводимых исследований отправляйтесь на Мадагаскар.
Сергей Фомель и Джон Клербаут , Введение приглашенных редакторов: Воспроизводимые исследования : Вычисления в науке и технике, том. 11, нет. 1, стр. 5–7, январь/февраль. 2009, два : 10.1109/MCSE.2009.14
Сергей Фомель, Пол Сава, Иоанн Влад, Ян Лю и Владимир Башкардин, 2013, Мадагаскар: проект программного обеспечения с открытым исходным кодом для многомерного анализа данных и воспроизводимых вычислительных экспериментов : Журнал открытого исследовательского программного обеспечения, 1 (1): e8, дои : 10.5334/jors.ag
Сергей Фомель, Воспроизводимые исследования как усилия сообщества: Уроки Мадагаскарского проекта : Вычисления в науке и технике, том. 17, нет. 1, стр. 20–26, январь/февраль. 2015, два : 10.1109/MCSE.2014.94
Джон Холден, Происхождение Мадагаскара : передний край, том. 34, нет. 11 ноября 2015 г., дои : 10.1190/tle34111386.1

[1] /sg/денмарка пример https://github.com/ahay/src/blob/master/book/bei/sg/denmark/SConstruct

[2] С. Фомель и Г. Хенненфент, 2007, Воспроизводимые вычислительные эксперименты с использованием SCons: 32-я Международная конференция по акустике, речи и обработке сигналов (ICASSP), IV/1257-1260.

[3] Файл AUTHORS.txt https://github.com/ahay/src/blob/master/AUTHORS.txt.

[4] Стоквелл, Дж. У., 1997, Бесплатное программное обеспечение в образовании: пример CWP/SU: Seismic Unix: The Leading Edge, 16 , 1045–1049.

[5] --------, 1999, CWP/SU: Пакет Seismic Un*x: Computers and Geosciences, 25 , 415--419.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]