БиоСимГрид

BioSimGrid — это проект, призванный сделать наборы данных компьютерного моделирования в области моделирования биологических систем , особенно биомолекулярных структур , более доступными для исследователей. Проект начался в 2004 году и был остановлен к 2009 году.

В 2004 году дизайнеры представили концепцию проекта как « банк данных о белках, расширенный во времени». ^[1] Другие разработчики представили веб-портал для доступа к данным проекта. ^[2] Другие дизайнеры назвали проект эффективным. ^[3]

В обзоре 2006 года описывалось, что BioSimGrid является модельным проектом, позволяющим сделать данные исследований более открытыми. ^[4]

Участники BioSimGrid приняли грант от Национальных институтов здравоохранения в 2007 году. ^[5]

Ссылки

^ Тай, Кайсу; Мердок, Стюарт; Ву, Бинг; Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон Дж.; Джеффрис, Пол; Эссекс, Джонатан В.; П. Сансом, Марк С. (2004). «BioSimGrid: к всемирному хранилищу биомолекулярного моделирования». Органическая и биомолекулярная химия . 2 (22): 3219–21. CiteSeerX 10.1.1.58.9886 . дои : 10.1039/b411352g . ПМИД 15534698 .
^ Ву, Б.; Дови, М.; Нг, МХ; Тай, К.; Мердок, С.; Джеффрис, П.; Кокс, С.; Эссекс, Дж.; Сансом, MSP (2004). «Реализация BioSimGrid на веб-портале / Grid: база данных биомолекулярного моделирования». Международная конференция по информационным технологиям: кодирование и вычисления, 2004 г. Материалы. ITCC 2004 . Том. 2. С. 50–54. CiteSeerX 10.1.1.108.6976 . дои : 10.1109/ITCC.2004.1286589 . ISBN 978-0-7695-2108-4 . S2CID 5729099 .
^ Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Мердок, Стюарт; Ву, Бинг; Тай, Кайсу; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон; Эссекс, Джонатан В.; Сансом, Марк; Джеффрис, Пол (2004). «Эффективное хранение и анализ данных для общих данных биомолекулярного моделирования» . стр. 443–450.
^ Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Ву, Бинг; Мердок, Стюарт Э.; Тай, Кайсу; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон Дж.; Эссекс, Джонатан В.; Сэнсом, Марк С.П.; Джеффрис, Пол (май 2006 г.). «BioSimGrid: хранение и анализ данных биомолекулярного моделирования с поддержкой Grid» (PDF) . Компьютерные системы будущего поколения . 22 (6): 657–664. дои : 10.1016/j.future.2005.10.005 .
^ Мердок, Стюарт (2007). «Расширение Biosimgrid для моделирования биомола» . Грантоме .

Внешние ссылки

Официальный сайт
biosimgrid.org больше не существует и заархивирован 17 июля 2009 г. в Wayback Machine.
файловый архив на SourceForge

[1] Тай, Кайсу; Мердок, Стюарт; Ву, Бинг; Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон Дж.; Джеффрис, Пол; Эссекс, Джонатан В.; П. Сансом, Марк С. (2004). «BioSimGrid: к всемирному хранилищу биомолекулярного моделирования». Органическая и биомолекулярная химия . 2 (22): 3219–21. CiteSeerX 10.1.1.58.9886 . дои : 10.1039/b411352g . ПМИД 15534698 .

[WuDovey2004-2] Ву, Б.; Дови, М.; Нг, МХ; Тай, К.; Мердок, С.; Джеффрис, П.; Кокс, С.; Эссекс, Дж.; Сансом, MSP (2004). «Реализация BioSimGrid на веб-портале / Grid: база данных биомолекулярного моделирования». Международная конференция по информационным технологиям: кодирование и вычисления, 2004 г. Материалы. ITCC 2004 . Том. 2. С. 50–54. CiteSeerX 10.1.1.108.6976 . дои : 10.1109/ITCC.2004.1286589 . ISBN 978-0-7695-2108-4 . S2CID 5729099 .

[3] Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Мердок, Стюарт; Ву, Бинг; Тай, Кайсу; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон; Эссекс, Джонатан В.; Сансом, Марк; Джеффрис, Пол (2004). «Эффективное хранение и анализ данных для общих данных биомолекулярного моделирования» . стр. 443–450.

[4] Нг, Муан Хонг; Джонстон, Стивен; Ву, Бинг; Мердок, Стюарт Э.; Тай, Кайсу; Фангор, Ганс; Кокс, Саймон Дж.; Эссекс, Джонатан В.; Сэнсом, Марк С.П.; Джеффрис, Пол (май 2006 г.). «BioSimGrid: хранение и анализ данных биомолекулярного моделирования с поддержкой Grid» (PDF) . Компьютерные системы будущего поколения . 22 (6): 657–664. дои : 10.1016/j.future.2005.10.005 .

[5] Мердок, Стюарт (2007). «Расширение Biosimgrid для моделирования биомола» . Грантоме .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]