ПабМед

Из Википедии, бесплатной энциклопедии
(Перенаправлено из PMID (идентификатор) )

ПабМед
Контакт
Исследовательский центр Национальная медицинская библиотека США (NLM)
Дата выпуска январь 1996 г .; 28 лет назад ( 1996-01 )
Доступ
Веб-сайт опубликовано .ncbi .нлм .nih .gov

PubMed — это бесплатная база данных , включающая в первую очередь MEDLINE базу данных , содержащую ссылки и рефераты по наукам о жизни и биомедицинским темам. ( Национальная медицинская библиотека США NLM) при Национальных институтах здравоохранения поддерживает базу данных как часть Entrez системы поиска информации . [1]

С 1971 по 1997 год онлайн-доступ к базе данных MEDLINE осуществлялся в основном через институциональные учреждения, такие как университетские библиотеки . [2] PubMed, впервые выпущенный в январе 1996 года, открыл эру частного, бесплатного поиска в MEDLINE дома и в офисе. [3] Система PubMed предлагалась бесплатно публике начиная с июня 1997 года. [2]

Содержание [ править ]

Помимо MEDLINE, PubMed предоставляет доступ к:

  • старые ссылки из печатной версии Index Medicus , датированные 1951 годом и раньше.
  • ссылки на некоторые журналы до того, как они были проиндексированы в Index Medicus и MEDLINE, например Science , BMJ и Annals of Surgery.
  • самые последние записи в записях статьи, прежде чем она будет проиндексирована с помощью медицинских предметных рубрик (MeSH) и добавлена ​​в MEDLINE.
  • коллекция книг, доступных в полнотекстовом формате и других подмножествах записей NLM [4]
  • ЧВК Цитаты
  • Книжная полка NCBI

Многие записи PubMed содержат ссылки на полные тексты статей, некоторые из которых находятся в свободном доступе, часто в PubMed Central. [5] и местные зеркала, такие как Europe PubMed Central . [6]

Информацию о журналах, индексируемых в MEDLINE и доступных через PubMed, можно найти в каталоге NLM. [7]

По состоянию на 23 мая 2023 г. , PubMed has more than 35 million citations and abstracts dating back to 1966, selectively to the year 1865, and very selectively to 1809. As of the same date, 24,6 миллиона записей PubMed перечислены с их рефератами, а 26,8 миллиона записей имеют ссылки на полнотекстовые версии (из которых 10,9 миллиона статей доступны в полнотекстовом режиме бесплатно). [8] За последние 10 лет (до 31 декабря 2019 г.) каждый год добавлялось в среднем около миллиона новых записей.

В 2016 году NLM изменила систему индексирования, чтобы издатели могли напрямую исправлять опечатки и ошибки в статьях, проиндексированных PubMed. [9]

Сообщается, что в PubMed включены некоторые статьи, опубликованные в хищнических журналах. Политика MEDLINE и PubMed по выбору журналов для включения в базу данных немного различается. Слабость критериев и процедур индексации журналов в PubMed Central может привести к утечке публикаций из журналов-хищников в PubMed. [10] Национальная медицинская библиотека ответила, что отдельные журнальные статьи могут быть включены в PMC для поддержки политики публичного доступа спонсоров исследований и что строгая политика в отношении журналов и издателей обеспечивает целостность литературных баз данных NLM. [11]

Характеристики [ править ]

Дизайн сайта [ править ]

Новый интерфейс PubMed был запущен в октябре 2009 года и поощрял использование таких быстрых поисковых формул, как у Google; их также называют поиском «телеграмм». [12] По умолчанию результаты сортируются по «Самым последним», но это можно изменить на «Лучшее совпадение», «Дата публикации», «Первый автор», «Последний автор», «Журнал» или «Название». [13]

Дизайн и домен веб-сайта PubMed были обновлены в январе 2020 года и стали стандартными 15 мая 2020 года с обновленными и новыми функциями. [14] Была критическая реакция со стороны многих исследователей, которые часто пользуются сайтом. [15]

PubMed для портативных/мобильных устройств [ править ]

Доступ к PubMed/MEDLINE можно получить через портативные устройства, используя, например, опцию «PICO» (для целенаправленных клинических вопросов), созданную NLM. [16] Также доступна опция «PubMed Mobile», обеспечивающая доступ к упрощенной версии PubMed, удобной для мобильных устройств. [17]

Поиск [ править ]

Стандартный поиск [ править ]

Простой поиск в PubMed можно выполнить, введя ключевые аспекты предмета в окно поиска PubMed.

PubMed переводит эту первоначальную формулировку поиска и автоматически добавляет имена полей, соответствующие термины MeSH (медицинские предметные рубрики), синонимы, логические операторы и соответствующим образом «вкладывает» полученные термины, значительно улучшая формулировку поиска, в частности, путем регулярного комбинирования (с использованием оператора OR). оператор) текстовые слова и термины MeSH. [ нужна цитата ]

Примеры, приведенные в руководстве PubMed [18] продемонстрировать, как работает этот автоматический процесс:

Причины Лунатизм переводится как («этиология» [Подзаголовок] ИЛИ «этиология» [Все поля] ИЛИ «причины» [Все поля] ИЛИ «причинность» [Термины MeSH] ИЛИ «причинность» [Все поля]) И («сомнамбулизм «[Термины MeSH] ИЛИ «сомнамбулизм» [Все поля] ИЛИ («сон» [Все поля] И «ходьба» [Все поля]) ИЛИ «ходьба во сне» [Все поля])

Так же,

мягкий Attack Aspirin Prevention переводится как («инфаркт миокарда» [Термины MeSH] ИЛИ («миокард» [Все поля] И «инфаркт» [Все поля]) ИЛИ «инфаркт миокарда» [Все поля] ИЛИ («сердце» [Все поля]) ИЛИ («сердце» [Все поля]) ] И «атака» [Все поля]) ИЛИ «сердечный приступ» [Все поля]) И («аспирин» [Термины MeSH] ИЛИ «аспирин» [Все поля]) И («профилактика и контроль» [Подзаголовок] ИЛИ ( «профилактика»[Все поля] И «контроль»[Все поля]) ИЛИ «профилактика и контроль»[Все поля] ИЛИ «профилактика»[Все поля])

Комплексный поиск [ править ]

Для оптимального поиска в PubMed необходимо понимать его основной компонент, MEDLINE, и особенно словарь, контролируемый MeSH (медицинские предметные рубрики), используемый для индексирования статей MEDLINE. Они также могут требовать сложных стратегий поиска, использования имен полей (тегов), правильного использования ограничений и других функций; Справочные библиотекари и специалисты по поиску предлагают услуги по поиску. [19] [20]

Поиск в окне поиска PubMed рекомендуется только для поиска однозначных тем или новых вмешательств, для которых еще не создан заголовок MeSH, а также для поиска коммерческих марок лекарств и имен собственных. Это также полезно, когда нет подходящего заголовка или дескриптор представляет собой частичный аспект. Поиск с использованием тезауруса MeSH более точен и дает меньше нерелевантных результатов. Кроме того, это избавляет от недостатка свободного текстового поиска, при котором необходимо учитывать различия в написании, единственном/множественном числе или сокращении. С другой стороны, статьи, недавно включенные в базу данных, которым еще не присвоены дескрипторы, не будут найдены. Поэтому, чтобы гарантировать исчерпывающий поиск, необходимо использовать комбинацию контролируемых языковых заголовков и свободных текстовых терминов. [21]

Параметры журнальной статьи [ править ]

Когда журнальная статья индексируется, многочисленные параметры статьи извлекаются и сохраняются в виде структурированной информации. К таким параметрам относятся: тип статьи (термины MeSH, например, «Клиническое исследование»), вторичные идентификаторы (термины MeSH), язык, страна журнала или история публикации (дата электронной публикации, дата публикации в печатном журнале).

Тип публикации: Клинические запросы/систематические обзоры [ править ]

Параметр «Тип публикации» позволяет осуществлять поиск по типу публикации , включая отчеты о различных видах клинических исследований. [22]

Вторичный идентификатор [ править ]

С июля 2005 года процесс индексирования статей MEDLINE извлекает идентификаторы из аннотации статьи и помещает их в поле под названием «Вторичный идентификатор» (SI). Поле вторичного идентификатора предназначено для хранения номеров доступа к различным базам данных данных о молекулярных последовательностях, экспрессии генов или химических соединениях, а также идентификаторов клинических испытаний. Для клинических испытаний PubMed извлекает идентификаторы исследований для двух крупнейших реестров исследований: ClinicalTrials.gov (идентификатор NCT) и Международного стандартного реестра номеров рандомизированных контролируемых исследований (идентификатор IRCTN). [23]

См. также [ править ]

Ссылка, которая считается особенно актуальной, может быть отмечена и обозначена «похожие статьи». При необходимости можно выбрать несколько исследований и создать соответствующие статьи для всех из них (в PubMed или любой другой базе данных NCBI Entrez), используя опцию «Найти связанные данные». Связанные статьи затем перечисляются в порядке «связанности». Чтобы создать эти списки связанных статей, PubMed сравнивает слова из заголовка и аннотации каждой цитаты, а также назначенные заголовки MeSH, используя мощный алгоритм взвешивания слов. [24] Функция «похожие статьи» была признана настолько точной, что авторы статьи предложили использовать ее вместо полного поиска. [25]

Сопоставление с MeSH [ править ]

PubMed автоматически ссылается на термины и подзаголовки MeSH. Примеры: «неприятный запах изо рта» связан с «неприятным запахом изо рта» (и включается в поиск), «сердечный приступ» с «инфарктом миокарда», «рак молочной железы» с «новообразованиями молочной железы». При необходимости эти термины MeSH автоматически «расширяются», то есть включают более конкретные термины. Такие термины, как «уход за больными», автоматически связываются с «уход [MeSH]» или «уход [подзаголовок]». Эта функция называется автоматическим сопоставлением терминов и по умолчанию применяется при свободном текстовом поиске, а не при точном поиске фраз (т. е. заключении поискового запроса в двойные кавычки). [26] Эта функция делает поиск в PubMed более чувствительным и позволяет избежать ложноотрицательных (пропущенных) совпадений за счет компенсации разнообразия медицинской терминологии. [26]

PubMed не применяет автоматическое сопоставление термина в следующих случаях: при написании цитируемой фразы (например, «аллотрансплантат почки»), при усечении звездочкой (например, аллотрансплантат почки*) и при просмотре с метками полей (например, Рак [ти]). [21]

Мой NCBI [ править ]

Дополнительный сервис PubMed «Мой NCBI» (с бесплатной регистрацией) предоставляет инструменты для

  • сохранение результатов поиска
  • фильтрация результатов поиска
  • настройка автоматических обновлений, отправляемых по электронной почте
  • сохранение наборов ссылок, полученных в ходе поиска PubMed
  • настройка форматов отображения или выделение условий поиска

и широкий спектр других опций. [27] Доступ к разделу «Мой NCBI» возможен с любого компьютера, имеющего веб-доступ. Более ранняя версия «My NCBI» называлась «PubMed Cubby». [28]

LinkOut[editLinkOut

LinkOut — это средство NLM, позволяющее связать и сделать доступными полнотекстовые фонды местных журналов. [29] Около 3200 объектов (в основном академических учреждений) участвуют в этом механизме NLM (по состоянию на март 2010 г.). ), от Ольборгского университета в Дании до ZymoGenetics в Сиэтле. [30] Пользователи этих учреждений видят логотип своего учреждения в результатах поиска PubMed (если журнал ведется в этом учреждении) и могут получить доступ к полному тексту. Link Out объединяется с Outside Tool после основного обновления платформы, которое выйдет летом 2019 года. [31]

PubMed Commons [ править ]

В 2016 году PubMed позволяет авторам статей комментировать статьи, индексируемые PubMed. Первоначально эта функция тестировалась в пилотном режиме (с 2013 года) и стала постоянной в 2016 году. [32] В феврале 2018 года поддержка PubMed Commons была прекращена в связи с тем, что «использование осталось минимальным». [33] [34]

спроситьМЕДЛАЙН [ править ]

AskMEDLINE, инструмент запросов на естественном языке с произвольным текстом для MEDLINE/PubMed, разработанный NLM, также подходит для портативных устройств. [35]

Идентификатор PubMed [ править ]

PMID ( идентификатор PubMed или уникальный идентификатор PubMed) [36] уникальное целочисленное значение , начиная с 1, назначенный каждой записи PubMed. PMID — это не то же самое, что PMCID с бесплатным доступом (идентификатор PubMed Central), который является идентификатором всех произведений, опубликованных в PubMed Central . [37]

Присвоение публикации PMID или PMCID ничего не говорит читателю о типе или качестве контента. PMID присваиваются письмам редактору , редакционным мнениям, колонкам с комментариями и любым другим материалам, которые редактор решает включить в журнал, а также рецензируемым статьям. Наличие идентификационного номера также не является доказательством того, что документы не были отозваны из-за мошенничества, некомпетентности или неправомерных действий. Объявлению о любых исправлениях в оригинальных статьях может быть присвоен PMID.

Каждое число, введенное в окно поиска PubMed, по умолчанию рассматривается как PMID. Таким образом, любую ссылку в PubMed можно найти с помощью PMID.

Альтернативные интерфейсы [ править ]

MEDLINE — одна из баз данных, доступных через PubMed. Несколько компаний предоставляют доступ к MEDLINE через свои платформы.

Национальная медицинская библиотека сдает в аренду информацию MEDLINE ряду частных поставщиков, таких как Embase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finder и многим другим коммерческим, некоммерческим и академическим поставщикам. [38] По состоянию на октябрь 2008 г. было выдано более 500 лицензий, более 200 из них — поставщикам за пределами США. Поскольку лицензии на использование данных MEDLINE доступны бесплатно, NLM фактически предоставляет бесплатную испытательную площадку для широкого круга [39] альтернативных интерфейсов и сторонних дополнений к PubMed, одной из очень немногих крупных, профессионально курируемых баз данных, предлагающих такую ​​возможность.

Лу приводит пример из 28 текущих и бесплатных веб-версий PubMed, не требующих установки или регистрации, которые сгруппированы в четыре категории: [39]

  1. Ранжирование результатов поиска, например: eTBLAST ; МедлайнРанкер; [40] МиПоиск; [41]
  2. Кластеризация результатов по темам, авторам, журналам и т. д., например: Anne O'Tate ; [42] КластерМед; [43]
  3. Улучшение семантики и визуализации, например: EBIMed; [44] С Эви. [45]
  4. Улучшен интерфейс поиска и возможности поиска, например, AskMEDLINE. [46] [47] БабельМеШ; [48] и ПабКраулер. [49]

Поскольку большинство этих и других альтернатив в основном полагаются на данные PubMed/MEDLINE, арендованные по лицензии у NLM/PubMed, был предложен термин «производные PubMed». [39] Без необходимости хранить около 90 ГБ исходных наборов данных PubMed любой может писать приложения PubMed, используя программный интерфейс eutils-application, как описано в книге Эрика Сэйерса, доктора философии «Подробно об электронных утилитах: параметры, синтаксис и многое другое». [50] Различные генераторы формата цитирования, принимающие в качестве входных данных номера PMID, являются примерами веб-приложений, использующих программный интерфейс eutils-application. Примеры веб-страниц включают Citation Generator – Mick Schroeder , Pubmed Citation Generator – Ultrasound of the Week , PMID2cite и Cite this for me .

Интеллектуальный анализ данных PubMed [ править ]

Альтернативные методы анализа данных в PubMed используют такие среды программирования, Matlab , Python или R. как В этих случаях запросы PubMed записываются в виде строк кода и передаются в PubMed, а затем ответ обрабатывается непосредственно в среде программирования. Код можно автоматизировать для систематических запросов по различным ключевым словам, таким как болезнь, год, органы и т. д.

Помимо своей традиционной роли биомедицинской базы данных, PubMed стал распространенным ресурсом для обучения биомедицинских языковых моделей . [51] Последние достижения в этой области включают разработку таких моделей, как PubMedGPT, модель параметров 2,7B, обученная на данных PubMed Стэнфордским CRFM, и BiomedCLIP-PubMedBERT от Microsoft, которая использует пары рисунков и подписей из PubMed Central для обработки изображения и языка . Эти модели демонстрируют значительный потенциал данных PubMed в расширении возможностей искусственного интеллекта в медицинских исследованиях и приложениях здравоохранения. Такие достижения подчеркивают растущее пересечение крупномасштабного анализа данных и разработки искусственного интеллекта в биомедицинской области.

Данные, доступные PubMed, можно зеркалировать локально с помощью неофициального инструмента, такого как MEDOC. [52]

Миллионы записей PubMed дополняют различные наборы открытых данных об открытом доступе , такие как Unpaywall . Инструменты анализа данных, такие как Unpaywall Journals, используются библиотеками для помощи при отмене крупных сделок : библиотеки могут избежать подписки на материалы, которые уже предоставляются в мгновенном открытом доступе через открытые архивы , такие как PubMed Central. [53]

См. также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ «ПабМед» . Архивировано из оригинала 13 декабря 2020 года . Проверено 22 февраля 2019 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б Линдберг Д.А. (2000). «Интернет-доступ к Национальной медицинской библиотеке» (PDF) . Эффективная клиническая практика . 3 (5): 256–60. ПМИД   11185333 . Архивировано из оригинала (PDF) 2 ноября 2013 года.
  3. ^ «PubMed отмечает свое 10-летие» . Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США . 5 октября 2006 г. Архивировано из оригинала 23 апреля 2018 г. . Проверено 22 марта 2011 г.
  4. ^ «PubMed: Поиск MEDLINE во Всемирной паутине» . Информационный бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 7 июня 2002 г. Архивировано из оригинала 1 сентября 2018 г. Проверено 22 марта 2011 г.
  5. ^ Робертс Р.Дж. (январь 2001 г.). «PubMed Central: Генбанк опубликованной литературы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (2): 381–2. Бибкод : 2001ПНАС...98..381Р . дои : 10.1073/pnas.98.2.381 . ПМК   33354 . ПМИД   11209037 .
  6. ^ Макинтайр Дж.Р., Ананиаду С., Эндрюс С., Блэк В.Дж., Боулдерстоун Р., Баттери П. и др. (январь 2011 г.). «UKPMC: полнотекстовый ресурс статей по наукам о жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (Проблема с базой данных): D58-65. дои : 10.1093/нар/gkq1063 . ПМК   3013671 . ПМИД   21062818 .
  7. ^ «Каталог NLM: журналы, указанные в базах данных NCBI» . НКБИ. 2011. Архивировано из оригинала 13 октября 2023 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  8. ^ «ПабМед» . ПабМед . Архивировано из оригинала 6 января 2022 года . Проверено 5 января 2023 г. Поисковый запрос «1800:2100[dp]» возвращает все результаты, дата публикации которых находится между 1800 и 2100 включительно.
  9. ^ «Происходит улучшение производства MEDLINE/PubMed» . Технический бюллетень NLM (411): e1. Июль – август 2016 г. Архивировано из оригинала 29 марта 2023 г. Проверено 29 июля 2016 г.
  10. ^ Манка А., Мохер Д., Кугуси Л., Двир З., Дериу Ф. (сентябрь 2018 г.). «Как хищнические журналы просачиваются в PubMed» . CMAJ . 190 (35): Е1042–Е1045. дои : 10.1503/cmaj.180154 . ПМК   6148641 . ПМИД   30181150 .
  11. ^ Топпер Л., Марилл Дж., Келли С., Фанк К. (11 марта 2019 г.). «Строгая политика обеспечивает целостность баз данных литературы NLM» . CMAJ . 191 (10): Е289. дои : 10.1503/cmaj.71602 . ISSN   1488-2329 . ПМК   6411471 . ПМИД   30858186 .
  12. ^ Кларк Дж., Венц Р. (сентябрь 2000 г.). «Прагматический подход эффективен в доказательном здравоохранении» . БМЖ . 321 (7260): 566–7. дои : 10.1136/bmj.321.7260.566/a . ПМК   1118450 . ПМИД   10968827 .
  13. ^ Фатехи Ф., Грей Л.К., Вуттон Р. (январь 2014 г.). «Как улучшить поиск в PubMed/MEDLINE: 2. настройки отображения, сложные поисковые запросы и поиск по темам». Журнал телемедицины и телемедицины . 20 (1): 44–55. дои : 10.1177/1357633X13517067 . ПМИД   24352897 . S2CID   43725062 .
  14. ^ Трэвик Б. (21 января 2020 г.). «Новый и улучшенный PubMed®» . Размышления НЛМ из мезонина . Архивировано из оригинала 7 октября 2023 года . Проверено 23 мая 2020 г.
  15. ^ Цена М (22 мая 2020 г.). «Они изменили дизайн PubMed, всеми любимого веб-сайта. Работа прошла не очень хорошо» . Наука . Архивировано из оригинала 21 мая 2022 года . Проверено 30 июня 2022 г.
  16. ^ «PubMed через портативные компьютеры (PICO)» . Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2004. Архивировано из оригинала 30 мая 2023 года . Проверено 7 апреля 2016 г.
  17. ^ «Бета-версия PubMed Mobile» . Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2011. Архивировано из оригинала 11 апреля 2023 года . Проверено 7 апреля 2016 г.
  18. ^ «Простой предметный поиск с помощью викторины» . НКБИ. 2010. Архивировано из оригинала 11 мая 2020 года . Проверено 7 апреля 2016 г.
  19. ^ Джадад А.Р., Маккуэй HJ (июль 1993 г.). «Поиск литературы. Будьте систематичны в своих поисках» . БМЖ . 307 (6895): 66. doi : 10.1136/bmj.307.6895.66-a . ПМЦ   1678459 . ПМИД   8343701 .
  20. ^ Эллисон Дж.Дж., Кифе К.И., Вайсман Н.В., Картер Дж., Центор Р.М. (весна 1999 г.). «Искусство и наука поиска в MEDLINE для ответа на клинические вопросы. Поиск нужного количества статей» . Международный журнал оценки технологий в здравоохранении . 15 (2): 281–96. дои : 10.1017/S0266462399015214 . ПМИД   10507188 . S2CID   11023273 . Архивировано из оригинала 19 февраля 2022 года . Проверено 13 декабря 2019 г.
  21. ^ Перейти обратно: а б Кампос-Асенсио К (2018). «Как разработать стратегию библиографического поиска». Интенсивный уход (на испанском языке). 29 (4): 182–186. дои : 10.1016/j.enfi.2018.09.001 . ПМИД   30291015 . S2CID   188132546 .
  22. ^ Объяснение терминов фильтра клинических запросов . НКБИ. 2010. Архивировано из оригинала 29 ноября 2022 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  23. ^ Хузер В., Чимино Дж. Дж. (июнь 2013 г.). «Оценка соблюдения политики Международного комитета редакторов медицинских журналов по обязательной и своевременной регистрации клинических исследований» . Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 20 (д1): е169-74. дои : 10.1136/amiajnl-2012-001501 . ПМЦ   3715364 . ПМИД   23396544 .
  24. ^ «Объяснение расчета связанных статей» . НКБИ. Архивировано из оригинала 18 декабря 2008 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  25. ^ Чанг А.А., Хескетт К.М., Дэвидсон Т.М. (февраль 2006 г.). «Поиск литературы по медицинским предметным заголовкам вместо текстового слова с помощью PubMed» (PDF) . Ларингоскоп . 116 (2): 336–40. дои : 10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2 . ПМИД   16467730 . S2CID   42510351 . Проверено 11 сентября 2018 г.
  26. ^ Перейти обратно: а б Фатехи Ф., Грей Л.К., Вуттон Р. (март 2014 г.). «Как улучшить поиск в PubMed/MEDLINE: 3. расширенный поиск, MeSH и My NCBI». Журнал телемедицины и телемедицины . 20 (2): 102–12. дои : 10.1177/1357633X13519036 . ПМИД   24614997 . S2CID   9948223 .
  27. ^ «Моя помощь NCBI». Мой NCBI объяснил . НКБИ. 13 декабря 2010 г. Архивировано из оригинала 26 июля 2023 г. Проверено 8 сентября 2017 г.
  28. ^ «ПабМед Кабби» . Технический бюллетень . Национальная медицинская библиотека США. 2000. Архивировано из оригинала 20 февраля 2023 года . Проверено 7 апреля 2016 г.
  29. ^ «Обзор LinkOut» . НКБИ. 2010. Архивировано из оригинала 10 сентября 2023 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  30. ^ «Участники LinkOut 2011» . НКБИ. 2011. Архивировано из оригинала 14 октября 2017 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  31. ^ «Обновленный PubMed уже в пути» . Архивировано из оригинала 16 мая 2023 года . Проверено 1 апреля 2019 г.
  32. ^ Команда PubMed Commons (17 декабря 2015 г.). «Комментарий к PubMed: успешный пилотный проект» . Архивировано из оригинала 25 октября 2017 года . Проверено 29 июля 2016 г.
  33. ^ «PubMed Commons будет прекращена» . Аналитика NCBI . 1 февраля 2018 года. Архивировано из оригинала 28 августа 2023 года . Проверено 2 февраля 2018 г.
  34. ^ «PubMed закрывает функцию комментариев PubMed Commons» . Часы втягивания . 2 февраля 2018 года. Архивировано из оригинала 28 июня 2022 года . Проверено 2 февраля 2018 г.
  35. ^ «Спросите Медлайн» . НКБИ. 2005. Архивировано из оригинала 17 июля 2013 года . Проверено 3 апреля 2011 г.
  36. ^ «Описания полей поиска и теги» . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 11 июля 2013 года . Проверено 15 июля 2013 г.
  37. ^ Кинер М. «PMID против PMCID: в чем разница?» (PDF) . Чикагский университет. Архивировано из оригинала (PDF) 6 июля 2014 года . Проверено 19 января 2014 г.
  38. ^ «Аренда цитирования журналов из PubMed/Medline» . НЛМ. 2011. Архивировано из оригинала 9 июля 2023 года . Проверено 7 апреля 2016 г.
  39. ^ Перейти обратно: а б с Лу З (2011). «PubMed и не только: обзор веб-инструментов для поиска биомедицинской литературы» . База данных . 2011 : baq036. дои : 10.1093/база данных/baq036 . ПМК   3025693 . ПМИД   21245076 .
  40. ^ Фонтейн Дж. Ф., Барбоза-Сильва А., Шефер М., Хуска М. Р., Муро Э. М., Андраде-Наварро М. А. (июль 2009 г.). «MedlineRanker: гибкое ранжирование биомедицинской литературы» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (проблема с веб-сервером): W141-6. дои : 10.1093/нар/gkp353 . ПМК   2703945 . ПМИД   19429696 .
  41. ^ Стейтс-ди-джей, Аде А.С., Райт З.К., Буквич А.В., Ати Б.Д. (апрель 2009 г.). «Адаптивный поисковый инструмент MiSearch pubMed» . Биоинформатика . 25 (7): 974–6. doi : 10.1093/биоинформатика/btn033 . ПМК   2660869 . ПМИД   18326507 .
  42. ^ Смальхейзер Н.Р., Чжоу В., Торвик VI (февраль 2008 г.). «Энн О'Тейт: инструмент для поддержки пользовательского обобщения, детализации и просмотра результатов поиска PubMed» . Журнал биомедицинских открытий и сотрудничества . 3 :2. дои : 10.1186/1747-5333-3-2 . ПМК   2276193 . ПМИД   18279519 .
  43. ^ «КластерМед» . Механизм кластеризации Vivisimo. 2011. Архивировано из оригинала 11 августа 2011 года . Проверено 3 июля 2011 г.
  44. ^ Ребхольц-Шуман Д., Кирш Х., Арреги М., Годан С., Ритховен М., Стер П. (январь 2007 г.). «EBIMed — обработка текста для сбора фактов о белках из Medline» . Биоинформатика . 23 (2): с237-44. doi : 10.1093/биоинформатика/btl302 . ПМИД   17237098 .
  45. ^ Ким Дж. Дж., Пезик П., Ребхольц-Шуман Д. (июнь 2008 г.). «MedEvi: получение текстовых свидетельств отношений между биомедицинскими концепциями из Medline» . Биоинформатика . 24 (11): 1410–2. doi : 10.1093/биоинформатика/btn117 . ПМК   2387223 . ПМИД   18400773 .
  46. ^ Фонтело П., Лю Ф., Акерман М., Шардт С.М., Кейтц С.А. (2006). «askMEDLINE: отчет о годовом опыте» . AMIA ... Материалы ежегодного симпозиума. Симпозиум АМИА . 2006 : 923. ПМК   1839379 . ПМИД   17238542 .
  47. ^ Фонтело П., Лю Ф., Акерман М. (2005). «MeSH Speller + AskMEDLINE: автоматически заполняет термины MeSH, а затем выполняет поиск в MEDLINE/PubMed с помощью произвольных текстовых запросов на естественном языке» . AMIA ... Материалы ежегодного симпозиума. Симпозиум АМИА . 2005 : 957. ПМК   1513542 . ПМИД   16779244 .
  48. ^ Фонтело П., Лю Ф., Леон С., Энн А., Акерман М. (2007). «PICO Linguist и BabelMeSH: разработка и частичная оценка научно обоснованных инструментов многоязычного поиска для MEDLINE/PubMed» . Исследования в области медицинских технологий и информатики . 129 (Часть 1): 817–21. ПМИД   17911830 . Архивировано из оригинала 18 октября 2023 года . Проверено 31 мая 2014 г.
  49. ^ Хокамп К., Вульф К.Х. (июль 2004 г.). «PubCrawler: комфортно идти в ногу с PubMed и GenBank» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (проблема с веб-сервером): W16-9. дои : 10.1093/nar/gkh453 . ПМК   441591 . ПМИД   15215341 .
  50. ^ Эрик Сэйерс, доктор философии (24 октября 2018 г.). Подробно об электронных утилитах: параметры, синтаксис и многое другое . НКБИ. Архивировано из оригинала 23 июня 2023 года . Проверено 8 сентября 2017 г.
  51. ^ Сингхал К., Азизи С., Ту Т., Махдави С.С., Вэй Дж., Чунг Х.В. и др. (3 августа 2023 г.). «Большие языковые модели кодируют клинические знания» . Природа . 620 (7972): 172–180. arXiv : 2212.13138 . Бибкод : 2023Natur.620..172S . дои : 10.1038/s41586-023-06291-2 . ПМЦ   10396962 . ПМИД   37438534 .
  52. ^ MEDOC на GitHub
  53. ^ Дениз Вулф (7 апреля 2020 г.). «SUNY ведет переговоры о новом, измененном соглашении с Elsevier – Центр новостей библиотек Университета в библиотеках Буффало» . библиотека.buffalo.edu . Университет в Буффало . Архивировано из оригинала 6 декабря 2020 года . Проверено 18 апреля 2020 г.

Внешние ссылки [ править ]