Список медицинского программного обеспечения с открытым исходным кодом
Ниже приводится список известных пакетов программного обеспечения и приложений, лицензированных по лицензии с открытым исходным кодом или находящихся в свободном доступе для использования в сфере здравоохранения .
Общественное здравоохранение и бионадзор [ править ]
- Epi Info — это общедоступное статистическое программное обеспечение для эпидемиологии, разработанное Центрами по контролю и профилактике заболеваний . [1]
- Spatiotemporal Epidemiological Modeler — это инструмент, первоначально разработанный в IBM Research , для моделирования и визуализации распространения инфекционных заболеваний. Он поддерживается Eclipse Foundation и доступен на условиях общественной лицензии Eclipse . [2] [3]
Электронные записи и управление медицинской практикой [ править ]
Управление системой здравоохранения [ править ]
- iHRIS — это интегрированная информационная система по кадрам, разработанная IntraHealth International в рамках USAID, , финансируемого проекта «CapacityPlus» и развернутая в более чем 20 странах мира. [27] iHRIS распространяется под лицензией GNU GPL . [28]
- DHIS — это районная информационная система управления здравоохранением и хранилище данных. DHIS2 выпускается под лицензией BSD . [29]
- HRHIS — это информационная система управления человеческими ресурсами здравоохранения, разработанная Колледжем информационных и коммуникационных технологий Университета Дар-эс-Салама , факультетом компьютерных наук и инженерии, для Министерства здравоохранения и социального обеспечения (Танзания) и финансируемая Японское агентство международного сотрудничества ( JICA ). [ нужна ссылка ]
болезнями Управление
- Дыхательные игры — это серия совместно созданных игр, поддерживаемых исследованиями, для профилактики, диагностики и лечения хронических респираторных заболеваний. Они выпускаются по лицензии Peer Production. [30]
- Nightscout — это набор программных инструментов, включая мобильные клиенты, которые позволяют осуществлять своими руками в облаке непрерывный мониторинг уровня глюкозы «…в информационных и образовательных целях». [31] Отдельные компоненты доступны по различным лицензиям с открытым исходным кодом, включая GNU GPL . [32] ГНУ АГПЛ , [33] МОЯ лицензия , [34] и лицензии BSD . [35]
- Tidepool создает инструменты с открытым исходным кодом, которые помогают людям лучше справляться с диабетом. Они получили разрешение FDA на свое приложение для дозирования инсулина Loop. [36] [37]
Визуализация/визуализация [ править ]
- CamBA — это набор конвейеров нейровизуализации , распространяемый под лицензией GNU GPL . [38]
- Drishti — пакет объемной визуализации для просмотра данных компьютерной томографии. Возможность импорта стеков изображений DICOM. Он доступен по лицензии MIT . [39]
- Endrov Просмотр и редактор изображений и данных. Он доступен по лицензии BSD . [40]
- GIMIAS — это среда, ориентированная на рабочий процесс, ориентированная на вычисления и моделирование биомедицинских изображений. Он доступен по лицензии BSD. [41]
- Ginkgo CADx Кроссплатформенная программа просмотра и дикомайзера DICOM с открытым исходным кодом. Он доступен под лицензией GNU LGPL . [42]
- Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) v4.0+ выпускается под лицензией Apache . [43]
- Программное обеспечение для реконструкции медицинских изображений InVesalius 3D. Он доступен под лицензией GNU GPL . [44]
- ITK-SNAP Интерактивное программное обеспечение для навигации по 3D-изображениям, аннотирования и автоматической сегментации. Он доступен под лицензией GNU GPL . [45] [46]
- Orthanc – легкий RESTful DICOM-сервер для медицинских изображений. Он доступен под лицензией GNU GPLv3 . [47]
- ParaView Инструмент масштабной визуализации . Он доступен по лицензии BSD . [48]
- 3DSlicer Платформа для визуализации медицинских изображений и разработки алгоритмов. Поддержка DICOM, сегментация и регистрация, обработка диффузионной МРТ и поддержка хирургии под визуальным контролем. Он доступен по лицензии BSD. [49]
- Механизм объемного рендеринга Voreen — библиотека для визуального изучения наборов объемных данных. Поддерживается DICOM, а Voreen используется в медицинской визуализации, а также для визуализации электронной микроскопии данных . Он доступен под лицензией GNU GPL . [50]
- VTK — набор инструментов для визуализации, доступный по лицензии BSD . [51]
- Studierfenster (StudierFenster) — это бесплатная некоммерческая онлайн-платформа клиент/серверной обработки медицинских изображений (MIP) Open Science. [52]
- Медицинская открытая сеть для искусственного интеллекта — это платформа для глубокого обучения в области визуализации в здравоохранении, которая доступна с открытым исходным кодом по лицензии Apache и поддерживается сообществом. [53]
Медицинские информационные системы [ править ]
- Caisis — это интернет-информационная система для хранения и анализа данных о больных раком, предназначенная для преодоления разрыва между клиникой и исследованиями. Он доступен под лицензией GNU GPL . [54]
- cTAKES ( «Программное обеспечение для извлечения знаний для клинического анализа текста» ) — это система обработки естественного языка для извлечения информации из электронных медицинских записей с клиническим свободным текстом, проект верхнего уровня Apache (TLP) с 2013 года, разработанный клиникой Мэйо и другими. Он доступен по лицензии Apache . [55]
Исследования [ править ]
- Galaxy — это веб-платформа для биологии с интенсивным использованием данных с использованием географически распределенных суперкомпьютеров. [56]
- LabKey Server — это расширяемая платформа для интеграции, анализа и обмена всеми типами данных биомедицинских исследований. Он обеспечивает безопасный веб-доступ к исследовательским данным и включает в себя настраиваемый конвейер обработки данных . Распространяется по лицензии Apache . [57]
Мобильные устройства [58] [ редактировать ]
- OpenAPS — это набор инструментов разработки и документации для поддержки самостоятельной реализации искусственной поджелудочной железы для людей с диабетом 1 типа . Общие настройки включают взаимодействие CGM , инсулиновых помп и устройств Raspberry Pi . Он выпускается под лицензией MIT , но совместимые медицинские устройства являются собственностью компании. [59]
- Ушахиди позволяет людям отправлять информацию о кризисе посредством текстовых сообщений с использованием мобильного телефона , электронной почты или веб-формы. Отображает информацию в виде карты. Он выпускается под лицензией GNU Affero General Public License , но некоторые библиотеки используют другие лицензии. [60]
Готовые дистрибутивы [ править ]
- БиоЛинукс
- Debian-Med — это чистая смесь Debian для использования в медицинских и биомедицинских целях. [61]
- Убунту Мед
Совместимость [62] [ редактировать ]
- Mirth — это кроссплатформенный механизм интерфейса HL7 с открытым исходным кодом , который обеспечивает двунаправленную отправку сообщений HL7 между системами и приложениями по нескольким транспортным каналам. Он доступен под лицензией Mozilla Public License . [63]
Технические характеристики [ править ]
- Документ о непрерывности ухода
- Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) — это спецификация совместимости Health Level 7 , которая определяет JSON и XML форматы данных , а также RESTful API . [64] [65] Он доступен по лицензии CC0 . [66]
- openEHR — это открытая стандартная спецификация в области медицинской информатики, которая описывает управление, хранение, поиск и обмен медицинскими данными в электронных медицинских записях (EHR) в соответствии с парадигмой двухуровневого моделирования. Базовая спецификация OpenEHR доступна по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported. [67]
См. также [ править ]
- Электронная медицинская карта
- электронное здравоохранение
- Язык выражений Gello
- Информатика здравоохранения
- Больничные информационные системы
- Список бесплатного программного обеспечения для здоровья
- Список программного обеспечения для биомедицинской кибернетики
- Список программного обеспечения для биоинформатики с открытым исходным кодом
- Список медицинского оборудования с открытым исходным кодом
- мобильное здравоохранение
Ссылки [ править ]
- ^ «Эпи Инфо» . CDC . 13 сентября 2016 г.
- ^ «Скачать STEM» . Затмение . 22 июня 2017 г.
- ^ «Пользовательское соглашение на программное обеспечение Eclipse Foundation» . Затмение . 9 апреля 2014 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «чистое здоровье/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 30 января 2013 г.
- ^ «чистое здоровье/чистое здоровье» . Гитхаб . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «ERPNext Healthcare/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 29 января 2016 г.
- ^ "gaiaehr/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 29 января 2016 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д «Часто задаваемые вопросы по Gnumed» . Гнумед . 10 октября 2011 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д «Здоровье GNU — Резюме» . Саванна . Проверено 29 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д «Больничная ОС» . СоурсФордж . 10 апреля 2013 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж «ХОСксП» . СоурсФордж . 17 апреля 2013 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «А propos» [О проекте]. Мединтукс (на французском языке) . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Дэв» . Мединтукс (на французском языке). 29 июня 2012 г.
- ^ «Установка» . Мединтукс (на французском языке) . Проверено 10 июля 2017 г.
- ^ «МедВебТукс» . Мединтукс (на французском языке). 13 июля 2013 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и «Функции OpenEMR» . OpenEMR . 6 мая 2017 г.
- ^ «Политика развития» . Вики проекта OpenEMR . 17 апреля 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Лицензия открытого исходного кода» . Открытая стоматология . Проверено 29 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д «Открытая больница» . СоурсФордж . 4 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Информация о лицензии OpenMRS» . ОпенМРС . Проверено 29 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с "Добро пожаловать" . Руководство пользователя ОСКАР . Проверено 29 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Добро пожаловать в Спинакер» . Спинакер . ООО Дентал АйТи . Проверено 30 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Спинакер» . ООО Дентал АйТи . Проверено 30 июня 2017 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и «Система электронных медицинских карт THIRRA» . СоурсФордж . 31 января 2017 г.
- ^ «Дистрибутивы Виста» . МирВистА . Проверено 1 ноября 2021 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Лицензирование» . ИКТэдж . Архивировано из оригинала 10 сентября 2014 года.
- ^ «Об iHRIS» . iHRIS . Проверено 3 июля 2017 г.
- ^ «Часто задаваемые вопросы» . iHRIS . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Обзор DHIS 2» . ДХИС2 . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Принимайте участие» . Дыхательные игры . 17 декабря 2016 г.
- ^ «Проект Ночной разведчик» . Проверено 3 июля 2017 г.
- ^ "android-загрузчик/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 27 сентября 2014 г.
«лассо/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 2 июля 2015 г.
"chrome-uploader/LICENSE.md" . Гитхаб . 24 ноября 2014 г.
«приложение-windows-phone/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 29 ноября 2014 г. - ^ «cgm-remote-monitor/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 25 сентября 2014 г.
«управление процессом/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 11 января 2015 г. - ^ "nightscout-apple-watch/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 23 июня 2015 г.
- ^ «предварительная подача FDA/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 24 июня 2014 г.
"cgm-pebble/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 22 февраля 2014 г. - ^ «tidepool-org/Loop: шаблон приложения для автоматической доставки инсулина для iOS, созданный на основе LoopKit» . Гитхаб . 8 декабря 2023 г.
- ^ «Tidepool Loop получил разрешение FDA!» . Тайдпул . 4 января 2023 г.
- ^ «CamBA: Информация об инструменте/ресурсе» . НИТРК . Информационный центр по инструментам и ресурсам нейровизуализации . Проверено 3 июля 2017 г.
- ^ "дришти/license.md" . Гитхаб . 1 февраля 2016 г.
- ^ «Ендров» . СоурсФордж . 3 января 2016 г.
- ^ «Лицензия» . ГИМИАС . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Гинкго CADx» . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Авторское право и лицензия» . ИТК . Посуда.
- ^ "invesalius3/LICENSE.txt" . Гитхаб . 10 июня 2009 г.
- ^ «ИТК-СНАП» . НИТРК . Информационный центр по инструментам и ресурсам нейровизуализации . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Лицензия» . МИТК . 1 декабря 2014 г.
- ^ "Скачать" . Ортханк . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Лицензия ПараВью» . ПараВью . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Лицензия» . СлайсерВики . 24 ноября 2016 г.
- ^ «О Ворине» . Ворин . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Лицензия» . ВТК . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Лицензия» . Студиер Фенстер . Проверено 5 октября 2020 г.
- ^ Кардосо, М. Хорхе; Ли, Вэньци; Браун, Ричард (04 октября 2022 г.). «MONAI: платформа с открытым исходным кодом для глубокого обучения в здравоохранении». стр. 1–25. arXiv : 2211.02701 [ cs.LG ].
- ^ «Часто задаваемые вопросы» . Цайсис . БиоЦифровой . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «История» . cTAKES . Фонд программного обеспечения Apache . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «Авторские права и лицензии» . Галактика вики . 14 мая 2015 г.
- ^ «FAQ – Часто задаваемые вопросы» . Поддержка LabKey . Проверено 30 июня 2017 г.
- ^ «глюкозио-андроид/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 19 августа 2015 г.
«глюкозио-ios/ЛИЦЕНЗИЯ» . Гитхаб . 19 августа 2015 г. - ^ "ЛИЦЕНЗИЯ.txt" . Гитхаб . 26 августа 2017 г.
- ^ "платформа/ЛИЦЕНЗИЯ.md" . Гитхаб . 18 ноября 2014 г.
- ^ «Дебиан Мед» . Дебиан . Программное обеспечение в интересах общества, Inc., 5 июля 2016 г.
- ^ «LAIKA: Система тестирования EHR» . СоурсФордж . 19 апреля 2013 г.
- ^ Брауэр, Джейкоб (14 августа 2013 г.). «Руководство по добавлению исходного кода» . Мирт Коннект .
- ^ «Фонд ФХИР» . Проверено 3 июля 2017 г.
- ^ «Фундаментальный модуль» . ФХИР . HL7. 19 апреля 2017 г.
- ^ «Лицензия и юридические условия» . ФХИР . HL7. 19 апреля 2017 г.
- ^ "спецификации-БАЗА/ЛИЦЕНЗИЯ" . Гитхаб . 29 июля 2015 г.
Дальнейшее чтение [ править ]
- «Медицинское бесплатное/свободное программное обеспечение с открытым исходным кодом» . IMIA Рабочая группа по открытому исходному коду . Проверено 3 июля 2017 г.
- Миллард, Питер С.; Брю, Хуан; Бергер, Кристофер А. (4 июля 2012 г.). «Электронные медицинские записи с открытым исходным кодом в местах оказания медицинской помощи для использования в условиях ограниченных ресурсов: систематический обзор и анкетирование» . БМЖ Опен . 2 (4): e000690. doi : 10.1136/bmjopen-2011-000690 . ПМЦ 3391372 . ПМИД 22763661 .