Суперкомпьютерный комплекс для биоинформатики и вычислительной биологии
Суперкомпьютерный центр биоинформатики и вычислительной биологии, Индийский технологический институт, Нью-Дели | |
 | |
| Тип | Общественные исследования |
|---|---|
| Учредил | 31 июля 2002 г. |
| Координатор | Проф. Б. Джаярам |
| Расположение | , 28 ° 54'35 "с.ш. 77 ° 19'11" в.д. / 28,90972 ° с.ш. 77,31972 ° в.д. |
| Кампус | Городской |
| Принадлежности | Индийский технологический институт Дели |
| Веб-сайт | СКФБио |
Суперкомпьютерный центр биоинформатики и вычислительной биологии , также известный как SCFBio IIT Delhi , является центром биоинформатики и вычислительной биологии в Индийском технологическом институте в Дели . Этот объект был создан в 2002 году под эгидой химического факультета ИИТ Дели. Он признан центром передового опыта в области биоинформатики Департаментом биотехнологии ( DBT ) правительства Индии.
История
[ редактировать ]Суперкомпьютерный центр биоинформатики и вычислительной биологии (SCFBio) ИИТ Дели был создан в июле 2002 года при финансовой поддержке Департамента биотехнологии под руководством профессора Б. Джаярама. Целью проекта является разработка новых научных методов и нового программного обеспечения для анализа генома, прогнозирования структуры белков и разработки лекарств in silico. Объект был открыт достопочтенным министром науки, технологий и развития человеческих ресурсов Шри Мурли Манохаром Джоши . IITD принял SCFBio в качестве центрального объекта национального значения в марте 2003 года.
SCFBio был модернизирован до объекта multi-tera FLOP при поддержке программы со стороны DBT и открыт в сентябре 2009 года почетным секретарем DBT, доктором М.К. Бханом . Суммарная вычислительная мощность объекта составляет более 50 терафлопс с хранилищем данных более 150 терабайт и современным дата-центром. Объект подключен по выделенной линии 100 Мбит/с.
Зрение
[ редактировать ]«Геном в лекарство» (Дханвантари) предусматривает доставку молекул лекарств обществу на основе геномной/протеомной информации. Он состоит в основном из трех этапов:
- Интерпретация языка геномной ДНК и идентификация гена, кодирующего лекарственный белок (Хемгеном), при заболеваниях/расстройствах,
- Определение трехмерной структуры белка-мишени (Bhageerath-H) и
- Создание небольших молекул (лекарств), которые могут связываться с высоким сродством и специфичностью к мишени белка/ДНК, но с наименьшей токсичностью для человека (Сандживини).
Разрабатывать новые научные методы и высокоэффективные алгоритмы, сочетая принципы химии и биологии с информационными технологиями для анализа генома, прогнозирования структуры белка и целенаправленного дизайна лекарств, преследуя мечту о доставке обществу ГЕНОМа и ЛЕКАРСТВА.
Собственное программное обеспечение
[ редактировать ]| S.No. | Имя | Связь |
|---|---|---|
| 1. | Хемгеном3.0 | связь |
| 2. | BHAGEERATH: сервер прогнозирования структуры белка на основе энергии | связь |
| 3. | Sanjeevini: полный пакет программного обеспечения для разработки лекарств | связь |
| 4. | Бхагират-H+ | связь |
| 5. | БАППЛ+ | связь |
| Полный список можно посмотреть здесь. |
Публикации
[ редактировать ]Обучение человеческих ресурсов
[ редактировать ]23 доктора философии. студенты защитили докторскую диссертацию. В настоящее время 2 студента получают докторскую степень. в области геномики, протеомики и дизайна лекарств. Более 1056 участников прошли обучение различным аспектам биоинформатики в рамках краткосрочных программ обучения. SCFBio организовал несколько семинаров и международных конференций, включая InCoB 2006.
Из СКФБио на данный момент развились две стартап-компании (Лидинвент и Новоинформатика). Он также имел плодотворное сотрудничество с Dabur, HCl Life Sciences и NIIT. Он образует вычислительную основу Школы биологических наук ИИТ Дели, обеспечивая тесное сотрудничество между вычислительной и экспериментальной биологией.