UB-AMC

Убиквитин-AMC является флуорогенным субстратом для широкого спектра деубиквитинирующих ферментов (DUBS), включая C-концевые гидролазы убиквитина (UCHS) и убиквитин-специфические протеазы (USPS). Это особенно полезный реагент для изучения деубиквитинирующей активности, где необходима чувствительность обнаружения или непрерывный мониторинг активности. [ 1 ]
Фон
[ редактировать ]Убиквитин-АМК готовится С-концевой дериватизацией убиквитина с 7-амино-4-метилкумарином и, как было показано, является полезным и чувствительным флуорогенным субстратом для широкого диапазона деубиквитинилирующих ферментов (DUBS), включая убиквитин -С-гидролазы (гидролазы C-концертов (DUBS), включая убиквитин-концертные гидролазы (DUBS), включая убиквитин-концертные гидролазы (DUBS), включая убиквитин-концертные гидролазы (DUBS), включая убиквитин-концертные гидролазы (DUBS), включая убиквитин-концертные UCHS) и убиквитин -специфические протеазы (USPS).
Было показано, что убиквитин-AMC является чувствительным субстратом для UCH-L3 (км = 0,039 мкм) и для изопептидазы-T (км = 0,17-1,4 мкм), [ 2 ] и особенно полезен для изучения деубиквитинилирующей активности, где необходима чувствительность обнаружения или непрерывный мониторинг активности. [ 3 ]
Типичная настройка анализа: концентрация подложки анализа: 0,01-1,0 мкм. Концентрации фермента, UCH-L3: 10-100 вечера, изопептидаза-T: 10-100 нм. Высвобождение флуоресценции AMC с помощью Dub Enzymes можно контролировать с помощью 380 нм возбуждения и 460 нм длина волн излучения.
Использование
[ редактировать ]- Субстрат для анализов активности деубиквитинилирующего фермента.
- Идентификация/подтверждение ферментной деубиквитинилирующей активности.
- Исследование деконъюгирующей специфичности субстрата фермента по сравнению с альтернативными субстратами UBL-AMC (например, NEDD8-AMC)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Biomol Online Catalog
- ^ Dang, LC, Melandri, FD и Stein, RL Кинетические и механистические исследования гидролиза убиквитина C-концевого 7-амидо-4-метилкумарина с помощью деубиквитинирующих ферментов. Биохимия, 37, 1868-1879 (1998)
- ^ Mason, DE, EK, J., Peters, EC и Harris JL Профилирование субстрата деубиквитиновых гидролаз с позиционной библиотекой сканирования и масс -спектрометрией. Биохимия, 43, 6535-44 (2004)