Барт Суперсемейство

Суперсемейство переносчика (BART) желчи /арсенита/рибофлавина является суперсемейством вездесущих транспортных белков . По состоянию на начало 2016 года суперсемейство содержит семь известных семей. ^{[ 1 ]} Функциональные данные для членов всех этих семей доступны. ^{[ 1 ]} Семь семей находятся в базе данных классификации Transporter со следующими номерами TC, именами и аббревиатурами включают: ^{[ 2 ]}

TC# 2.A.10 -семейство транспортера 2-кето-3-дезоксиглуконата (KDGT)
TC# 2.A.28 - Семейство желчной кислоты: Na+ Symporter (Bass)
TC# 2.A.59 - Семейство ACRSENCALE -3 (ACR3)
TC# 2.A.69 - Семья Auxin Efclux Carrier (AEC)
TC# 2.A.87 - Семейство прокариотического рибофлавина транспортера (P -RFT)
TC# 9.B.33 - Семейство датчика гистидинкиназы (SHK)
TC# 9.B.34 -Киназа/фосфатаза/циклическая синтаза/циклическая гидролаза (KPSH) (KPSH)

Первые идентифицированные субстраты для переносчиков в первых 5 семьях обозначены именами семей, но все эти семьи транспортируют множество других субстратов. Большинство членов белка первых четырех из этих семейств демонстрируют вероятную топологию трансмембранного гаечного газа (TMS), которая возникла из тандемно дублированного 5 -TMS -блока. Считается, что N- и C-концевые находятся в цитоплазме бактериальных клеток, и то же самое может быть верно и для большинства других членов. Члены семейства RFT имеют топологию 5 TMS и гомологичны каждому из двух повторных единиц в 10 белках TMS. The other two families [sensor histidine kinase (SHK) and kinase/phosphatase/synthetase/hydrolase (KPSH)] have a single 5 TMS unit preceded by an N-terminal TMS and followed by a hydrophilic sensor histidine kinase domain (the SHK family) или каталитические домены, напоминающие сенсорную киназу, фосфатазу, циклический дигуанилат (GMP) Синтетаза и циклические каталитические домены гидролазы DI-GMP, а также различные некаталитические домены (семейство KPSH). Поскольку функциональные данные не доступны для трансмембранных доменов членов семейств SHK и KPSH, не известно, сохраняют ли эти транспортные домены транспортную активность или разработали исключительные функции при молекулярном приеме и передаче сигналов. Они могли бы служить просто для привязки каталитических доменов на мембрану. Пожалуйста, обратитесь к TCDB для получения более подробной информации. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Mansour, NM, Sawhney, M., Tamang, DG, Vogl, C., Saier, MH Jr. 2007. Транспортер Bile-Arsenite-Riboflavin (BART) Суперсемейство FEBS Journal 274 (3): 612-29.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Барт суперсемейство» . База данных классификации Transporter . Получено 2016-03-13 .
^ Chen, JS, V. Reddy, JH Chen, Ma Shlykov, WH Zheng, J. Cho, Mr Yen и MH Saier, Jr. (2011). Филогенетическая характеристика транспортных белковых суперсемейств: превосходство программ суперфамилитри по сравнению с множественными выравниваниями. J. Mol. Микробиол. Биотехнол. 21: 83-96.

[:0-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Mansour, NM, Sawhney, M., Tamang, DG, Vogl, C., Saier, MH Jr. 2007. Транспортер Bile-Arsenite-Riboflavin (BART) Суперсемейство FEBS Journal 274 (3): 612-29.

[:1-2] Jump up to: ^а ^{беременный} «Барт суперсемейство» . База данных классификации Transporter . Получено 2016-03-13 .

[3] Chen, JS, V. Reddy, JH Chen, Ma Shlykov, WH Zheng, J. Cho, Mr Yen и MH Saier, Jr. (2011). Филогенетическая характеристика транспортных белковых суперсемейств: превосходство программ суперфамилитри по сравнению с множественными выравниваниями. J. Mol. Микробиол. Биотехнол. 21: 83-96.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]