База данных классификации транспортеров

База данных классификации транспортеров (или TCDB ) — это одобренная Международным союзом биохимии и молекулярной биологии (IUBMB) система классификации мембранных транспортных белков , включая ионные каналы .

Классификация

Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:

1. Каналы и поры

1.Каналы α-типа

• 1.A.1 Надсемейство потенциал-управляемых ионных каналов
• 1.A.2 Внутренний выпрямитель K ⁺ семейство каналов
• 1.A.3 Рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор Ca ²⁺ семейство каналов
• 1.A.4 Переходный рецепторный потенциал Ca ²⁺ семейство каналов
• 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина
• 1.A.6 Эпителиальный нет ⁺ семейство каналов
• 1.A.7 Семейство катионных каналов АТФ-управляемого рецептора P2X
• 1.A.8 Суперсемейство основных внутренних белков
• 1.A.9 Рецептор нейромедиатора, Cys-петля, семейство лиганд-управляемых ионных каналов
• 1.A.10 управляемых глутаматом ионных каналов Семейство рецепторов нейромедиаторов,
• 1.A.11 Семейство транспортеров аммиачных каналов
• 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов
• 1.A.14 Семейство переноса генов, усиленных семенниками
• 1.A.15 Семейство неселективных катионных каналов-2
• 1.A.16 Семейство транспортеров формиата-нитрита
• 1.A.17 Семейство кальций-зависимых хлоридных каналов
• 1.A.18 Семейство Tic110, образующее анионные каналы оболочки хлоропластов
• 1.A.19 Семейство каналов матрицы-2 вируса гриппа типа А
• 1.A.20 Семейство белков 3, взаимодействующих с BCL2/аденовирусом E1B
• 1.A.21 Семейство Bcl-2
• 1.A.22 Механочувствительный ионный канал с большой проводимостью
• 1.A.23 Механочувствительный ионный канал малой проводимости
• 1.A.24 Семейство коннексинов, образующих щелевые соединения
• 1.A.25 Семейство иннексинов, образующих щелевые соединения
• 1.А.26 Мг ²⁺ семейство транспортеров-Е
• 1.A.27 Семья Фосфолемманов
• 1.A.28 Семейство транспортеров мочевины
• 1.A.29 Семейство мочевино-амидных каналов
• 1.А.30 Ч ⁺ - или На ⁺ -транслоцирующий бактериальный жгутиковый двигатель MotAB/суперсемейство активаторов транспорта внешней мембраны ExbBD
• 1.A.31 Семейство аннексинов
• 1.A.32 Семейство каналов NB вируса гриппа типа B
• 1.A.33 Семейство белков теплового шока 70, образующих катионные каналы
• 1.A.34 Bacillus Семейство комплексов, образующих каналы, подобные щелевым соединениям
• 1.A.35 Семейство переносчиков металлических ионов CorA
• 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.37 CD20 Са ²⁺ семейство каналов
• 1.A.38 Семейство регуляторов pH по методу Гольджи
• 1.A.39 Семейство каналов CM2 вируса гриппа типа C
• 1.A.40 Семейство каналов Vpu вируса иммунодефицита человека типа I
• 1.A.41 Птичий реовирус р10 семейства Ввропоринов
• 1.A.42 Семейство R вирусных белков ВИЧ
• 1.A.43 Устойчивость к камфоре или семейство экспортеров фторида
• 1.A.44 Порообразующий белок кончика хвоста pb2 семейства фага Т5
• 1.A.45 Семейство инъекционных фагов P22
• 1.A.46 Семейство бесстрофинов, образующих анионные каналы
• 1.A.47 Нуклеотид-чувствительный анион-селективный канал, семейство ICln
• 1.A.48 Анионный канал семейства Твити
• 1.A.49 Коронавирус человека ns12.9, семейство виропоринов
• 1.A.50 Фосфоламбан (Ca ²⁺ -канал и Ca ²⁺ -Семейство регуляторов АТФазы
• 1.A.51 Семейство потенциал-управляемых протонных каналов (VPC)
• 1.A.52 Калифорния ²⁺ Активированный высвобождением Ca ²⁺ (CRAC) Семейство каналов (CRAC-C)
• 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина P7 (HCV-P7) вируса гепатита С
• 1.A.54 Пресенилин ER Ca ²⁺ Семейство каналов утечки (пресенилин)
• 1.A.55 Са, связанный с синаптическими пузырьками ²⁺ Канал, Цветочная (Цветочная) Семья
• 1.A.56 Семейство медных транспортеров (Ctr)
• 1.A.57 Коронавирус SARS человека Виропорин (SARS-VP)
• 1.A.58 Семейство матричных белков 2 вируса гриппа типа B (BM2-C)
• 1.A.59 Порообразующий пептид вируса бурсальной болезни, семейство Pep46 (Pep46)
• 1.A.60 Предварительно формирующий пептид реовируса млекопитающих, семейство Mu-1 (Mu-1)
• 1.A.61 Семейство цепей F (гамма-пептидов), образующих каналы нодавирусов насекомых
• 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC)
• 1.A.63 α-спиральный порин внешней мембраны Ignicoccus (семейство I-OMP)
• 1.A.64 Семейство плазмолипинов (плазмолипинов)
• 1.A.65 Семейство белков виропорина E (виропорина E) коронавируса
• 1.A.66 Семейство пардаксинов (пардаксинов)
• 1.A.67 Мембрана Mg ²⁺ Семейство Транспортеров (ММгТ)
• 1.A.68 Семейство вирусных малых гидрофобных виропоринов (V-SH)
• 1.A.69 Семейство гетеромерных каналов рецепторов одоранта (HORC)
• 1.A.70 Молекула против микробов семейства А (MamA)
• 1.A.71 Семейство кислоторастворимых белковых каналов мозга (канал BASP1)
• 1.A.72 Суперсемья Мер
• 1.A.73 Семейство белков лизиса колицина (CLP)
• 1.A.74 Семья Мицугумин 23 (MG23)
• 1.A.75 Механические ноцицепторы, семейство пьезо (пьезо)
• 1.A.76 Семейство переносчиков магния1 (MagT1)
• 1.A.77 Мг ²⁺ /Что ²⁺ Семейство Uniporter (MCU)
• 1.A.78 К ⁺ -селективный канал в семействе эндосом и лизосом (KEL)
• 1.A.79 Белок, поглощающий холестерин (ChUP), или семейство двухцепочечных РНК, поглощающих холестерин.
• 1.A.80 Семейство виропоринов NS4a (NS4a)
• 1.A.81 Ca с низким сродством ²⁺ Семейство каналов (LACC)
• 1.A.82 Семейство механотрансдукционных каналов волосковых клеток (HCMC)
• 1.A.83 Вирус SV40, семейство виропоринов VP2 (SV40 VP2).
• 1.A.84 Модулятор гомеостаза кальция Ca ²⁺ Семейство каналов (CALHM-C)
• 1.A.85 Семейство полиовирусов 2B виропоринов (2B виропоринов)
• 1.A.86 Семейство виропоринов L2 (L2 виропоринов) вируса папилломы человека типа 16 (ВПЧ16)
• 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA)
• 1.А.88 Семейство грибковых калиевых каналов (Ф-Кч)
• 1.A.89 Семейство коронавирусов человека 229E виропоринов (229E виропоринов)
• 1.A.90 Семейство метапневмовирусов человека (HMPV) виропоринов (HMPV-виропорин)
• 1.A.91 Связанный с цитоадгезией бесполый белок 3.2 семейства Plasmodium falciparum (Clag3)
• 1.A.92 Семейство реовирусов виропоринов VP10 (RVP10)
• 1.A.93 Семейство неструктурных белков 3 вируса голубого языка виропоринов (NS3)
• 1.A.94 Семейство ротавирусного неструктурного гликопротеина 4 виропорина (NSP4)
• 1.A.95 Семейство эфемеровирусов виропоринов (EVVP)
• 1.A.96 Семейство виропоринов (ПВВП) вируса полиомы человека
• 1.A.97 Семейство виропоринов вируса папилломы человека типа 16 E5 (HPV-E5)
• 1.A.98 Семейство белков P13 человеческого Т-лимфотропного вируса 1 (HTLV1-P13)
• 1.A.99 Семейство малых мембранных белков Е (IBV-E) вируса инфекционного бронхита
• 1.A.100 Предполагаемое семейство виропоринов Rhabdoviridae, U5 (RV-U5)
• 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих Pex11 (Pex11)
• 1.A.102 Семейство виропоринов PB1-F2 (PB1-F2) гриппа А
• 1.A.103 Семейство обезьяньего вируса 5 (вирус парагриппа 5) SH (SV5-SH)
• 1.A.104 Предлагаемый биосинтез жгутиков Na ⁺ Канал, семейство FlaH (FlaH)
• 1.A.105 Семейство киназных доменов смешанного происхождения (MLKL)
• 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых кальциевой нагрузкой (CLAC)
• 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)

1.Б. Порины β-бочонка и другие белки внешней мембраны

• 1.B.1 Общее семейство бактериальных поринов
• 1.B.2 Семейство хламидийных поринов (CP)
• 1.B.3 Семейство сахарных поринов (SP)
• 1.B.4 Семейство поринов Brucella-Rhizobium (BRP)
• 1.B.5 Pseudomonas OprP (POP) Семейство поринов
• 1.B.6 Семейство поринов OmpA-OmpF (ООП)
• 1.B.7 Семейство поринов Rhodobacter PorCa (RPP)
• 1.B.8 Семейство митохондриальных и пластидных поринов (MPP)
• 1.B.9 Семейство белков внешней мембраны FadL (FadL)
• 1.B.10 Семейство нуклеозид-специфичных поринов внешней мембраны (Tsx), образующих каналы
• 1.B.11 Семейство фимбриальных поринов наружной мембраны (FUP)
• 1.Б.12 Семейство Автовоз-1 (АТ-1)
• 1.B.13 экспортных альгинатных поринов (AEP) Семейство
• 1.B.14 Семейство рецепторов наружной мембраны (OMR)
• 1.B.15 Семейство раффинозных поринов (RafY)
• 1.B.16 Семейство короткоцепочечных амидов и мочевинопоринов (SAP)
• 1.B.17 Семейство факторов внешней мембраны (OMF)
• 1.B.18 Семейство вспомогательных белков внешней мембраны (OMA)
• 1.B.19 Семейство поринов OprB, селективных к глюкозе (OprB)
• 1.B.20 Семья с двухпартнерской секрецией (TPS)
• 1.B.21 Семейство поринов OmpG (OmpG)
• 1.B.22 Семейство секретинов (секретинов) наружной бактериальной мембраны
• 1.B.23 Семейство цианобактериальных поринов (CBP)
• 1.B.24 Микобактериальный порин
• 1.B.25 Семейство поринов наружной мембраны (Opr)
• 1.B.26 Семейство циклодекстриновых поринов (CDP)
• 1.B.31 Семейство основных поринов наружной мембраны Campylobacter jejuni (MomP)
• 1.B.32 Семейство поринов наружной мембраны фузобактерий (FomP)
• 1.B.33 Семейство поринов, встраивающих белки внешней мембраны (комплекс Bam) (OmpIP)
• 1.B.34 ​​Коринебактериальные порины
• 1.B.35 Семейство олигогалактуронат-специфичных поринов (KdgM)
• 1.B.39 Бактериальные порины, семейство OmpW (OmpW)
• 1.B.42 Семейство экспортных поринов липополисахаридов внешней мембраны (LPS-EP)
• 1.B.43 Семейство Coxiella Pori P1 (CPP1)
• 1.B.44 Вероятный белок, транслоцирующий семейство поринов porphyromonas gingivalis (PorT)
• 1.B.49 Семейство поринов Anaplasma P44 (A-P44)
• 1.B.48 Спиралевидные транспортеры
• 1.B.54 Интимин /Инвазин (Инт/Инв) или аутотранспортеров-3 семейство
• 1.B.55 Семейство полиацетил-D-глюкозамина поринов (PgaA)
• 1.B.57 Семейство белков внешней мембраны Legionella (LM-OMP)
• 1.Б.60 Семейство Омп50 Порин (Омп50 Порин)
• 1.B.61 Семейство дельта-протеобактерий поринов (Дельта-порины)
• 1.B.62 Предполагаемое семейство бактериальных поринов (PBP)
• 1.B.66 Предполагаемое семейство бета-бочковых поринов-2 (ВВР2)
• 1.B.67 Предполагаемое семейство бета-цилиндров поринов-4 (BBP4)
• 1.B.68 Предполагаемое суперсемейство поринов-5 (BBP5) бета-цилиндра
• 1.B.70 Семейство наружных мембранных каналов (OMC)
• 1.B.71 Семейство протеобактериальных/веррукомикробных поринов (ПВП)
• 1.B.72 Семейство поринов наружной мембраны протохламидий (PomS/T)
• 1.B.73 Семейство капсульного биогенеза/сборки (CBA)
• 1.B.78 Семейство поринов, связанных с транспортом электронов DUF3374 (ETPorin)

1.C Порообразующие токсины (белки и пептиды)

• 1.C.3 Семейство α- гемолизина (αHL)
• 1.C.4 аэролизинов Семейство
• 1.C.5 ε-токсинов Семейство
• 1.C.11 Суперсемейство RTX-токсинов
• 1.C.12 Мембранно-атакующий комплекс/суперсемейство перфоринов
• 1.C.13 лейкоцидинов Семейство
• 1.C.14 цитогемолизина (CHL) Семейство
• 1.C.39 Семейство тиол-активируемых холестерин-зависимых цитолизинов
• 1.С.43 Лысениных Семья
• 1.C.56 Pseudomonas syringae HrpZ Семейство катионных каналов
• 1.C.57 Семейство клостридиальных цитотоксинов
• 1.C.58 Семейство Microcin E492/C24 (Микроцин E492)
• 1.C.74 Семейство змеиных цитотоксинов (SCT)
• 1.C.97 Семейство порообразующих плевротолизинов

1.D Нерибосомально синтезируемые каналы

• 1.D.1 Семейство грамицидиновых А- каналов
• , образующих каналы сирингомицинов 1.D.2 Семейство
• 1.D.3 Семейство сирингопептинов, образующих каналы
• 1.D.4 Семья, образующая каналы Толаасин
• 1.D.5 Семейство антибиотиков аламетицина или пептайбола , образующих каналы
• 1.D.6 Комплексный поли-3-гидроксибутират кальция ²⁺ Семейство каналов (cPHB-CC)
• 1.D.7 Семья бетиколина
• 1.D.8 Сапонинов Семья
• 1.D.9 Семейство полиглутаминовых ионных каналов (PG-IC)
• 1.D.10 церамиды Семейство каналов, образующих
• 1.D.11 сурфактинов Семейство
• 1.D.12 Семейство Боверицина (Боверицин)
• 1.D.13 Амфипатические пептидные антибиотики с доставкой ДНК (DAPA)
• 1.D.14 Семейство синтетических пептидов, образующих амфипатические каналы Leu/Ser (l/S-SCP)
• 1.D.15 Семейство даптомицинов (даптомицинов)
• 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH)
• 1.D.17 Комбинаторно разработанное семейство порообразующих пептидов β-листа
• 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозина и желчной кислоты
• 1.Д.19 Калифорния ²⁺ Каналообразующее лекарственное средство, дигитоксинов семейство
• 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков/грибковых агентов (ПМАА)
• 1.D.21 Семейство липидных нанопор (LipNP)
• 1.D.22 Протон-транслокирующий каротиноидный пигмент зеаксантина . семейства
• 1.D.23 Семейство порообразующих противомикробных средств фенилен-этинилен (PEPA)
• 1.D.24 Семейство морских губок политеонамида B (pTB)
• 1.D.25 Семейство ариламинов фолдамеров (AAF)
• 1.D.26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G)
• 1.D.27 Семейство изостеров тиомочевины
• 1.D.28 Семейство липопептайболов
• 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов
• 1.D.30 Семейство искусственных столбчатых [5]ареновых каналов с добавлением гидразида (HAPA-C)
• 1.D.31 амфотерицинов B Семейство
• порообразующих ноцидинов 1.D.32 Семейство
• каналообразующих политеонамидов B 1.D.33 Семейство
• 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные боламфифилы
• порообразующих циклических липодепсипептидов 1.D.35 Семейство
• 1.D.36 Семейство олигоборненовых ионных каналов
• 1.D.37 гибикуслидов C. Семейство
• 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT)
• 1.D.39 Семейство светоуправляемых амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола (AAM-IC)
• 1.D.40 Семейство липидных тороидальных пор, индуцированных белками
• 1.D.41 Семейство ионофоров спротетонатного типа (спирогексанолидов)
• 1.D.42 Семейство трипептидных столбцов Phe-Arg[5]ареновых каналов (TPPA-C)
• 1.D.43 Семейство гуанозиндинуклеозидных каналов, адаптированных к триазолу (TT-GDN-C)
• 1.D.44 Синтетический ионный канал с семейством редокс-активных ферроценов (ICRF).
• 1.D.45 Семейство мембранных пор для сонопорации и электропорации (SEMP)
• 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP)
• 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP)
• порообразующих сирингомицина Е 1.D.48 Семейство
• 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC)
• 1.D.50 Семейство амфифильных переносчиков бис-катехиновых анионов (AC-AT)
• 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP)
• 1.D.52 Семейство макроциклических нанопор ароматических олигоамидов (OmnNP)
• 1.D.53 Семейство альфа-, гамма-пептидных нанотрубок (a,gPepNT)
• 1.D.54 Семейство калий-селективных гексил-бензоуреидо-15-краун-5-эфирных ионных каналов (HBEC)
• 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфиринов (PorNP)
• 1.D.56 Семейство олигомерных нанопор альфа-аминоизобутират (Aib) (AibNP)
• 1.D.57 Семейство липидных электропор (LEP)
• 1.D.58 Семейство продигиозена (продигиозена), переносящего анионы
• 1.D.59 The Anion Transporting Perenosin (Perenosin) Family
• 1.D.60 Семейство альфа-гамма-циклических пептидов (AGCP)
• 1.D.61 Семейство анионофорных 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридиновых (ABBP)
• 1.D.62 Семейство производных бис-триазолилдигуанозина, образующих каналы (TDG)
• 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP)
• 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT)
• 1.D.65 Семейство порообразующих амфидинолов (амфидинолов).
• 1.D.66 Семейство спиральных макромолекул нанопор (HmmNP)
• 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов, модифицированных краун-эфиром (CEHP)
• 1.D.68 Семейство порообразующих плевроновых блок-полимеров (PPBP)
• 1.D.69 Семейство конических нанопор (ConNP)
• 1.D.70 Семейство металлических (Au/Ag/Pt/графен) нанопор (MetNP)
• 1.D.71 Семейство синтетических пептидов TP359 (TP359).
• 1.D.72 Семейство триазиновых триазиновых рецепторов-переносчиков хлорида (CCTTR)
• 1.D.73 Семейство нанопор мезопористого кремнезема (SilNP)
• 1.D.74 Семейство чувствительных к стимулам синтетических жестких п-октифениловых пор (SSROP)

1.Э Холинс

Основная статья: Холинс

1.F слияния пузырьков Поры

• 1.F.1 Семейство пор слияния синаптосомальных пузырьков (SVF-поры)
• 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист)

1.G слияния вирусов Поры

• 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-1 (VMFP1)
• 1.G.2 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-2 (VMFP2)
• 1.G.3 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-3 (VMFP3)
• 1.G.4 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-4 (VMFP4)
• 1.G.5 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-5 (VMFP5)
• 1.G.6 Семейство гепаднавирусных слитых белков S (белок HBV-S)
• 1.G.7 Семейство слитых белков FAST реовируса (R-FAST)
• 1.G.8 Семейство слитых белков аренавируса (AV-FP)
• 1.G.9 Семейство синцитинов (синцитинов)
• 1.G.10 Семейство мембранно-слитого комплекса вируса простого герпеса (HSV-MFC)
• 1.G.11 Семейство белковых комплексов входа в клетку поксвируса (PEP-C)
• 1.G.12 Семейство гибридных белков gp95 вируса птичьего лейкоза (ALV-gp95)
• 1.G.13 Семейство малых трансмембранных (FAST) ассоциированных со слиянием ортореовирусов
• 1.G.14 Семейство гемагглютининов/слитых порообразующих белков вируса гриппа (Influenza-H/FPP)
• 1.G.15 Семейство гликопротеинов GP64 (GP64) вируса ядерного полиэдроза Autographa Californica с основной оболочкой
• 1.G.16 Семейство гибридных пептидов вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) (ВИЧ-FP)
• 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкоза крупного рогатого скота (BLV-Env)
• 1.G.18 Слитый пептид SARS-CoV в семействе предшественников шиповидных гликопротеинов (SARS-FP)
• 1.G.19 Семейство ротавирусных порообразующих мембранных слитых комплексов (ротавирусный MFC)
• 1.G.20 Семейство гликопротеинов слитой оболочки Gc хантавируса (Gc-EFG)
• 1.G.21 Семейство вируса Эпштейна-Барра (вирус герпеса человека 4) Gp42 (Gp42)
• 1.G.22 Цитомегаловирус (герпесвирус человека 5) Семейство гликопротеинов gO (gO)

1.H Парацеллюлярные каналы

• 1.H.1 Семейство Claudin Tight Junction (Claudin1)
• 1.H.2 Семейство беспозвоночных PMP22-Клаудин (Claudin2)

1.Мембраносвязанные каналы

• 1.I.1 комплексов ядерных пор Семейство , включая кариоферины
• 1.I.2 плазмодесматовых растений Семейство

2. Транспортеры, управляемые электрохимическим потенциалом.

2. Портеры ( унипортеры , симпортеры , антипортеры )

См. Также: Транспортер аминокислот.

• 2.A.1 Суперсемейство основных фасилитаторов (MFS), см. также Пермеаза лактозы , Пермеаза фосфата и Переносчик глюкозы.
• 2.A.2 Гликозид-пентозид-гексуронид (GPH): семейство катионных симпортеров
• 2.A.3 Семейство аминокислот-полиаминов (APC)
• 2.A.4 Семейство стимуляторов диффузии катионов (CDF)
• 2.A.5 Цинк (Zn ²⁺ )-Железо (Fe ²⁺ Пермеаз ) Семья
• 2.A.6 Суперсемейство резистентных нодуляционных клеток , см. также мембранный белок SecDF, экспортирующий белок
• 2.A.7 Суперсемейство переносчиков лекарств/метаболитов (ДМТ)
• 2.A.8 Глюконат:H ⁺ Семейство Симпортер (GntP)
• 2.A.9 Семейство мембранных протеининсертаз (YidC/Alb3/Oxa1)
• 2.A.10 Семейство переносчиков 2-кето-3-дезоксиглюконата (KdgT)
• 2.A.11 Цитрат-Mg ²⁺ :ЧАС ⁺ (CitM) Цитрат-Ca ²⁺ :ЧАС ⁺ (CitH) Семья Symporter (CitMHS)
• 2.A.12 ATP:Семейство антипортеров ADP
• 2.A.13 Семейство поглощения C4-дикарбоксилата (Dcu)
• 2.A.14 Семейство лактатпермеаз
• 2.A.15 Семейство транспортеров бетаина/карнитина/холина (BCCT)
• 2.A.16 устойчивых к теллуриту/дикарбоксилатных переносчиков Семейство
• 2.A.17 Семейство протон-зависимых олигопептидных транспортеров
• 2.A.18 Семейство аминокислот/ауксинов пермеаз (AAAP)
• 2.A.19 Ка ²⁺ :Семейство катион-антипортеров (CaCA).
• 2.A.20 Семейство переносчиков неорганических фосфатов (PiT)
• 2.A.21 Растворенное вещество: семейство симпортеров натрия
• 2.A.22 Нейротрансмиттер: семейство симпортеров натрия
• 2.A.23 Дикарбоксилат/аминокислота: катион (Na ⁺ или Ч ⁺ ) Семейство Symporter (DAACS)
• 2.A.24 Семейство транспортеров 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT)
• 2.A.25 Семейство аланина или глицина: катион-симпортера (AGCS)
• 2.A.26 Семейство аминокислот с разветвленной цепью: катион-симпортер (LIVCS)
• 2.A.27 Глутамат: Na ⁺ Семья Симпортеров (ESS)
• 2.A.28 Желчная кислота: Na ⁺ Симпортеров Семья
• 2.A.29 митохондриальных носителей Семейство
• 2.A.30 катион-хлоридных котранспортеров (CCC) Семейство
• 2.A.31 Семейство анионообменников
• 2.A.32 Семейство кремниевых транспортеров (Sit)
• 2.A.33 НхаА На ⁺ :ЧАС ⁺ Семья Антипортеров (NhaA)
• 2.A.34 Номер Нет ⁺ :ЧАС ⁺ Семья антипортеров (NhaB)
• 2.A.35 NhaC Na ⁺ :ЧАС ⁺ Семейство антипортеров (NhaC)
• 2.A.36 протонных антипортеров-1 (CPA1) Моновалентный катион: семейство
• 2.A.37 протонных антипортеров-2 (CPA2) Моновалентный катион: семейство
• 2.А.38 К ⁺ Транспортер (Трк) Семья
• 2.A.39 Нуклеиновое основание: семейство катионов-симпортеров-1 (NCS1)
• 2.A.40 Нуклеиновое основание: семейство катионов-симпортеров-2 (NCS2)
• 2.A.41 Семейство концентрационных переносчиков нуклеозидов (CNT)
• 2.A.42 Семейство пермеаз гидрокси/ароматических аминокислот (HAAAP)
• 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистина (LCT)
• 2.A.45 Семейство арсенит-антимонитовых эффлюксов
• 2.A.46 Бензоат:H ⁺ Семья Симпортер (BenE)
• 2.A.47 Двухвалентный анион: Na ⁺ Семья Симпортеров (DASS)
• 2.A.48 Семейство редуцированных переносчиков фолата (RFC)
• 2.A.49 хлоридных носителей/каналов (ClC) Семейство
• 2.A.50 Семейство поглощения глицерина (GUP)
• 2.A.51 Семейство переносчиков хроматных ионов (CHR)
• 2.A.52 Солнце ²⁺ -Ко ²⁺ Семейство транспортеров (NiCoT)
• 2.A.53 Семейство сульфатпермеаз (SulP)
• 2.A.54 Семейство митохондриальных трикарбоксилатных переносчиков (MTC)
• 2.A.55 Ион металла (Mn ²⁺ -железо) Транспортер (Нрамп) Семья
• 2.A.56 Семейство трехсторонних АТФ-независимых периплазматических транспортеров (TRAP-T)
• 2.A.57 Семейство равновесных переносчиков нуклеозидов (ENT)
• 2.A.58 Фосфат: Na ⁺ Семейство Симпортер (PNaS)
• 2.A.59 Семейство устойчивости к мышьяку-3 (ACR3)
• 2.A.60 Семейство органоанионных транспортеров (ОАТ)
• 2.A.61 Семейство поглощения C4-дикарбоксилата (DcuC)
• 2.A.62 НхаД На ⁺ :ЧАС ⁺ Семья антипортеров (NhaD)
• 2.A.63 Моновалентный катион (K ⁺ или На ⁺ ): Семейство протонных антипортеров-3 (CPA3)
• 2.A.64 Семейство двойного аргинина (Tat)
• 2.A.65 Семейство транспортеров билирубина (BRT)
• 2.A.66 Суперсемейство мультилекарственных/олигосахаридиллипидных/полисахаридных (MOP) флиппаз
• 2.A.67 Семейство транспортеров олигопептидов (OPT)
• 2.A.68 Семейство переносчиков п-аминобензоилглутамата (AbgT)
• 2.A.69 Семейство переносчиков оттока ауксина (AEC)
• 2.A.70 Малонат: Na ⁺ Семья Симпортеров (MSS)
• 2.A.71 Семейство транспортеров фолата-биоптерина (FBT)
• 2.А.72 К ⁺ Семейство поглощающих пермеаз (KUP)
• 2.A.73 Семейство поглощения короткоцепочечных жирных кислот (AtoE)
• 2.A.74 4 Семейство мультилекарственных эндосомальных переносчиков TMS (MET)
• 2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE)
• 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерина/треонина (RhtB)
• 2.A.77 Семейство устойчивых к кадмию (CadD)
• 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E)
• 2.A.79 Семейство экспортеров треонина/серина (ThrE)
• 2.A.80 Семейство транспортеров трикарбоксилатов (ТТТ)
• 2.A.81 Семейство аспартат-аланиновых обменников (AAEx)
• 2.A.82 Семейство переносчиков органических веществ (ОСТ).
• 2.A.83 На ⁺ Семейство -зависимых переносчиков бикарбоната (SBT)
• 2.A.84 Семейство экспортеров хлоропластов и мальтозы (MEX)
• 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE)
• 2.A.86 Семейство экспортеров автоиндуктора-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC № 9.B.22)
• 2.A.87 Семейство прокариотических переносчиков рибофлавина (P-RFT)
• 2.A.88 Семейство транспортеров поглощения витаминов (VUT или ECF)
• 2.A.89 Семейство вакуольных транспортеров железа (VIT).
• 2.A.90 рецепторов/переносчиков витамина А (STRA6) Семейство
• 2.A.91 Импортный комплекс митохондриальной тРНК (M-RIC) (ранее 9.C.8)
• 2.A.92 Семейство транспортеров холина (CTL)
• 2.A.94 Семейство фосфатпермеаз (Pho1)
• 2.A.95 Семейство переносчиков нейтральных аминокислот (NAAT) 6TMS
• 2.A.96 Семейство транспортеров поглощения ацетата (AceTr)
• 2.A.97 Внутренняя мембрана митохондрий K ⁺ /ЧАС ⁺ и Ca ²⁺ /ЧАС ⁺ Семейство обменников (LetM1)
• 2.A.98 Семья предполагаемых экспортеров сульфатов (PSE)
• 2.А.99 6ТМС Ni ²⁺ Семейство поглощающих транспортеров (HupE-UreJ)
• 2.A.100 Семейство ферропортинов (Fpn)
• 2.A.101 Семейство поглощения малоната (MatC) (ранее UIT1)
• 2.A.102 Семейство пермеаз поглощения 4-толуолсульфоната (TSUP)
• 2.A.103 Семейство бактериальных экспортеров предшественников муреина (MPE)
• 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE)
• 2.A.105 Семейство митохондриальных пируватных переносчиков (MPC)
• 2.A.106 Ка ²⁺ :ЧАС ⁺ Семейство антипортеров-2 (CaCA2)
• 2.A.107 MntP Mn ²⁺ Семья экспортеров (MntP)
• 2.A.108 Семейство транспортеров железа/свинца (ILT)
• 2.A.109 Семейство устойчивых к ионам теллура (TerC)
• 2.A.110 Транспортер гема, семейство гем-чувствительных генных белков (HRG)
• 2.A.111 На ⁺ /ЧАС ⁺ Семейство антипортеров-E (NhaE)
• 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA)
• 2.A.113 Семейство переносчиков никеля/кобальта (NicO).
• 2.A.114 Предполагаемое семейство CstA (CstA) – переносчиков пептидов, вызывающих углеродное голодание
• 2.A.115 Семья экспортеров новобиоцина (NbcE)
• 2.A.116 Семейство пептидогликолипид-адресующих белков (GAP)
• 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексадина (CHX)
• 2.A.118 Семейство антипортеров основных аминокислот (ArcD)
• 2.A.119 Семья экспортеров мышьякорганических соединений (ArsP)
• 2.A.120 Семейство предполагаемых аминокислотных пермеаз (PAAP)
• 2.A.121 Семейство переносчиков сульфатов (CysZ)
• 2.A.122 Семейство холиноподобных вспомогательных белков LrgB/CidB (LrgB/CidB)
• 2.A.123 Сладкое; PQ-петля; Слюна; Семья MtN3 (Сладкая)
• 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO).
• 2.A.125 Семейство эукариотических переносчиков рибофлавина (E-RFT)
• 2.A.126 Семья экспортеров жирных кислот (FAX)
• 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)

2.B Портеры, синтезируемые нерибосомально

• 2.B.1 валиномицина Семейство носителей
• 2.B.2 Моненсен Семья
• 2.B.3 нигерицинов Семья
• 2.B.4 Семейство макротетролидных антибиотиков (МА)
• 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (МП)
• 2.B.6 иономицинов Семейство
• 2.B.7 Семейство трансмембранных α-спиральных пептид-фосфолипидных транслокаций (TMP-PLT)
• 2.B.8 Семейство бафиломицина А1 (бафиломицина)
• 2.B.9 Функциональное семейство проникающих в клетку пептидов (CPP)
• 2.B.10 Синтетический CPP, транспортанов семейство
• 2.B.11 кальцимицина или A23187 Семейство ионофоров-носителей
• 2.B.12 салиномицинов Семейство
• 2.B.13 Семейство антипортеров тетрапиррольных макроциклических анионов (TPMC-AA)
• 2.B.14 Семейство лазалоцидов A или X-537A ионофоров (лазалоцидов)
• 2.B.15 Семейство триподальных хлоридных носителей на основе трис-тиомочевины (TTT-CC)
• 2.B.16 Семейство соединений-анионов-носителей, содержащих галогенные связи (HCAC).
• 2.B.17 Производное изофталаминда H ⁺ :Cl ⁻ Семья котранспортеров (IDC)
• 2.B.18 Производное пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H+:Cl ⁻ Семья со-перевозчика
• 2.B.19 Семейство производных каликс(4)пиррола (C4P)
• 2.B.20 Семейство хлорид/бикарбонатных обменников продигиозина (продигиозина)
• 2.B.21 Семейство переносчиков анионов, производных орто-фенилендиамина-бис-мочевины (oPDA-U).
• 2.B.22 Семейство функционализированных имидазолием переносчиков анионов (IAT)
• 2.B.23 Гомотетрамерный трансмембранный Zn ²⁺ /Ко ²⁺ :Протонный синтетический антипортер, семейство рокеров (рокеров).
• 2.B.24 Семейство 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридиновых носителей аниона (BBP-AC)
• 2.B.25 Семейство пептид-опосредованных липидных триггеров (PLFF)
• 2.B.26 Семейство бис(имидазолил)-функционализированных бис(холоил)-конъюгатов (BIBCC)
• 2.B.27 Семейство транспортеров анионов трис-мочевины
• анионофорных морских алкалоидов тамджамина 2.B.29 Семейство

2.C. Генераторы, управляемые ионным градиентом.

• 2.C.1 Семейство вспомогательных белков TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) для активизации активного транспорта, опосредованного рецептором внешней мембраны (OMR).

3. Первично-активные транспортеры

3.А. Транспортеры, управляемые гидролизом PP-связи

• 3.A.1 Транспортеры ABC, включая BtuCD, транспортер поглощения молибдата, регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие.
• 3.A.2 Н ⁺ - или На ⁺ -транслокация АТФазы F-типа , АТФазы V-типа и суперсемейства АТФаз А-типа
• 3.A.3 АТФаз P-типа Суперсемейство
• 3.A.4 арсенит-антимонитовых эффлюксов Семейство
• 3.A.5 общего секреторного пути (Sec) Транслокон (препротеиновая транслоказа SecY)
• 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанных с вирулентностью) (IIISP)
• 3.A.7 Семейство секреторного пути типа IV (супружеский перенос ДНК-белка или VirB) (IVSP)
• 3.A.8 Семейство митохондриальных белковых транслоказ (MPT)
• 3.A.9 Семейство белков-транслоказ оболочки хлоропластов (CEPT или Tic-Toc)
• 3.А.10 Ч ⁺ , уже ⁺ -транслокация семейства пирофосфатаз
• 3.A.11 Семейство транспортеров трансформации ДНК, связанных с компетентностью бактерий (DNA-T)
• 3.A.12 Семейство септальных ДНК-транслокаторов (S-DNA-T)
• 3.A.13 Семейство экспортеров нитчатых фагов (FPhE)
• 3.A.14 Семейство фимбрилина/экспортера белка (FPE)
• 3.A.15 Семейство главных концевых ветвей, секретирующих белки внешней мембраны (MTB)
• 3.A.16 Семейство эндоплазматических ретикулярных ретротранслоконов (ER-RT)
• 3.A.17 Семейство фагов T7 Injectisome (T7 Injectisome)
• 3.A.18 Семейство экспортеров ядерной мРНК (мРНК-Е)
• 3.A.19 Семейство комплексов распознавания/вставки TMS (TRC)
• 3.A.20 Семейство импортеров пероксисомального белка (PPI)
• 3.A.21 Семейство C-концевых мембранных белковых комплексов биогенеза/инсерции (TAMP-B)
• 3.A.22 Семейство связанных с транскрипцией комплексов экспорта ядерной мРНК TREX/TAP (TREX)
• 3.A.23 Семейство симбиоза/секреторного пути вирулентности типа VI (VISP)
• 3.A.24 Семейство систем секреции белка типа VII или ESX (T7SS)
• 3.A.25 Семейство ERAD-подобных машин (SELMA) для симбионтов
• 3.A.26 Семейство транслоконов экспортируемых белков плазмодия (PTEX)

3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием

• 3.B.1 Na ⁺ Семейство -транспортирующих декарбоксилаз карбоновых кислот (NaT-DC)

3.C Транспортеры, управляемые метилтрансфером

• 3.C.1 Na ⁺ Транспортировка метилтетрагидрометаноптерина: семейство коэнзима М-метилтрансферазы (NaT-MMM)

3.Д. Транспортеры с окислительно-восстановительным приводом

Они включают ряд трансмембранных цитохром b -подобных белков, включая кофермент Q-цитохром c-редуктазу (цитохром bc1); комплекс цитохрома b6f ; формиатдегидрогеназа, респираторная нитратредуктаза ; сукцинат - коэнзим Q-редуктаза (фумаратредуктаза); и сукцинатдегидрогеназа . См. Цепь переноса электронов .

• 3.D.1 Н ⁺ или На ⁺ -транслоцирующее семейство НАДН-дегидрогеназы («комплекс I»)
• 3.D.2 Семейство протон-транслоцирующих трансгидрогеназ (ПТГ)
• 3.D.3 протон-транслоцирующих хинол:цитохром-c-редуктаза Суперсемейство
• 3.D.4 протон-транслокационной цитохромоксидазы (ЦОГ) Суперсемейство
• 3.D.5 На ⁺ -транслокация НАДН:Семейство хинондегидрогеназы (Na-NDH или NQR)
• 3.D.6 Предполагаемый ион (H ⁺ или На ⁺ Семейство )-транслоцирующих НАДН:ферредоксиноксидоредуктазы (NFO или RNF)
• 3.D.7 Семейство H ₂ :гетеродисульфидоксидоредуктазы (HHO)
• 3.D.8 На ⁺ - или Ч ⁺ -Перекачивающее семейство формилметанофурандегидрогеназы (FMF-DH)
• 3.D.9 Н ⁺ Семейство -транслокирующих дегидрогеназ F420H2 (F420H2DH)
• 3.D.10 Семейство прокариотических сукцинатдегидрогеназ (SDH)

3.Э. Транспортеры, управляемые поглощением света

• Бактериородопсин -подобные белки, включая родопсин (см. также опсин )
• Бактериальные фотосинтетические реакционные центры и фотосистемы I и II.
• Светособирающие бактерий хлоропластов и комплексы

4. Групповые транслокаторы

4. Групповые транслокаторы, управляемые фосфотрансфером.

Основная статья: Суперсемейство PTS-GFL

• 4.A.1 Семейство PTS-глюкозы-глюкозидов (Glc)
• 4.A.2 Семейство PTS фруктоза-маннитол (Fru)
• 4.A.3 Семейство PTS лактоза-N,N'-диацетилхитобиоза-β-глюкозид (Lac)
• 4.A.4 Семейство PTS-глюцитола (кишечника)
• 4.A.5 Семейство PTS-галактитола (Gat)
• 4.A.6 Семейство PTS манноза-фруктоза-сорбоза (человеческое)
• 4.A.7 Семейство PTS L-аскорбатов (L-Asc)

4.B Транспортеры захвата никотинамидрибонуклеозидов

• 4.B.1 Семейство пермеаз поглощения никотинамид-рибонуклеозида (NR) (PnuC)

4.C Транспортеры, связанные с ацил-КоА-лигазой.

• 4.C.1 Предлагаемое семейство транспортеров жирных кислот (FAT)
• 4.C.2 Семейство карнитин-о-ацилтрансферазы (CrAT)
• 4.C.3 Семейство ацил-КоА-тиоэстеразы (AcoT)

4.D Синтаза/экспортеры полисахаридов

• 4.D.1 Предполагаемое семейство векторной гликозильной полимеризации (VGP)
• 4.D.2 Семейство гликозилтрансферазы 2 (GT2)
• 4.D.3 Семейство гликан-глюкозилтрансфераз (OpgH)

4.Э. Вакуольные транслокаторы групп, катализируемые полифосфатной полимеразой

• 4.E.1 Семейство вакуолярных (ацидокальцисом) полифосфат-полимераз (V-PPP)

5. Транспортные носители электронов.

5.А. Трансмембранные переносчики двух электронов.

• 5.A.1 Семейство оксидоредуктазы D с дисульфидной связью (DsbD)
• 5.A.2 Семейство оксидоредуктазы B с дисульфидной связью (DsbB)
• 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптеринсодержащих оксидоредуктаз (PMO)

5.B Трансмембранные переносчики 1 электрона

• фагоцитов ( gp91phox ) НАДФН-оксидаз 5.B.1 Семейство
• 5.B.2 Семейство эукариотических цитохромов b561 (Cytb561)
• 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire с переносом электронов (G-NET)
• 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы растений I (PSI)
• 5.B.5 Семейство внеклеточных металлоксидоредуктаз (EMOR)
• 5.B.6 Семейство трансмембранного эпителиального антигена белка-3 железоредуктазы (STEAP)
• 5.B.7 Семья YedZ (ЙедЗ)
• 5.B.8 Семейство транс-наружно-мембранных комплексов поринов и цитохромов (ET-PCC)
• 5.B.9 Семейство порин-цитохром c (Cyc2)

Внешние ссылки

• База данных классификации транспортеров
• Список на qmul.ac.uk
• Сайер М.Х., Тран К.В., Баработе Р.Д. (январь 2006 г.). «TCDB: база данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D181–6. дои : 10.1093/нар/gkj001 . ПМЦ   1334385 . ПМИД   16381841 .
• Буш В., Сайер М.Х. (2002). «Система классификации транспортеров (ТС), 2002». Крит. Преподобный Биохим. Мол. Биол . 37 (5): 287–337. дои : 10.1080/10409230290771528 . ПМИД   12449427 . S2CID   10558982 .
• Классификация переносчиков человека в фармакологии