CLCNKA

CLCNKA
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2PFI
Идентификаторы
Псевдонимы	CLCNKA , CLCK1, ClC-K1, hClC-Ka, хлоридный потенциалзависимый канал Ka
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602024 ; МГИ : 1930643 ; Гомологен : 107317 ; GeneCards : CLCNKA ; ОМА : CLCNKA — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	16,034,050 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	141,143,325 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; body of pancreas; ; human kidney; ; right adrenal cortex; ; testicle; ; right hemisphere of cerebellum; ; body of stomach;
	Top expressed in
	blastocyst; ; right kidney; ; inner renal medulla; ; human kidney; ; outer renal medulla; ; inner stripe of outer renal medulla; ; submandibular gland; ; connecting tubule; ; distal tubule; ; morula;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; voltage-gated ion channel activity; chloride channel activity; voltage-gated chloride channel activity; identical protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; chloride channel complex; membrane;
Biological process	ion transmembrane transport; chloride transport; excretion; regulation of ion transmembrane transport; ion transport; transmembrane transport; chloride transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1187
	56365
	ENSG00000186510
	ENSMUSG00000006216
	P51800
	Q9WUB6
	НМ_004070 ; НМ_001042704 ; НМ_001257139
	НМ_019701
	НП_001036169 ; НП_001244068 ; НП_004061
	НП_062675
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок хлоридных каналов ClC-Ka представляет собой белок , который у человека кодируется CLCNKA геном . Для этого гена обнаружено множество вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы. ^[5]^[6]

Функция

Этот ген является членом семейства CLC потенциалзависимых хлоридных каналов . Предполагается, что кодируемый белок будет иметь 12 трансмембранных доменов и требует бета-субъединицы, называемой барттин, для формирования функционального канала. Считается, что он участвует в реабсорбции соли в почках и рециркуляции калия во внутреннем ухе. Ген очень похож на CLCNKB , который расположен на 10 т.п.н. ниже этого гена. ^[6]

Варианты генов

CLCNKA кодирует один из двух основных хлоридных каналов, обнаруженных в почках, канал ClC-Ka (другой класс - ClC-Kb из CLCNKB). Ген CLCNKA, как и все гены, подвержен вариациям из-за однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), при которых одно основание (A, T, C или G) случайным образом заменяется другим основанием. ^[7] SNP в кодирующих областях CLCKNA могут иметь последующие изменения в аминокислотной последовательности хлоридного канала ClC-Ka, приводящие к изменению функциональных возможностей и последующим физиологическим изменениям. ^[7]

Четыре SNP (rs848307, rs1739843, rs1010069 и rs1805152) были связаны с повышенной чувствительностью к соли, демонстрируя нерегулярно большое повышение артериального давления после умеренного потребления соли (Na ⁺) потребление, несмотря на регулярную частоту сердечных сокращений, артериальное давление и уровень ренина в плазме до приема соли. ^[7] Особый интерес представляет общий SNP, приводящий к замене аминокислоты аргинина в 83-м положении на глицин. ^[8] Этот вариант обнаружен примерно у половины всех европеоидов, при этом четверть европеоидов гомозиготны по этому аллелю. ^[8] Хотя SNP в основном изучается среди представителей европеоидной расы, на самом деле SNP встречается с большей частотой у людей африканского происхождения, где частота гена составляет 70%. ^[8] Этот SNP (rs10927887) первоначально был вовлечен в развитие застойной сердечной недостаточности после того, как исследования белка теплового шока HSPB7 показали, что ген CLCNKA находится в неравновесном сцеплении , а это означает, что два гена часто не разделяются во время рекомбинации. ^[8] Затем было показано, что вариант CLCNKA является причиной патологии. ^[8]

Патология

Установлено, что четыре SNP связаны с чувствительностью к соли, следовательно, предрасполагают к таким сердечно-сосудистым проблемам, как гипертрофия левого желудочка и дисфункция эндотелия. ^[7] SNP Arg83Gly приводит к значительному снижению потока ионов хлорида через канал ClC-Ka в тонком и толстом восходящем отделе нефронов. ^[8] Экспериментально, мембранный потенциал, при котором каналы не демонстрируют чистого движения ионов при данной концентрации хлорида, значительно падает с мутацией, что указывает на изменение функции in situ. ^[8] Это проявляется как хроническое расстройство, связанное с потерей соли, подобное синдрому Бартера . ^[8] поскольку реабсорбция натрия сочетается с реабсорбцией хлоридов. ^[7] Потеря соли приводит к уменьшению объема крови и, как следствие, к гиперренинемии, ведущей (через конечный продукт ангиотензин II и альдостерон) к повышению сосудистого тонуса, частоты сердечных сокращений, реабсорбции воды и артериального давления, что в совокупности называется кардиоренальным синдромом . ^[8] Гетерозиготность по этому варианту Arg83Gly увеличивает риск сердечной недостаточности на 27%, а гомозиготность увеличивает риск на 54%. ^[8] Дополнительная нагрузка на сердце из-за повышения артериального давления и частоты сердечных сокращений часто проявляется только как патология с дополнительными сердечно-сосудистыми проблемами, такими как гипертония. ^[8] Лечение гиперренинемии, связанной с SNP, включает препараты, блокирующие систему ренин-ангиотензин-альдостерон, чтобы снять вышеупомянутую нагрузку на сердце. ^[8]

См. также

Хлоридный канал
BSND , barttin, бета-версия добавочной субъединицы для этого канала

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186510 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006216 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Такеучи Ю., Учида С., Марумо Ф., Сасаки С. (февраль 1996 г.). «Клонирование, распределение в тканях и внутрипочечная локализация хлоридных каналов ClC в почках человека» . Почки Int . 48 (5): 1497–503. дои : 10.1038/ki.1995.439 . ПМИД 8544406 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: CLCNKA хлоридный канал Ка» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Барлассина С, Даль Фиуме С, Ланзани С, Манунта П, Гуффанти Дж, Руэлло А, Бьянки Дж, Дель Веккьо Л, Маккарди Ф, Куси Д (июль 2007 г.). «Общие генетические варианты и гаплотипы почечного гена CLCNKA связаны с гипертонией, чувствительной к соли» . Хм. Мол. Жене . 16 (13): 1630–8. дои : 10.1093/hmg/ddm112 . ПМИД 17510212 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л
Каппола Т.П., Маткович С.Дж., Ван В., ван Боовен Д., Ли М., Ван Х, Цюй Л., Свейцер Н.К., Фанг Дж.К., Рейли М.П., Хаконарсон Х., Нербонн Дж.М., Дорн Г.В. (февраль 2011 г.). «Вариант последовательности ДНК с потерей функции в хлоридном канале CLCNKA влияет на сердечно-почечную ось в индивидуальных вариациях риска сердечной недостаточности» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (6): 2456–61. Бибкод : 2011PNAS..108.2456C . дои : 10.1073/pnas.1017494108 . ПМК 3038744 . ПМИД 21248228 .
- «Исследователи обнаружили новый ген сердечной недостаточности у европеоидов» . Система здравоохранения Пенсильванского университета . 18 января 2011 г.

Дальнейшее чтение

Йентш Т.Дж., Гюнтер В. (1997). «Хлоридные каналы: новая молекулярная картина». Биоэссе . 19 (2): 117–26. дои : 10.1002/bies.950190206 . ПМИД 9046241 . S2CID 19904492 .
Киферле С., Фонг П., Бенс М., Вандевалле А., Йентч Т.Дж. (1994). «Два высоко гомологичных члена семейства хлоридных каналов ClC в почках крысы и человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (15): 6943–7. Бибкод : 1994PNAS...91.6943K . дои : 10.1073/pnas.91.15.6943 . ПМК 44314 . ПМИД 8041726 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сайто-Охара Ф., Учида С., Такеучи Ю., Сасаки С., Хаяши А., Марумо Ф., Икеучи Т. (1997). «Присвоение генов, кодирующих хлоридные каналы человека, CLCNKA и CLCNKB, 1p36 и CLCN3 4q32-q33 путем гибридизации in situ». Геномика . 36 (2): 372–4. дои : 10.1006/geno.1996.0479 . ПМИД 8812470 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Эстивес Р., Беттгер Т., Штейн В., Биркенхагер Р., Отто Э., Хильдебрандт Ф., Йентш Т.Дж. (2002). «Барттин — это CL ⁻ бета-субъединица канала имеет решающее значение для почечного Cl ⁻ реабсорбция и внутреннее ухо К ⁺ секреция». Природа . 414 (6863): 558–61. : 10.1038 /35107099 . PMID 11734858. . S2CID 4407807 doi
Шлингманн К.П., Конрад М., Джек Н., Вальдеггер П., Рейнальтер С.К., Холдер М., Зайберт Х.В., Вальдеггер С. (2004). «Солевая потеря и глухота в результате мутаций двух хлоридных каналов» . Н. англ. Дж. Мед . 350 (13): 1314–9. doi : 10.1056/NEJMoa032843 . ПМИД 15044642 . S2CID 30018159 .
Шолль У., Хебайзен С., Янссен А.Г., Мюллер-Ньюен Г., Алеков А., Фальке С. (2006). «Барттин модулирует трафик и функцию каналов ClC-K» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (30): 11411–6. Бибкод : 2006PNAS..10311411S . дои : 10.1073/pnas.0601631103 . ПМК 1544099 . ПМИД 16849430 .
Барлассина С, Даль Фиуме С, Ланцани С, Манунта П, Гуффанти Дж, Руэлло А, Бьянки Дж, Дель Веккьо Л, Маккарди Ф, Куси Д (2007). «Общие генетические варианты и гаплотипы почечного гена CLCNKA связаны с гипертонией, чувствительной к соли» . Хм. Мол. Жене . 16 (13): 1630–8. дои : 10.1093/hmg/ddm112 . ПМИД 17510212 .
Маркович С., Дутцлер Р. (2007). «Структура цитоплазматического домена хлоридного канала ClC-Ka обнаруживает консервативный интерфейс взаимодействия» . Структура . 15 (6): 715–25. дои : 10.1016/j.str.2007.04.013 . ПМИД 17562318 .

Внешние ссылки

CLCNKA+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека CLCNKA Расположение генома CLCNKA и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186510 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006216 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8544406-5] Такеучи Ю., Учида С., Марумо Ф., Сасаки С. (февраль 1996 г.). «Клонирование, распределение в тканях и внутрипочечная локализация хлоридных каналов ClC в почках человека» . Почки Int . 48 (5): 1497–503. дои : 10.1038/ki.1995.439 . ПМИД 8544406 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: CLCNKA хлоридный канал Ка» .

[Barlassina-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Барлассина С, Даль Фиуме С, Ланзани С, Манунта П, Гуффанти Дж, Руэлло А, Бьянки Дж, Дель Веккьо Л, Маккарди Ф, Куси Д (июль 2007 г.). «Общие генетические варианты и гаплотипы почечного гена CLCNKA связаны с гипертонией, чувствительной к соли» . Хм. Мол. Жене . 16 (13): 1630–8. дои : 10.1093/hmg/ddm112 . ПМИД 17510212 .

[Cappola-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Каппола Т.П., Маткович С.Дж., Ван В., ван Боовен Д., Ли М., Ван Х, Цюй Л., Свейцер Н.К., Фанг Дж.К., Рейли М.П., Хаконарсон Х., Нербонн Дж.М., Дорн Г.В. (февраль 2011 г.). «Вариант последовательности ДНК с потерей функции в хлоридном канале CLCNKA влияет на сердечно-почечную ось в индивидуальных вариациях риска сердечной недостаточности» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (6): 2456–61. Бибкод : 2011PNAS..108.2456C . дои : 10.1073/pnas.1017494108 . ПМК 3038744 . ПМИД 21248228 .
«Исследователи обнаружили новый ген сердечной недостаточности у европеоидов» . Система здравоохранения Пенсильванского университета . 18 января 2011 г.

[9] «Исследователи обнаружили новый ген сердечной недостаточности у европеоидов» . Система здравоохранения Пенсильванского университета . 18 января 2011 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]