ASIC4

ASIC4
Идентификаторы
Псевдонимы	ASIC4 , ACCN4, BNAC4, член 4 семейства субъединиц кислотно-чувствительных ионных каналов
Внешние идентификаторы	Опустить : 606715 ; МГИ : 2652846 ; Гомологен : 11166 ; GeneCards : ASIC4 ; OMA : ASIC4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	219,538,772 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	75,450,987 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pituitary gland; ; anterior pituitary; ; right hemisphere of cerebellum; ; amygdala; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; lateral nuclear group of thalamus; ; right frontal lobe; ; hypothalamus; ; substantia nigra;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; primary visual cortex; ; olfactory tubercle; ; embryo; ; superior colliculus; ; nucleus accumbens; ; central gray substance of midbrain; ; lumbar subsegment of spinal cord;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	ion channel activity; sodium ion transmembrane transporter activity; sodium channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; integral component of plasma membrane; membrane;
Biological process	ion transport; sodium ion transport; ion transmembrane transport; sodium ion transmembrane transport; behavioral fear response;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55515
	241118
	ENSG00000072182
	ENSMUSG00000033007
	Q96FT7
	Q7TNS7
	НМ_018674 ; НМ_182847
	НМ_183022
	НП_061144 ; НП_878267
	НП_898843
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кислоточувствительный ионный канал 4 ( ASIC4 ), также известный как амилорид-чувствительный катионный канал 4 (ACCN4), представляет собой белок , который у людей кодируется геном ASIC4 . Ген ASIC4 является одним из пяти паралогичных генов, которые кодируют белки, образующие тримерные кислоточувствительные ионные каналы (ASIC) у млекопитающих. ^[5] кДНК этого гена была впервые клонирована в 2000 году. ^[6]^[7] Гены ASIC имеют варианты сплайсинга, которые кодируют разные белки, называемые изоформами.

Эти гены в основном экспрессируются в центральной и периферической нервной системе.

ASIC могут образовывать как гомотримерные (то есть состоящие из трех идентичных субъединиц), так и гетеротримерные каналы. ^[8]

Структура и функции

Этот ген кодирует члена ASIC/ ENaC . суперсемейства белков ^[9] Членами этого семейства являются амилориду чувствительные к натриевые каналы, которые содержат внутриклеточные N- и C-концы, 2 гидрофобные трансмембранные (ТМ) области и большую внеклеточную петлю, которая имеет множество остатков цистеина с консервативными интервалами. Области TM обычно обозначаются как TM1 (клон к N-концу) и TM2 (близко к C-концу).

Пора канала, через который ионы избирательно перетекают с внеклеточной стороны в цитоплазму, образована тремя участками ТМ2 тримера. ^[5]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000072182 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033007 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Ханукоглу I (2017). «Натриевые каналы типа ASIC и ENaC: конформационные состояния и структуры ионно-селективных фильтров» . Журнал ФЭБС . 284 (4): 525–545. дои : 10.1111/февраль 13840 . ПМИД 27580245 . S2CID 24402104 .
^ Грюндер С., Гейслер Х.С., Бэсслер Э.Л., Рупперсберг Дж.П. (2000). «Новый член кислоточувствительных ионных каналов гипофиза». НейроОтчет . 11 (8): 1607–11. дои : 10.1097/00001756-200006050-00003 . ПМИД 10852210 . S2CID 46420660 .
^ Грюндер С., Гейслер Х.С., Ренье С., Финк Дж.К. (2001). «Ген 4-го кислотно-чувствительного ионного канала (ASIC): физическое картирование, геномная организация и оценка как кандидата на пароксизмальную дистонию» . Евро. Дж. Хум. Жене . 9 (9): 672–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200699 . ПМИД 11571555 .
^ Бабински К., Катарси С., Бьяджини Дж., Сегела П. (сентябрь 2000 г.). «Субъединицы ASIC2a и ASIC3 млекопитающих совместно собираются в гетеромерные протон-зависимые каналы, чувствительные к Gd3+» . Журнал биологической химии . 275 (37): 28519–25. дои : 10.1074/jbc.M004114200 . hdl : 11380/304669 . ПМИД 10842183 .
^ Ханукоглу I, Ханукоглу А (январь 2016 г.). «Семейство эпителиальных натриевых каналов (ENaC): филогения, структура-функция, распределение в тканях и связанные с ними наследственные заболевания» . Джин . 579 (2): 95–132. дои : 10.1016/j.gene.2015.12.061 . ПМЦ 4756657 . ПМИД 26772908 .

Дальнейшее чтение

Чен X, Поллейхтнер Г, Кадурин И, Грюндер С (2007). «Кислотно-чувствительный ионный канал рыбки данио (ASIC) 4, характеристика гомо- и гетеромерных каналов и идентификация областей, важных для активации H +» . Ж. Биол. Хим . 282 (42): 30406–13. дои : 10.1074/jbc.M702229200 . ПМИД 17686779 .
Донье Э., Руджеро Ф., Джейкоб С., Вуд Дж.Н. (2008). «Регуляция активности ASIC с помощью ASIC4 - новое понимание функции каналов ASIC, выявленное с помощью двухгибридного анализа дрожжей». Евро. Дж. Нейроски . 28 (1): 74–86. дои : 10.1111/j.1460-9568.2008.06282.x . ПМИД 18662336 . S2CID 29369987 .
Центр Сэнгера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, (1998). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома ASIC4 и страница сведений о гене ASIC4 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000072182 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033007 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[2017-Hanukoglu-5] Jump up to: ^а ^б Ханукоглу I (2017). «Натриевые каналы типа ASIC и ENaC: конформационные состояния и структуры ионно-селективных фильтров» . Журнал ФЭБС . 284 (4): 525–545. дои : 10.1111/февраль 13840 . ПМИД 27580245 . S2CID 24402104 .

[6] Грюндер С., Гейслер Х.С., Бэсслер Э.Л., Рупперсберг Дж.П. (2000). «Новый член кислоточувствительных ионных каналов гипофиза». НейроОтчет . 11 (8): 1607–11. дои : 10.1097/00001756-200006050-00003 . ПМИД 10852210 . S2CID 46420660 .

[7] Грюндер С., Гейслер Х.С., Ренье С., Финк Дж.К. (2001). «Ген 4-го кислотно-чувствительного ионного канала (ASIC): физическое картирование, геномная организация и оценка как кандидата на пароксизмальную дистонию» . Евро. Дж. Хум. Жене . 9 (9): 672–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200699 . ПМИД 11571555 .

[8] Бабински К., Катарси С., Бьяджини Дж., Сегела П. (сентябрь 2000 г.). «Субъединицы ASIC2a и ASIC3 млекопитающих совместно собираются в гетеромерные протон-зависимые каналы, чувствительные к Gd3+» . Журнал биологической химии . 275 (37): 28519–25. дои : 10.1074/jbc.M004114200 . hdl : 11380/304669 . ПМИД 10842183 .

[2016-Hanukoglu-9] Ханукоглу I, Ханукоглу А (январь 2016 г.). «Семейство эпителиальных натриевых каналов (ENaC): филогения, структура-функция, распределение в тканях и связанные с ними наследственные заболевания» . Джин . 579 (2): 95–132. дои : 10.1016/j.gene.2015.12.061 . ПМЦ 4756657 . ПМИД 26772908 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]