CLIC1

CLIC1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1K0M, 1K0N, 1K0O, 1RK4, 3O3T, 3P8W, 3P90, 3QR6, 3SWL, 3TGZ, 3UVH, 4IQA, 4JZQ, 4K0G, 4K0N
Идентификаторы
Псевдонимы	CLIC1 , G6, NCC27, хлоридный внутриклеточный канал 1, CL1C1, CLCNL1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602872 ; МГИ : 2148924 ; Гомологен : 20343 ; GeneCards : CLIC1 ; OMA : CLIC1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p21.33 Start 31,730,581 bp End 31,739,763 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17 B1|17 18.58 cM Start 35,268,942 bp End 35,277,725 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in granulocyte blood monocyte mucosa of transverse colon rectum gallbladder islet of Langerhans olfactory zone of nasal mucosa placenta right lung Top expressed in corneal stroma granulocyte superior surface of tongue thymus endothelial cell of lymphatic vessel pyloric antrum lip mucous cell of stomach dermis cervix More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function voltage-gated ion channel activity protein binding chloride channel activity cadherin binding glutathione transferase activity Cellular component cytoplasm integral component of membrane vesicle nuclear membrane blood microparticle nuclear envelope membrane plasma membrane chloride channel complex mitochondrion brush border perinuclear region of cytoplasm extracellular exosome nucleus extracellular space Biological process regulation of ion transmembrane transport ion transport regulation of cell cycle regulation of mitochondrial membrane potential positive regulation of osteoblast differentiation chloride transport platelet aggregation signal transduction chloride transmembrane transport glutathione metabolic process transport Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 1192 114584 Вместе показывать ENSG00000213719 ENSG00000223639 ENSG00000226248 ENSG00000226651 ENSG00000226417 ENSG00000230685 ENSG00000206394 ENSMUSG00000007041 ЮниПрот О00299 Q9Z1Q5 RefSeq (мРНК) НМ_001288 НМ_001287593 НМ_001287594 НМ_033444 RefSeq (белок) НП_001274522 НП_001274523 НП_001279 НП_254279 Местоположение (UCSC) Chr 6: 31,73 – 31,74 Мб Чр 17: 35,27 – 35,28 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок 1 хлоридных внутриклеточных каналов — это белок , который у человека кодируется CLIC1 геном .

Хлоридные каналы представляют собой разнообразную группу белков, которые регулируют фундаментальные клеточные процессы, включая стабилизацию потенциала клеточной мембраны, трансэпителиальный транспорт, поддержание внутриклеточного pH и регуляцию объема клетки. Хлоридный внутриклеточный канал 1 является членом семейства p64; белок локализуется преимущественно в клеточном ядре и проявляет активность хлорид-ионного канала как в ядерной, так и в плазматической мембране.

Взаимодействия

Было показано, что CLIC1 взаимодействует с TRAPPC2 .

См. также

• Хлоридный канал

Дальнейшее чтение

• Сингх Х (2010). «Два десятилетия с диморфными хлоридными внутриклеточными каналами (CLIC)». Письма ФЭБС . 584 (10): 2112–21. Бибкод : 2010FEBSL.584.2112S . дои : 10.1016/j.febslet.2010.03.013 . ПМИД   20226783 . S2CID   21056278 .
• Окубо К., Хори Н., Матоба Р. и др. (1994). «Крупномасштабное секвенирование кДНК для анализа количественных и качественных аспектов экспрессии генов». Нат. Жене . 2 (3): 173–9. дои : 10.1038/ng1192-173 . ПМИД   1345164 . S2CID   35309579 .
• Фриджерио Х.М., Бертезен П., Гарридо П. и др. (1995). «Анализ 2166 клонов из библиотеки кДНК колоректального рака человека путем частичного секвенирования». Хм. Мол. Жене . 4 (1): 37–43. дои : 10.1093/hmg/4.1.37 . ПМИД   7711732 .
• Сингх Х, Эшли Р.Х. (2006). «Окислительно-восстановительная регуляция CLIC1 с помощью остатков цистеина, связанных с предполагаемой порой канала» . Биофиз. Дж . 90 (5): 1628–1638. Бибкод : 2006BpJ....90.1628S . дои : 10.1529/biophysj.105.072678 . ПМЦ   1367314 . ПМИД   16339885 .
• Лью CC, Хван Д.М., Фунг Ю.В. и др. (1994). «Каталог генов сердечно-сосудистой системы, идентифицированных по выраженным меткам последовательностей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (22): 10645–9. Бибкод : 1994PNAS...9110645L . дои : 10.1073/pnas.91.22.10645 . ПМК   45078 . ПМИД   7938007 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Хейсс Н.С., Пустка А (1997). «Геномная структура нового гена хлоридного канала, CLIC2, в Xq28». Геномика . 45 (1): 224–8. дои : 10.1006/geno.1997.4922 . ПМИД   9339381 .
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Тулк Б.М., Эдвардс Дж.К. (1998). «NCC27, гомолог внутриклеточного Cl ⁻ канал p64 экспрессируется в щеточной кайме проксимальных канальцев почек» . Am. J. Physiol . 274 (6 Pt 2): F1140–9. : 10.1152 /ajprenal.1998.274.6.F1140 . PMID   9841507. doi S2CID   39652235 .
• Чуанг Дж. З., Милнер Т. А., Чжу М, Сун Ч. (1999). «Внутриклеточный хлоридный канал p64H1 массой 29 кДа связан с большими везикулами с плотным ядром в нейронах гиппокампа крысы» . Дж. Нейроски . 19 (8): 2919–28. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-08-02919.1999 . ПМЦ   6782274 . ПМИД   10191309 .
• Рибас Г., Невилл М., Виксон Дж.Л. и др. (1999). «Гены, кодирующие трех новых членов суперсемейства лейкоцитарного антигена 6 и нового члена суперсемейства Ig, вместе с генами, кодирующими регуляторный белок ядерного хлорид-ионного канала (hRNCC) и гомолог N омега-N омега-диметиларгинин диметиламиногидролазы, обнаружены в Сегмент 30 КБ региона MHC класса III". Дж. Иммунол . 163 (1): 278–87. дои : 10.4049/jimmunol.163.1.278 . ПМИД   10384126 .
• Берриман М., Бретчер А. (2000). «Идентификация нового члена семейства генов хлоридных внутриклеточных каналов (CLIC5), который связан с актиновым цитоскелетом плацентарных микроворсинок» . Мол. Биол. Клетка . 11 (5): 1509–21. дои : 10.1091/mbc.11.5.1509 . ПМК   14863 . ПМИД   10793131 .
• Тонини Р., Феррони А., Валенсуэла С.М. и др. (2000). «Функциональная характеристика ядерного белка NCC27 в стабильных трансфицированных клетках CHO-K1» . ФАСЕБ Дж . 14 (9): 1171–8. дои : 10.1096/fasebj.14.9.1171 . ПМИД   10834939 . S2CID   30652670 .
• Валенсуэла С.М., Маццанти М., Тонини Р. и др. (2001). «Ядерный хлорид-ионный канал NCC27 участвует в регуляции клеточного цикла» . Дж. Физиол . 529 (3): 541–52. дои : 10.1111/j.1469-7793.2000.00541.x . ПМК   2270212 . ПМИД   11195932 .
• Харроп С.Дж., ДеМэр М.З., Фэрли В.Д. и др. (2002). «Кристаллическая структура растворимой формы внутриклеточного хлорид-ионного канала CLIC1 (NCC27) с разрешением 1,4 А» . Ж. Биол. Хим . 276 (48): 44993–5000. дои : 10.1074/jbc.M107804200 . ПМИД   11551966 .
• Уортон К., Тонини Р., Фэрли В.Д. и др. (2002). «Рекомбинантный CLIC1 (NCC27) собирается в липидные бислои посредством pH-зависимого двухуровневого процесса с образованием каналов хлорид-ионов с идентичными характеристиками тем, которые наблюдаются в клетках яичника китайского хомячка, экспрессирующих CLIC1» . Ж. Биол. Хим . 277 (29): 26003–11. дои : 10.1074/jbc.M203666200 . ПМИД   11978800 .
• Шанкс Р.А., Ларокка М.К., Берриман М. и др. (2002). «AKAP350 в аппарате Гольджи. II. Ассоциация AKAP350 с новым членом семейства хлоридных внутриклеточных каналов (CLIC)» . Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40973–80. дои : 10.1074/jbc.M112277200 . ПМИД   12163479 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Фань Л, Ю В, Чжу Икс (2003). «Взаимодействие Седлина с белками хлоридных внутриклеточных каналов» . ФЭБС Летт . 540 (1–3): 77–80. Бибкод : 2003FEBSL.540...77F . дои : 10.1016/S0014-5793(03)00228-X . ПМИД   12681486 . S2CID   8573651 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Литтлер Д.Р., Харроп С.Дж., Фэрли В.Д. и др. (2004). «Внутриклеточный белок хлорид-ионного канала CLIC1 претерпевает окислительно-восстановительный структурный переход» . Ж. Биол. Хим . 279 (10): 9298–305. дои : 10.1074/jbc.M308444200 . ПМИД   14613939 .
• Сингх Х, двоюродный брат М.А., Эшли Р.Х. (2007). «Функциональное восстановление «хлоридных внутриклеточных каналов» млекопитающих CLIC1, CLIC4 и CLIC5 обнаруживает дифференциальную регуляцию цитоскелетным актином». ФЕБС Дж . 274 (24): 6306–6316. дои : 10.1111/j.1742-4658.2007.06145.x . ПМИД   18028448 . S2CID   22494250 .

Внешние ссылки

• CLIC1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• человека Местоположение генома CLIC1 и страница сведений о гене CLIC1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .