КЦНИП4

КЦНИП4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3DD4
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNIP4 , CALP, KCHIP4, белок 4, взаимодействующий с калиевым потенциалзависимым каналом
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608182 ; МГИ : 1933131 ; Гомологен : 23528 ; Генные карты : KCNIP4 ; OMA : KCNIP4 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	21,948,772 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	49,524,907 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	lateral nuclear group of thalamus; ; middle temporal gyrus; ; pons; ; cerebellar vermis; ; Brodmann area 23; ; superior frontal gyrus; ; parietal lobe; ; superior vestibular nucleus; ; postcentral gyrus; ; ventral tegmental area;
	Top expressed in
	medial dorsal nucleus; ; lobe of cerebellum; ; medial geniculate nucleus; ; cerebellar vermis; ; medial vestibular nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; ventral tegmental area; ; supraoptic nucleus; ; mammillary body; ; superior colliculus;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	calcium ion binding; potassium channel regulator activity; potassium channel activity; voltage-gated ion channel activity; metal ion binding; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; voltage-gated potassium channel complex; plasma membrane; endoplasmic reticulum; membrane;
Biological process	potassium ion transport; regulation of ion transmembrane transport; protein localization to plasma membrane; ion transport; regulation of potassium ion transmembrane transport; potassium ion transmembrane transport; cardiac conduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	80333
	80334
	ENSG00000185774 ; ENSG00000281758
	ENSMUSG00000029088
	Q6PIL6
	Q6PHZ8
показывать НМ_001035003 ; НМ_001035004 ; НМ_025221 ; НМ_147181 ; НМ_147182 ;
	NM_147183; NM_001363504
	НМ_001199242 ; НМ_001199243 ; НМ_001199244 ; НМ_001199245 ; НМ_030265
показывать НП_001030175 ; НП_001030176 ; НП_079497 ; НП_671710 ; НП_671711 ;
	NP_671712; NP_001350433
	НП_001186171 ; НП_001186172 ; НП_001186173 ; НП_001186174 ; НП_084541
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 4, взаимодействующий с Kv-каналами, представляет собой белок , который у человека кодируется KCNIP4 геном . ^[5]^[6]^[7]

Этот ген кодирует члена семейства белков, взаимодействующих с потенциал-управляемыми калиевыми (Kv) каналами (KCNIP), которые принадлежат к регенериновой ветви суперсемейства EF-hand. ^[8] Члены семейства KCNIP представляют собой небольшие кальцийсвязывающие белки. Все они имеют домены, подобные EF-hand, и отличаются друг от друга N-концом . Они являются неотъемлемыми компонентами субъединиц нативных комплексов каналов Kv4. Они могут регулировать токи А-типа и, следовательно, возбудимость нейронов в ответ на изменения внутриклеточного кальция. Этот белок-член также взаимодействует с пресенилином. Для этого гена было идентифицировано множество вариантов альтернативно сплайсированных транскриптов, кодирующих различные изоформы. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что KCNIP4 взаимодействует с PSEN2 . ^[6]

См. также

Потенциал-управляемый калиевый канал

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000281758 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000185774, ENSG00000281758 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029088 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Холмквист М.Х., Као Дж., Эрнандес-Пинеда Р., Джейкобсон М.Д., Кэрролл К.И., Сунг М.А., Бетти М., Ге П., Гилбрайд К.Дж., Браун М.Е., Джурман М.Э., Лоусон Д., Силос-Сантьяго I, Се Ю, Коваррубиас М., Роудс К.Дж., Дистефано П.С., Ан ВФ (январь 2002 г.). «Устранение быстрой инактивации в калиевых каналах Kv4 A-типа с помощью домена вспомогательной субъединицы» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (2): 1035–40. Бибкод : 2002PNAS...99.1035H . дои : 10.1073/pnas.022509299 . ПМЦ 117799 . ПМИД 11805342 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Морохаси Ю., Хатано Н., Охья С., Такикава Р., Ватабики Т., Такасуги Н., Имаидзуми Ю., Томита Т., Ивацубо Т. (апрель 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика CALP/KChIP4, нового белка EF-hand, взаимодействующего с пресенилином 2 и субъединицей потенциалзависимого калиевого канала Kv4» . J Биол Хим . 277 (17): 14965–75. дои : 10.1074/jbc.M200897200 . ПМИД 11847232 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4, взаимодействующий с каналом KCNIP4 Kv» .
^ Бургойн Р.Д. (2007). «Нейрональные белки-сенсоры кальция: создание разнообразия в передаче сигналов Ca2+ в нейронах» . Нат. Преподобный Нейроски . 8 (3): 182–193. дои : 10.1038/nrn2093 . ПМЦ 1887812 . ПМИД 17311005 .

Дальнейшее чтение

Штраусберг Р.Л.; Фейнгольд Э.А.; тетерев ЛХ; и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Линь Ю.Л., Линь С.Р., Ву Т.Т., Чанг Л.С. (2004). «Доказательства, показывающие межмолекулярное взаимодействие между белками KChIP и кардиотоксинами тайваньской кобры». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 319 (3): 720–4. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.05.064 . ПМИД 15184042 .
Герхард Д.С.; Вагнер Л; Фейнгольд Э.А.; и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Хиллер Л.В.; Грейвс Т.А.; Фултон РС; и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Пруунсилд П., Тиммуск Т. (2005). «Структура, альтернативный сплайсинг и экспрессия семейства генов KCNIP человека и мыши». Геномика . 86 (5): 581–93. дои : 10.1016/j.ygeno.2005.07.001 . ПМИД 16112838 .
Чен КП, Ли Л, Чанг ЛС (2007). «Влияние металлосвязывающих свойств белков, взаимодействующих с Kv-каналом человека, на их молекулярную структуру и связывание с каналом Kv4.2». Протеин Дж . 25 (5): 345–51. дои : 10.1007/s10930-006-9020-9 . ПМИД 16951992 . S2CID 43400673 .
Юинг Р.М.; Чу П; Элизма Ф; и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ЧВК 1847948 . ПМИД 17353931 .
Бонн А; Вриде Л; Койпер РП; и др. (2008). «Картирование конституционных точек останова транслокации у пациентов с почечно-клеточным раком: идентификация KCNIP4 как гена-кандидата». Рак Генет. Цитогенет . 179 (1): 11–8. doi : 10.1016/j.cancergencyto.2007.07.005 . ПМИД 17981209 .

Внешние ссылки

KCNIP4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000281758 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000185774, ENSG00000281758 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029088 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11805342-5] Холмквист М.Х., Као Дж., Эрнандес-Пинеда Р., Джейкобсон М.Д., Кэрролл К.И., Сунг М.А., Бетти М., Ге П., Гилбрайд К.Дж., Браун М.Е., Джурман М.Э., Лоусон Д., Силос-Сантьяго I, Се Ю, Коваррубиас М., Роудс К.Дж., Дистефано П.С., Ан ВФ (январь 2002 г.). «Устранение быстрой инактивации в калиевых каналах Kv4 A-типа с помощью домена вспомогательной субъединицы» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (2): 1035–40. Бибкод : 2002PNAS...99.1035H . дои : 10.1073/pnas.022509299 . ПМЦ 117799 . ПМИД 11805342 .

[pmid11847232-6] Перейти обратно: ^а ^б Морохаси Ю., Хатано Н., Охья С., Такикава Р., Ватабики Т., Такасуги Н., Имаидзуми Ю., Томита Т., Ивацубо Т. (апрель 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика CALP/KChIP4, нового белка EF-hand, взаимодействующего с пресенилином 2 и субъединицей потенциалзависимого калиевого канала Kv4» . J Биол Хим . 277 (17): 14965–75. дои : 10.1074/jbc.M200897200 . ПМИД 11847232 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4, взаимодействующий с каналом KCNIP4 Kv» .

[pmid17311005-8] Бургойн Р.Д. (2007). «Нейрональные белки-сенсоры кальция: создание разнообразия в передаче сигналов Ca2+ в нейронах» . Нат. Преподобный Нейроски . 8 (3): 182–193. дои : 10.1038/nrn2093 . ПМЦ 1887812 . ПМИД 17311005 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]