ТКПН1

ТКПН1
Идентификаторы
Псевдонимы	TPCN1 , TPC1, канал с двумя сегментами пор 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 609666 ; МГИ : 2182472 ; Гомологен : 9905 ; Генные карты : TPCN1 ; OMA : TPCN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	113,298,585 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	120,726,738 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; gastric mucosa; ; apex of heart; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; body of pancreas; ; left adrenal cortex; ; left ovary;
	Top expressed in
	lacrimal gland; ; saccule; ; otic vesicle; ; yolk sac; ; aortic valve; ; ankle; ; intestinal villus; ; molar; ; ascending aorta; ; submandibular gland;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	calcium channel activity; voltage-gated ion channel activity; ion channel activity; protein binding; identical protein binding; NAADP-sensitive calcium-release channel activity; voltage-gated calcium channel activity; calcium activated cation channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; endosome; membrane; plasma membrane; lysosomal membrane; lysosome; endosome membrane; CatSper complex;
Biological process	membrane depolarization during action potential; positive regulation of autophagy; regulation of ion transmembrane transport; ion transport; ion transmembrane transport; calcium ion transmembrane transport; calcium ion transport; transmembrane transport; release of sequestered calcium ion into cytosol; flagellated sperm motility;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	53373
	252972
	ENSG00000186815
	ENSMUSG00000032741
	Q9ULQ1
	Q9EQJ0
	НМ_001143819 ; НМ_001301214 ; НМ_017901 ; НМ_001351346 ; НМ_001351347
	НМ_145853
	НП_001137291 ; НП_001288143 ; НП_060371 ; НП_001338275 ; НП_001338276
	НП_665852
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Канал 1 с двумя сегментами пор ( TPC1 ) представляет собой человеческий белок, кодируемый TPCN1 геном . ^[5] Белок, кодируемый этим геном, является ионным каналом . В отличие от других кальциевых и натриевых каналов , которые имеют четыре гомологичных домена, каждый из которых содержит шесть трансмембранных сегментов (от S1 до S6), TPCN1 содержит только два домена (каждый содержит сегменты от S1 до S6). ^[6]^[7]^[8]

Структура

Структура ортолога TPC1 Arabidopsis thaliana была расшифрована двумя лабораториями. ^[9]^[10] Структуры были решены с помощью рентгеновской кристаллографии и содержали складку потенциалзависимого ионного канала и руки EF . По-видимому, за измерение напряжения отвечает только один домен датчика напряжения.

Филовирусные инфекции

Эксперименты по генетическому нокауту и фармакологическому ингибированию показывают, что двухпоровые каналы , TPC1 и TPC2 филовирусами Эбола и Марбург . , необходимы для заражения мышей ^[11]

См. также

Двухпоровый канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186815 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032741 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: двухпоровый сегментный канал 1» .
^ Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК из мозга человека» . Исследование ДНК . 6 (5): 329–36. дои : 10.1093/dnares/6.5.329 . ПМИД 10574461 .
^ Ишибаси К., Сузуки М., Имаи М. (апрель 2000 г.). «Молекулярное клонирование новой формы (двухповторного) белка, связанного с потенциалзависимыми натриевыми и кальциевыми каналами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 270 (2): 370–6. дои : 10.1006/bbrc.2000.2435 . ПМИД 10753632 .
^ Клэпхэм Д.Э., Гарберс Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. Л. Номенклатура и структурно-функциональные связи CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 451–4. дои : 10.1124/пр.57.4.7 . ПМИД 16382101 . S2CID 35096827 .
^ Го Дж, Цзэн В, Чен Ц, Ли С, Чен Л, Ян Ю, Цан С, Жэнь Д, Цзян Ю (март 2016 г.). «Структура потенциалзависимого двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 196–201. Бибкод : 2016Natur.531..196G . дои : 10.1038/nature16446 . ПМЦ 4841471 . ПМИД 26689363 .
^ Кинтцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 258–62. Бибкод : 2016Natur.531..258K . дои : 10.1038/nature17194 . ПМЦ 4863712 . ПМИД 26961658 .
^ Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.С., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм С., Валь-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпоровые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетку-хозяина и являются мишенями для лечения заболеваний» . Наука . 347 (6225): 995–8. дои : 10.1126/science.1258758 . ПМК 4550587 . ПМИД 25722412 .

Дальнейшее чтение

Ишибаси К., Сузуки М., Имаи М. (апрель 2000 г.). «Молекулярное клонирование новой формы (двухповторного) белка, связанного с потенциалзависимыми натриевыми и кальциевыми каналами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 270 (2): 370–6. дои : 10.1006/bbrc.2000.2435 . ПМИД 10753632 .
Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК из мозга человека» . Исследование ДНК . 6 (5): 329–36. дои : 10.1093/dnares/6.5.329 . ПМИД 10574461 .
Клэпхэм Д.Э., Гарберс Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. Л. Номенклатура и структурно-функциональные связи CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 451–4. дои : 10.1124/пр.57.4.7 . ПМИД 16382101 . S2CID 35096827 .
Калкрафт П.Дж., Руас М., Пан З., Ченг Х., Арредуани А., Хао Х., Тан Дж., Ритдорф К., Тебул Л., Чуанг К.Т., Линь П., Сяо Р., Ван С., Чжу Ю., Линь Ю., Вятт К.Н., Паррингтон Дж. , Ма Дж., Эванс А.М., Галион А., Чжу М.Х. (май 2009 г.). «NAADP мобилизует кальций из кислых органелл через двухпоровые каналы» . Природа . 459 (7246): 596–600. Бибкод : 2009Natur.459..596C . дои : 10.1038/nature08030 . ПМЦ 2761823 . ПМИД 19387438 .
Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». Исследование ДНК . 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .

Внешние ссылки

TPCN1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186815 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032741 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Энтрез Ген: двухпоровый сегментный канал 1» .

[pmid10574461-6] Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Характеристика клонов кДНК, выбранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК из мозга человека» . Исследование ДНК . 6 (5): 329–36. дои : 10.1093/dnares/6.5.329 . ПМИД 10574461 .

[pmid10753632-7] Ишибаси К., Сузуки М., Имаи М. (апрель 2000 г.). «Молекулярное клонирование новой формы (двухповторного) белка, связанного с потенциалзависимыми натриевыми и кальциевыми каналами». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 270 (2): 370–6. дои : 10.1006/bbrc.2000.2435 . ПМИД 10753632 .

[pmid16382101-8] Клэпхэм Д.Э., Гарберс Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. Л. Номенклатура и структурно-функциональные связи CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 451–4. дои : 10.1124/пр.57.4.7 . ПМИД 16382101 . S2CID 35096827 .

[9] Го Дж, Цзэн В, Чен Ц, Ли С, Чен Л, Ян Ю, Цан С, Жэнь Д, Цзян Ю (март 2016 г.). «Структура потенциалзависимого двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 196–201. Бибкод : 2016Natur.531..196G . дои : 10.1038/nature16446 . ПМЦ 4841471 . ПМИД 26689363 .

[10] Кинтцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 258–62. Бибкод : 2016Natur.531..258K . дои : 10.1038/nature17194 . ПМЦ 4863712 . ПМИД 26961658 .

[11] Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.С., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм С., Валь-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпоровые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетку-хозяина и являются мишенями для лечения заболеваний» . Наука . 347 (6225): 995–8. дои : 10.1126/science.1258758 . ПМК 4550587 . ПМИД 25722412 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]