KCNA4

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Тандемный домен инактивации калиевого канала Kv1.4
Тандемный домен инактивации калиевого канала Kv1.4
	структура раствора тандемного домена инактивации (остатки 1-75) калиевого канала rck4 (kv1.4)
Идентификаторы
Символ	K_channel_TIME
Пфам	PF07941
ИнтерПро	ИПР012897
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1кн7 / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

KCNA4
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNA4 , HBK4, HK1, HPCN2, HUKII, KCNA4L, KCNA8, KV1.4, PCN2, подсемейство A потенциалзависимых калиевых каналов, член 4, MCIDDS
Внешние идентификаторы	Опустить : 176266 ; МГИ : 96661 ; Гомологен : 20514 ; Генные карты : KCNA4 ; OMA : KCNA4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	30,017,030 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	107,128,847 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	nucleus accumbens; ; secondary oocyte; ; caudate nucleus; ; left adrenal cortex; ; putamen; ; prefrontal cortex; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; ventricular zone; ; paraflocculus of cerebellum;
	Top expressed in
	nucleus accumbens; ; lumbar spinal ganglion; ; medial geniculate nucleus; ; medial dorsal nucleus; ; lateral geniculate nucleus; ; olfactory tubercle; ; substantia nigra; ; globus pallidus; ; mammillary body; ; supraoptic nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	potassium channel activity; potassium ion binding; voltage-gated ion channel activity; ion channel activity; protein binding; voltage-gated potassium channel activity; delayed rectifier potassium channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; cell projection; membrane; voltage-gated potassium channel complex; plasma membrane; axon; integral component of plasma membrane; dendritic spine;
Biological process	regulation of ion transmembrane transport; ion transport; potassium ion transport; transmembrane transport; potassium ion transmembrane transport; protein homooligomerization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3739
	16492
	ENSG00000182255
	ENSMUSG00000042604
	P22459
	Q61423
	НМ_002233
	НМ_021275
	НП_002224
	НП_067250
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Член 4 подсемейства калиевых потенциалзависимых каналов, также известный как K _v 1.4, представляет собой белок , который у людей кодируется KCNA4 геном . ^[5]^[6]^[7] Он способствует кардиальному транзиторному внешнему току калия (I _to1 ), основному току, способствующему фазе реполяризации 1 сердечного потенциала действия . ^[8]

Описание

Калиевые каналы представляют собой наиболее сложный класс потенциал-управляемых ионных каналов как с функциональной, так и со структурной точки зрения. Их разнообразные функции включают регулирование высвобождения нейромедиаторов, частоты сердечных сокращений, секреции инсулина, возбудимости нейронов, транспорта эпителиальных электролитов, сокращения гладких мышц и объема клеток. У дрозофилы были идентифицированы четыре связанных с последовательностью гена калиевых каналов - шейкер, shaw, shab и shal, и было показано, что каждый из них имеет гомолог(ы) человека. Этот ген кодирует члена подсемейства калиевых каналов, потенциалзависимых и шейкерных. Этот член содержит шесть трансмембранных доменов с повтором шейкерного типа в четвертом сегменте. Он принадлежит к классу калиевых токов А-типа, члены которого могут играть важную роль в регуляции фазы быстрой реполяризации потенциалов действия в сердце и, таким образом, могут влиять на продолжительность сердечного потенциала действия. Кодирующая область этого гена не имеет интрона, и ген кластерен с генами KCNA3 и KCNA10 на хромосоме 1 у человека. ^[7]

KCNA4 (Kv1.4) содержит тандемный домен инактивации на N-конце . Он состоит из двух поддоменов. Домен инактивации 1 (ID1, остатки 1–38) состоит из гибкого N-конца, закрепленного на 5-витковой спирали , и, как полагают, действует, перекрывая путь иона, как в случае с классическим шаровым доменом. Домен инактивации 2 (ID2, остатки 40-50) представляет собой 2,5-витковую спираль с высокой долей гидрофобных остатков, которая, вероятно, служит для прикрепления ID1 к цитоплазматической поверхности канала. Таким образом, это может способствовать быстрому доступу ID1 к рецепторному участку в открытом канале. ID1 и ID2 функционируют вместе, вызывая быструю инактивацию канала Kv1.4, что важно для роли канала в краткосрочной пластичности. ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что KCNA4 взаимодействует с DLG4 . ^[10]^[11]^[12]^[13] ЦТАК2 ^[14] и DLG1 . ^[10]^[12]^[15]

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182255 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042604 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Филипсон Л.Х., Шефер К., ЛаМендола Дж., Белл Г.И., Штайнер Д.Ф. (декабрь 1990 г.). «Последовательность кДНК калиевого канала скелетных мышц плода человека, связанная с RCK4» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (23): 7160. doi : 10.1093/nar/18.23.7160 . ПМК 332806 . ПМИД 2263489 .
^ Гутман Г.А., Чанди К.Г., Гриссмер С., Лаздунски М., Маккиннон Д., Пардо Л.А. и др. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные взаимоотношения потенциалзависимых калиевых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 473–508. дои : 10.1124/пр.57.4.10 . ПМИД 16382104 . S2CID 219195192 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: калиевый потенциалзависимый канал KCNA4, подсемейство, связанное с шейкером, член 4» .
^ Оудит Г.И., Кассири З., Сах Р., Рамирес Р.Дж., Зобель С., Баккс П.Х. (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного внешнего тока калия (I (к)) в нормальном и больном миокарде». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 33 (5): 851–72. дои : 10.1006/jmcc.2001.1376 . ПМИД 11343410 . S2CID 829154 .
^ Виссманн Р., Билдл В., Оливер Д., Бейерманн М., Кальбитцер Х.Р., Бентроп Д., Факлер Б. (май 2003 г.). «Структура раствора и функция «тандемного домена инактивации» калиевого канала А-типа нейронов Kv1.4» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16142–50. дои : 10.1074/jbc.M210191200 . ПМИД 12590144 .
^ Jump up to: ^а ^б Инанобе А., Фудзита А., Ито М., Томойке Х., Инагэда К., Курачи Ю. (июнь 2002 г.). «Внутренний выпрямительный К+-канал Kir2.3 локализован на постсинаптической мембране возбуждающих синапсов». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 282 (6): C1396-403. doi : 10.1152/ajpcell.00615.2001 . ПМИД 11997254 .
^ Нитхаммер М., Вальшанов Дж.Г., Капур Т.М., Эллисон Д.В., Вайнберг Р.Дж., Крейг А.М., Шэн М. (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95/SAP90» . Нейрон . 20 (4): 693–707. дои : 10.1016/S0896-6273(00)81009-0 . ПМИД 9581762 . S2CID 16068361 .
^ Jump up to: ^а ^б Ким Э, Шэн М (1996). «Дифференциальная кластерная активность K+-каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембранассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология . 35 (7): 993–1000. дои : 10.1016/0028-3908(96)00093-7 . ПМИД 8938729 . S2CID 23755452 .
^ Элдстрем Дж., Дорксен К.В., Стил Д.Ф., Федида Д. (ноябрь 2002 г.). «N-концевой PDZ-связывающий домен в калиевых каналах Kv1» . Письма ФЭБС . 531 (3): 529–37. Бибкод : 2002FEBSL.531..529E . дои : 10.1016/S0014-5793(02)03572-X . ПМИД 12435606 . S2CID 40689829 .
^ Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж.О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека» . Журнал нейрохимии . 73 (2): 849–58. дои : 10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x . ПМИД 10428084 . S2CID 20632070 .
^ Элдстрем Дж., Чой В.С., Стил Д.Ф., Федида Д. (июль 2003 г.). «SAP97 увеличивает токи Kv1.5 посредством непрямого N-концевого механизма» . Письма ФЭБС . 547 (1–3): 205–11. Бибкод : 2003FEBSL.547..205E . дои : 10.1016/S0014-5793(03)00668-9 . ПМИД 12860415 . S2CID 34857270 .

Дальнейшее чтение

Скотт Х.С., Литдженс Т., Хопвуд Дж.Дж., Моррис С.П. (ноябрь 1992 г.). «ПЦР-обнаружение двух ПДРФ в экзоне I гена альфа-L-идуронидазы (IDUA)». Генетика человека . 90 (3): 327. дои : 10.1007/bf00220095 . ПМИД 1362562 . S2CID 22700269 .
Гесслер М., Группа А, Гжещик К.Х., Понгс О. (ноябрь 1992 г.). «Ген калиевого канала HK1 картирован на хромосоме человека 11p14.1, близкой к гену FSHB» . Генетика человека . 90 (3): 319–21. дои : 10.1007/bf00220091 . ПМИД 1487251 . S2CID 10237322 .
Филипсон Л.Х., Хис Р.Э., Шефер К., ЛаМендола Дж., Белл Дж.И., Нельсон Д.Д., Штайнер Д.Ф. (январь 1991 г.). «Последовательность и функциональная экспрессия в ооцитах Xenopus инсулиномы человека и островкового калиевого канала» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (1): 53–7. Бибкод : 1991ПНАС...88...53П . дои : 10.1073/pnas.88.1.53 . ПМК 50746 . ПМИД 1986382 .
Тамкун М.М., Нот К.М., Уолбридж Дж.А., Кремер Х., Роден Д.М., Гловер Д.М. (март 1991 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика двух кДНК потенциал-управляемых K+-каналов из желудочка человека» . Журнал ФАСЭБ . 5 (3): 331–7. дои : 10.1096/fasebj.5.3.2001794 . ПМИД 2001794 . S2CID 23737559 .
Ким Э., Нитхаммер М., Ротшильд А., Ян Ю.Н., Шэн М. (ноябрь 1995 г.). «Кластеризация K+-каналов шейкерного типа путем взаимодействия с семейством мембранассоциированных гуанилаткиназ». Природа . 378 (6552): 85–8. Бибкод : 1995Natur.378...85K . дои : 10.1038/378085a0 . ПМИД 7477295 . S2CID 4362906 .
Клок Р., Робердс С.Л., Тамкун М.М., Гронемайер М., Огюстен А., Альбрехт Б. и др. (декабрь 1993 г.). «Хромосомное картирование у мышей восьми генов K (+)-каналов, представляющих четыре шейкер-подобных подсемейства Shaker, Shab, Shaw и Shal». Геномика . 18 (3): 568–74. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80358-1 . ПМИД 7905852 .
Филипсон Л.Х., Эдди Р.Л., Показывает ТБ, Белл Г.И. (февраль 1993 г.). «Присвоение гена калиевого канала человека KCNA4 (Kv1.4, PCN2) хромосоме 11q13.4 → q14.1». Геномика . 15 (2): 463–4. дои : 10.1006/geno.1993.1094 . ПМИД 8449523 .
Нитхаммер М., Ким Э., Шэн М. (апрель 1996 г.). «Взаимодействие между C-концом субъединиц рецептора NMDA и несколькими членами семейства PSD-95 мембранассоциированных гуанилаткиназ» . Журнал неврологии . 16 (7): 2157–63. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-07-02157.1996 . ПМК 6578538 . ПМИД 8601796 .
Ким Э, Шэн М (1997). «Дифференциальная кластерная активность K+-каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембранассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология . 35 (7): 993–1000. дои : 10.1016/0028-3908(96)00093-7 . ПМИД 8938729 . S2CID 23755452 .
Ким Э., Нэйсбитт С., Сюэ Ю.П., Рао А., Ротшильд А., Крейг А.М., Шэн М. (февраль 1997 г.). «GKAP, новый синаптический белок, который взаимодействует с гуанилаткиназоподобным доменом семейства молекул кластеризации каналов PSD-95/SAP90» . Журнал клеточной биологии . 136 (3): 669–78. дои : 10.1083/jcb.136.3.669 . ПМК 2134290 . ПМИД 9024696 .
Нитхаммер М., Вальшанов Дж.Г., Капур Т.М., Эллисон Д.В., Вайнберг Р.Дж., Крейг А.М., Шэн М. (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95/SAP90» . Нейрон . 20 (4): 693–707. дои : 10.1016/S0896-6273(00)81009-0 . ПМИД 9581762 . S2CID 16068361 .
Бренман Дж.Э., Топинка Дж.Р., Купер Э.К., МакГи А.В., Розен Дж., Милрой Т. и др. (ноябрь 1998 г.). «Локализация постсинаптической плотности-93 в дендритных микротрубочках и взаимодействие с белком 1А, связанным с микротрубочками» . Журнал неврологии . 18 (21): 8805–13. doi : 10.1523/JNEUROSCI.18-21-08805.1998 . ПМК 6793550 . ПМИД 9786987 .
Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж.О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека» . Журнал нейрохимии . 73 (2): 849–58. дои : 10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x . ПМИД 10428084 . S2CID 20632070 .
Д'Адамо MC, Имбричи П., Спончикетти Ф., Пессия М. (август 1999 г.). «Мутации в гене KCNA1, связанные с синдромом эпизодической атаксии типа 1, нарушают функцию гетеромерного потенциалзависимого K(+) канала» . Журнал ФАСЭБ . 13 (11): 1335–45. дои : 10.1096/fasebj.13.11.1335 . ПМИД 10428758 . S2CID 12876970 .
Хоган А., Шепард Л., Шабо Дж., Кенневиль С., Прескотт С.М., Топхэм М.К., Джи Ш. (июль 2001 г.). «Взаимодействие гамма-1-синтрофина с диацилглицеролкиназой-дзета. Регуляция ядерной локализации посредством взаимодействий PDZ» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26526–33. дои : 10.1074/jbc.M104156200 . ПМИД 11352924 .
Цукович Д., Лу Г.В., Вибл Б., Стил Д.Ф., Федида Д. (июнь 2001 г.). «Дискретный аминоконцевой домен калиевых каналов Kv1.5 и Kv1.4 взаимодействует со спектриновыми повторами альфа-актинина-2» . Письма ФЭБС . 498 (1): 87–92. Бибкод : 2001FEBSL.498...87C . дои : 10.1016/S0014-5793(01)02505-4 . ПМИД 11389904 . S2CID 20622483 .
Имамура Ф., Маэда С., Дои Т., Фудзиеси Ю. (февраль 2002 г.). «Связывание лиганда второго домена PDZ регулирует кластеризацию PSD-95 с калиевым каналом Kv1.4» . Журнал биологической химии . 277 (5): 3640–6. дои : 10.1074/jbc.M106940200 . ПМИД 11723117 .
Пизеркио А., Пеллегрини М., Мехта С., Блэкман С.М., Гарсия Э.П., Маршалл Дж., Мирке Д.Ф. (март 2002 г.). «Домен PDZ1 SAP90. Характеристика структуры и связывания» . Журнал биологической химии . 277 (9): 6967–73. дои : 10.1074/jbc.M109453200 . ПМИД 11744724 .

Внешние ссылки

Kv1.4+Калий+Канал в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
KCNA4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P15385 (член 4 подсемейства потенциалзависимых каналов крысиного калия, член 4) на PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR012897.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182255 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042604 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2263489-5] Филипсон Л.Х., Шефер К., ЛаМендола Дж., Белл Г.И., Штайнер Д.Ф. (декабрь 1990 г.). «Последовательность кДНК калиевого канала скелетных мышц плода человека, связанная с RCK4» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (23): 7160. doi : 10.1093/nar/18.23.7160 . ПМК 332806 . ПМИД 2263489 .

[pmid16382104-6] Гутман Г.А., Чанди К.Г., Гриссмер С., Лаздунски М., Маккиннон Д., Пардо Л.А. и др. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. LIII. Номенклатура и молекулярные взаимоотношения потенциалзависимых калиевых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 473–508. дои : 10.1124/пр.57.4.10 . ПМИД 16382104 . S2CID 219195192 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: калиевый потенциалзависимый канал KCNA4, подсемейство, связанное с шейкером, член 4» .

[oudit-8] Оудит Г.И., Кассири З., Сах Р., Рамирес Р.Дж., Зобель С., Баккс П.Х. (май 2001 г.). «Молекулярная физиология сердечного транзиторного внешнего тока калия (I (к)) в нормальном и больном миокарде». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии . 33 (5): 851–72. дои : 10.1006/jmcc.2001.1376 . ПМИД 11343410 . S2CID 829154 .

[pmid12590144-9] Виссманн Р., Билдл В., Оливер Д., Бейерманн М., Кальбитцер Х.Р., Бентроп Д., Факлер Б. (май 2003 г.). «Структура раствора и функция «тандемного домена инактивации» калиевого канала А-типа нейронов Kv1.4» . Журнал биологической химии . 278 (18): 16142–50. дои : 10.1074/jbc.M210191200 . ПМИД 12590144 .

[pmid11997254-10] Jump up to: ^а ^б Инанобе А., Фудзита А., Ито М., Томойке Х., Инагэда К., Курачи Ю. (июнь 2002 г.). «Внутренний выпрямительный К+-канал Kir2.3 локализован на постсинаптической мембране возбуждающих синапсов». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 282 (6): C1396-403. doi : 10.1152/ajpcell.00615.2001 . ПМИД 11997254 .

[pmid9581762-11] Нитхаммер М., Вальшанов Дж.Г., Капур Т.М., Эллисон Д.В., Вайнберг Р.Дж., Крейг А.М., Шэн М. (апрель 1998 г.). «CRIPT, новый постсинаптический белок, который связывается с третьим доменом PDZ PSD-95/SAP90» . Нейрон . 20 (4): 693–707. дои : 10.1016/S0896-6273(00)81009-0 . ПМИД 9581762 . S2CID 16068361 .

[pmid8938729-12] Jump up to: ^а ^б Ким Э, Шэн М (1996). «Дифференциальная кластерная активность K+-каналов PSD-95 и SAP97, двух родственных мембранассоциированных предполагаемых гуанилаткиназ». Нейрофармакология . 35 (7): 993–1000. дои : 10.1016/0028-3908(96)00093-7 . ПМИД 8938729 . S2CID 23755452 .

[pmid12435606-13] Элдстрем Дж., Дорксен К.В., Стил Д.Ф., Федида Д. (ноябрь 2002 г.). «N-концевой PDZ-связывающий домен в калиевых каналах Kv1» . Письма ФЭБС . 531 (3): 529–37. Бибкод : 2002FEBSL.531..529E . дои : 10.1016/S0014-5793(02)03572-X . ПМИД 12435606 . S2CID 40689829 .

[pmid10428084-14] Коулман С.К., Ньюкомб Дж., Прайк Дж., Долли Дж.О. (август 1999 г.). «Субъединичный состав каналов Kv1 в ЦНС человека» . Журнал нейрохимии . 73 (2): 849–58. дои : 10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x . ПМИД 10428084 . S2CID 20632070 .

[pmid12860415-15] Элдстрем Дж., Чой В.С., Стил Д.Ф., Федида Д. (июль 2003 г.). «SAP97 увеличивает токи Kv1.5 посредством непрямого N-концевого механизма» . Письма ФЭБС . 547 (1–3): 205–11. Бибкод : 2003FEBSL.547..205E . дои : 10.1016/S0014-5793(03)00668-9 . ПМИД 12860415 . S2CID 34857270 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]