КЦНИП1

КЦНИП1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1S1E, 2I2R, 2NZ0
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNIP1 , KCHIP1, VABP, белок 1, взаимодействующий с калиевым потенциалзависимым каналом
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604660 ; МГИ : 1917607 ; Гомологен : 22824 ; Генные карты : KCNIP1 ; OMA : KCNIP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q35.1 Start 170,353,487 bp End 170,736,632 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11|11 A4 Start 33,579,339 bp End 33,943,152 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in nucleus accumbens anterior cingulate cortex caudate nucleus amygdala right frontal lobe prefrontal cortex hypothalamus putamen testicle dorsolateral prefrontal cortex Top expressed in habenula dorsomedial hypothalamic nucleus lateral hypothalamus ventromedial nucleus superior colliculus lobe of cerebellum cerebellar vermis paraventricular nucleus of hypothalamus lateral septal nucleus islet of Langerhans More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function calcium ion binding potassium channel regulator activity potassium channel activity protein binding metal ion binding voltage-gated ion channel activity Cellular component cytoplasm extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane voltage-gated potassium channel complex plasma membrane cell projection dendrite membrane Biological process potassium ion transport regulation of ion transmembrane transport ion transport regulation of potassium ion transmembrane transport potassium ion transmembrane transport cardiac conduction Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 30820 70357 Вместе ENSG00000182132 ENSMUSG00000053519 ЮниПрот Q9NZI2 Q9JJ57 RefSeq (мРНК) НМ_001034837 НМ_001034838 НМ_001278339 НМ_001278340 НМ_014592 НМ_001190885 НМ_001190886 НМ_001290690 НМ_027398 НМ_001363115 RefSeq (белок) НП_001030009 НП_001030010 НП_001265268 НП_001265269 НП_055407 НП_001177814 НП_001177815 НП_001277619 НП_081674 НП_001350044 Местоположение (UCSC) Chr 5: 170,35 – 170,74 Мб Чр 11: 33,58 – 33,94 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Kv _- Белок 1, взаимодействующий с каналом, также известный как KChIP1, представляет собой белок , который у человека кодируется KCNIP1 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков, взаимодействующих с потенциал-управляемыми калиевыми ( ) _Kv каналами (KCNIP, также часто называемых «KChIP»), которые принадлежат к регенериновой ветви суперсемейства EF-hand . Члены семейства KCNIP представляют собой небольшие кальцийсвязывающие белки. Все они имеют домены, подобные EF-hand, и отличаются друг от друга N-концом . Они являются неотъемлемыми компонентами субъединиц нативных _{K v} комплексов каналов 4. Они могут регулировать токи А-типа и, следовательно, возбудимость нейронов в ответ на изменения внутриклеточного кальция. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множественных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.

См. также

• Потенциал-управляемый калиевый канал

Дальнейшее чтение

• Беринг Р., Данненберг Дж., Петерс Х.К. и др. (2001). «Консервативный N-концевой домен Kv4, критически важный для влияния белка 2.2, взаимодействующего с Kv-каналом, на экспрессию и ворота канала» . Ж. Биол. Хим . 276 (26): 23888–23894. дои : 10.1074/jbc.M101320200 . ПМИД   11287421 .
• Накамура Т., Нанди С., Паунтни Дж. и др. (2001). «Различные эффекты Ca(2+)-связывающего белка KChIP1 на двух членов подсемейства Kv4, Kv4.1 и Kv4.2» . ФЭБС Летт . 499 (3): 205–209. Бибкод : 2001FEBSL.499..205N . дои : 10.1016/S0014-5793(01)02560-1 . ПМИД   11423117 . S2CID   23908034 .
• Куценко А.С., Гизатуллин Р.З., Аль-Амин А.Н. и др. (2002). «Фланкирующие последовательности NotI: инструмент для открытия генов и проверки генома человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (14): 3163–3170. дои : 10.1093/nar/gkf428 . ПМК   135748 . ПМИД   12136098 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Шибата Р., Мисону Х., Кампоманес С.Р. и др. (2003). «Фундаментальная роль КЧИП в определении молекулярных свойств и транспортировке калиевых каналов Kv4.2» . Ж. Биол. Хим . 278 (38): 36445–36454. дои : 10.1074/jbc.M306142200 . ПМИД   12829703 .
• Ван Хурик Д., Раес А., Кейзерс В. и др. (2004). «Дифференциальная модуляция кинетики Kv4 с помощью вариантов сплайсинга KCHIP1». Мол. Клетка. Нейроски . 24 (2): 357–366. дои : 10.1016/S1044-7431(03)00174-X . ПМИД   14572458 . S2CID   40647616 .
• Сканневин Р.Х., Ван К., Джоу Ф. и др. (2004). «Два N-концевых домена K(+)-каналов Kv4 регулируют связывание и модуляцию KChIP1» . Нейрон . 41 (4): 587–598. дои : 10.1016/S0896-6273(04)00049-2 . ПМИД   14980207 . S2CID   17380435 .
• Линь Ю.Л., Линь С.Р., Ву Т.Т., Чанг Л.С. (2004). «Доказательства, показывающие межмолекулярное взаимодействие между белками KChIP и кардиотоксинами тайваньской кобры». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 319 (3): 720–724. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.05.064 . ПМИД   15184042 .
• Линь Ю.Л., Чен С.И., Ченг С.П., Чанг Л.С. (2004). «Белко-белковые взаимодействия белков КЧИП и Kv4.2». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 321 (3): 606–610. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.006 . ПМИД   15358149 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Пруунсилд П., Тиммуск Т. (2005). «Структура, альтернативный сплайсинг и экспрессия семейства генов KCNIP человека и мыши». Геномика . 86 (5): 581–593. дои : 10.1016/j.ygeno.2005.07.001 . ПМИД   16112838 .
• Пиолетти М., Финдайзен Ф., Хура Г.Л., Минор Д.Л. (2007). «Трехмерная структура комплекса KChIP1-Kv4.3 T1 обнаруживает крестообразный октамер» . Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (11): 987–995. дои : 10.1038/nsmb1164 . ПМК   3018330 . ПМИД   17057713 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
• Хасдемир Б., Фицджеральд DJ, Приор И.А., Тепикин А.В., Бургойн Р.Д. (2005). «Трафик Kv4 K+-каналов, опосредованный KChIP1, осуществляется через новый везикулярный путь после ER» . Дж. Клеточная Биол . 171 (3): 459–469. дои : 10.1083/jcb.200506005 . ПМК   2171252 . ПМИД   16260497 .
• Венн Н., Хейнс Л.П., Бургойн Р.Д. (2008). «Специфические эффекты KChIP3/кальсенилина/DREAM, но не KChIPs1, 2 и 4, на передачу сигналов кальция и регулируемую секрецию в клетках PC12» . Биохим. Дж . 413 (1): 71–80. дои : 10.1042/BJ20080441 . ПМЦ   2474559 . ПМИД   18393943 .

Внешние ссылки

• KCNIP1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .