ТКПН2

ТКПН2
Идентификаторы
Псевдонимы	TPCN2 , SHEP10, TPC2, канал с двумя сегментами пор 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 612163 ; МГИ : 2385297 ; Гомологен : 16375 ; Генные карты : TPCN2 ; OMA : TPCN2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	69,136,316 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	144,837,748 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; mucosa of ileum; ; gastric mucosa; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of uterus; ; monocyte; ; right hemisphere of cerebellum; ; tibialis anterior muscle; ; left uterine tube; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	granulocyte; ; inner renal medulla; ; stroma of bone marrow; ; lip; ; ventricular zone; ; spermatid; ; yolk sac; ; embryo; ; blastocyst; ; embryo;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	calcium channel activity; voltage-gated ion channel activity; ion channel activity; protein binding; identical protein binding; protein kinase binding; NAADP-sensitive calcium-release channel activity; voltage-gated calcium channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; endosome membrane; lysosome; lysosomal membrane;
Biological process	release of sequestered calcium ion into cytosol; membrane depolarization during action potential; response to vitamin D; regulation of ion transmembrane transport; cellular calcium ion homeostasis; ion transport; ion transmembrane transport; regulation of autophagy; calcium ion transmembrane transport; lysosome organization; calcium-mediated signaling; calcium ion transport; transmembrane transport; smooth muscle contraction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	219931
	233979
	ENSG00000162341
	ENSMUSG00000048677
	Q8NHX9
	Q8BWC0
	НМ_139075
	НМ_146206
	НП_620714
	НП_666318
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Канал 2 с двумя сегментами пор ( TPC2 ) представляет собой белок , который у человека кодируется TPCN2 геном . ^[5] TPC2 представляет собой ионный канал , однако, в отличие от других кальциевых и натриевых каналов , которые имеют четыре гомологичных домена, каждый из которых содержит 6 трансмембранных сегментов (от S1 до S6), TPCN1 содержит только два домена (каждый содержит сегменты от S1 до S6). ^[6]

Структура

TPC2 гомологичен TPC1, наиболее изученному члену семейства TPC. Структура ортолога TPC1 Arabidopsis thaliana была расшифрована двумя лабораториями. ^[7]^[8] Структуры были решены с помощью рентгеновской кристаллографии и содержали складку потенциалзависимого ионного канала и руки EF .

Филовирусные инфекции

Эксперименты по генетическому нокауту и фармакологическому ингибированию показывают, что двухпоровые каналы , TPC1 и TPC2 филовирусами Эбола и Марбург . , необходимы для заражения мышей ^[9]

См. также

Двухпоровый канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162341 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048677 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: двухпоровый сегментный канал 2» .
^ Клэпхэм Д.Э., Гарберс Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. Л. Номенклатура и структурно-функциональные связи CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 451–4. дои : 10.1124/пр.57.4.7 . ПМИД 16382101 . S2CID 35096827 .
^ Го Дж, Цзэн В, Чен Ц, Ли С, Чен Л, Ян Ю, Цан С, Жэнь Д, Цзян Ю (март 2016 г.). «Структура потенциалзависимого двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 196–201. Бибкод : 2016Natur.531..196G . дои : 10.1038/nature16446 . ПМЦ 4841471 . ПМИД 26689363 .
^ Кинтцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 258–62. Бибкод : 2016Natur.531..258K . дои : 10.1038/nature17194 . ПМЦ 4863712 . ПМИД 26961658 .
^ Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.С., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм С., Валь-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпоровые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетку-хозяина и являются мишенями для лечения заболеваний» . Наука . 347 (6225): 995–8. дои : 10.1126/science.1258758 . ПМК 4550587 . ПМИД 25722412 .

Дальнейшее чтение

Сулем П, Гудбьартссон Д.Ф., Стейси С.Н., Хельгасон А, Рафнар Т, Якобсдоттир М, Стейнберг С., Гудйонссон С.А., Палссон А, Торлейфссон Г, Палссон С, Сигургирссон Б, Торисдоттир К, Рагнарссон Р, Бенедиктсдоттир КР, Абен К.К., Вермюлен Ш.Х. , Гольдштейн А.М., Такер М.А., Кимени Л.А., Олафссон Дж.Х., Галчер Дж., Конг А., Торстейнсдоттир У., Стефанссон К. (июль 2008 г.). «Два недавно выявленных генетических детерминанта пигментации у европейцев». Природная генетика . 40 (7): 835–7. дои : 10.1038/ng.160 . ПМИД 18488028 . S2CID 13411482 .
Сузуки Ю, Ямасита Р, Широта М, Сакакибара Ю, Тиба Дж, Мидзусима-Сугано Дж, Накаи К, Сугано С (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК 515316 . ПМИД 15342556 .
Калкрафт П.Дж., Руас М., Пан З., Ченг Х., Арредуани А., Хао Х., Тан Дж., Ритдорф К., Тебул Л., Чуанг К.Т., Линь П., Сяо Р., Ван С., Чжу Ю., Линь Ю., Вятт К.Н., Паррингтон Дж. , Ма Дж., Эванс А.М., Галион А., Чжу М.Х. (май 2009 г.). «NAADP мобилизует кальций из кислых органелл через двухпоровые каналы» . Природа . 459 (7246): 596–600. Бибкод : 2009Natur.459..596C . дои : 10.1038/nature08030 . ПМЦ 2761823 . ПМИД 19387438 .
Тейлор Т.Д., Ногучи Х., Тотоки Ю., Тойода А., Куроки Ю., Дьюар К., Ллойд С., Ито Т., Такеда Т., Ким Д.В., Ше Икс, Барлоу К.Ф., Блум Т., Бруфорд Э., Чанг Дж.Л., Куомо К.А., Эйхлер Э. , Фитцджеральд М.Г., Джаффе Д.Б., ЛаБутти К., Никол Р., Парк Х.С., Симэн С., Суньез С., Ян Х, Циммер А.Р., Зоди М.К., Биррен Б.В., Нусбаум С., Фудзияма А., Хаттори М., Роджерс Дж., Лендер Э.С., Сакаки Ю (март 2006 г.). «Последовательность и анализ ДНК хромосомы 11 человека, включая идентификацию новых генов» . Природа . 440 (7083): 497–500. Бибкод : 2006Natur.440..497T . дои : 10.1038/nature04632 . ПМИД 16554811 .
Фу Г.К., Ван Дж.Т., Ян Дж., Ау-Янг Дж., Стув Л.Л. (июль 2004 г.). «Циркулярная быстрая амплификация концов кДНК для высокопроизводительного расширенного клонирования частичных генов». Геномика . 84 (1): 205–10. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . ПМИД 15203218 .

Внешние ссылки

TPCN2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162341 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048677 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Энтрез Ген: двухпоровый сегментный канал 2» .

[pmid16382101-6] Клэпхэм Д.Э., Гарберс Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. Л. Номенклатура и структурно-функциональные связи CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры . 57 (4): 451–4. дои : 10.1124/пр.57.4.7 . ПМИД 16382101 . S2CID 35096827 .

[7] Го Дж, Цзэн В, Чен Ц, Ли С, Чен Л, Ян Ю, Цан С, Жэнь Д, Цзян Ю (март 2016 г.). «Структура потенциалзависимого двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 196–201. Бибкод : 2016Natur.531..196G . дои : 10.1038/nature16446 . ПМЦ 4841471 . ПМИД 26689363 .

[8] Кинтцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 Arabidopsis thaliana» . Природа . 531 (7593): 258–62. Бибкод : 2016Natur.531..258K . дои : 10.1038/nature17194 . ПМЦ 4863712 . ПМИД 26961658 .

[9] Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.С., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм С., Валь-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпоровые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетку-хозяина и являются мишенями для лечения заболеваний» . Наука . 347 (6225): 995–8. дои : 10.1126/science.1258758 . ПМК 4550587 . ПМИД 25722412 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]