CLCA2

CLCA2
Идентификаторы
Псевдонимы	CLCA2 , CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, аксессуар для хлоридного канала 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 604003 ; МГИ : 2139758 ; Гомологен : 4765 ; Генные карты : CLCA2 ; OMA : CLCA2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	86,456,553 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	144,805,204 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; human penis; ; skin of thigh; ; vulva; ; oral cavity; ; hair follicle; ; skin of arm; ; bronchial epithelial cell; ; skin of hip; ; mucosa of pharynx;
	Top expressed in
	skin of external ear; ; esophagus; ; lower jaw; ; skin of back; ; incisor; ; mandibular molars; ; skin of abdomen; ; lip; ; embryo; ; Meckel's cartilage;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; peptidase activity; ligand-gated ion channel activity; hydrolase activity; metallopeptidase activity; chloride channel activity; metalloendopeptidase activity; intracellular calcium activated chloride channel activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; integral component of plasma membrane; extracellular region; cell junction; basal plasma membrane; nucleus; cytosol; plasma membrane; nuclear membrane;
Biological process	chloride transmembrane transport; ion transport; proteolysis; cell adhesion; chloride transport; ion transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9635
	229933
	ENSG00000137975
	ENSMUSG00000036960
	Q9UQC9
	Q8BG22
	НМ_006536
	НМ_178697
	НП_006527
	НП_848812
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Аксессуар 2 хлоридного канала представляет собой белок , который у человека кодируется CLCA2 геном . ^[5]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству белков хлоридной проводимости, чувствительных к кальцию. На сегодняшний день все члены этого семейства генов локализованы в одном и том же участке хромосомы 1p31-p22 и имеют высокую степень гомологии по размеру, последовательности и предполагаемой структуре, но значительно различаются по распределению в тканях. Поскольку этот белок экспрессируется преимущественно в трахее и легких, предполагается, что он играет роль в сложном патогенезе муковисцидоза. Он также может служить молекулой адгезии для метастатических раковых клеток легких, опосредуя остановку сосудов и колонизацию, и, кроме того, предполагается, что он действует как ген-супрессор опухоли при раке молочной железы. ^[5] Методы прогнозирования структуры белка предполагают, что N-концевая область белка CLCA2 представляет собой металлопротеазу цинка . ^[6]

См. также

Хлоридный канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000137975 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036960 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: хлоридный канал CLCA2, активированный кальцием, член семейства 2» .
^ Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

Дальнейшее чтение

Паули Б.У., Абдель-Гани М., Ченг Х.К. и др. (2001). «Молекулярные характеристики и функциональное разнообразие членов семейства CLCA». Клин. Эксп. Фармакол. Физиол . 27 (11): 901–5. дои : 10.1046/j.1440-1681.2000.03358.x . ПМИД 11071307 . S2CID 28762005 .
Грубер А.Д., Шреур К.Д., Джи Х.Л. и др. (1999). «Молекулярное клонирование и трансмембранная структура hCLCA2 из легких, трахеи и молочной железы человека». Являюсь. Дж. Физиол . 276 (6, часть 1): C1261–70. дои : 10.1152/ajpcell.1999.276.6.C1261 . ПМИД 10362588 . S2CID 4518177 .
Агнель М., Вермат Т., Кулуску Ж.М. (1999). «Идентификация трех новых членов семейства кальций-зависимых хлоридных каналов (CaCC), преимущественно экспрессируемых в пищеварительном тракте и трахее» . ФЭБС Летт . 455 (3): 295–301. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00891-1 . ПМИД 10437792 . S2CID 82094058 .
Грубер А.Д., Паули Б.Ю. (1999). «Туморогенность рака молочной железы человека связана с потерей Ca ²⁺-активированный хлоридный канал CLCA2». Cancer Res . 59 (21): 5488–91. PMID 10554024 .
Грубер А.Д., Паули Б.Ю. (1999). «Кластеризация семейства генов человека CLCA на коротком плече хромосомы 1 (1p22-31)». Геном . 42 (5): 1030–2. дои : 10.1139/gen-42-5-1030 . ПМИД 10584316 .
Лю К.Х., Уильямс Д.А., Макманус С. и др. (2000). «Gp120 ВИЧ-1 и хемокины активируют ионные каналы в первичных макрофагах посредством стимуляции CCR5 и CXCR4» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (9): 4832–7. Бибкод : 2000PNAS...97.4832L . дои : 10.1073/pnas.090521697 . ЧВК 18318 . ПМИД 10758170 .
Когель Х., Альцгеймер С. (2001). «Экспрессия и биологическое значение Ca ²⁺-активированные ионные каналы в кератиноцитах человека» . FASEB J. 15 ( 1): 145–154. : 10.1096 /fj.00-0055com . PMID 11149902. S2CID doi 7187615 .
Ито Р., Кавамото С., Миямото Ю. и др. (2001). «Выделение и характеристика Ca ²⁺-активированный хлоридный канал из эпителия роговицы человека». Curr. Eye Res . 21 (6): 918–25. : 10.1076 /ceyr.21.6.918.6983 . PMID 11262615. doi S2CID 20814432 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Эльбле Р.К., Паули БУ (2001). «Интегрин бета-4 рака молочной железы и эндотелиальный человеческий CLCA2 опосредуют метастазы в легкие» . Ж. Биол. Хим . 276 (27): 25438–46. дои : 10.1074/jbc.M100478200 . ПМИД 11320086 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Эльбле Р.К., Паули БУ (2002). «Киназа фокальной адгезии, активируемая лигированием бета (4) интегрина с mCLCA1, опосредует ранний метастатический рост» . Ж. Биол. Хим . 277 (37): 34391–400. дои : 10.1074/jbc.M205307200 . ПМИД 12110680 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Молл М., Гонска Т., Томас Дж. и др. (2003). «Модуляция Ca ²⁺-активирован Cl ⁻ секреция базолатеральным K ⁺ каналы в эпителии дыхательных путей нормального и муковисцидозного человека» . Pediatr. Res . 53 (4): 608–18. doi : 10.1203/01.PDR.0000057204.51420.DC . PMID 12612194 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.К., Эльбл Р.К. и др. (2004). «Взаимодействующие связывающие домены бета (4) интегрина и кальций-активируемых хлоридных каналов (CLCA) при метастазах» . Ж. Биол. Хим . 278 (49): 49406–16. дои : 10.1074/jbc.M309086200 . ПМИД 14512419 .
Коннон С.Дж., Кавасаки С., Ямасаки К. и др. (2005). «Количественная оценка hCLCA2 и колокализация с интегрином бета4 в многослойном эпителии человека». Акта Гистохим . 106 (6): 421–5. дои : 10.1016/j.acthis.2004.08.003 . ПМИД 15707651 .
Коннон С.Дж., Кавасаки С., Лайлс М. и др. (2006). «Экспрессия генов и иммунолокализация кальций-активируемых хлоридных каналов во время стратификации культивируемого и развивающегося эпителия роговицы». Ресурсы клеточных тканей . 323 (1): 177–82. дои : 10.1007/s00441-005-0059-2 . ПМИД 16158324 . S2CID 20539445 .
Эльбле Р.К., Валия В., Ченг Х.К. и др. (2006). «Предполагаемый хлоридный канал hCLCA2 имеет единственный С-концевой трансмембранный сегмент» . Ж. Биол. Хим . 281 (40): 29448–54. дои : 10.1074/jbc.M605919200 . ПМИД 16873362 .

Внешние ссылки

CLCN1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека Местоположение генома CLCA2 и CLCA2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000137975 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036960 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: хлоридный канал CLCA2, активированный кальцием, член семейства 2» .

[pmid16470849-6] Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный гидролазный домен в семействе CLCA предполагаемых хлоридных каналов, активируемых кальцием». Белки . 63 (3): 424–39. дои : 10.1002/прот.20887 . ПМИД 16470849 . S2CID 40041491 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]