Хромосома 1
Хромосома 1 | |
---|---|
Функции | |
Длина ( б.п. ) | 248 387 328 п.н. (CHM13) |
Количество генов | 1961 ( CCDS ) [1] |
Тип | Аутосома |
Положение центромеры | Метацентрический [2] (123,4 Мбит/с) [3] ) |
Полные списки генов | |
CCDS | Список генов |
HGNC | Список генов |
ЮниПрот | Список генов |
NCBI | Список генов |
Внешние программы просмотра карт | |
Вместе | Хромосома 1 |
Входить | Хромосома 1 |
NCBI | Хромосома 1 |
УКСК | Хромосома 1 |
Полные последовательности ДНК | |
RefSeq | NC_000001 ( ИСПРАВЛЕНО ) |
ГенБанк | CM000663 ( ИСПРАВЛЕНО ) |
Хромосома 1 — обозначение самой крупной хромосомы человека . У людей есть две копии хромосомы 1, как и у всех аутосом , которые являются неполовыми хромосомами . Хромосома 1 охватывает около 249 миллионов нуклеотидов пар , которые являются основными единицами информации для ДНК . [4] Он составляет около 8% от общего количества ДНК в клетках человека. [5]
Это была последняя завершенная хромосома, секвенированная через два десятилетия после начала проекта «Геном человека» .
Гены
[ редактировать ]Количество генов
[ редактировать ]Ниже приведены некоторые оценки количества генов в хромосоме 1 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотированию генома, их прогнозы количества генов в каждой хромосоме различаются (технические подробности см. в разделе «Прогнозирование генов »). Среди различных проектов проект совместного консенсусного кодирования последовательностей ( CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих человеческие белки. [6]
По оценкам | Гены, кодирующие белки | Некодирующие гены РНК | Псевдогены | Источник | Дата выпуска |
---|---|---|---|---|---|
CCDS | 1,961 | — | — | [1] | 2016-09-08 |
HGNC | 1,993 | 707 | 1,113 | [7] | 2017-05-12 |
Вместе | 2,044 | 1,924 | 1,223 | [8] | 2017-03-29 |
ЮниПрот | 2,064 | — | — | [9] | 2018-02-28 |
NCBI | 2,093 | 1,790 | 1,426 | [10] [11] [12] | 2017-05-19 |
Список генов
[ редактировать ]Ниже приводится неполный список генов в хромосоме 1 человека. Полный список можно найти по ссылке в информационном окне справа.
- C1orf112 : кодирующий белок открытой рамки считывания 112 хромосомы 1.
- C1orf127 : кодирующий белок открытой рамки считывания 127 хромосомы 1.
- C1orf27 : кодирующий белок открытой рамки считывания 27 хромосомы 1.
- C1orf38 : кодирующий белок открытой рамки считывания 38 хромосомы 1.
- CCDC181 : кодирующий белок Белок 181, содержащий домен спиральной спирали.
- DENN1B : предположительно связано с астмой.
- FHAD1 : кодирующий белок домен, связанный с Forkhead, содержащий белок 1.
- LOC100132287 : неохарактеризованный белок.
- LRRIQ3 : кодирующий белок, богатый лейцином повторы и мотив IQ, содержащий 3
- Член 4 семейства Shisa : кодирующий белок член 4 семейства Shisa.
- TINAGL1 : кодирующий белок, подобный антигену тубулоинтерстициального нефрита.
п-бедный
[ редактировать ]Неполный список генов, расположенных на p-плече (коротком плече) хромосомы 1 человека:
- AADACL3 : арилацетамиддеацетилазоподобный 3.
- AADACL4 : арилацетамиддеацетилазоподобный 4.
- ACADM : ацил-коэнзим А дегидрогеназа, прямая цепь от C-4 до C-12.
- ACTG1P6 : кодирующий белок актин, псевдоген гамма 1 6.
- ACTL8 : актиноподобный 8
- ADGRL2 (1p31.1): рецептор L2, связанный с G-белком адгезии.
- ADPRHL2 : поли(АДФ-рибоза)гликогидролаза ARH3.
- AMPD2 : кодирующий фермент AMP-дезаминазу 2.
- ARID1A (1p36)
- ATXN7L2 : атаксин 7-подобный 2.
- AZIN2 : кодирующий фермент ингибитор антизима 2 (AzI2), также известный как аргининдекарбоксилаза (ADC).
- BCAS2 : амплифицированная последовательность 2 карциномы молочной железы.
- БКЛ10 (1п22)
- LRIF1 : кодирующий белок лиганд-зависимый фактор взаимодействия с ядерными рецепторами 1.
- C1orf109 : открытая рамка считывания хромосомы 1 109.
- C1orf162 : кодирующий белок открытой рамки считывания 162 хромосомы 1.
- C1orf194 : кодирующий белок открытой рамки считывания хромосомы 1 194.
- CZIB : открытая рамка считывания хромосомы 1 123.
- CACHD1, кодирующий белка, содержащий 1 домен кэша
- CAMK2N1 : кодирующий белок, ингибитор 1 кальций/кальмодулин-зависимой протеинкиназы II.
- КАМТА1 (1p36)
- CASP9 (1p36)
- CASZ1 (1p36): Касторовый цинковый палец 1
- CCDC17 : кодирующий белок спиральный домен, содержащий 17
- CCDC18 : кодирующий белок спиральный домен, содержащий 18
- CEP85 : кодирующий белок Центросомальный белок 85.
- CFAP74 : кодирующий белок 74, связанный с ресничками и жгутиками.
- CHD5 (1p36)
- CLIC4 (1p36)
- CLSPN (1p34)
- CMPK : киназа UMP-CMP.
- COL16A1 (1p35)
- COL11A1 : коллаген типа XI, альфа 1.
- CPT2 : карнитинпальмитоилтрансфераза II
- CRYZ : Кристаллин зета.
- CSDE1 : Домен холодного шока, содержащий E1.
- CYP4B1 (1p33)
- CYR61 (1p22)
- DBT : дигидролипоамид-трансацилаза с разветвленной цепью E2.
- DCLRE1B : восстановление поперечных связей ДНК 1B.
- DEPDC1, кодирующий домен белка DEP, содержащий 1
- DIRAS3 (1p31): семейство DIRAS, GTP-связывающий RAS-подобный 3.
- DISP3 : кодирующий белок, член 3 семейства транспортеров rnd.
- DNASE2B : кодирует белок дезоксирибонуклеазу 2 бета.
- DPH5 : дифтинсинтаза.
- ДВЛ1 (1п36)
- ЭНО1 (1p36)
- ЭФА2 (1p36)
- EPS15 (1p32)
- ESPN : эспин (аутосомно-рецессивная глухота 36)
- EVI5 : сайт экотропной вирусной интеграции 5.
- EXO5 : кодирующий белок экзонуклеазу 5.
- EXTL1 : экзостозин-подобная гликозилтрансфераза 1.
- EXTL2 : экзостозинподобная гликозилтрансфераза 2.
- FAM46B : семейство со сходством последовательностей 46, член B.
- FAM46C : семейство со сходством последовательностей 46, член C.
- FAM76A : семейство со сходством последовательностей 76, член A.
- FAM87B : кодирующее семейство белков со сходством последовательностей, член B 87.
- FBXO2 : белок F-бокса 2.
- FNBP1L, кодирующий белок, подобный формин-связывающему белку 1
- FPGT : фукозо-1-фосфат-гуанилилтрансфераза.
- ФУБП1 (1p31)
- ГЕЙЛ : УДФ-галактозо-4-эпимераза.
- ГЭДД45А (1p31)
- 1 фунт стерлингов (1p22)
- GBP2 : гуанилатсвязывающий белок 2.
- GBP5, кодирующий белок 5, связывающий гуанилат
- GBP6 : кодирующий белок, член семейства 6 белков, связывающих гуанилат.
- GJB3 : белок щелевого соединения, бета 3, 31 кДа (коннексин 31)
- ГЛМН (1p22)
- GNL2 : G-белок ядрышка 2
- ГСТМ1 (1п13)
- GUCA2B : кодирующий белок активатор гуанилатциклазы 2B.
- HDAC1 (1p35)
- HES2 : транскрипционный фактор 2 bHLH семейства Hes.
- HES3 : транскрипционный фактор 3 bHLH семейства Hes.
- HMGCL : 3-гидроксиметил-3-метилглутарил-коэнзим А лиаза (гидроксиметилглутарикацидурия)
- HAO2, кодирующий белок гидроксикислотоксидазу 2
- HMGCS2 : 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-синтаза 2.
- HP1BP3 : белок гетерохроматина 1, связывающий белок 3.
- IFI6 : Белок 6, индуцируемый интерфероном альфа.
- IL22RA1 (1p36)
- INTS11 : Подблок 11 комплекса интегратора.
- ЯК1 (1п31)
- ИЮНЬ (1 стр. 32)
- KANK4 : кодирует мотив белка KN и домены 4 повторов анкирина.
- KCNQ4 : калиевый потенциалзависимый канал, KQT-подобное подсемейство, член 4.
- KIF1B : член семейства кинезинов 1B.
- L1TD1 : домен транспозазы типа LINE-1, содержащий 1
- ЛКК (1п35)
- LINC01137 : кодирующий белок. Длинная межгенная небелковая кодирующая РНК 1137.
- LRRC39 : белок 39, содержащий богатые лейцином повторы.
- LRRC40 : белок 40, содержащий богатые лейцином повторы.
- LRRC41 : белок 41, содержащий богатые лейцином повторы.
- LRRC8D : белок 8D, содержащий богатые лейцином повторы.
- MACO1 : кодирующий белок. Трансмембранный белок 57.
- MAN1A2 : маннозилолигосахарид 1,2-альфа-маннозидаза IB.
- MAP3K6 : кодирующий белок митоген-активируемая протеинкиназная киназа киназа 6
- MEAF6 : фактор 6, связанный с MYST/ESA1.
- MECR : Транс-2-еноил-КоА-редуктаза, митохондриальная.
- MFAP2 : белок 2, связанный с микрофибриллярами.
- МИБ2 (1p36)
- МИЕР1 (1p31)
- MIGA1 : кодирующий белок митогардин 1
- MFN2 : митофузин 2
- MFSD2 : домен суперсемейства основного фасилитатора, содержащий 2A.
- MIR6079 : микроРНК 6079
- MMEL1 : мембраноподобная металлоэндопептидаза 1.
- MTFR1L : регулятор деления митохондрий 1 типа.
- MTHFR (1p36): 5,10-метилентетрагидрофолатредуктаза (НАДФН).
- MUL1 : митохондриальная убиквитинпротеинлигаза 1 E3.
- MUTYH (1p34): гомолог mutY (E. coli)
- NBPF3 : член семейства 3 точки перелома нейробластомы.
- NDUFA4P1 : кодирующий белок Nadh-дегидрогеназу (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 4, 9 кДа, псевдоген 1.
- NGF : фактор роста нервов
- NOL9 : ядрышковый белок 9.
- НРАС (1p13)
- ВЫРЕЗКА2 (1p12)
- OLFML3 : Ольфактомединоподобный 3
- OMA1 : Металлоэндопептидаза OMA1, митохондриальная.
- OVGP1 : гликопротеин 1 яйцевода.
- PARK7 (1p36): болезнь Паркинсона (аутосомно-рецессивный тип, раннее начало) 7
- PINK1 : предполагаемая киназа 1, индуцированная PTEN.
- PLOD1 : проколлаген-лизин 1,2-оксоглутарат-5-диоксигеназа 1.
- PRAMEF10 : кодирующий белок члена 10 семейства Prame.
- PRMT6 : белок аргининметилтрансфераза 6.
- PRXL2B : кодирующий белок пероксиредоксин, подобный 2B.
- PSRC1 : спиральный белок 1, богатый пролином/серином.
- RAD54L : аналог RAD54.
- РАП1А (1п13)
- РБМ15 (1п13)
- RCC2 : регулятор конденсации хромосом 2.
- РЕГ4 (1п12)
- RHBDL2 : ромбовидный, как 2.
- РОК (1п13)
- RIMS3 : кодирующий белок, регулирующий экзоцитоз синаптической мембраны 3.
- RLF : переаранжированный слияние L-myc
- РНФ11 (1p32)
- RNF19B : кодирующий белок белок 19B безымянного пальца.
- RNF220 : белок безымянного пальца 220.
- РПА2 (1п35)
- РСПО1 (1п34)
- S100A1 (1q21)
- SAMD11 : кодирующий белок стерильный домен мотива альфа, содержащий 11
- SDC3 : Синдекан-3
- СДХБ (1p36)
- SFPQ (1p34): кодирующий белок, фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином.
- SGIP1 : белок 1 взаимодействия GRB2-подобного белка 3 домена SH3
- SH3BGRL3 : белок 3, связывающий домен SH3, богатый глутаминовой кислотой.
- SLC16A1 (1p13)
- SLC2A1 Транспортер глюкозы 1
- SPSB1 : белок 1 SOCS-бокса, содержащий домен SPRY.
- СТИЛЬ (1p33)
- SYCP1 : белок 1 синаптонемного комплекса.
- SZT2 : гомолог порога приступа 2.
- TACSTD2 : преобразователь 2 сигнала опухолеассоциированного кальция.
- ТАЛ1 (1п33)
- TCTEX1D4 : кодирующий домен белка Tctex1, содержащий 4
- TCEB3 : полипептид 3 фактора элонгации транскрипции B.
- TGFBR3 (1p22)
- ТРАП3 (1p34)
- TIE1 (1p34)
- TM2D1 : кодирующий домен белка Tm2, содержащий 1
- TMCO2 : кодирует белка 2. трансмембранные и спирально-спиральные домены
- TMCO4 : кодирует белка 4. трансмембранные и спирально-спиральные домены
- TMEM48 : кодирующий белок нуклеопорин NDC1.
- TMEM50A : трансмембранный белок 50А.
- TMEM59 : трансмембранный белок 59.
- TMEM69 : трансмембранный белок 69.
- TMEM201, кодирующий белок Трансмембранный белок 201
- TMEM222 : трансмембранный белок 222.
- TOE1 : мишень белка 1 EGR1.
- TRABD2B : кодирующий домен белка Trab, содержащий 2b.
- TRAPPC3 : Субъединица 3 комплекса белковых частиц, осуществляющих транспортировку
- TRIT1 : тРНК изопентенилтрансфераза, митохондриальная.
- ТТГБ : тиреотропный гормон, бета.
- TTC39A : тетратрикопептидный повтор 39А.
- UBR4 : компонент убиквитин-белковой лигазы E3, n-распознаватель 4.
- UROD : уропорфириноген декарбоксилаза (ген поздней кожной порфирии )
- USP1 (1p31)
- USP48 : Гидролаза убиквитин-карбоксильного конца 48.
- ВАВ3 (1п13)
- VPS13D : белок 13D, связанный с сортировкой вакуолярных белков.
- ВТЦН1 (1п13)
- WARS2 : Триптофанил-тРНК-синтетаза, митохондриальная.
- WDR77 (1p13)
- YBX1 (1p34)
- ZCCHC17 : тип CCHC с цинковым пальцем, содержащий 17
- ZFP69 : кодирующий белок Zfp69, белок цинкового пальца.
- ZMYM1, кодирующий белок цинкового пальца MYM-типа, содержащий 1
- ZNF436 : белок 436 цинковых пальцев.
- ZNF684 : кодирующий белок белок 684 цинкового пальца.
- ZYG11B, кодирующий белок члена B семейства Zyg-11, регулятор клеточного цикла
- ZZZ3 : белок 3, содержащий цинковые пальцы ZZ-типа.
q-образный рычаг
[ редактировать ]Неполный список генов, расположенных на q-плече (длинном плече) хромосомы 1 человека:
- ABL2 (1q25)
- АДИПОР1 (1q32)
- AHCTF1 : кодирующий белок ELYS
- АКТ3 (1q43-44)
- ANGPTL1 : белок 1, родственный ангиопоэтину.
- ARHGEF2 (1q22)
- ARID4B : кодирующий белок AT-богатый интерактивный домен, содержащий белок 4B
- ARV1, кодирующий гомолог белка ARV1 (S. cerevisiae)
- АРНТ (1q21)
- ASPM (1q31): фактор, определяющий размер мозга
- АТФ3 (1q32)
- АТФ2В4 (1q32)
- BCL9 (1q21)
- CATSPERE : кодирующий белок вспомогательную субъединицу эпсилон канала Catsper.
- C1orf21 : открытая рамка считывания 21 хромосомы 1.
- MMTAP2. кодирующий Белок, Белок 2, ассоциированный с опухолью множественной миеломы.
- ТЕХ35 : ТЕХ35
- C1orf74 : открытая рамка считывания хромосомы 1 74.
- C2CD4D : C2-кальций-зависимый домен, содержащий 4D
- CTSS: катепсин S
- CD5L : молекула CD5, подобная
- CENPL : центромерный белок L
- ЦЕНПФ (1q41)
- CHTOP : Хроматиновая мишень prmt1.
- CNIH4 : гомолог 4 рассола
- CNST : Консорциум
- CREG1 : клеточный репрессор генов, стимулируемых E1A 1.
- СРБ : С-реактивный белок
- CRTC2 (1q21)
- CSRP1 : белок 1, богатый цистеином и глицином.
- DCAF8 : кодирует белок DDB1 и фактор 8, связанный с CUL4.
- DDX59 : геликаза МЕРТВОГО бокса 59.
- DEL1Q21 : кодирующий белок синдром делеции хромосомы 1q21.1.
- ДПТ : дермапонтин
- DISC2 — длинная некодирующая РНК.
- DNAH14, кодирующий белок динеин, аксонема, тяжелая цепь 14
- ДУСП10 (1q41)
- DUSP27 : кодирующий белок фосфатазу 27 двойной специфичности (предполагаемый)
- ЕСМ1 (1q21)
- EDEM3 : деградация ER усиливает альфа-маннозидазу, подобную белку 3.
- EGLN1 (1q42)
- ELF3 : кодирует белок E74, подобный ets транскрипционному фактору 3.
- ЭНА (1q42)
- СОЭРГ (1q41)
- FAM129A : семейство со сходством последовательностей 129, член A.
- FAM163A : кодирующий белок секреторный белок, полученный из нейробластомы.
- FAM20B : FAM20B, гликозаминогликанксилосилкиназа.
- FAM63A : Семейство со сходством последовательностей 63, член A.
- FAM78B : семейство со сходством последовательностей 78, член B.
- FAM89A : кодирующий белок Fam89A.
- FBXO28 : белок 28 F-бокса.
- FCMR : Fc-фрагмент рецептора IgM.
- FCGR2B (1q23)
- FCGR2C : кодирующий фрагмент белка Fc рецептора iic igg (ген/псевдоген)
- FH (1q43): фумараза
- FLAD1 : кодирующий белок флавинадениндинуклеотидсинтетазу 1.
- FLG-AS1 : кодирующий белок антисмысловой РНК FLG 1.
- FMO3 : флавинсодержащая монооксигеназа 3.
- FRA1J, кодирующий белок. Хрупкий сайт, тип 5-азацитидина, общий, fra(1)(q12)
- G0S2 : кодирование переключателя G0/G1 2.
- ГАЗ5 (1q25)
- GBA : глюкозидаза, бета; кислота (включает глюкозилцерамидазу) (ген болезни Гоше )
- GBAP1 : псевдоген 1 бета-глюкозилцерамидазы.
- GLC1A : ген глаукомы.
- GON4L : как Гон-4
- ГПА33 (1q24)
- GPR37L1 G-рецептор, связанный с белком 37, подобный 1
- H3C13 : кодирующий белок кластера гистонов 2, член семейства h3 d.
- HEATR1 : белок 1, содержащий повторы HEAT.
- HFE2 : гемохроматоз 2 типа (ювенильный).
- HIST2H2AB : гистон 2А типа 2-B.
- HIST2H2BF : гистон H2B типа 2-F.
- HIST2H3PS2 : кластер гистонов 2, H3, псевдоген 2.
- HIST3H2A : гистон H2A типа 3.
- HIST3H2BB : гистон H2B типа 3-B.
- HRM2 : Волосы вьющиеся.
- IGSF8 (1q23)
- INAVA : белок-активатор врожденного иммунитета.
- INTS3 : Подблок 3 комплекса интегратора.
- IRF2BP2 : кодирующий белок 2, связывающий регуляторный фактор интерферона 2.
- IRF6 : ген соединительной ткани. образования
- KCNH1 (1q32)
- KIF14 (1q32)
- LEFTY1 : Коэффициент определения левого и правого 1.
- LHX9, кодирующий белок LIM гомеобокс 9
- LMNA : ламинарный кондиционер
- LMOD1 : кодирующий белок лейомодин 1.
- LOC645166, кодирующий белок Псевдоген лимфоцит-специфического белка 1
- LYPLAL1 : лизофосфолипазоподобный 1
- МАПКАРК2 (1q32)
- МИР194-1 : микроРНК 194-1
- MIR5008 : микроРНК 5008
- MPC2 : митохондриальный пируватный носитель 2.
- MOSC1 : С-концевой домен сульфуразы MOCO, содержащий 1
- MOSC2 : белок 2, содержащий домен MOSC, митохондриальный.
- MPZ : нулевой миелиновый белок (нейропатия Шарко-Мари-Тута 1B).
- MSTO1 : мисато 1
- MTR : 5-метилтетрагидрофолат-гомоцистеин метилтрансфераза.
- NAV1 : Нейрон-навигатор 1.
- NBPF16 : семейство точек останова нейробластомы, член 16.
- NOC2L : гомолог белка 2 ядрышкового комплекса.
- NUCKS1 : субстрат повсеместно встречающегося в ядре казеина и циклин-зависимых киназ.
- NVL : ядерный валозин-содержащий белок-подобный
- OLFML2B : Ольфактомедин-подобный 2B.
- OPTC : Оптицин
- OTUD7B : белок 7B, содержащий домен OTU.
- PACERR, кодирующий белок PTGS2, антисмысловой регулятор экспрессии комплекса NFKB1, РНК
- УАТС1 (1q23)
- ПЭА15 (1q23)
- PGDB5 : производный мобильный элемент PiggyBac 5
- ПИАС3 (1q21)
- PI4KB : бета-фосфатидилинозитол-4-киназа.
- PIP5K1A (1q21): фосфатидилинозитол-4-фосфат 5-киназа типа 1 альфа.
- PLA2G4A (1q31)
- PPOX : протопорфириногеноксидаза
- ПКРК (1q23)
- PRR9, кодирующий белок, богатый пролином 9
- PSEN2 (1q42): пресенилин 2 (болезнь Альцгеймера 4)
- ПТГС2 (1q31)
- PTPN14 (1q32-41)
- PTPN7 (1q32)
- RABIF : фактор взаимодействия RAB.
- RASSF5 (1q32)
- RGS2 (1q31)
- RN5S1@ : РНК, 5S рибосомальный кластер 1q42.
- RPS27 (1q21)
- SCAMP3 : мембранный белок 3, связанный с секреторным носителем.
- СДГК (1q23)
- УЖЕ (1q24)
- SFT2D2 : кодирующий домен белка Sft2, содержащий 2
- SHC1 (1q21)
- SHCBP1L : кодирующий связывающий белок Shc и связанный с веретеном 1 подобный
- SLC30A10 : кодирующий белок, член 10 семейства растворенных носителей 30.
- SLC39A1 (1q21)
- SLC50A1 : Семейство растворенных носителей, 50 членов, 1.
- SMCP : богатый цистеином белок спермы, связанный с митохондриями.
- SMG7 : нонсенс-опосредованный фактор распада мРНК.
- SMYD3 (1q44)
- СПГ23
- SPRR1A : Корнифин-А
- SPRR1B : Корнифин-Б
- SPRR2A : небольшой белок 2А, богатый пролином.
- СПРТН : Спартанец
- TARBP1 : РНК-связывающий белок 1 TAR (ВИЧ-1).
- TBCE : тубулин-специфичный шаперон E.
- THBS3 : Тромбоспондин 3
- TMCO1 : белок 1, содержащий трансмембранный и спиральноспиральный домен.
- TMEM9 : трансмембранный белок 9.
- TMEM63A : трансмембранный белок 63А.
- TMEM81 : трансмембранный белок 81.
- TNFAIP8L2 : кодирует белок 8, подобный 2, индуцируемый TNF-альфа.
- TNFSF18 (1q25)
- TNNT2 : сердечный тропонин Т2.
- TOR1AIP1 : белок 1, взаимодействующий с торсином-1A.
- TOR3A : кодирующий белок, член A семейства 3 торсинов.
- TP53BP2 (1q41)
- TRE-CTC1-5 : Транспортная РНК-Glu (CTC) 1-5.
- UAP1 : UDP-N-ацетилгексозаминпирофосфорилаза.
- USH2A : синдром Ушера 2А (аутосомно-рецессивный, легкая форма).
- USF1 (1q23)
- VANGL2 : кодирующий белок VANGL, белок 2 планарной клеточной полярности.
- VPS45 : белок 45, связанный с вакуолярной сортировкой белков.
- VPS72 : белок 72, связанный с вакуолярной сортировкой белков.
- YY1AP1 : YY1-ассоциированный белок 1.
- ZBED6 : цинковый палец, тип BED, содержащий 6
- ZC3H11A : белок 11A, содержащий домен CCCH с цинковым пальцем.
- ZNF648, кодирующий белок Белок 648 цинкового пальца
- ZNF669 : белок цинковых пальцев 669.
- ZNF687 : белок 687 цинковых пальцев.
- ZNF692 : белок 692 цинковых пальцев.
- ZNF695 : белок цинковых пальцев 695.
Болезни и расстройства
[ редактировать ]Известно 890 заболеваний, связанных с этой хромосомой. [ нужна ссылка ] Некоторые из этих заболеваний — потеря слуха , болезнь Альцгеймера , глаукома и рак молочной железы . Перестройки и мутации хромосомы 1 широко распространены при раке и многих других заболеваниях. Паттерны вариаций последовательностей выявляют сигналы недавнего отбора в конкретных генах, которые могут способствовать приспособленности человека, а также в регионах, где никакая функция не очевидна.
Полная моносомия (имеющая только одну копию всей хромосомы) неизменно приводит к летальному исходу до рождения. [13] Полная трисомия (наличие трех копий всей хромосомы) смертельна в течение нескольких дней после зачатия . [13] Некоторые частичные делеции и частичные дупликации приводят к врожденным дефектам .
Следующие заболевания относятся к числу тех, которые связаны с генами на хромосоме 1 (которая содержит наиболее известные генетические заболевания любой хромосомы человека):
- синдром делеции 1q21.1
- синдром дупликации 1q21.1
- болезнь Альцгеймера
- Аутосомно-доминантная болезнь Шарко-Мари-Тута 2 типа с гигантскими аксонами
- Биполярное расстройство
- Рак молочной железы
- Болезнь Брука-Гринберга (синдром X)
- Дефицит карнитинпальмитоилтрансферазы II
- Болезнь Шарко-Мари-Тута , типы 1 и 2.
- коллагенопатия типов II и XI
- врожденный гипотиреоз
- Синдром Элерса-Данлоса
- Лейденская тромбофилия фактора V
- Семейный аденоматозный полипоз
- галактоземия
- болезнь Гоше
- болезнь Гоше
- Студенистая каплевидная дистрофия роговицы
- Глаукома
- Синдром дефицита GLUT1
- Тугоухость , аутосомно-рецессивная глухота 36
- Гемохроматоз
- Гепатоэритропоэтическая порфирия
- Гомоцистинурия
- Синдром прогерии Хатчинсона-Гилфорда
- Дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиазы
- Гипертрофическая кардиомиопатия , аутосомно-доминантные мутации TNNT2; гипертрофия обычно легкая; может присутствовать рестриктивный фенотип; может нести высокий риск внезапной сердечной смерти
- болезнь мочи кленового сиропа
- дефицит среднецепочечного ацил-коэнзима А дегидрогеназы
- Микроцефалия
- Синдром Макла-Уэллса
- Несиндромальная глухота
- Олигодендроглиома
- болезнь Паркинсона
- Феохромоцитома
- порфирия
- поздняя кожная порфирия
- синдром подколенного птеригиума
- рак простаты
- Синдром Стиклера
- ТАР-синдром
- триметиламинурия
- синдром Ашера
- Синдром Ушера II типа
- Синдром Ван дер Вуда
- Пестрая порфирия
Цитогенетическая полоса
[ редактировать ]Хр. | Рука [18] | Группа [19] | ISCN начинать [20] | ISCN останавливаться [20] | Базовая пара начинать | Базовая пара останавливаться | Пятно [21] | Плотность |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | п | 36.33 | 0 | 100 | 1 | 2,300,000 | гнег | |
1 | п | 36.32 | 100 | 244 | 2,300,001 | 5,300,000 | GPS | 25 |
1 | п | 36.31 | 244 | 344 | 5,300,001 | 7,100,000 | гнег | |
1 | п | 36.23 | 344 | 459 | 7,100,001 | 9,100,000 | GPS | 25 |
1 | п | 36.22 | 459 | 660 | 9,100,001 | 12,500,000 | гнег | |
1 | п | 36.21 | 660 | 861 | 12,500,001 | 15,900,000 | GPS | 50 |
1 | п | 36.13 | 861 | 1206 | 15,900,001 | 20,100,000 | гнег | |
1 | п | 36.12 | 1206 | 1321 | 20,100,001 | 23,600,000 | GPS | 25 |
1 | п | 36.11 | 1321 | 1521 | 23,600,001 | 27,600,000 | гнег | |
1 | п | 35.3 | 1521 | 1651 | 27,600,001 | 29,900,000 | GPS | 25 |
1 | п | 35.2 | 1651 | 1780 | 29,900,001 | 32,300,000 | гнег | |
1 | п | 35.1 | 1780 | 1895 | 32,300,001 | 34,300,000 | GPS | 25 |
1 | п | 34.3 | 1895 | 2210 | 34,300,001 | 39,600,000 | гнег | |
1 | п | 34.2 | 2210 | 2411 | 39,600,001 | 43,700,000 | GPS | 25 |
1 | п | 34.1 | 2411 | 2770 | 43,700,001 | 46,300,000 | гнег | |
1 | п | 33 | 2770 | 2986 | 46,300,001 | 50,200,000 | GPS | 75 |
1 | п | 32.3 | 2986 | 3273 | 50,200,001 | 55,600,000 | гнег | |
1 | п | 32.2 | 3273 | 3416 | 55,600,001 | 58,500,000 | GPS | 50 |
1 | п | 32.1 | 3416 | 3732 | 58,500,001 | 60,800,000 | гнег | |
1 | п | 31.3 | 3732 | 3976 | 60,800,001 | 68,500,000 | GPS | 50 |
1 | п | 31.2 | 3976 | 4206 | 68,500,001 | 69,300,000 | гнег | |
1 | п | 31.1 | 4206 | 4852 | 69,300,001 | 84,400,000 | GPS | 100 |
1 | п | 22.3 | 4852 | 5210 | 84,400,001 | 87,900,000 | гнег | |
1 | п | 22.2 | 5210 | 5440 | 87,900,001 | 91,500,000 | GPS | 75 |
1 | п | 22.1 | 5440 | 5741 | 91,500,001 | 94,300,000 | гнег | |
1 | п | 21.3 | 5741 | 5957 | 94,300,001 | 99,300,000 | GPS | 75 |
1 | п | 21.2 | 5957 | 6029 | 99,300,001 | 101,800,000 | гнег | |
1 | п | 21.1 | 6029 | 6244 | 101,800,001 | 106,700,000 | GPS | 100 |
1 | п | 13.3 | 6244 | 6459 | 106,700,001 | 111,200,000 | гнег | |
1 | п | 13.2 | 6459 | 6660 | 111,200,001 | 115,500,000 | GPS | 50 |
1 | п | 13.1 | 6660 | 6861 | 115,500,001 | 117,200,000 | гнег | |
1 | п | 12 | 6861 | 7048 | 117,200,001 | 120,400,000 | GPS | 50 |
1 | п | 11.2 | 7048 | 7119 | 120,400,001 | 121,700,000 | гнег | |
1 | п | 11.1 | 7119 | 7335 | 121,700,001 | 123,400,000 | акцент | |
1 | д | 11 | 7335 | 7579 | 123,400,001 | 125,100,000 | акцент | |
1 | д | 12 | 7579 | 8483 | 125,100,001 | 143,200,000 | гвар | |
1 | д | 21.1 | 8483 | 8756 | 143,200,001 | 147,500,000 | гнег | |
1 | д | 21.2 | 8756 | 8957 | 147,500,001 | 150,600,000 | GPS | 50 |
1 | д | 21.3 | 8957 | 9244 | 150,600,001 | 155,100,000 | гнег | |
1 | д | 22 | 9244 | 9459 | 155,100,001 | 156,600,000 | GPS | 50 |
1 | д | 23.1 | 9459 | 9832 | 156,600,001 | 159,100,000 | гнег | |
1 | д | 23.2 | 9832 | 10048 | 159,100,001 | 160,500,000 | GPS | 50 |
1 | д | 23.3 | 10048 | 10349 | 160,500,001 | 165,500,000 | гнег | |
1 | д | 24.1 | 10349 | 10507 | 165,500,001 | 167,200,000 | GPS | 50 |
1 | д | 24.2 | 10507 | 10679 | 167,200,001 | 170,900,000 | гнег | |
1 | д | 24.3 | 10679 | 10894 | 170,900,001 | 173,000,000 | GPS | 75 |
1 | д | 25.1 | 10894 | 11009 | 173,000,001 | 176,100,000 | гнег | |
1 | д | 25.2 | 11009 | 11196 | 176,100,001 | 180,300,000 | GPS | 50 |
1 | д | 25.3 | 11196 | 11598 | 180,300,001 | 185,800,000 | гнег | |
1 | д | 31.1 | 11598 | 11827 | 185,800,001 | 190,800,000 | GPS | 100 |
1 | д | 31.2 | 11827 | 11942 | 190,800,001 | 193,800,000 | гнег | |
1 | д | 31.3 | 11942 | 12172 | 193,800,001 | 198,700,000 | GPS | 100 |
1 | д | 32.1 | 12172 | 12617 | 198,700,001 | 207,100,000 | гнег | |
1 | д | 32.2 | 12617 | 12803 | 207,100,001 | 211,300,000 | GPS | 25 |
1 | д | 32.3 | 12803 | 13033 | 211,300,001 | 214,400,000 | гнег | |
1 | д | 41 | 13033 | 13320 | 214,400,001 | 223,900,000 | GPS | 100 |
1 | д | 42.11 | 13320 | 13406 | 223,900,001 | 224,400,000 | гнег | |
1 | д | 42.12 | 13406 | 13607 | 224,400,001 | 226,800,000 | GPS | 25 |
1 | д | 42.13 | 13607 | 13966 | 226,800,001 | 230,500,000 | гнег | |
1 | д | 42.2 | 13966 | 14153 | 230,500,001 | 234,600,000 | GPS | 50 |
1 | д | 42.3 | 14153 | 14397 | 234,600,001 | 236,400,000 | гнег | |
1 | д | 43 | 14397 | 14756 | 236,400,001 | 243,500,000 | GPS | 75 |
1 | д | 44 | 14756 | 15100 | 243,500,001 | 248,956,422 | гнег |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Результаты поиска — 1[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («имеет ccds»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . CCDS Release 20 для Homo Sapiens . 08.09.2016 . Проверено 28 мая 2017 г.
- ^ Том Страчан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека . Гирляндная наука. п. 45. ИСБН 978-1-136-84407-2 .
- ^ Перейти обратно: а б с Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (850 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 3 июня 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ http://vega.sanger.ac.uk/Homo_sapiens/mapview?chr=1 Размер хромосом и количество генов, полученные из этой базы данных, полученные 11 марта 2012 г.
- ^ Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э., Каул Р., Сварбрек Д., Данэм А. и др. (май 2006 г.). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека» . Природа . 441 (7091): 315–21. Бибкод : 2006Natur.441..315G . дои : 10.1038/nature04727 . ПМИД 16710414 .
- ^ Пертеа М., Зальцберг С.Л. (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества генов человека» . Геном Биол . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . ПМК 2898077 . ПМИД 20441615 .
- ^ «Статистика и загрузки для хромосомы 1» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . 12 мая 2017 г. Архивировано из оригинала 29 июня 2017 г. Проверено 19 мая 2017 г.
- ^ «Хромосома 1: Сводка хромосом — Homo sapiens» . Ансамбль Выпуск 88 . 2017-03-29 . Проверено 19 мая 2017 г.
- ^ «Хромосома человека 1: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM» . ЮниПрот . 28 февраля 2018 г. Проверено 16 марта 2018 г.
- ^ «Результаты поиска — 1[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («кодирующий белок генотипа»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ "Результаты поиска - 1[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ( ("genetype miscrna"[Свойства] OR "генотип ncrna"[Свойства] OR "генотип rrna"[Свойства] OR "генотип trna"[Свойства] ИЛИ "генотип scrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства] ИЛИ "генотип snrna"[Свойства]) НЕ "генотип, кодирующий белок"[Свойства] И живой[prop]) - Ген" . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ «Результаты поиска — 1[CHR] И «Homo sapiens»[Организм] И («псевдогенный ген»[Свойства] И живой[prop]) — Ген» . НКБИ . 19 мая 2017 г. Проверено 20 мая 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б Герсен, Стивен Л.; Кигл, Марта Б. (26 марта 2013 г.). Принципы клинической цитогенетики . Springer Science & Business Media. п. 278. ИСБН 9781441916884 .
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (400 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 4 марта 2014 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы Homo sapience (550 ударов в час, сборка GRCh38.p3) . Последнее обновление 11 августа 2015 г. Проверено 26 апреля 2017 г.
- ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013 г.). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013) . Каргерское медицинское и научное издательство. ISBN 978-3-318-02253-7 .
- ^ Сетакулвичай, В.; Манитпорнсут, С.; Вибунрат, М.; Лилакиацакун, В.; Ассавамакин, А.; Тонгсима, С. (2012). «Оценка разрешения на уровне полос изображений хромосом человека» . 2012 Девятая Международная конференция по информатике и программной инженерии (JCSSE) . стр. 276–282. дои : 10.1109/JCSSE.2012.6261965 . ISBN 978-1-4673-1921-8 . S2CID 16666470 .
- ^ " p ": Короткая рука; « q »: Длинная рука.
- ^ Номенклатуру цитогенетических полос см. в статье locus .
- ^ Перейти обратно: а б Эти значения (начало/конец ISCN) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN «Международная система цитогенетической номенклатуры человека» (2013). Произвольная единица .
- ^ gpos : область, положительно окрашенная G-полосами , обычно богатая АТ и бедная генами; gneg : область, отрицательно окрашенная G-полосами, обычно богатая CG и богатая генами; acen Центромера . var : Переменная область; стебель : Стебель.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Мерфи В.Дж., Фронике Л., О'Брайен С.Дж., Стэньон Р. (2003). «Происхождение человеческой хромосомы 1 и ее гомологов у плацентарных млекопитающих» . Геном Рез . 13 (8): 1880–8. дои : 10.1101/гр.1022303 . ПМК 403779 . ПМИД 12869576 .
- Ревера, М.; Ван дер Мерве, Л; и др. (2007). «Долгосрочное наблюдение за семьями HCM R403WMHY7 и R92WTNNT2: мутации определяют размеры левого желудочка, но не толщину стенки во время прогрессирования заболевания» . Сердечно-сосудистый журнал Африки . 18 (3): 146–153. ПМЦ 4213759 . ПМИД 17612745 .
- Шутте BC, Карптен Дж.Д., Форус А., Грегори С.Г., Хории А., Уайт PS (2001). «Отчет и тезисы шестого международного семинара по картированию хромосомы 1 человека, 2000 г. Айова-Сити, Айова, США. 30 сентября - 3 октября 2000 г.». Цитогенетический клеточный генетик . 92 (1–2): 23–41. дои : 10.1159/000056867 . ПМИД 11306795 . S2CID 202651814 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Национальные институты здравоохранения. «Хромосома 1» . Домашний справочник по генетике . Архивировано из оригинала 4 февраля 2012 г. Проверено 6 мая 2017 г.
- «Окончательная «глава» генома опубликована» . Новости Би-би-си . 18 мая 2006 г. Проверено 6 мая 2017 г.
- «Хромосома 1» . Информационный архив проекта «Геном человека», 1990–2003 гг . Проверено 6 мая 2017 г.