УАТС1

УАТС1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 1B72, 1PUF
Идентификаторы
Псевдонимы	УАТС1 , Гомеобокс УАТС 1, CAKUHED
Внешние идентификаторы	Опустить : 176310 ; МГИ : 97495 ; Гомологен : 20574 ; GeneCards : PBX1 ; OMA : PBX1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1q23.3 Start 164,555,584 bp End 164,899,296 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 1 (mouse) Band 1 H2.3|1 75.95 cM Start 167,946,933 bp End 168,259,839 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in tail of epididymis body of uterus pars reticulata ganglionic eminence buccal mucosa cell optic nerve myometrium canal of the cervix seminal vesicula Brodmann area 23 Top expressed in Rostral migratory stream habenula vas deferens genital tubercle olfactory bulb external carotid artery median eminence ventral tegmental area internal carotid artery ciliary body More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function sequence-specific DNA binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding protein heterodimerization activity DNA-binding transcription factor activity DNA binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific transcription factor binding protein binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Cellular component cytoplasm nucleus transcription regulator complex nucleoplasm RNA polymerase II transcription regulator complex Biological process anterior/posterior pattern specification proximal/distal pattern formation positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle embryonic organ development embryonic hemopoiesis negative regulation of DNA-binding transcription factor activity transcription, DNA-templated sex differentiation multicellular organism development embryonic limb morphogenesis somatic stem cell population maintenance regulation of cell population proliferation adrenal gland development spleen development thymus development positive regulation of cell population proliferation urogenital system development regulation of transcription, DNA-templated regulation of ossification positive regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II negative regulation of neuron differentiation embryonic skeletal system development branching involved in ureteric bud morphogenesis steroid biosynthetic process cell differentiation animal organ morphogenesis positive regulation of transcription of Notch receptor target Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 5087 18514 Вместе ENSG00000185630 ENSMUSG00000052534 ЮниПрот P40424 P41778 RefSeq (мРНК) НМ_001204961 НМ_001204963 НМ_002585 НМ_001353130 НМ_001353131 НМ_001291508 НМ_001291509 НМ_008783 НМ_183355 RefSeq (белок) НП_001191890 НП_001191892 НП_002576 НП_001340059 НП_001340060 НП_001278437 НП_001278438 НП_032809 НП_899198 Местоположение (UCSC) Chr 1: 164,56 – 164,9 Мб Chr 1: 167,95 – 168,26 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор 1 пре-В-клеточного лейкоза представляет собой белок , который у человека кодируется PBX1 геном . Гомологичный белок у дрозофилы известен как экстрадентикул и вызывает изменения в эмбриональном развитии.

Функция

Исследования на мышах показывают, что PBX1 участвует в формировании костей и формировании скелета.

Взаимодействия

Было показано, что PBX1 взаимодействует с:

• НОХВ1 ,
• НОХB7 ,
• МЭИС1 , и
• Подготовка1 .

Гомолог плодовой мухи

Ген Drosophila melangoster , называемый extradenticle, кодирует гомеодоменовый белок, который на 71% похож на белок Pbx1 и считается гомологичным PBX1. экстрадентикул - гомеодоменный транскрипционный фактор экспрессируется во время эмбриогенеза и связан с морфологическими изменениями и развитием.

Снижение уровня экстрадентикул вызывает сегментарные трансформации, не влияя на функциональность или расположение гомеозисных генов. Полное удаление экстрадентикулярных белков как материнских, так и зиготных, приводит к изменениям из-за нарушения экспрессии неэкстрадентикулярных белков.

Исследование экспрессии белка экстрадентикул в эмбриональном развитии с помощью моноклональных антител показало, что он равномерно распределяется, а также исключается из ядер клеток до гаструляции . На стадии развития ретракции зародышевых полосок экстрадентикулярный белок начинает накапливаться в ядрах клеток по определенному образцу. крыльев и ног В проксимальных областях имагинальных дисков экстрадентикул присутствует в ядре, тогда как в дистальных областях он имеется только в цитоплазме.

Дальнейшее чтение

• Саньял М., Тунг Дж.В., Карсунки Х., Зенг Х., Селлери Л., Вайсман И.Л. и др. (май 2007 г.). «Развитие B-клеток прекращается в отсутствие протоонкогена Pbx1» . Кровь . 109 (10): 4191–4199. дои : 10.1182/кровь-2006-10-054213 . ПМЦ   1885499 . ПМИД   17244677 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
• Хуэй Х, Перфетти Р. (февраль 2002 г.). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки регулирует развитие поджелудочной железы во время эмбриогенеза и функцию островковых клеток во взрослом возрасте» . Европейский журнал эндокринологии . 146 (2): 129–141. дои : 10.1530/eje.0.1460129 . ПМИД   11834421 .
• Хунгер С.П., Галили Н., Кэрролл А.Дж., Крист В.М., Линк М.П., ​​Клири М.Л. (февраль 1991 г.). «t(1;19)(q23;p13) приводит к последовательному слиянию кодирующих последовательностей E2A и PBX1 при острых лимфобластных лейкозах» . Кровь . 77 (4): 687–693. дои : 10.1182/blood.V77.4.687.687 . ПМИД   1671560 .
• Моника К., Галили Н., Нурс Дж., Солтман Д., Клири М.Л. (декабрь 1991 г.). «PBX2 и PBX3, новые гомеобоксные гены, имеющие обширную гомологию с протоонкогеном человека PBX1» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (12): 6149–6157. дои : 10.1128/mcb.11.12.6149 . ПМК   361792 . ПМИД   1682799 .
• Нурс Дж., Меллентин Дж.Д., Галили Н., Уилкинсон Дж., Стэнбридж Э., Смит С.Д. и др. (февраль 1990 г.). «Хромосомная транслокация t(1;19) приводит к синтезу слитой гомеобоксной мРНК, которая кодирует потенциальный химерный фактор транскрипции» . Клетка . 60 (4): 535–545. дои : 10.1016/0092-8674(90)90657-Z . ПМИД   1967982 . S2CID   7975269 .
• Кампс MP, Мурре C, Сан XH, Балтимор D (февраль 1990 г.). «Новый ген гомеобокса вносит вклад в ДНК-связывающий домен транслокационного белка t(1;19) в pre-B ALL». Клетка . 60 (4): 547–555. дои : 10.1016/0092-8674(90)90658-2 . ПМИД   1967983 . S2CID   39661371 .
• Лу Кью, Райт Д.Д., член парламента от Кампса (июнь 1994 г.). «Слияние с E2A превращает гомеодоменовый белок Pbx1 в конститутивный активатор транскрипции при лейкозах человека, несущий транслокацию t (1;19)» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (6): 3938–3948. дои : 10.1128/mcb.14.6.3938 . ПМК   358760 . ПМИД   7910944 .
• Ван Дейк М.А., Вурхув П.М., Мурре С. (июль 1993 г.). «Pbx1 превращается в активатор транскрипции при приобретении N-концевой области E2A при пре-B-клеточном остром лимфобластоидном лейкозе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (13): 6061–6065. Бибкод : 1993PNAS...90.6061D . дои : 10.1073/pnas.90.13.6061 . ПМК   46867 . ПМИД   8327485 .
• Лу Ц, член парламента Кампса (апрель 1996 г.). «Структурные детерминанты внутри Pbx1, которые опосредуют кооперативное связывание ДНК с пентапептидсодержащими белками Hox: предложение модели комплекса Pbx1-Hox-ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (4): 1632–1640. дои : 10.1128/mcb.16.4.1632 . ПМК   231149 . ПМИД   8657138 .
• Бертельсен Дж., Заппавинья В., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Prep1, новый функциональный партнер белков Pbx» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1423–1433. дои : 10.1093/emboj/17.5.1423 . ПМК   1170490 . ПМИД   9482739 .
• Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1434–1445. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ   1170491 . ПМИД   9482740 .
• Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–597. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД   10052460 . S2CID   16122785 .
• Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Кёмвес Л.Г., Лоуренс Х.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 3051–3061. дои : 10.1128/MCB.19.4.3051 . ПМЦ   84099 . ПМИД   10082572 .
• Джейкобс Ю., Шнабель К.А., Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменовых белков Hox и TALE опосредует активность энхансера заднего мозга Hoxb2» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5134–5142. дои : 10.1128/MCB.19.7.5134 . ПМЦ   84356 . ПМИД   10373562 .
• Кнопфлер П.С., Бергстром Д.А., Уэцуки Т., Дак-Корытко И., Сан Ю.Х., Райт В.Е. и др. (сентябрь 1999 г.). «Консервативный мотив, N-концевой по отношению к ДНК-связывающим доменам миогенных факторов транскрипции bHLH, опосредует совместное связывание ДНК с pbx-Meis1/Prep1» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (18): 3752–3761. дои : 10.1093/нар/27.18.3752 . ПМК   148632 . ПМИД   10471746 . {{cite journal}}: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
• МакВиртер-младший, Нойтбум С.Т., Ванцевич Е.В., Моня Б.П., Даунинг-младший, Мурре С. (сентябрь 1999 г.). «Онкогенный гомеодоменный транскрипционный фактор E2A-Pbx1 активирует новый ген WNT при остром лимфобластном лейкозе pre-B» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (20): 11464–11469. Бибкод : 1999PNAS...9611464M . дои : 10.1073/pnas.96.20.11464 . ЧВК   18056 . ПМИД   10500199 .
• Шанмугам К., Грин Северная Каролина, Рамбальди И., Сарагови Х.У., Физерстоун М.С. (ноябрь 1999 г.). «PBX и MEIS как несвязывающиеся с ДНК партнеры в тримерных комплексах с белками НОХ» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7577–7588. дои : 10.1128/MCB.19.11.7577 . ПМЦ   84774 . ПМИД   10523646 .
• Миккола И., Бруун Дж.А., Холм Т., Йохансен Т. (февраль 2001 г.). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из парных сайтов связывания доменов путем независимого от ДНК рекрутирования различных гомеодоменовых белков» . Журнал биологической химии . 276 (6): 4109–4118. дои : 10.1074/jbc.M008882200 . ПМИД   11069920 .
• Тамим Ф., Вулфорд Дж.К., Богардус С., Прохазка М. (март 2001 г.). «Анализ PBX1 как гена-кандидата сахарного диабета 2 типа у индейцев пима». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1518 (1–2): 215–220. дои : 10.1016/S0167-4781(01)00189-0 . ПМИД   11267683 .
• Лю Ю, Макдональд Р.Дж., Свифт Г.Х. (май 2001 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции с помощью тримера PDX1.PBX1b.MEIS2b и сотрудничество со специфичным для поджелудочной железы базовым комплексом спираль-петля-спираль» . Журнал биологической химии . 276 (21): 17985–17993. дои : 10.1074/jbc.M100678200 . ПМИД   11279116 .
• Мал А., Стурниоло М., Шильц Р.Л., Гош М.К., Хартер М.Л. (апрель 2001 г.). «Роль гистондеацетилазы HDAC1 в модуляции транскрипционной активности MyoD: ингибирование миогенной программы» . Журнал ЭМБО . 20 (7): 1739–1753. дои : 10.1093/emboj/20.7.1739 . ПМК   145490 . ПМИД   11285237 .

Внешние ссылки

• PBX1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P40424 (фактор транскрипции 1 человеческого пре-B-клеточного лейкоза) на PDBe-KB .
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P41778 (фактор транскрипции 1 мышиного пре-B-клеточного лейкоза) на PDBe-KB .