GTF2E1

GTF2E1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1VD4, 2JTX, 2RNQ, 2RNR, 5IY9, 5IYC, 5IYD, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2E1 , FE, TF2E1, TFIIE-A, субъединица 1 общего фактора транскрипции IIE
Внешние идентификаторы	Опустить : 189962 ; МГИ : 1921447 ; Гомологен : 38062 ; Генные карты : GTF2E1 ; OMA : GTF2E1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 3 (human) Band 3q13.33 Start 120,742,637 bp End 120,783,069 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 16 (mouse) Band 16|16 B3 Start 37,330,152 bp End 37,360,151 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in oocyte secondary oocyte testicle gonad periodontal fiber sperm monocyte stromal cell of endometrium right adrenal cortex islet of Langerhans Top expressed in hand superior cervical ganglion otic vesicle endocardial cushion primitive streak medial ganglionic eminence abdominal wall atrioventricular valve iris trigeminal ganglion More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function metal ion binding sequence-specific DNA binding protein binding RNA polymerase II complex binding TFIIH-class transcription factor complex binding RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Cellular component nucleus nucleoplasm transcription factor TFIID complex cytosol transcription preinitiation complex transcription factor TFIIE complex Biological process regulation of transcription, DNA-templated transcription by RNA polymerase II transcription, DNA-templated transcription initiation from RNA polymerase II promoter snRNA transcription by RNA polymerase II viral process transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2960 74197 Вместе ENSG00000153767 ENSMUSG00000022828 ЮниПрот P29083 Q9D0D5 RefSeq (мРНК) НМ_005513 НМ_028812 НМ_001355727 RefSeq (белок) НП_005504 НП_083088 НП_001342656 Местоположение (UCSC) Chr 3: 120,74 – 120,78 Мб Чр 16: 37,33 – 37,36 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 1 общего фактора транскрипции IIE ( GTF2E1 ), также известная как субъединица альфа фактора инициации транскрипции IIE (TFIIE-альфа), представляет собой белок , который у людей кодируется GTF2E1 геном .

См. также

• Фактор транскрипции II E

Дальнейшее чтение

• Джеронимо С, Форже Д, Бушар А, Ли Кью, Чуа Дж, Пойтрас С, Терьен С, Бержерон Д, Бурасса С, Гринблатт Дж, Шабо Б, Пуарье Г.Г., Хьюз Т.Р., Бланшетт М, Прайс Д.Х., Куломб Б (июль 2007 г.) ). «Систематический анализ сети взаимодействия белков человеческого транскрипционного аппарата выявил идентичность фермента, кэпирующего 7SK» . Молекулярная клетка . 27 (2): 262–74. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.027 . ПМЦ   4498903 . ПМИД   17643375 .
• Ланжелье М.Ф., Форже Д., Рохас А., Порлье Ю., Бертон З.Ф., Куломб Б. (октябрь 2001 г.). «Структурные и функциональные взаимодействия транскрипционного фактора (ТФ) IIA с TFIIE и TFIIF при инициации транскрипции РНК-полимеразой II» . Журнал биологической химии . 276 (42): 38652–7. дои : 10.1074/jbc.M106422200 . ПМЦ   4492724 . ПМИД   11509574 .
• Вега А, Салас А, Милн РЛ, Карраседо Б, Рибас Г, Руибаль А, де Леон АС, Гонсалес-Эрнандес А, Бенитес Х, Карраседо А (январь 2009 г.). «Оценка новых кандидатов SNP как факторов риска с низкой пенетрантностью при спорадическом раке молочной железы: двухэтапное испанское исследование случай-контроль». Гинекологическая онкология . 112 (1): 210–4. дои : 10.1016/j.ygyno.2008.09.012 . ПМИД   18950845 .
• Ямамото С., Ватанабэ Ю., ван дер Спек П.Дж., Ватанабэ Т., Фудзимото Х., Ханаока Ф., Окума Ю. (январь 2001 г.). «Исследования функции TFIIE нематод выявили связь между фосфорилированием Ser-5 РНК-полимеразы II и переходом от инициации транскрипции к элонгации» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (1): 1–15. дои : 10.1128/MCB.21.1.1-15.2001 . ПМК   86563 . ПМИД   11113176 .
• Ватанабэ Т., Хаяси К., Танака А., Фурумото Т., Ханаока Ф., Окума Ю. (апрель 2003 г.). «Карбокси-конец малой субъединицы TFIIE регулирует переход от инициации транскрипции к элонгации с помощью РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (8): 2914–26. дои : 10.1128/mcb.23.8.2914-2926.2003 . ПМЦ   152561 . ПМИД   12665589 .
• Джаухари А., Уринг М., Де Карло С., Распятие С., Токкини-Валентини Г., Морас Д., Шульц П., Потершман А. (май 2006 г.). «Структура и олигомерное состояние фактора транскрипции человека TFIIE» . Отчеты ЭМБО . 7 (5): 500–5. дои : 10.1038/sj.embor.7400663 . ПМЦ   1479554 . ПМИД   16547462 .
• Орфанидес Г., Лагранж Т., Рейнберг Д. (ноябрь 1996 г.). «Общие факторы транскрипции РНК-полимеразы II» . Гены и развитие . 10 (21): 2657–83. дои : 10.1101/gad.10.21.2657 . ПМИД   8946909 .
• Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» ( ) 16 1 : 55–65 « 10.1101 /gr.4039406 . PMID   . . .   16344560 doi
• Аршамбо Дж., Пан Дж., Дамус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С., Дамус М.Э., Гринблатт Дж. (октябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица человеческой протеинфосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . Журнал биологической химии . 273 (42): 27593–601. дои : 10.1074/jbc.273.42.27593 . ПМИД   9765293 .
• Ким Т.К., Эбрайт Р.Х., Рейнберг Д. (май 2000 г.). «Механизм плавления АТФ-зависимого промотора транскрипционным фактором IIH». Наука . 288 (5470): 1418–22. Бибкод : 2000Sci...288.1418K . дои : 10.1126/science.288.5470.1418 . ПМИД   10827951 .
• Икеда К., Галле Дж. П., Стельцер Г., Мейстернст М., Каваками К. (январь 1998 г.). «Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии транскрипционным фактором AREB6 с гомеодоменом цинкового пальца» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 10–8. дои : 10.1128/mcb.18.1.10 . ПМЦ   121442 . ПМИД   9418848 .
• Ю Х, Ли П, Редер Р.Г., Ван З (июль 2001 г.). «Ингибирование транскрипции, опосредованной рецептором андрогенов, с помощью аминоконцевого энхансера расщепления» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (14): 4614–25. дои : 10.1128/MCB.21.14.4614-4625.2001 . ПМЦ   87125 . ПМИД   11416139 .
• Ди Лелло П., Миллер Дженкинс Л.М., Мас С., Ланглуа С., Малицкая Е., Фраде-Тюркотт А., Аршамбо Дж., Лего П., Омичински Дж.Г. (январь 2008 г.). «p53 и TFIIEalpha имеют общий сайт связывания на субъединице Tfb1/p62 TFIIH» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (1): 106–11. Бибкод : 2008PNAS..105..106D . дои : 10.1073/pnas.0707892105 . ПМК   2224167 . ПМИД   18160537 .
• Лю Л., Исихара К., Ичимура Т., Фудзита Н., Хино С., Томита С., Ватанабэ С., Сайто Н., Ито Т., Накао М. (февраль 2009 г.). «MCAF1/AM участвует в Sp1-опосредованном поддержании теломеразной активности, связанной с раком» . Журнал биологической химии . 284 (8): 5165–74. дои : 10.1074/jbc.M807098200 . ПМИД   19106100 .
• Окамото Т., Ямамото С., Ватанабэ Ю., Охта Т., Ханаока Ф., Редер Р.Г., Окума Ю. (июль 1998 г.). «Анализ роли TFIIE в регуляции транскрипции посредством исследования структурно-функциональной субъединицы TFIIEbeta» . Журнал биологической химии . 273 (31): 19866–76. дои : 10.1074/jbc.273.31.19866 . ПМИД   9677423 .
• Окуда М., Танака А., Араи Ю., Сато М., Окамура Х., Нагадой А., Ханаока Ф., Окума Ю., Нишимура Ю. (декабрь 2004 г.). «Новая структура цинковых пальцев в большой субъединице общего фактора транскрипции человека TFIIE» . Журнал биологической химии . 279 (49): 51395–403. дои : 10.1074/jbc.M404722200 . ПМИД   15385556 .
• Окуда М., Танака А., Сато М., Мизута С., Такадзава М., Окума Ю., Нисимура Ю. (апрель 2008 г.). «Структурное понимание взаимодействия TFIIE-TFIIH: TFIIE и p53 имеют общую область связывания на TFIIH» . Журнал ЭМБО . 27 (7): 1161–71. дои : 10.1038/emboj.2008.47 . ПМК   2275666 . ПМИД   18354501 .
• Фрейзер Р.А., Херд DJ, Адам С., Лавин AC, Ле Дуарен Б, Тора Л., Лоссон Р., Рошетт-Эгли С., Шамбон П. (июнь 1998 г.). «Предполагаемый кофактор TIF1альфа представляет собой протеинкиназу, которая гиперфосфорилируется при взаимодействии с лигандированными ядерными рецепторами» . Журнал биологической химии . 273 (26): 16199–204. дои : 10.1074/jbc.273.26.16199 . ПМИД   9632676 .
• Раваси Т., Сузуки Х., Каннистрачи К.В., Катаяма С., Бажич В.Б., Тан К., Акалин А., Шмайер С., Канамори-Катаяма М., Бертин Н., Карнинчи П., Дауб К.О., Форрест А.Р., Гоф Дж., Гриммонд С., Хан Дж.Х., Хашимото Т, Хиде В, Хофманн О, Камбуров А, Каур М, Каваджи Х, Кубосаки А, Лассманн Т, ван Нимвеген Е, Макферсон ЧР, Огава С, Радованович А, Шварц А, Тисдейл РД, Тегнер Дж, Ленхард Б, Тейхманн С.А., Аракава Т., Ниномия Н., Мураками К., Тагами М., Фукуда С., Имамура К., Кай С., Исихара Р., Китадзуме Ю., Каваи Дж., Хьюм Д.А., Идекер Т., Хаяшизаки Ю. (март 2010 г.). «Атлас комбинаторной регуляции транскрипции у мыши и человека» . Клетка . 140 (5): 744–52. дои : 10.1016/j.cell.2010.01.044 . ПМЦ   2836267 . ПМИД   20211142 .