Protein-coding gene in the species Homo sapiens
НФКБ1 Идентификаторы Псевдонимы NFKB1 Внешние идентификаторы ОМИМ : 164011 ; МГИ : 97312 ; Гомологен : 2971 ; Генные карты : NFKB1 ; ОМА : NFKB1 — ортологи показывать Мышь ) Chr. Chromosome 3 (mouse)[2] Band 3 G3|3 62.82 cM Start 135,290,416 bp [2] End 135,397,308 bp [2]
Викиданные
Субъединица p105 ядерного фактора NF-каппа-B представляет собой белок , который у человека кодируется NFKB1 геном . [5]
Этот ген кодирует белок 26S массой 105 кДа, который может подвергаться котрансляционному процессингу протеасомой с образованием белка массой 50 кДа. Белок массой 105 кДа представляет собой специфичный для белка Rel ингибитор транскрипции, а белок массой 50 кДа представляет собой ДНК-связывающую субъединицу белкового комплекса NF-kappaB ( NF-κB ). NF-κB представляет собой фактор транскрипции , который активируется различными внутри- и внеклеточными стимулами, такими как цитокины , свободные окислительные радикалы, ультрафиолетовое облучение, а также бактериальные или вирусные продукты. Активированный NF-κB транслоцируется в ядро и стимулирует экспрессию генов, участвующих в широком спектре биологических функций; более 200 известных генов являются мишенями NF-κB в различных типах клеток в определенных условиях. Несоответствующая активация NF-κB связана с рядом воспалительных заболеваний, тогда как стойкое ингибирование NF-κB приводит к неправильному развитию иммунных клеток или задержке роста клеток. [6]
Было показано, что NFKB1 взаимодействует с:
БКЛ3 , [7] [8] [9] C22orf25 , HDAC1 , [10] ХМГА2 [11] ИКК2 , [7] [12] ITGB3BP , [13] IκBα , [14] [15] ЛИЛ1 , [16] МАП3К7ИП2 , [17] МАП3К8 , [18] [19] МУЖЧИНЫ1 , [20] НФКБ2 , [18] НФКБИ , [21] НОТЧ1 , [22] [23] Коактиватор ядерного рецептора 1 , [24] [25] РЕЛА , [18] [26] РЭЛБ , [18] СТАТ3 , [27] СТАТ6 , [28] TSC22D3 . [29]
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109320 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028163 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Мейер Р., Хатада Э.Н., Хоманн Х.П., Хайкер М., Барч С., Ретлисбергер У., Лам Х.В., Шлагер Э.Дж., ван Лун А.П., Шайдерайт К. (март 1991 г.). «Клонирование ДНК-связывающей субъединицы человеческого ядерного фактора каппа B: уровень его мРНК строго регулируется эфиром форбола или фактором некроза опухоли альфа» . Proc Natl Acad Sci США . 88 (3): 966–70. Бибкод : 1991ПНАС...88..966М . дои : 10.1073/pnas.88.3.966 ПМК 50935 ПМИД 1992489 . ^ «Ген Энтрез: энхансер гена ядерного фактора NF-κB каппа-легкого полипептида в B-клетках 1 (p105)» . ^ Перейти обратно: а б Хейсмейер В., Краппманн Д., Вульчин Ф.Г., Шайдерайт К. (сентябрь 1999 г.). «NF-kappaB p105 является мишенью киназ IkappaB и контролирует индукцию сигнала комплексов Bcl-3-p50» . ЭМБО Дж . 18 (17): 4766–78. дои : 10.1093/emboj/18.17.4766 . ПМЦ 1171549 ПМИД 10469655 . ^ Торнбург, штат Нью-Джерси, Патманатан Р., Рааб-Трауб Н. (декабрь 2003 г.). «Активация комплексов ядерный фактор-каппаB p50 гомодимер/Bcl-3 при карциноме носоглотки». Рак Рез . 63 (23): 8293–301. ПМИД 14678988 . ^ Науманн М., Вульчин Ф.Г., Шайдерайт К. (январь 1993 г.). «Предшественник NF-каппа B p105 и протоонкогенный продукт Bcl-3 представляют собой молекулы I каппа B и контролируют ядерную транслокацию NF-каппа B» . ЭМБО Дж . 12 (1): 213–22. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05647.x . ПМЦ 413194 ПМИД 8428580 . ^ Чжун Х., Мэй М.Дж., Джими Э., Гош С. (март 2002 г.). «Статус фосфорилирования ядерного NF-каппа B определяет его связь с CBP/p300 или HDAC-1» . Мол. Клетка . 9 (3): 625–36. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00477-x ПМИД 11931769 . ^ Норо Б., Личери Б., Сгарра Р., Рустиги А., Тессари М.А., Чау К.Ю., Оно С.Дж., Джанкотти В., Манфиолетти Г. (апрель 2003 г.). «Молекулярное исследование архитектурного фактора транскрипции HMGA2». Биохимия . 42 (15): 4569–77. дои : 10.1021/bi026605k . ПМИД 12693954 . S2CID 39605320 . ^ Хейсмейер В., Краппманн Д., Хатада Э.Н., Шайдерайт К. (февраль 2001 г.). «Общие пути убиквитинирования и деградации предшественника NF-kappaB p105 и IkappaBalpha, индуцированного киназой IkappaB SCF (betaTrCP)» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1024–35. дои : 10.1128/MCB.21.4.1024-1035.2001 . ПМК 99557 ПМИД 11158290 . ^ Беста Ф., Массберг С., Бранд К., Мюллер Э., Пейдж С., Грюнер С., Лоренц М., Садул К., Коланус В., Лендьел Э., Гаваз М. (октябрь 2002 г.). «Роль бета (3)-эндонексина в регуляции NF-kappaB-зависимой экспрессии рецептора активатора плазминогена урокиназного типа» . Дж. Клеточная наука . 115 (Часть 20): 3879–88. дои : 10.1242/jcs.00081 ПМИД 12244126 . ^ Хэй, округ Колумбия, Кемп, Г.Д., Даргемонт С., Хэй RT (май 2001 г.). «Взаимодействие между hnRNPA1 и IkappaBalpha необходимо для максимальной активации NF-kappaB-зависимой транскрипции» . Мол. Клетка. Биол . 21 (10): 3482–90. дои : 10.1128/MCB.21.10.3482-3490.2001 . ПМЦ 100270 ПМИД 11313474 . ^ Малек С., Хаксфорд Т., Гош Г. (сентябрь 1998 г.). «Икаппа-бальфа функционирует посредством прямых контактов с сигналами ядерной локализации и ДНК-связывающими последовательностями NF-каппаВ» . Ж. Биол. Хим . 273 (39): 25427–35. дои : 10.1074/jbc.273.39.25427 ПМИД 9738011 . ^ Феррье Р., Нугаред Р., Дусе С., Кан-Перлес Б., Имбер Дж., Матье-Махуль Д. (январь 1999 г.). «Физическое взаимодействие белка bHLH LYL1 и NF-kappaB1 p105» . Онкоген . 18 (4): 995–1005. дои : 10.1038/sj.onc.1202374 ПМИД 10023675 . ^ Пэк С.Х., Оги К.А., Роуз Д.В., Ку Э.Х., Гласс С.К., Розенфельд М.Г. (июль 2002 г.). «Обмен комплексов корепрессора N-CoR и коактиватора Tip60 связывает экспрессию генов с помощью NF-kappaB и белка-предшественника бета-амилоида» . Клетка . 110 (1): 55–67. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00809-7 ПМИД 12150997 . S2CID 17679498 . ^ Перейти обратно: а б с д Баумистер Т, Баух А, Раффнер Х, Ангранд П.О., Бергамини Г, Кротон К., Крусиа С, Эберхард Д., Ганьер Дж., Гиделли С., Хопф С., Хузе Б., Мангано Р., Мишон А.М., Ширле М., Шлегль Дж., Шваб М. , Штейн М.А., Бауэр А., Казари Г., Древес Г., Гэвин А.С., Джексон Д.Б., Джоберти Г., Нойбауэр Г., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Г. (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 . ^ Белич, член парламента, Салмерон А., Джонстон Л.Х., Лей С.С. (январь 1999 г.). «Киназа TPL-2 регулирует протеолиз NF-kappaB-ингибирующего белка NF-kappaB1 p105». Природа . 397 (6717): 363–8. Бибкод : 1999Natur.397..363B . дои : 10.1038/16946 . ПМИД 9950430 . S2CID 4391108 . ^ Хеппнер С., Билимория К.Ю., Агарвал С.К., Кестер М., Уитти Л.Дж., Гуру С.С., Чандрасехараппа С.К., Коллинз Ф.С., Шпигель А.М., Маркс С.Дж., Бернс А.Л. (август 2001 г.). «Белок-супрессор опухоли менин взаимодействует с белками NF-kappaB и ингибирует опосредованную NF-kappaB трансактивацию» . Онкоген . 20 (36): 4917–25. дои : 10.1038/sj.onc.1204529 ПМИД 11526476 . ^ Ли З., Набель Г.Дж. (октябрь 1997 г.). «Новый член семейства белков I kappaB, I kappaB epsilon, ингибирует RelA (p65)-опосредованную транскрипцию NF-kappaB» . Мол. Клетка. Биол . 17 (10): 6184–90. дои : 10.1128/mcb.17.10.6184 . ПМЦ 232469 ПМИД 9315679 . ^ Гуань Э., Ван Дж., Лаборда Дж., Норкросс М., Бауэрле П.А., Хоффман Т. (май 1996 г.). «Связанный с Т-клеточной лейкемией человеческий Notch/связанный с транслокацией гомолог Notch обладает I каппа B-подобной активностью и физически взаимодействует с белками ядерного фактора каппа B в Т-клетках» . Дж. Эксп. Мед . 183 (5): 2025–32. дои : 10.1084/jem.183.5.2025 . ПМК 2192574 ПМИД 8642313 . ^ Ван Дж., Шелли Л., Миле Л., Бойкинс Р., Норкросс М.А., Гуань Э. (июль 2001 г.). «Человеческий Notch-1 ингибирует активность NF-каппа B в ядре посредством прямого взаимодействия с участием нового домена» . Дж. Иммунол . 167 (1): 289–95. дои : 10.4049/jimmunol.167.1.289 ПМИД 11418662 . ^ Ли С.К., На С.Ю., Юнг С.Ю., Чхве Дж.Э., Джун Б.Х., Чеонг Дж., Мельцер П.С., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (июнь 2000 г.). «Активация белка-1, ядерного фактора-каппаВ и фактора ответа сыворотки как новых молекул-мишеней коактиватора транскрипции, амплифицированного раком, ASC-2» . Мол. Эндокринол . 14 (6): 915–25. дои : 10.1210/mend.14.6.0471 ПМИД 10847592 . ^ На С.Ю., Ли С.К., Хан С.Дж., Чой Х.С., Им С.Ю., Ли Дж.В. (май 1998 г.). «Коактиватор-1 стероидного рецептора взаимодействует с субъединицей р50 и коактивирует трансактивацию, опосредованную ядерным фактором каппаВ» . Ж. Биол. Хим . 273 (18): 10831–4. дои : 10.1074/jbc.273.18.10831 ПМИД 9556555 . ^ Палвимо Дж.Дж., Рейникайнен П., Иконен Т., Каллио П.Дж., Мойланен А., Янне О.А. (сентябрь 1996 г.). «Взаимная транскрипционная интерференция между RelA и андрогенным рецептором» . Ж. Биол. Хим . 271 (39): 24151–6. дои : 10.1074/jbc.271.39.24151 ПМИД 8798655 . ^ Ю З, Чжан В, Коне BC (октябрь 2002 г.). «Преобразователи сигналов и активаторы транскрипции 3 (STAT3) ингибируют транскрипцию индуцибельного гена синтазы оксида азота путем взаимодействия с ядерным фактором каппаВ» . Биохим. Дж . 367 (Часть 1): 97–105. дои : 10.1042/BJ20020588 . ПМЦ 1222853 ПМИД 12057007 . ^ Шен Ч., Ставнезер Дж. (июнь 1998 г.). «Взаимодействие stat6 и NF-kappaB: прямая ассоциация и синергическая активация транскрипции, индуцированной интерлейкином-4» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3395–404. дои : 10.1128/mcb.18.6.3395 . ПМК 108921 ПМИД 9584180 . ^ Айрольди Э., Мильорати Дж., Брусколи С., Маркетти С., Золло О., Каннариле Л., Д'Адамио Ф., Риккарди К. (август 2001 г.). «Модуляция активации Т-клеток с помощью глюкокортикоид-индуцированного фактора лейциновой молнии посредством ингибирования ядерного фактора каппаВ» . Кровь . 98 (3): 743–53. дои : 10.1182/blood.v98.3.743 ПМИД 11468175 . Болдуин А.С. (1996). «Белки NF-каппа B и I каппа B: новые открытия и идеи» . Анну. Преподобный Иммунол . 14 : 649–83. doi : 10.1146/annurev.immunol.14.1.649 . ПМИД 8717528 . Снасель Й, Пихова I (1997). «Расщепление белков клетки-хозяина протеазой ВИЧ-1». Фолиа Биол. (Прага) . 42 (5): 227–30. дои : 10.1007/BF02818986 . ПМИД 8997639 . S2CID 7617882 . Чен Ф., Кастранова В., Ши Х., Демерс Л.М. (1999). «Новое понимание роли ядерного фактора каппаВ, повсеместного транскрипционного фактора в возникновении заболеваний» . Клин. Хим . 45 (1): 7–17. дои : 10.1093/клинчем/45.1.7 ПМИД 9895331 . Боттекс-Готье С., Поллет С., Фавье А., Видаль Д.Р. (2002). «[Факторы транскрипции Rel/NF-каппа-B: сложная роль в клеточной регуляции]». Патол. Биол . 50 (3): 204–11. дои : 10.1016/s0369-8114(02)00289-4 . ПМИД 11980335 . Гарг А, Аггарвал Б.Б. (2002). «Ядерный фактор транскрипции каппаB как мишень для разработки лекарств от рака» . Лейкемия . 16 (6): 1053–68. дои : 10.1038/sj.leu.2402482 ПМИД 12040437 . Сунь З., Андерссон Р. (2003). «Активация и ингибирование NF-kappaB: обзор» . Шок . 18 (2): 99–106. дои : 10.1097/00024382-200208000-00001 ПМИД 12166787 . Меркурио AM (2003). «Инвазивный рак кожи: интегрин Ras и альфа6бета4 лидируют» . Раковая клетка . 3 (3): 201–2. дои : 10.1016/S1535-6108(03)00049-7 ПМИД 12676577 . Сунь СК, Сяо Г (2004). «Дерегуляция NF-kappaB и его вышестоящих киназ при раке». Раковые метастазы Rev. 22 (4): 405–22. дои : 10.1023/А:1023733231406 . ПМИД 12884915 . S2CID 44227245 . Кухарчак Дж., Симмонс М.Дж., Фан Ю., Гелинас С. (2004). «Быть или не быть: NF-каппаВ – вот ответ – роль Rel/NF-каппаВ в регуляции апоптоза» . Онкоген . 22 (56): 8961–82. дои : 10.1038/sj.onc.1207230 ПМИД 14663476 . Су Дж, Рабсон А.Б. (2004). «Активация NF-kappaB при раке простаты человека: важный медиатор или эпифеномен?». Дж. Селл. Биохим . 91 (1): 100–17. дои : 10.1002/jcb.10729 . ПМИД 14689584 . S2CID 84116960 . Мутумани К., Десаи Б.М., Хван Д.С., Чу А.Ю., Ледди DJ, Тьеу К.П., Рао Р.Г., Вайнер Д.Б. (2004). «Впр ВИЧ-1 и противовоспалительная активность». ДНК Клеточная Биол . 23 (4): 239–47. дои : 10.1089/104454904773819824 . ПМИД 15142381 . Шмитц М.Л., Маттиоли И., Бусс Х., Крахт М. (2005). «NF-kappaB: многогранный фактор транскрипции, регулируемый на нескольких уровнях». ХимБиоХим . 5 (10): 1348–58. дои : 10.1002/cbic.200400144 . ПМИД 15457532 . S2CID 85775279 . Пайс-Мейсон, Калифорния, Брэди Дж. Н. (2006). «Подготовка почвы для трансформации: налоговое ингибирование функции р53 HTLV-1» . Передний. Биосци . 10 (1–3): 919–30. дои : 10.2741/1586 ПМИД 15569630 . S2CID 35215552 . Джозеф А.М., Кумар М., Митра Д. (2005). «Нэф: «необходимый и принудительный фактор» при ВИЧ-инфекции». Курс. ВИЧ Рез . 3 (1): 87–94. дои : 10.2174/1570162052773013 . ПМИД 15638726 . Ле Рузик Э, Бенишу С (2006). «Белок Vpr ВИЧ-1: различные роли в жизненном цикле вируса» . Ретровирусология . 2:11 . дои : 10.1186/1742-4690-2-11 ПМК 554975 ПМИД 15725353 . Чжао Р.Ю., старейшина RT (2005). «Вирусные инфекции и регуляция G2/M клеточного цикла» . Сотовый Res . 15 (3): 143–9. дои : 10.1038/sj.cr.7290279 ПМИД 15780175 . Чжао Р.Ю., Букринский М., Старейшина RT (2005). «Вирусный белок R ВИЧ-1 (Vpr) и клеточные реакции хозяина». Индийский Дж. Мед. Рез . 121 (4): 270–86. ПМИД 15817944 . Мутумани К., Чу А.Ю., Хван Д.С., Уген К.Е., Вайнер Д.Б. (2006). «Впр ВИЧ-1: повышение чувствительности опухолей к апоптозу». Текущая доставка лекарств . 1 (4): 335–44. дои : 10.2174/1567201043334614 . ПМИД 16305395 . Куртуа Г., Смахи А. (2006). «Генетические заболевания, связанные с NF-каппаВ» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 843–51. дои : 10.1038/sj.cdd.4401841 ПМИД 16397577 . Маттсон, член парламента, Мефферт, М.К. (2006). «Роль NF-kappaB в выживании, пластичности и заболевании нервных клеток» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 852–60. дои : 10.1038/sj.cdd.4401837 ПМИД 16397579 . Шмитц М.Л., Краппманн Д. (2006). «Контроль активации NF-kappaB в Т-клетках с помощью костимулирующих рецепторов» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 834–42. дои : 10.1038/sj.cdd.4401845 ПМИД 16410801 . Янссенс С, Чопп Дж (2006). «Сигналы изнутри: реакция NF-kappaB, вызванная повреждением ДНК» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 773–84. дои : 10.1038/sj.cdd.4401843 ПМИД 16410802 . Перкинс Н.Д., Гилмор Т.Д. (2006). «Хороший полицейский, плохой полицейский: разные лица NF-kappaB» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 759–72. дои : 10.1038/sj.cdd.4401838 ПМИД 16410803 . Вейль Р., Израиль А. (2006). «Расшифровка пути от TCR к NF-kappaB» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 826–33. дои : 10.1038/sj.cdd.4401856 ПМИД 16439988 . Ким Х.Дж., Хоук Н., Болдуин А.С. (2006). «NF-kappaB и IKK как терапевтические мишени при раке» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 738–47. дои : 10.1038/sj.cdd.4401877 ПМИД 16485028 . Браун Т., Карвалью Г., Фабр С., Грожан Дж., Фено П., Кремер Г. (2006). «Нацеливание на NF-каппаВ при гематологических злокачественных новообразованиях» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 748–58. дои : 10.1038/sj.cdd.4401874 ПМИД 16498458 . Боттеро В., Витофф С., Верма И.М. (2006). «NF-каппаВ и регуляция кроветворения» . Гибель клеток отличается . 13 (5): 785–97. дои : 10.1038/sj.cdd.4401888 ПМИД 16528384 . Сяо Г (2007). «Аутофагия и NF-κB борются за судьбу» . Цитокиновый фактор роста Rev. 18 (3–4): 233–43. doi : 10.1016/j.cytogfr.2007.04.006 . ПМК 2810660 ПМИД 17485237 .
показывать галерея PDB
1bfs : STRUCTURE OF NF-KB P50 HOMODIMER BOUND TO A KB SITE
1ikn : IKAPPABALPHA/NF-KAPPAB COMPLEX
1le5 : Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to an IFNb-kB
1le9 : Crystal structure of a NF-kB heterodimer bound to the Ig/HIV-kB siti
1lei : The kB DNA sequence from the HLV-LTR functions as an allosteric regulator of HIV transcription
1nfi : I-KAPPA-B-ALPHA/NF-KAPPA-B COMPLEX
1nfk : STRUCTURE OF THE NUCLEAR FACTOR KAPPA-B (NF-KB) P50 HOMODIMER
1ooa : CRYSTAL STRUCTURE OF NF-kB(p50)2 COMPLEXED TO A HIGH-AFFINITY RNA APTAMER
1svc : NFKB P50 HOMODIMER BOUND TO DNA
1u36 : Crystal structure of WLAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1u3j : Crystal structure of MLAV mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1u3y : Crystal structure of ILAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1u3z : Crystal structure of MLAC mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1u41 : Crystal structure of YLGV mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1u42 : Crystal structure of MLAM mutant of dimerisation domain of NF-kB p50 transcription factor
1vkx : CRYSTAL STRUCTURE OF THE NFKB P50/P65 HETERODIMER COMPLEXED TO THE IMMUNOGLOBULIN KB DNA
2dbf : Solution structure of the Death domain in human Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit
2i9t : Structure of NF-kB p65-p50 heterodimer bound to PRDII element of B-interferon promoter
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
show (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
hide (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
