КУП-ТФИ

НР2Ф1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2EBL
Идентификаторы
Псевдонимы	NR2F1 , BBOAS, BBSOAS, COUP-TFI, EAR-3, EAR3, ERBAL3, NR2F2, SVP44, TCFCOUP1, TFCOUP1, член 1 группы F подсемейства 2 ядерных рецепторов, COUPTF1
Внешние идентификаторы	Опустить : 132890 ; МГИ : 1352451 ; Гомологен : 21158 ; Генные карты : NR2F1 ; ОМА : NR2F1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q15 Start 93,583,222 bp End 93,594,611 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13 C1|13 41.38 cM Start 78,337,092 bp End 78,347,876 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in ventricular zone optic nerve seminal vesicula trigeminal ganglion left uterine tube germinal epithelium ganglionic eminence parietal pleura lower lobe of lung primary visual cortex Top expressed in vestibular membrane of cochlear duct lateral geniculate nucleus anterior amygdaloid area barrel cortex medial dorsal nucleus ventricular zone vas deferens saccule ciliary body subiculum More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA-binding transcription factor activity steroid hormone receptor activity sequence-specific DNA binding transcription coactivator activity DNA binding nuclear receptor activity zinc ion binding protein binding metal ion binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific retinoic acid-responsive element binding Cellular component nucleus nucleoplasm cytosol Biological process transcription initiation from RNA polymerase II promoter regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription, DNA-templated signal transduction steroid hormone mediated signaling pathway intracellular receptor signaling pathway positive regulation of nucleic acid-templated transcription nervous system development negative regulation of neuron projection development positive regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 7025 13865 Вместе ENSG00000175745 ENSMUSG00000069171 ЮниПрот P10589 Q60632 RefSeq (мРНК) НМ_005654 НМ_010151 НМ_001347538 НМ_001347539 RefSeq (белок) НП_005645 showНП_001334467 НП_001334468 НП_034281 НП_001390702 НП_001390704 NP_001390706 Местоположение (UCSC) Чр 5: 93,58 – 93,59 Мб Чр 13: 78,34 – 78,35 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

COUP-TF1 ( COUP - транскрипционный F актор 1 ), также известный как NR2F1 ( ядерных подсемейство рецепторов 2 1 , группа F , член - ), представляет собой белок , который у людей кодируется NR2F1 геном . Этот белок является членом ядерных рецепторов гормонов семейства рецепторов стероидных гормонов .

Функция

Coup ( куриного овальбумина вышестоящий промотор Транскрипционный фактор ) связывается с промотором овальбумина и в сочетании с другим белком ( S300-II ) стимулирует инициацию транскрипции . COUP-TF1 связывается как с прямыми повторами, так и с палиндромами мотива 5'-AGGTCA-3'.

Взаимодействия

Было показано, что COUP-TFI взаимодействует с:

• БКЛ11А ,
• БКЛ11Б ,
• КОПС2 , и
• СОЭ1 .

Клинический

Мутации в этом гене связаны с синдромом атрофии зрительного нерва Боша-Бунстра-Шаафа .

Внешние ссылки

• человека NR2F1 Расположение генома NR2F1 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
• человека Местоположение генома NR2F2 и NR2F2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

• Кливер С.А., Умесоно К., Хейман Р.А., Мангельсдорф Д.Д., Дайк Дж.А., Эванс Р.М. (февраль 1992 г.). «Взаимодействия ретиноидного рецептора X-COUP-TF модулируют передачу сигналов ретиноевой кислоты» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (4): 1448–52. Бибкод : 1992PNAS...89.1448K . дои : 10.1073/pnas.89.4.1448 . ПМК   48468 . ПМИД   1311101 .
• Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора гормона щитовидной железы, рецептора ретиноевой кислоты, рецептора ретиноида X, фактора транскрипции промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени» . Молекулярная эндокринология . 6 (9): 1468–78. дои : 10.1210/mend.6.9.1331778 . ПМИД   1331778 . S2CID   24291055 .
• Инг Н.Х., Бикман Дж.М., Цай С.Ю., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (сентябрь 1992 г.). «Члены суперсемейства рецепторов стероидных гормонов взаимодействуют с TFIIB (S300-II)» . Журнал биологической химии . 267 (25): 17617–23. дои : 10.1016/S0021-9258(19)37087-5 . ПМИД   1517211 .
• Ван Л.Х., Цай С.Ю., Кук Р.Г., Битти В.Г., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (июль 1989 г.). «Транскрипционный фактор COUP является членом суперсемейства стероидных рецепторов». Природа . 340 (6229): 163–6. Бибкод : 1989Natur.340..163W . дои : 10.1038/340163a0 . ПМИД   2739739 . S2CID   4364164 .
• Миядзима Н., Кадоваки Ю., Фукусигэ С., Симидзу С., Семба К., Яманаси Ю., Мацубара К., Тоёшима К., Ямамото Т. (декабрь 1988 г.). «Идентификация двух новых членов суперсемейства erbA путем молекулярного клонирования: генные продукты обоих тесно связаны друг с другом» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (23): 11057–74. дои : 10.1093/нар/16.23.11057 . ПМК   338996 . ПМИД   2905047 .
• Савая Б.Е., Рор О., Аунис Д., Шеффер Э. (сентябрь 1996 г.). «Фактор транскрипции промотора куриного овальбумина, транскрипционный активатор экспрессии гена ВИЧ-1 в клетках головного мозга человека» . Журнал биологической химии . 271 (38): 23572–6. дои : 10.1074/jbc.271.38.23572 . ПМИД   8798567 .
• Рор О., Аунис Д., Шеффер Э. (декабрь 1997 г.). «COUP-TF и Sp1 взаимодействуют и сотрудничают в активации транскрипции длинного концевого повтора вируса иммунодефицита человека типа 1 в микроглиальных клетках человека» . Журнал биологической химии . 272 (49): 31149–55. дои : 10.1074/jbc.272.49.31149 . ПМИД   9388268 .
• Дрессел У., Тормейер Д., Алтинчичек Б., Паулулат А., Эггерт М., Шнайдер С., Тенбаум С.П., Ренкавиц Р., Баниахмад А. (май 1999 г.). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных рецепторов гормонов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3383–94. дои : 10.1128/mcb.19.5.3383 . ПМЦ   84131 . ПМИД   10207062 .
• Клинге С.М., Каур К., Суонсон Х.И. (январь 2000 г.). «Арильный углеводородный рецептор взаимодействует с рецептором эстрогена альфа и орфанными рецепторами COUP-TFI и ERRalpha1». Архив биохимии и биофизики . 373 (1): 163–74. дои : 10.1006/abbi.1999.1552 . ПМИД   10620335 .
• Рор О., Шварц С., Хери С., Онис Д., Тардье М., Шеффер Э. (январь 2000 г.). «Фактор транскрипции промотора ядерного рецептора куриного овальбумина взаимодействует с Tat ВИЧ-1 и стимулирует репликацию вируса в клетках микроглии человека» . Журнал биологической химии . 275 (4): 2654–60. дои : 10.1074/jbc.275.4.2654 . ПМИД   10644726 .
• Сугияма Т., Ван Дж.К., Скотт Д.К., Граннер Д.К. (февраль 2000 г.). «Активация транскрипции сиротским ядерным рецептором, вышестоящим промотором куриного овальбумина - фактором транскрипции I (COUP-TFI). Определение домена, участвующего в глюкокортикоидном ответе гена фосфоенолпируваткарбоксикиназы» . Журнал биологической химии . 275 (5): 3446–54. дои : 10.1074/jbc.275.5.3446 . ПМИД   10652338 .
• Влаху А., Флитзанис CN (февраль 2000 г.). «Субклеточный транспорт ядерного рецептора COUP-TF в раннем эмбриональном клеточном цикле» . Биология развития . 218 (2): 284–98. дои : 10.1006/dbio.1999.9456 . ПМИД   10656770 .
• Аврам Д., Филдс А., Pretty On Top K, Невриви DJ, Измаил Дж. Э., Лейд М. (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной орфанными ядерными рецепторами фактора транскрипции промотора куриного овальбумина (COUP-TF)» . Журнал биологической химии . 275 (14): 10315–22. дои : 10.1074/jbc.275.14.10315 . ПМК   2819356 . ПМИД   10744719 .
• Гей Ф., Англад И., Гонг З., Салберт Дж. (октябрь 2000 г.). «LIM/гомеодоменный белок островок-1 модулирует функции рецептора эстрогена» . Молекулярная эндокринология . 14 (10): 1627–48. дои : 10.1210/me.14.10.1627 . ПМИД   11043578 .
• Ю М., Фишер М., Чо В.К., Крабб Д. (февраль 2002 г.). «Транкрипционный контроль промотора альдегиддегидрогеназы 2 человека с помощью ядерного фактора 4 гепатоцитов: ингибирование факторами транскрипции циклического AMP и COUP» . Архив биохимии и биофизики . 398 (1): 79–86. дои : 10.1006/abbi.2001.2713 . ПМИД   11811951 .
• Линь Ф., Коллури С.К., Чен GQ, Чжан XK (июнь 2002 г.). «Регуляция индуцированного ретиноевой кислотой ингибирования активности AP-1 с помощью сиротского рецептора куриного овальбумина, расположенного выше промотора-транскрипционного фактора» . Журнал биологической химии . 277 (24): 21414–22. дои : 10.1074/jbc.M201885200 . ПМИД   11934895 .
• Метивье Р., Гей Ф.А., Хюбнер М.Р., Флурио Дж., Салберт Дж., Ганнон Ф., Ках О., Пакдель Ф. (июль 2002 г.). «Образование комплекса hER альфа-COUP-TFI усиливает hER альфа AF-1 за счет фосфорилирования Ser118 с помощью MAPK» . Журнал ЭМБО . 21 (13): 3443–53. дои : 10.1093/emboj/cdf344 . ПМК   126093 . ПМИД   12093745 .
• Ю Х, Мерц Дж. Э. (февраль 2003 г.). «Различные способы регуляции транскрипции вируса гепатита В ядерными рецепторами HNF4альфа и COUP-TF1» . Журнал вирусологии . 77 (4): 2489–99. doi : 10.1128/JVI.77.4.2489-2499.2003 . ПМК   141100 . ПМИД   12551987 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .