ВИЧEP1

ВИЧEP1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1BBO, 4ZNF
Идентификаторы
Псевдонимы	ВИЧEP1 , CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, белок 1, связывающий энхансер вируса иммунодефицита человека I типа, цинковый палец 1 ВИЧEP
Внешние идентификаторы	Опустить : 194540 ; МГИ : 96100 ; Гомологен : 1596 ; Генные карты : ВИЧEP1 ; ОМА : ВИЧEP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p24.1 Start 12,008,762 bp End 12,164,999 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13 A4|13 20.72 cM Start 42,205,497 bp End 42,346,013 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in Achilles tendon cartilage tissue sural nerve epithelium of colon superficial temporal artery jejunal mucosa seminal vesicula oral cavity right lobe of liver caput epididymis Top expressed in zygote genital tubercle secondary oocyte primary oocyte tail of embryo medial dorsal nucleus lateral geniculate nucleus primary motor cortex habenula medial geniculate nucleus More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA binding sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific protein binding metal ion binding nucleic acid binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Cellular component cytoplasm mitochondrion nucleus nucleoplasm nuclear body Biological process multicellular organism development regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II signal transduction transcription, DNA-templated BMP signaling pathway positive regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3096 110521 Вместе ENSG00000095951 ENSMUSG00000021366 ЮниПрот P15822 Q03172 RefSeq (мРНК) НМ_002114 НМ_007772 RefSeq (белок) НП_002105 НП_031798 Местоположение (UCSC) Чр 6: 12.01 – 12.16 Мб Чр 13: 42,21 – 42,35 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок цинковых пальцев 40 — это белок , который у человека кодируется ВИЧEP1 геном .

Члены семейства ZAS, такие как ZAS1 (HIVEP1), представляют собой крупные белки, содержащие домен ZAS, модульную белковую структуру, состоящую из пары цинковых пальцев C2H2 с богатой кислотой областью и последовательностью, богатой серином/треонином. Эти белки связывают специфические последовательности ДНК, включая мотив каппа-B (GGGACTTTCC), в промоторах и энхансерных областях нескольких генов и вирусов, включая вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). Гены ZAS занимают более 150 т.п.н. и содержат не менее 10 экзонов, один из которых длиннее 5,5 т.п.н. (Allen and Wu, 2004). [предоставлено OMIM]

Дальнейшее чтение

• Омичински Дж.Г., Клор Г.М., Робиен М. и др. (1992). «Структура раствора с высоким разрешением двойного цинкового пальца Cys2His2 из белка, связывающего энхансер человека MBP-1». Биохимия . 31 (16): 3907–17. дои : 10.1021/bi00131a004 . ПМИД   1567844 .
• Накамура Т., Донован Д.М., Хамада К. и др. (1990). «Регуляция гена альфа-А-кристаллина мыши: выделение кДНК, кодирующей белок, который связывается с мотивом цис-последовательности, общим с геном класса I главного комплекса гистосовместимости и другими генами» . Мол. Клетка. Биол . 10 (7): 3700–8. дои : 10.1128/mcb.10.7.3700 . ПМК   360816 . ПМИД   1694016 .
• Мухардт С., Зеелер Дж.С., Нирула А. и др. (1992). «Регуляция функции энхансера вируса иммунодефицита человека с помощью продуктов гена PRDII-BF1 и c-rel» . Дж. Вирол . 66 (1): 244–50. doi : 10.1128/JVI.66.1.244-250.1992 . ПМК   238281 . ПМИД   1727488 .
• Фан СМ, Маниатис Т (1990). «ДНК-связывающий белок, содержащий два широко разделенных мотива цинковых пальцев, которые распознают одну и ту же последовательность ДНК» . Генс Дев . 4 (1): 29–42. дои : 10.1101/gad.4.1.29 . ПМИД   2106471 .
• Болдуин А.С., Леклер К.П., Сингх Х., Шарп П.А. (1990). «Большой белок, содержащий домены цинковых пальцев, связывается с родственными элементами последовательности в энхансерах главного комплекса гистосовместимости класса I и генах каппа-иммуноглобулина» . Мол. Клетка. Биол . 10 (4): 1406–14. дои : 10.1128/mcb.10.4.1406 . ПМК   362243 . ПМИД   2108316 .
• Омичински Дж.Г., Клор Г.М., Аппелла Е. и др. (1991). «Трехмерная структура высокого разрешения одного цинкового пальца из белка, связывающего энхансер человека, в растворе». Биохимия . 29 (40): 9324–34. дои : 10.1021/bi00492a004 . ПМИД   2248949 .
• Маэкава Т., Сакура Х., Судо Т., Исии С. (1989). «Предполагаемая структура металлического пальца белка ВИЧ-EP1, связывающего энхансер вируса иммунодефицита человека типа 1» . Ж. Биол. Хим . 264 (25): 14591–3. дои : 10.1016/S0021-9258(18)63733-0 . ПМИД   2504707 .
• Оцука М., Фудзита М., Аоки Т. и др. (1995). «Новые хелаторы цинка с двойной активностью в ингибировании белков, связывающих сайт каппа B, ВИЧ-EP1 и NF-каппа B». Дж. Мед. Хим . 38 (17): 3264–70. дои : 10.1021/jm00017a011 . ПМИД   7650680 .
• Зеелер Дж.С., Мухардт С., Сюссле А., Гейнор Р.Б. (1994). «Транскрипционный фактор PRDII-BF1 активирует экспрессию гена вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 68 (2): 1002–9. doi : 10.1128/JVI.68.2.1002-1009.1994 . ПМК   236538 . ПМИД   8289330 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК   442148 . ПМИД   15231748 .
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК   514446 . ПМИД   15302935 .
• Виссмюллер С., Косян Т., Вольф М. и др. (2006). «Домен группы высокой подвижности белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (6): 1735–44. дои : 10.1093/нар/gkl105 . ПМЦ   1421504 . ПМИД   16582099 .
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД   16713569 . S2CID   13709685 .

Внешние ссылки

• ВИЧEP1+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .