Ядерный транслокатор арильного углеводородного рецептора

АРНТ
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT , HIF-1-бета, HIF-1бета, HIF1-бета, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, ядерный транслокатор арильного углеводородного рецептора, ядерный транслокатор арильного углеводородного рецептора
Внешние идентификаторы	Опустить : 126110 ; МГИ : 88071 ; Гомологен : 1261 ; Генные карты : ARNT ; ОМА : ARNT – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1q21.3 Start 150,809,713 bp End 150,876,708 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 3 (mouse) Band 3 F2.1|3 40.74 cM Start 95,341,699 bp End 95,404,551 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in epithelium of colon Achilles tendon sural nerve canal of the cervix left ovary right ovary gastric mucosa stromal cell of endometrium ectocervix body of uterus Top expressed in ascending aorta aortic valve parotid gland muscle of thigh tongue cumulus cell molar atrium pineal gland external carotid artery More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function sequence-specific DNA binding DNA binding protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity transcription coactivator activity aryl hydrocarbon receptor binding transcription factor binding protein binding protein heterodimerization activity transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific protein homodimerization activity sequence-specific double-stranded DNA binding nuclear receptor activity Cellular component cytoplasm transcription regulator complex nucleoplasm RNA polymerase II transcription regulator complex nucleus nuclear body Biological process positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway cell differentiation response to hypoxia regulation of transcription, DNA-templated positive regulation of endothelial cell proliferation regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress positive regulation of erythrocyte differentiation embryonic placenta development mRNA transcription by RNA polymerase II positive regulation of protein sumoylation transcription, DNA-templated positive regulation of transcription, DNA-templated intracellular receptor signaling pathway regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia positive regulation of vascular endothelial growth factor production positive regulation of glycolytic process positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of hormone biosynthetic process xenobiotic metabolic process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 405 11863 Вместе ENSG00000143437 ENSMUSG00000015522 ЮниПрот P27540 P53762 RefSeq (мРНК) showНМ_001197325 НМ_001286035 НМ_001286036 НМ_001668 НМ_178426 NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226 НМ_001037737 НМ_009709 RefSeq (белок) showНП_001184254 НП_001272964 НП_001272965 НП_001659 НП_848514 NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155 НП_001032826 НП_033839 Местоположение (UCSC) Chr 1: 150,81 – 150,88 Мб Chr 3: 95,34 – 95,4 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Ген ARNT , который образует кодирует -ядерный транслокатор рецептора арилуглеводородов белок комплекс со связанным с лигандом рецептором арилуглеводородов (AhR) и необходим для функции рецептора. Кодируемый белок также был идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного фактора транскрипции, фактора 1, индуцируемого гипоксией (HIF1). Транслокация t(1;12)(q21;p13), которая приводит к образованию слитого белка TEL-ARNT , связана с острым миелобластным лейкозом . Для этого гена описаны три альтернативно сплайсированных варианта, кодирующих разные изоформы.

Арильный углеводородный рецептор (AhR) участвует в индукции ряда ферментов , участвующих в метаболизме ксенобиотиков . Безлигандная цитозольная форма арилуглеводородного рецептора образует комплекс с белком теплового шока 90 . Связывание лиганда, в состав которого входят диоксин и полициклические ароматические углеводороды , приводит к транслокации лигандсвязывающей субъединицы только в ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит путем связывания связанного с лигандом AhR с чувствительными к ксенобиотикам элементами в промоторах генов этих ферментов.

Взаимодействия

Было показано, что ядерный транслокатор арильного углеводородного рецептора взаимодействует с:

• АИП ,
• АХР ,
• ЭПАС1 ,
• ХИФ1А ,
• НКОА2 ,
• SIM1 , и
• SIM2 .

Дальнейшее чтение

• Хаазе В.Х. (август 2006 г.). «Факторы, индуцирующие гипоксию в почках» . Американский журнал физиологии. Почечная физиология . 291 (2): F271–F281. дои : 10.1152/ajprenal.00071.2006 . ПМЦ   4232221 . ПМИД   16554418 .
• Рейес Х., Рейс-Порсас С., Хэнкинсон О. (май 1992 г.). «Идентификация белка ядерного транслокатора рецептора Ah (Arnt) как компонента ДНК-связывающей формы рецептора Ah». Наука . 256 (5060): 1193–1195. Бибкод : 1992Sci...256.1193R . дои : 10.1126/science.256.5060.1193 . ПМИД   1317062 . S2CID   34075046 .
• Хоффман Э.К., Рейес Х., Чу Ф.Ф., Сандер Ф., Конли Л.Х., Брукс Б.А. и др. (май 1991 г.). «Клонирование фактора, необходимого для активности рецептора Ah (диоксина)». Наука . 252 (5008): 954–958. Бибкод : 1991Sci...252..954H . дои : 10.1126/science.1852076 . ПМИД   1852076 .
• Ямагути Ю, Куо М.Т. (октябрь 1995 г.). «Функциональный анализ взаимодействий ядерного транслокатора арилуглеводородного рецептора с арилуглеводородным рецептором в двугибридной системе дрожжей». Биохимическая фармакология . 50 (8): 1295–1302. дои : 10.1016/0006-2952(95)02016-6 . ПМИД   7488247 .
• Ван Г.Л., Цзян Б.Х., Рю Э.А., Семенза Г.Л. (июнь 1995 г.). «Фактор 1, индуцируемый гипоксией, представляет собой гетеродимер основная спираль-петля-спираль-PAS, регулируемый клеточным напряжением O2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (12): 5510–5514. Бибкод : 1995PNAS...92.5510W . дои : 10.1073/pnas.92.12.5510 . ПМК   41725 . ПМИД   7539918 .
• Линдебро MC, Поеллингер Л., Уайтлоу ML (июль 1995 г.). «Белко-белковое взаимодействие через домены PAS: роль домена PAS в положительной и отрицательной регуляции комплекса рецептор диоксина bHLH/PAS-транскрипционный фактор Arnt» . Журнал ЭМБО . 14 (14): 3528–3539. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07359.x . ПМЦ   394421 . ПМИД   7628454 .
• Эбботт Б.Д., Пробст М.Р., Пердью Г.Х. (ноябрь 1994 г.). «Иммуногистохимическое двойное окрашивание на Ah-рецептор и ARNT на небных полках эмбриона человека». Тератология . 50 (5): 361–366. дои : 10.1002/тера.1420500507 . ПМИД   7716743 .
• Рейс-Порсас С., Пробст М.Р., Фукунага Б.Н., Хэнкинсон О. (сентябрь 1994 г.). «Идентификация функциональных доменов белка-транслокатора арильного углеводородного рецептора (ARNT)» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (9): 6075–6086. дои : 10.1128/mcb.14.9.6075 . ПМК   359134 . ПМИД   8065341 .
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Джонсон Б., Брукс Б.А., Хайнцманн С., Дип А., Мохандас Т., Спаркс Р.С. и др. (сентябрь 1993 г.). «Ген ядерного транслокатора рецептора Ah (ARNT) расположен на q21 хромосомы 1 человека и на хромосоме 3 мыши рядом с Cf-3». Геномика . 17 (3): 592–598. дои : 10.1006/geno.1993.1377 . ПМИД   8244375 .
• Уайтлоу М., Понгратц И., Вильгельмссон А., Густафссон Дж.А., Пёллингер Л. (апрель 1993 г.). «Лиганд-зависимое рекрутирование корегулятора Arnt определяет узнавание ДНК рецептором диоксина» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (4): 2504–2514. дои : 10.1128/MCB.13.4.2504 . ПМЦ   359572 . ПМИД   8384309 .
• Цзян Б.Х., Рю Э, Ван Г.Л., Роу Р., Семенза Г.Л. (июль 1996 г.). «Димеризация, связывание ДНК и трансактивационные свойства фактора 1, индуцируемого гипоксией» . Журнал биологической химии . 271 (30): 17771–17778. дои : 10.1074/jbc.271.30.17771 . ПМИД   8663540 .
• Роулендс Дж. К., Макьюэн И. Дж., Густафссон Дж. А. (сентябрь 1996 г.). «Транс-активация человеческими арилуглеводородными рецепторами и ядерными белками-транслокаторами арилуглеводородных рецепторов: прямое взаимодействие с базальными факторами транскрипции». Молекулярная фармакология . 50 (3): 538–548. ПМИД   8794892 .
• Эма М., Морита М., Икава С., Танака М., Мацуда Ю., Гото О. и др. (октябрь 1996 г.). «Два новых члена семейства мышиных генов Sim являются репрессорами транскрипции и демонстрируют разные паттерны экспрессии во время эмбриогенеза мышей» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (10): 5865–5875. дои : 10.1128/MCB.16.10.5865 . ПМК   231588 . ПМИД   8927054 .
• Суонсон Х.И., Ян Дж. (декабрь 1996 г.). «Картирование сайтов контакта белка с ДНК рецептора Ah и ядерного транслокатора рецептора Ah» . Журнал биологической химии . 271 (49): 31657–31665. дои : 10.1074/jbc.271.49.31657 . ПМИД   8940186 .
• Пробст М.Р., Фан К.М., Тессье-Лавин М., Хэнкинсон О. (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однонаправленного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком-транслокатором ядерного рецептора арильного углеводорода мыши» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4451–4457. дои : 10.1074/jbc.272.7.4451 . ПМИД   9020169 .
• Хогенеш Дж.Б., Чан В.К., Джекив В.Х., Браун Р.К., Гу Ю.З., Прей-Грант М. и др. (март 1997 г.). «Характеристика подмножества суперсемейства основная спираль-петля-спираль-PAS, которое взаимодействует с компонентами сигнального пути диоксина» . Журнал биологической химии . 272 (13): 8581–8593. дои : 10.1074/jbc.272.13.8581 . ПМИД   9079689 .
• Карвер, Лос-Анджелес, Брэдфилд, Калифорния (апрель 1997 г.). «Лиганд-зависимое взаимодействие арилуглеводородного рецептора с новым гомологом иммунофилина in vivo» . Журнал биологической химии . 272 (17): 11452–11456. дои : 10.1074/jbc.272.17.11452 . ПМИД   9111057 .
• Эма М., Тая С., Ёкотани Н., Согава К., Мацуда Ю., Фуджи-Курияма Ю. (апрель 1997 г.). «Новый фактор bHLH-PAS с близким сходством последовательностей с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа регулирует экспрессию VEGF и потенциально участвует в развитии легких и сосудов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4273–4278. дои : 10.1073/pnas.94.9.4273 . ПМК   20712 . ПМИД   9113979 .
• Моффетт П., Рис М., Пеллетье Дж. (сентябрь 1997 г.). «Продукт мышиного гена Sim-2 ингибирует транскрипцию путем активной репрессии и функционального вмешательства» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (9): 4933–4947. дои : 10.1128/mcb.17.9.4933 . ПМК   232345 . ПМИД   9271372 .

Внешние ссылки

• Арил + углеводород + рецептор + ядерный + транслокатор в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .