Рецептор ретиноевой кислоты бета

РАРБ
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1HRA, 1XAP, 4DM6, 4DM8, 4JYG, 4JYH, 4JYI
Идентификаторы
Псевдонимы	RARB , HAP, MCOPS12, NR1B2, RRB2, RARbeta1, бета-рецептор ретиноевой кислоты, RARbeta
Внешние идентификаторы	Опустить : 180220 ; МГИ : 97857 ; Гомологен : 68100 ; GeneCards : РАРБ ; ОМА : RARB — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 3 (human) Band 3p24.2 Start 24,687,887 bp End 25,597,932 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 14 (mouse) Band 14 A1|14 7.08 cM Start 5,650,540 bp End 6,038,924 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in Epithelium of choroid plexus palpebral conjunctiva buccal mucosa cell right lung gonad nucleus accumbens caudate nucleus olfactory zone of nasal mucosa right auricle Achilles tendon Top expressed in olfactory tubercle nucleus accumbens wall of esophagus stroma of kidney mucosa of esophagus epithelium of esophagus genital tubercle globus pallidus abdominal wall atrioventricular valve More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity zinc ion binding metal ion binding steroid hormone receptor activity protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific protein-containing complex binding retinoid X receptor binding transcription cis-regulatory region binding transcription factor binding nuclear receptor coactivator activity signaling receptor activity nuclear receptor activity Cellular component cytoplasm nucleoplasm nucleus RNA polymerase II transcription regulator complex Biological process growth plate cartilage development positive regulation of transcription by RNA polymerase II neurogenesis ureteric bud development regulation of transcription, DNA-templated negative regulation of cartilage development multicellular organism growth embryonic eye morphogenesis positive regulation of programmed cell death negative regulation of apoptotic process negative regulation of transcription by RNA polymerase II retinal pigment epithelium development transcription, DNA-templated outflow tract septum morphogenesis negative regulation of chondrocyte differentiation retinoic acid receptor signaling pathway regulation of myelination retina development in camera-type eye positive regulation of neuron differentiation positive regulation of cell population proliferation positive regulation of apoptotic process ventricular cardiac muscle cell differentiation transcription initiation from RNA polymerase II promoter bone development embryonic digestive tract development striatum development signal transduction negative regulation of cell population proliferation glandular epithelial cell development steroid hormone mediated signaling pathway embryonic hindlimb morphogenesis liver development multicellular organism development hormone-mediated signaling pathway cell differentiation response to retinoic acid response to lipid gland development bone morphogenesis epithelium development cellular response to retinoic acid Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 5915 218772 Вместе ENSG00000077092 ENSMUSG00000017491 ЮниПрот P10826 Q5QHG3 P22605 RefSeq (мРНК) showНМ_000965 НМ_001290216 НМ_001290217 НМ_001290266 НМ_001290276 NM_001290277 NM_001290300 NM_016152 НМ_001289760 НМ_001289761 НМ_001289762 НМ_011243 RefSeq (белок) showНП_000956 НП_001277145 НП_001277146 НП_001277195 НП_001277205 NP_001277206 NP_001277229 NP_057236 NP_001277146.1 NP_001277205.1 NP_057236.1 НП_001276689 НП_001276690 НП_001276691 НП_035373 Местоположение (UCSC) Chr 3: 24,69 – 25,6 Мб Чр 14: 5,65 – 6,04 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Бета-рецептор ретиноевой кислоты ( RAR-бета ), также известный как NR1B2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа B, член 2), представляет собой ядерный рецептор , который у человека кодируется RARB геном .

Функция

Этот ген кодирует бета-рецептор ретиноевой кислоты, члена суперсемейства ядерных регуляторов транскрипции рецепторов тиреоидных гормонов. Этот рецептор локализуется в цитоплазме и субъядерных компартментах. Он связывает ретиноевую кислоту, биологически активную форму витамина А , которая опосредует передачу клеточных сигналов в эмбриональном морфогенезе, росте и дифференцировке клеток. Считается, что этот белок ограничивает рост многих типов клеток, регулируя экспрессию генов. Этот ген был впервые идентифицирован при гепатоцеллюлярной карциноме, где он фланкирует гепатита B. сайт интеграции вируса Нарушение регуляции этого гена также было обнаружено при предопухолевых поражениях карциномы шейки матки . Ген экспрессирует по крайней мере два варианта транскрипта; был описан еще один транскрипт, но его полноразмерная природа не определена.

Эпигенетика

бета-промотора рецептора ретиноевой кислоты, гиперметилирование ДНК Наблюдалось связанное с возникновением/прогрессированием рака. Действительно, этот неправильный эпигенетический феномен наблюдался у женщин, страдающих плоскоклеточным раком вульвы, возникшим из склеротического лишая вульвы . Метилирование промотора бета-рецептора ретиноевой кислоты может быть маркером риска рака у пациентов, страдающих этим заболеванием.

Взаимодействия

Было показано, что бета-рецептор ретиноевой кислоты взаимодействует с NR4A2 .

См. также

• Рецептор ретиноевой кислоты

Дальнейшее чтение

• Дежан А., де Те Х (июнь 1990 г.). «Вирус гепатита В как инсерционный мутаген при гепатоцеллюлярной карциноме человека». Молекулярная биология и медицина . 7 (3): 213–22. ПМИД   2170809 .
• Сан С.Ю. (январь 2004 г.). «Бета-рецептор ретиноевой кислоты и рак толстой кишки». Биология и терапия рака . 3 (1): 87–8. дои : 10.4161/cbt.3.1.686 . ПМИД   14726690 . S2CID   42332707 .
• Саба Н., Джайн С., Хури Ф. (2004). «Химиопрофилактика рака легких». Текущие проблемы рака . 28 (5): 287–306. doi : 10.1016/j.currproblcancer.2004.05.005 . ПМИД   15375805 .
• Кляйн О., Гриньон И., Сивит Т., Оке Дж., Маршаль Дж.К. (сентябрь 2005 г.). «[Статус метилирования промотора гена RARbeta в церебральной глиоме низкой и высокой степени злокачественности. Сравнение с нормальной тканью. Иммуно-гистохимическое исследование ядерной экспрессии RARbeta в клетках церебральной глиомы низкой и высокой степени злокачественности. Сравнение с нормальными клетками. 48 опухолей]». Нейрохирургия . 51 (3–4, часть 1): 147–54. дои : 10.1016/S0028-3770(05)83470-8 . ПМИД   16389900 .
• Катахира М., Кнегтель Р.М., Боеленс Р., Эйб Д., Шилтуис Дж.Г., ван дер Сааг П.Т., Каптейн Р. (июль 1992 г.). «Гомо- и гетероядерные ЯМР-исследования ДНК-связывающего домена бета-рецептора ретиноевой кислоты человека: последовательное отнесение и идентификация элементов вторичной структуры». Биохимия . 31 (28): 6474–80. дои : 10.1021/bi00143a017 . ПМИД   1321662 .
• Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора гормона щитовидной железы, рецептора ретиноевой кислоты, рецептора ретиноида X, фактора транскрипции промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени» . Молекулярная эндокринология . 6 (9): 1468–78. дои : 10.1210/mend.6.9.1331778 . ПМИД   1331778 . S2CID   24291055 .
• ван дер Лиде Б.Дж., Фолкерс GE, Круйт Ф.А., ван дер Сааг П.Т. (октябрь 1992 г.). «Геномная организация человеческого рецептора ретиноевой кислоты бета 2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 188 (2): 695–702. дои : 10.1016/0006-291X(92)91112-4 . ПМИД   1332705 .
• Прентис А., Мэтьюз С.Дж., Томас Э.Дж., Редферн С.П. (май 1992 г.). «Экспрессия рецепторов ретиноевой кислоты в культивируемых стромальных клетках эндометрия человека и эффекты ретиноевой кислоты». Репродукция человека . 7 (5): 692–700. doi : 10.1093/oxfordjournals.humrep.a137721 . ПМИД   1379266 .
• Шен С., Круйт Ф.А., ден Хертог Дж., ван дер Сааг П.Т., Круйер В. (1992). «Промоторы бета-2 рецептора ретиноевой кислоты мыши и человека: сравнение последовательностей и локализация чувствительности к ретиноевой кислоте». Последовательность ДНК . 2 (2): 111–9. дои : 10.3109/10425179109039679 . ПМИД   1663808 .
• де Те Х, Виванко-Руис М.М., Тиолле П., Станненберг Х., Дежан А. (январь 1990 г.). «Идентификация элемента, реагирующего на ретиноевую кислоту, в гене бета-рецептора ретиноевой кислоты». Природа . 343 (6254): 177–80. Бибкод : 1990Natur.343..177D . дои : 10.1038/343177a0 . ПМИД   2153268 . S2CID   4314508 .
• Хоффманн Б., Леманн Дж.М., Чжан К.К., Герман Т., Хусманн М., Граупнер Г., Пфаль М. (ноябрь 1990 г.). «Элемент, специфичный для рецептора ретиноевой кислоты, контролирует промотор бета-рецептора ретиноевой кислоты» . Молекулярная эндокринология . 4 (11): 1727–36. дои : 10.1210/mend-4-11-1727 . ПМИД   2177841 .
• де Те Х, Маркио А, Тиолле П, Дежан А (1988). «Новый ген, связанный с рецептором стероидного гормона щитовидной железы, неправильно экспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме человека». Природа . 330 (6149): 667–70. дои : 10.1038/330667a0 . ПМИД   2825037 . S2CID   4327614 .
• Бранд Н., Петкович М., Краст А., Шамбон П., де Те Х., Маркио А., Тиолле П., Дежан А. (апрель 1988 г.). «Идентификация второго рецептора ретиноевой кислоты человека». Природа . 332 (6167): 850–3. Бибкод : 1988Natur.332..850B . дои : 10.1038/332850a0 . ПМИД   2833708 . S2CID   4349193 .
• Бенбрук Д., Лернхардт Э., Пфаль М. (июнь 1988 г.). «Новый рецептор ретиноевой кислоты, выявленный в гепатоцеллюлярной карциноме». Природа . 333 (6174): 669–72. Бибкод : 1988Natur.333..669B . дои : 10.1038/333669a0 . ПМИД   2836738 . S2CID   4313063 .
• Дежан А., Бугелере Л., Гжещик К.Х., Тиолле П. (1986). «Интеграция ДНК вируса гепатита B в последовательность, гомологичную генам v-erb-A и стероидных рецепторов при гепатоцеллюлярной карциноме». Природа . 322 (6074): 70–2. Бибкод : 1986Natur.322...70D . дои : 10.1038/322070a0 . ПМИД   3014347 . S2CID   4355348 .
• Си СП, Цоу ХК, Ли Икс, Пикок М (июль 1995 г.). «Влияние клеточного старения и ретиноевой кислоты на экспрессию клеточных белков, связывающих ретиноевую кислоту, в фибробластах кожи». Экспериментальные исследования клеток . 219 (1): 243–8. дои : 10.1006/excr.1995.1224 . ПМИД   7628539 .
• Хоул Б., Пеллетье М., Ву Дж., Гудиер С., Брэдли В.Е. (январь 1994 г.). «Фетальная изоформа бета-рецептора ретиноевой кислоты человека, экспрессируемая в линиях мелкоклеточного рака легких». Исследования рака . 54 (2): 365–9. ПМИД   8275470 .
• Кнегтель Р.М., Катахира М., Шилтуис Дж.Г., Бонвин А.М., Боеленс Р., Эйб Д., ван дер Сааг П.Т., Каптейн Р. (январь 1993 г.). «Структура раствора ДНК-связывающего домена бета-рецептора ретиноевой кислоты человека». Журнал биомолекулярного ЯМР . 3 (1): 1–17. дои : 10.1007/BF00242472 . hdl : 1874/378403 . ПМИД   8383553 . S2CID   24063437 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .