RFX4

RFX4
Идентификаторы
Псевдонимы	RFX4 , NYD-SP10, регуляторный фактор X4
Внешние идентификаторы	Опустить : 603958 ; МГИ : 1918387 ; Гомологен : 31119 ; Генные карты : RFX4 ; OMA : RFX4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	106,762,803 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	84,742,402 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; external globus pallidus; ; ventricular zone; ; internal globus pallidus; ; sperm; ; caudate nucleus; ; amygdala; ; nucleus accumbens; ; superior vestibular nucleus;
	Top expressed in
	lumbar subsegment of spinal cord; ; spermatocyte; ; spermatid; ; suprachiasmatic nucleus; ; Rostral migratory stream; ; globus pallidus; ; ventricular zone; ; deep cerebellar nuclei; ; seminiferous tubule; ; dorsal tegmental nucleus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; chromatin binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity;
Cellular component	nucleus;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; forebrain development; telencephalon development; dorsal spinal cord development; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning; cerebellar cortex morphogenesis; midbrain development; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of protein processing; transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; cilium assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5992
	71137
	ENSG00000111783
	ЭНСМУСГ00000020037
	Q33E94
	Q7TNK1
	НМ_213594 ; НМ_001206691 ; НМ_002920 ; НМ_032491
	НМ_001024918 ; НМ_027689
	НП_001193620 ; НП_115880 ; НП_998759
	НП_001020089 ; НП_081965
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Транскрипционный фактор RFX4 представляет собой белок , который у человека кодируется RFX4 геном . ^[5]^[6]^[7]

Этот ген является членом семейства генов регуляторного фактора X, которое кодирует факторы транскрипции , содержащие высококонсервативный домен, связывающий ДНК с крылатой спиралью . Белок, кодируемый этим геном, структурно связан с регуляторными факторами X1, X2, X3 и X5. Было показано, что он взаимодействует сам с собой, а также с регуляторными факторами X2 и X3, но не взаимодействует с регуляторным фактором X1. Этот белок может быть скорее репрессором транскрипции , чем активатором транскрипции. три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена описаны ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111783 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020037 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Эмери П., Дюран Б., Мах Б., Рейт В. (май 1996 г.). «Белки RFX, новое семейство ДНК-связывающих белков, консервативных в царстве эукариот» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (5): 803–7. дои : 10.1093/нар/24.5.803 . ПМК 145730 . ПМИД 8600444 .
^ Моротоми-Яно К., Яно К., Сайто Х., Сан З., Ивама А., Мики Ю. (январь 2002 г.). «Человеческий регуляторный фактор X 4 (RFX4) представляет собой димерный ДНК-связывающий белок, специфичный для семенников, который взаимодействует с другими членами RFX человека» . J Биол Хим . 277 (1): 836–42. дои : 10.1074/jbc.M108638200 . ПМИД 11682486 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: регуляторный фактор RFX4 X, 4 (влияет на экспрессию HLA класса II)» .

Дальнейшее чтение

Доцлав Х., Алхалаф М., Мерфи Л.С. (1992). «Характеристика мРНК вариантов рецепторов эстрогена из рака молочной железы человека» . Мол. Эндокринол . 6 (5): 773–85. дои : 10.1210/mend.6.5.1603086 . ПМИД 1603086 . S2CID 25208340 .
Рейт В., Укла С., Баррас Э. и др. (1994). «RFX1, трансактиватор энхансера I вируса гепатита В, принадлежит к новому семейству гомодимерных и гетеродимерных ДНК-связывающих белков» . Мол. Клетка. Биол . 14 (2): 1230–44. дои : 10.1128/mcb.14.2.1230 . ПМЦ 358479 . ПМИД 8289803 .
Гадживала К.С., Чен Х., Корнилл Ф. и др. (2000). «Структура белка hRFX1 с крылатой спиралью открывает новый способ связывания ДНК». Природа . 403 (6772): 916–21. Бибкод : 2000Natur.403..916G . дои : 10.1038/35002634 . ПМИД 10706293 . S2CID 4425783 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Блэкшир П.Дж., Грейвс Дж.П., Стампо DJ и др. (2003). «Градуированный фенотипический ответ на частичный и полный дефицит специфичного для мозга варианта транскрипции фактора транскрипции крылатой спирали RFX4» . Разработка . 130 (19): 4539–52. дои : 10.1242/dev.00661 . ПМИД 12925582 .
Араки Р., Такахаши Х., Фукумура Р. и др. (2004). «Ограниченная экспрессия и фототическая индукция нового транскрипта мышиного регуляторного фактора X4 в супрахиазматическом ядре» . Ж. Биол. Хим . 279 (11): 10237–42. дои : 10.1074/jbc.M312761200 . ПМИД 14701801 .
Глейзер Б., Киров Г., Брей Н.Дж. и др. (2005). «Идентификация потенциального гаплотипа биполярного риска в гене, кодирующем фактор транскрипции крылатой спирали RFX4» . Мол. Психиатрия . 10 (10): 920–7. дои : 10.1038/sj.mp.4001689 . ПМИД 15940297 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Мацусита Х., Уэнака А., Оно Т. и др. (2006). «Идентификация глиомоспецифичных изоформ RFX4-E и -F и гуморального иммунного ответа у пациентов» (PDF) . Наука о раке . 96 (11): 801–9. дои : 10.1111/j.1349-7006.2005.00112.x . ПМИД 16271074 . S2CID 25967004 .

Внешние ссылки

RFX4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111783 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020037 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8600444-5] Эмери П., Дюран Б., Мах Б., Рейт В. (май 1996 г.). «Белки RFX, новое семейство ДНК-связывающих белков, консервативных в царстве эукариот» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (5): 803–7. дои : 10.1093/нар/24.5.803 . ПМК 145730 . ПМИД 8600444 .

[pmid11682486-6] Моротоми-Яно К., Яно К., Сайто Х., Сан З., Ивама А., Мики Ю. (январь 2002 г.). «Человеческий регуляторный фактор X 4 (RFX4) представляет собой димерный ДНК-связывающий белок, специфичный для семенников, который взаимодействует с другими членами RFX человека» . J Биол Хим . 277 (1): 836–42. дои : 10.1074/jbc.M108638200 . ПМИД 11682486 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: регуляторный фактор RFX4 X, 4 (влияет на экспрессию HLA класса II)» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]