Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Лизин-специфическая деметилаза 5D — это фермент , который у человека кодируется KDM5D геном . [5] [6] [7] суперсемейству альфа-кетоглутарат-зависимых гидроксилаз .
Этот ген кодирует белок, содержащий домены цинковых пальцев . Короткий пептид, полученный из этого белка, представляет собой минорный антиген гистосовместимости , который может привести к отторжению трансплантата мужских донорских клеток у женщин-реципиентов. [7]
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000012817 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056673 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Фроггатт П. (февраль 1977 г.). «Основание медицинского отделения «Инст» и его объединение с лихорадочной больницей Белфаста» . Ольстерский медицинский журнал . 45 (2): 107–45. ПМЦ 2385577 ПМИД 795123 . ^ Кент-Ферст М.Г., Маффитт М., Муаллем А., Бриско П., Шульц Дж., Экенберг С., Агульник А.И., Агульник И., Шрамм Д., Бавистер Б., Абдул-Могуд А., Вандеберг Дж. (октябрь 1996 г.). «Последовательность генов и эволюционное сохранение SMCY человека». Природная генетика . 14 (2): 128–9. дои : 10.1038/ng1096-128 . ПМИД 8841177 . S2CID 23054699 . ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: JARID1D jumonji, AT-богатый интерактивный домен 1D» . Симпсон Э., Скотт Д., Чендлер П. (1997). «Мужской специфичный антиген гистосовместимости, HY: история трансплантации, гены иммунного ответа, определение пола и экспрессионное клонирование». Ежегодный обзор иммунологии . 15 : 39–61. doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.39 . ПМИД 9143681 . Вольф У (1998). «Возврат к серологически обнаруженному антигену HY». Цитогенетика и клеточная генетика . 80 (1–4): 232–5. doi : 10.1159/000014986 (неактивен 25 июля 2024 г.). ПМИД 9678364 . S2CID 25908189 . {{cite journal }}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка ) Агульник А.И., Митчелл М.Дж., Лернер Дж.Л., Вудс Д.Р., Бишоп CE (июнь 1994 г.). «Ген Y-хромосомы мыши, кодируемый участком, необходимым для сперматогенеза и экспрессии малых антигенов гистосовместимости, специфичных для самцов». Молекулярная генетика человека . 3 (6): 873–8. дои : 10.1093/hmg/3.6.873 . ПМИД 7524912 . Ван В., Медоуз Л.Р., ден Хаан Дж.М., Шерман Н.Е., Чен Ю., Блокланд Э., Шабановиц Дж., Агульник А.И., Хендриксон Р.К., Бишоп К.Э. (сентябрь 1995 г.). «Человеческий HY: мужской специфичный антиген гистосовместимости, полученный из белка SMCY». Наука . 269 (5230): 1588–90. Бибкод : 1995Sci...269.1588W . дои : 10.1126/science.7667640 . HDL : 1887/2988 ПМИД 7667640 . Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси Ю., Охара О., Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из клеточной линии KG-1 и головного мозга» . Исследование ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. дои : 10.1093/dnares/3.5.321 ПМИД 9039502 . Агульник А.И., епископ С.Э., Лернер Ю.Л., Агульник С.И., Соловьев В.В. (февраль 1997 г.). «Анализ частоты мутаций в генах SMCY/SMCX показывает, что эволюцией млекопитающих руководят самцы». Геном млекопитающих . 8 (2): 134–8. дои : 10.1007/s003359900372 . ПМИД 9060413 . S2CID 8099911 . Руфер Н., Вулперт Э., Хельг С., Тирси Дж. М., Гратволь А., Шапюи Б., Жаннет М., Гулми Э., Руснек Э. (октябрь 1998 г.). «HA-1 и производный от SMCY пептид FIDSYICQV (HY) являются иммунодоминантными минорными антигенами гистосовместимости после трансплантации костного мозга» . Трансплантация . 66 (7): 910–6. дои : 10.1097/00007890-199810150-00016 ПМИД 9798702 . Лау Ю.Ф., Чжан Дж. (апрель 2000 г.). «Анализ экспрессии тридцати одного гена Y-хромосомы при раке простаты человека». Молекулярный канцерогенез . 27 (4): 308–21. doi : 10.1002/(SICI)1098-2744(200004)27:4<308::AID-MC9>3.0.CO;2-R . ПМИД 10747295 . S2CID 23677925 . Шен П., Ван Ф., Андерхилл П.А., Франко С., Ян В.Х., Роксас А., Сун Р., Лин А.А., Хайман Р.В., Воллрат Д., Дэвис Р.В., Кавалли-Сфорца Л.Л., Офнер П.Дж. (июнь 2000 г.). «Популяционно-генетические последствия изменения последовательности четырех генов Y-хромосомы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (13): 7354–9. Бибкод : 2000PNAS...97.7354S . дои : 10.1073/pnas.97.13.7354 ЧВК 16549 ПМИД 10861003 . Скалецкий Х, Курода-Кавагути Т, Минкс П.Дж., Кордум Х.С., Хиллиер Л., Браун Л.Г., Реппинг С., Пынтикова Т., Али Дж., Биери Т., Чинвалла А., Делехаунти А., Делехонти К., Ду Х., Фьюэлл Дж., Фултон Л., Фултон Р., Грейвс Т., Хоу С.Ф., Латриэль П., Леонард С., Мардис Э., Мопин Р., Макферсон Дж., Майнер Т., Нэш В., Нгуен С., Озерский П., Пепин К., Рок С., Ролфинг Т., Скотт К., Шульц Б. , Стронг С., Тин-Воллам А., Ян С.П., Уотерстон Р.Х., Уилсон Р.К., Розен С., Пейдж DC (июнь 2003 г.). «Мужская область Y-хромосомы человека представляет собой мозаику дискретных классов последовательностей» . Природа . 423 (6942): 825–37. Бибкод : 2003Natur.423..825S . дои : 10.1038/nature01722 ПМИД 12815422 . Агат Р.Дж., Чой М., Арнольд А.П. (февраль 2004 г.). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых амадин» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (2): 384–96. дои : 10.1093/molbev/msh027 ПМИД 14660691 . Миклос Д.Б., Ким Х.Т., Миллер К.Х., Го Л., Зорн Э., Ли С.Дж., Хохберг Э.П., Ву СиДжей, Алия Э.П., Катлер С., Хо В., Сойффер Р.Дж., Антин Дж.Х., Ритц Дж. (апрель 2005 г.). «Реакция антител на минорные антигены гистосовместимости HY коррелирует с хронической болезнью «трансплантат против хозяина» и ремиссией заболевания» . Кровь . 105 (7): 2973–8. дои : 10.1182/кровь-2004-09-3660 . ПМК 1350982 ПМИД 15613541 . Пайпер К.П., МакЛарнон А., Аррази Дж., Хорлок С., Эйнсворт Дж., Килби М.Д., Мартин В.Л., Мосс П.А. (январь 2007 г.). «Функциональные HY-специфичные CD8+ Т-клетки обнаруживаются у большого количества женщин после беременности плодом мужского пола» . Биология размножения . 76 (1): 96–101. дои : 10.1095/biolreprod.106.055426 ПМИД 16988213 . Ивасе С., Лан Ф., Бэйлисс П., де ла Торре-Убьета Л., Уарте М., Ци Х.Х., Уэтстайн Дж.Р., Бонни А., Робертс Т.М., Ши Ю. (март 2007 г.). «Х-сцепленный ген умственной отсталости SMCX/JARID1C определяет семейство лизин-4-деметилаз гистона H3» . Клетка . 128 (6): 1077–88. дои : 10.1016/j.cell.2007.02.017 ПМИД 17320160 . S2CID 14729302 . Ли М.Г., Норман Дж., Шилатифард А., Шихаттар Р. (март 2007 г.). «Физическая и функциональная ассоциация триметилдеметилазы H3K4 и Ring6a / MBLR, белка, подобного полисоте» . Клетка . 128 (5): 877–87. дои : 10.1016/j.cell.2007.02.004 ПМИД 17320162 . S2CID 6519228 . Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
hide (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
показывать Activity Regulation Classification Kinetics Types
