Protein-coding gene in the species Homo sapiens
GTF2F2 Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB show 1BBY , 1F3U , 2BBY , 5IY9 , 5IYA , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6
Идентификаторы Псевдонимы GTF2F2 Внешние идентификаторы Опустить : 189969 ; МГИ : 1915955 ; Гомологен : 37884 ; Генные карты : GTF2F2 ; OMA : GTF2F2 — ортологи Викиданные
Субъединица 2 общего транскрипционного фактора IIF представляет собой белок , который у человека кодируется GTF2F2 геном . [5] [6]
Было показано, что GTF2F2 взаимодействует с POLR2E. [7] HTATSF1 . [8]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000188342 – Ensembl , май 2017 г. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067995 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Хэн Х.Х., Сяо Х., Ши Х.М., Гринблатт Дж., Цуй Л.К. (май 1994 г.). «Гены, кодирующие общие факторы инициации транскрипции РНК-полимеразы II, разбросаны по геному человека». Хм. Мол. Жене . 3 (1): 61–4. дои : 10.1093/hmg/3.1.61 . ПМИД 8162052 . ^ «Ген Энтрез: общий фактор транскрипции GTF2F2 IIF, полипептид 2, 38 кДа» . ^ Вэй В., Доржсурен Д., Линь Ю., Цинь В., Номура Т., Хаяши Н., Мураками С. (апрель 2001 г.). «Прямое взаимодействие между субъединицей RAP30 фактора транскрипции IIF (TFIIF) и субъединицей 5 РНК-полимеразы, что способствует ассоциации между TFIIF и РНК-полимеразой II» . Ж. Биол. Хим . 276 (15): 12266–73. дои : 10.1074/jbc.M009634200 ПМИД 11278533 . ^ Ким Дж.Б., Ямагути Ю., Вада Т., Ханда Х., Шарп П.А. (сентябрь 1999 г.). «Белок Tat-SF1 ассоциируется с белками RAP30 и SPT5 человека» . Мол. Клетка. Биол . 19 (9): 5960–8. дои : 10.1128/mcb.19.9.5960 . ПМЦ 84462 ПМИД 10454543 . Като Х., Сумимото Х., Поньонек П., Чен Ч., Розен К.А., Редер Р.Г. (1992). «Тат ВИЧ-1 действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточной элонгации» . Генс Дев . 6 (4): 655–66. дои : 10.1101/gad.6.4.655 ПМИД 1559613 . Хорикоши М., Фудзита Х., Ван Дж., Такада Р., Редер Р.Г. (1991). «Нуклеотидная и аминокислотная последовательность RAP30» . Нуклеиновые кислоты Рез . 19 (19): 5436. doi : 10.1093/nar/19.19.5436 . ПМК 328912 ПМИД 1840667 . Сопта М., Бертон З.Ф., Гринблатт Дж. (1989). «Структура и связанная с ней ДНК-хеликазная активность общего фактора инициации транскрипции, который связывается с РНК-полимеразой II». Природа . 341 (6241): 410–4. Бибкод : 1989Natur.341..410S . дои : 10.1038/341410a0 . ПМИД 2477704 . S2CID 4321793 . Сопта М., Картью Р.В., Гринблатт Дж. (1985). «Выделение трех белков, которые связываются с РНК-полимеразой II млекопитающих» . Ж. Биол. Хим . 260 (18): 10353–60. дои : 10.1016/S0021-9258(17)39255-4 ПМИД 3860504 . Тан С., Асо Т., Конэвей Р.К., Конэвей Дж.В. (1994). «Роль субъединиц RAP30 и RAP74 транскрипционного фактора IIF в инициации и элонгации транскрипции с помощью РНК-полимеразы II» . Ж. Биол. Хим . 269 (41): 25684–91. дои : 10.1016/S0021-9258(18)47303-6 ПМИД 7929273 . Йонаха М., Асо Т., Кобаяши Ю., Васавада Х., Ясукочи Ю., Вайсман С.М., Китадзима С. (1993). «Доменная структура человеческого общего фактора инициации транскрипции, TFIIF» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (2): 273–9. дои : 10.1093/нар/21.2.273 . ПМК 309103 ПМИД 8441635 . Тан Х, Сан Х, Рейнберг Д., Эбрайт Р.Х. (1996). «Белко-белковые взаимодействия при инициации транскрипции эукариот: структура преинициаторного комплекса» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (3): 1119–24. Бибкод : 1996PNAS...93.1119T . дои : 10.1073/pnas.93.3.1119 ПМК 40041 ПМИД 8577725 . Мартин М.Л., Либерман П.М., Карран Т. (1996). «Димеризация Fos-Jun способствует взаимодействию основной области с TFIIE-34 и TFIIF» . Мол. Клетка. Биол . 16 (5): 2110–8. дои : 10.1128/mcb.16.5.2110 . ПМК 231198 ПМИД 8628277 . Фанг С.М., Бертон З.Ф. (1996). «Белок, ассоциированный с РНК-полимеразой II (RAP) 74, связывает фактор транскрипции (TF) IIB и блокирует связывание TFIIB-RAP30» . Ж. Биол. Хим . 271 (20): 11703–9. дои : 10.1074/jbc.271.20.11703 ПМИД 8662660 . Дубровская В., Лавин А.С., Дэвидсон И., Акер Дж., Стауб А., Тора Л. (1996). «Отдельные домены hTAFII100 необходимы для функционального взаимодействия с фактором транскрипции TFIIF бета (RAP30) и включения в комплекс TFIID» . ЭМБО Дж . 15 (14): 3702–12. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00740.x . ПМК 452026 ПМИД 8758937 . Роулендс Дж.К., Макьюэн И.Дж., Густафссон Дж.А. (1996). «Транс-активация человеческими арилуглеводородными рецепторами и ядерными белками-транслокаторами арилуглеводородных рецепторов: прямое взаимодействие с базальными факторами транскрипции». Мол. Фармакол . 50 (3): 538–48. ПМИД 8794892 . Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1996). «Tat-SF1: кофактор стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Бибкод : 1996Sci...274..605Z . дои : 10.1126/science.274.5287.605 . ПМИД 8849451 . S2CID 13266489 . Парада Калифорния, Редер Р.Г. (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, запускаемая Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбокси-концевого домена». Природа . 384 (6607): 375–8. Бибкод : 1996Natur.384..375P . дои : 10.1038/384375a0 . ПМИД 8934526 . S2CID 4278432 . Кодзима С., Кобаяши А., Гото О., Окума Ю., Фуджи-Курияма Ю., Согава К. (1997). «Домен транскрипционной активации человеческого BTEB2, фактора связывания GC-бокса». Дж. Биохим . 121 (2): 389–96. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021600 . ПМИД 9089417 . Кужек Т.П., Чо Х., Мальдонадо Э., Мейер Дж., Рейнберг Д., Петерлин Б.М. (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с голоферментом РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. дои : 10.1128/mcb.17.4.1817 . ПМК 232028 ПМИД 9121429 . Макьюэн И.Дж., Густафссон Дж. (1997). «Взаимодействие функции трансактивации андрогенных рецепторов человека с общим фактором транскрипции TFIIF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (16): 8485–90. Бибкод : 1997PNAS...94.8485M . дои : 10.1073/pnas.94.16.8485 ПМК 22967 ПМИД 9238003 . Ньюберри EP, Латифи Т., Баттайл Дж.Т., Таулер Д.А. (1997). «Структурно-функциональный анализ Msx2-опосредованной подавления транскрипции». Биохимия . 36 (34): 10451–62. дои : 10.1021/bi971008x . ПМИД 9265625 . Лян Г, Хай Т (1997). «Характеристика человеческого активирующего фактора транскрипции 4, активатора транскрипции, который взаимодействует с несколькими доменами белка, связывающего цАМФ-чувствительный элемент (CREB)» . Ж. Биол. Хим . 272 (38): 24088–95. дои : 10.1074/jbc.272.38.24088 ПМИД 9295363 . Окамото Т., Ямамото С., Ватанабэ Ю., Охта Т., Ханаока Ф., Редер Р.Г., Окума Ю. (1998). «Анализ роли TFIIE в регуляции транскрипции посредством исследования структурно-функциональной субъединицы TFIIEbeta» . Ж. Биол. Хим . 273 (31): 19866–76. дои : 10.1074/jbc.273.31.19866 ПМИД 9677423 . Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
показывать галерея PDB
1bby : DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, MINIMIZED AVERAGE
1f3u : CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF
2bby : DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, 30 STRUCTURES
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
hide (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
