ЗБТБ33

ЗБТБ33
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2LT7, 3FKC, 3M4T, 3M8V, 4F6M, 4F6N
Идентификаторы
Псевдонимы	ZBTB33 , ZNF-kaiso, ZNF348, цинковый палец и домен BTB, содержащий 33
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 300329 ; МГИ : 1927290 ; Гомологен : 4931 ; Генные карты : ZBTB33 ; ОМА : ZBTB33 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	120,258,398 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	37,285,923 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; skin of thigh; ; endothelial cell; ; skin of hip; ; Brodmann area 23; ; gingival epithelium; ; epithelium of nasopharynx; ; corpus epididymis; ; bronchial epithelial cell; ; middle temporal gyrus;
	Top expressed in
	medial ganglionic eminence; ; hair follicle; ; condyle; ; pineal gland; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; trigeminal ganglion; ; Epithelium of choroid plexus; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; parotid gland; ; fossa;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	methyl-CpG binding; sequence-specific DNA binding; DNA binding; protein binding; metal ion binding; nucleic acid binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	plasma membrane; nucleolus; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; cytosol;
Biological process	intracellular signal transduction; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; Wnt signaling pathway; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10009
	56805
	ENSG00000177485
	ENSMUSG00000048047
	Q86T24
	Q8BN78
	НМ_006777 ; НМ_001184742
	НМ_001079513 ; НМ_020256
	НП_001171671 ; НП_006768
	НП_001072981 ; НП_064652
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Регулятор транскрипции Kaiso представляет собой белок , который у человека кодируется ZBTB33 геном . ^[5] Этот ген кодирует регулятор транскрипции с бимодальной специфичностью связывания ДНК, который связывается с метилированным CGCG, а также с неметилированным консенсусным сайтом связывания KAISO TCCTGCNA. Белок содержит N-концевой домен POZ/BTB и 3 C-концевых мотива цинковых пальцев. Он привлекает репрессорный комплекс N-CoR для содействия деацетилированию гистонов и образованию репрессивных структур хроматина в промоторах генов-мишеней. Он может способствовать репрессии генов-мишеней сигнального пути Wnt, а также может активировать транскрипцию подмножества генов-мишеней за счет рекрутирования катенина дельта-2 (CTNND2). Его взаимодействие с катенином дельта-1 (CTNND1) ингибирует связывание как с метилированной, так и с неметилированной ДНК. Он также напрямую взаимодействует с рецептором ядерного импорта импортином-α2 (также известным как кариоферин альфа2 или когорта RAG 1), который может опосредовать ядерный импорт этого белка. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок, были идентифицированы. ^[6]

Ген KAISO, НАЗВАННЫЙ доктором Джульет Дэниэлс, был назван в честь музыки «калипсо», популярной на Карибах, в Тринидаде и Тобаго и т. д.

Взаимодействия

Было показано, что ZBTB33 взаимодействует с HDAC3 , ^[7] Ко-репрессор 1 ядерного рецептора ^[7] и CTNND1 . ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177485 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048047 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33» .
^ «Цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 22 марта 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Молекулярная клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .
^ Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинковых пальцев домена BTB/POZ» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614–23. дои : 10.1128/mcb.19.5.3614 . ПМК 84161 . ПМИД 10207085 .

Дальнейшее чтение

Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинковых пальцев домена BTB/POZ» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614–23. дои : 10.1128/mcb.19.5.3614 . ПМК 84161 . ПМИД 10207085 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Прохорчук А, Хендрих Б, Йоргенсен Х, Рузов А, Вильм М, Георгиев Г, Бёрд А, Прохорчук Е (июль 2001 г.). «Катенин-партнер p120 Кайсо представляет собой зависимый от метилирования ДНК репрессор транскрипции» . Гены и развитие . 15 (13): 1613–8. дои : 10.1101/gad.198501 . ПМК 312733 . ПМИД 11445535 .
Дэниел Дж. М., Иретон Р. К., Рейнольдс А. Б. (июнь 2001 г.). «Моноклональные антитела к Кайсо: новый фактор транскрипции и белок, связывающий p120ctn». Гибридома . 20 (3): 159–66. дои : 10.1089/027245701750293484 . ПМИД 11461664 .
Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Молекулярная клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .
Кондапалли Дж., Флозак А.С., Альбукерке М.Л. (март 2004 г.). «Ламинарный сдвиговый стресс дифференциально модулирует экспрессию генов катенина p120, транскрипционного фактора Kaiso и сосудистого эндотелиального кадгерина в эндотелиальных клетках коронарной артерии человека» . Журнал биологической химии . 279 (12): 11417–24. дои : 10.1074/jbc.M306057200 . ПМИД 14699141 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Ким С.В., Пак Дж.И., Спринг СМ, Сатер А.К., Джи Х., Отчер А.А., Дэниел Дж.М., МакКри П.Д. (декабрь 2004 г.). «Неканонические сигналы Wnt модулируются репрессором транскрипции Kaiso и p120-катенином». Природная клеточная биология . 6 (12): 1212–20. дои : 10.1038/ncb1191 . ПМИД 15543138 . S2CID 19404686 .
Рузов А., Дуникан Д.С., Прохорчук А., Пеннингс С., Станчева И., Прохорчук Е., Михан Р.Р. (декабрь 2004 г.). «Кайсо — это общегеномный репрессор транскрипции, который необходим для развития амфибий» . Разработка . 131 (24): 6185–94. дои : 10.1242/dev.01549 . hdl : 20.500.11820/1328870e-099c-4bbd-8061-06b8b21f25ef . ПМИД 15548582 .
Келли К.Ф., Отчер А.А., Грэм М., Дэниел Дж.М. (декабрь 2004 г.). «Ядерный импорт регулятора транскрипции BTB/POZ Kaiso». Журнал клеточной науки . 117 (Часть 25): 6143–52. дои : 10.1242/jcs.01541 . ПМИД 15564377 . S2CID 17008036 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа XM, Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Субри А., ван Хенгель Дж., Партенс Е., Колпаерт С., Ван Марк Е., Валтреньи Д., Рейнольдс А.Б., ван Рой Ф. (март 2005 г.). «Экспрессия и ядерное расположение репрессора транскрипции Кайсо регулируется микроокружением опухоли» . Исследования рака . 65 (6): 2224–33. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-2020 . ПМИД 15781635 .
Спринг СМ, Келли К.Ф., О'Келли И, Грэм М., Кроуфорд ХК, Дэниел Дж.М. (май 2005 г.). «Катенин p120ctn ингибирует Kaiso-опосредованную репрессию транскрипции матрилизина, гена-мишени бета-катенина/TCF». Экспериментальные исследования клеток . 305 (2): 253–65. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.01.007 . ПМИД 15817151 .
Араньи Т., Фошо Б.А., Халфалла О., Водждани Г., Биге Н.Ф., Малле Дж., Мелони Р. (июль 2005 г.). «Тканеспецифическое метилирование гена тирозингидроксилазы человека открывает новые регуляторные элементы в первом экзоне» . Журнал нейрохимии . 94 (1): 129–39. дои : 10.1111/j.1471-4159.2005.03173.x . ПМИД 15953356 .
Дефосс П.А., Келли К.Ф., Филион Дж.Дж., Перес-Торрадо Р., Магдинье Ф., Менони Х., Нордгаард К.Л., Дэниел Дж.М., Гилсон Э. (декабрь 2005 г.). «Фактор связывания CTC-блокатора энхансеров человека взаимодействует с фактором транскрипции Kaiso» . Журнал биологической химии . 280 (52): 43017–23. дои : 10.1074/jbc.M510802200 . ПМИД 16230345 .

Внешние ссылки

ZBTB33+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук ZBTB33
ZBTB33 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека ZBTB33 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177485 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048047 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33» .

[6] «Цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 22 марта 2016 г.

[pmid14527417-7] Jump up to: ^а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Молекулярная клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .

[pmid10207085-8] Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120(ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции цинковых пальцев домена BTB/POZ» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3614–23. дои : 10.1128/mcb.19.5.3614 . ПМК 84161 . ПМИД 10207085 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]