Jump to content

ХМГА2

ХМГА2
Идентификаторы
Псевдонимы HMGA2 , BABL, HMGI-C, HMGIC, LIPO, STQTL9, группа высокой мобильности AT-крючок 2, SRS5
Внешние идентификаторы ОМИМ : 600698 ; МГИ : 101761 ; Гомологен : 136767 ; Генные карты : HMGA2 ; ОМА : HMGA2 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_010441
НМ_001347170

RefSeq (белок)

НП_001287847
НП_001287848
НП_001317119
НП_003474
НП_003475

НП_001334099
НП_034571

Местоположение (UCSC) Чр 12: 65,82 – 65,97 Мб Чр 10: 120,2 – 120,31 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Группа AT-крючка 2 с высокой подвижностью , также известная как HMGA2 , представляет собой белок , который у человека кодируется HMGA2 геном . [5] [6] [7]

Этот ген кодирует белок, который принадлежит к семейству белков негистоновой хромосомной группы высокой подвижности (HMG). Белки HMG функционируют как архитектурные факторы и являются важными компонентами энхансосомы . Этот белок содержит структурные ДНК-связывающие домены и может действовать как фактор, регулирующий транскрипцию. Идентификация делеции, амплификации и реаранжировки этого гена, связанных с липомами, предполагает его роль в адипогенезе и мезенхимальной дифференцировке. Исследование с нокаутом гена на мышах показало, что этот ген участвует в ожирении, вызванном диетой . Охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы. [7]

Экспрессия HMGA2 во взрослых тканях обычно связана с образованием как злокачественных, так и доброкачественных опухолей, а также с некоторыми характерными мутациями, способствующими развитию рака. Гомологичные белки с высококонсервативными последовательностями обнаружены у других видов млекопитающих, включая лабораторных мышей ( Mus musculus ).

HMGA2 содержит три основных ДНК-связывающих домена ( АТ-крючки ), которые заставляют белок связываться с богатыми аденином и тимином (АТ) областями ядерной ДНК. HMGA2 напрямую не стимулирует и не ингибирует транскрипцию каких-либо генов, но изменяет структуру ДНК и способствует сборке белковых комплексов, которые регулируют транскрипцию генов. За некоторыми исключениями, HMGA2 экспрессируется у людей только на ранних стадиях развития и снижается до неопределяемого или почти неопределяемого уровня транскрипции во взрослых тканях. [8] МикроРНК в значительной степени let-7 ответственна за эту зависящую от времени регуляцию HMGA2. [9] Очевидная функция HMGA2 в пролиферации и дифференцировке клеток во время развития подтверждается наблюдением, что мыши с мутантными генами HMGA2 необычно малы (фенотип карликовых или мини-мышей). [10] и полногеномные исследования ассоциации, связывающие HMGA2 -ассоциированные SNP с изменением роста человека. [11]

Регулирование Let-7

[ редактировать ]

Let-7 ингибирует выработку специфических белков путем комплементарного связывания с их транскриптами мРНК . Транскрипт зрелой мРНК HMGA2 содержит семь областей, комплементарных или почти комплементарных let-7 в его 3'-нетранслируемой области (UTR). [12] Экспрессия Let-7 очень низкая на ранних этапах развития человека, что совпадает с наибольшей транскрипцией HMGA2. Зависимое от времени снижение экспрессии HMGA2 вызвано увеличением экспрессии let-7. [9]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Связь с раком

[ редактировать ]

Повышенная экспрессия HMGA2 обнаруживается при различных видах рака человека, но точный механизм, посредством которого HMGA2 способствует образованию рака, неизвестен. [13] [14] Те же мутации, которые приводят к аденомам гипофиза у мышей, можно обнаружить и при схожем раке у людей. [13] Его наличие связано с плохим прогнозом для пациента, а также с сенсибилизацией раковых клеток к определенным формам лечения рака. [15] Если говорить конкретнее, рак с высоким уровнем HMGA2 демонстрирует аномально сильную реакцию на двухцепочечные разрывы ДНК, вызванные лучевой терапией и некоторыми формами химиотерапии . Искусственное добавление HMGA2 к некоторым формам рака, не реагирующим на повреждение ДНК, заставляет их вместо этого реагировать на лечение, хотя механизм, посредством которого происходит это явление, также не понятен. [15] Однако экспрессия HMGA2 также связана с повышенным уровнем метастазирования при раке молочной железы , а также с метастазами и рецидивами плоскоклеточного рака . Эти свойства ответственны за плохой прогноз пациентов. Как и в случае с влиянием HMGA2 на реакцию на лучевую и химиотерапию, механизм, посредством которого HMGA2 оказывает эти эффекты, неизвестен. [15]

Очень распространенной находкой при раке с высоким содержанием HMGA2 является недостаточная экспрессия let-7. [16] Это не является неожиданным, учитывая естественную роль let-7 в регуляции HMGA2. Однако многие виды рака обнаруживаются с нормальными уровнями let-7 и высоким уровнем HMGA2. Многие из этих видов рака экспрессируют нормальный белок HMGA2, но транскрипт зрелой мРНК укорочен, в нем отсутствует часть 3'UTR, которая содержит критические комплементарные области let-7. Без них let-7 не может связываться с мРНК HMGA2 и, следовательно, не может ее подавлять. Укороченные мРНК могут возникнуть в результате хромосомной транслокации , которая приводит к потере части гена HMGA2. [12]

Сверхэкспрессия HMGA2 может играть роль в частой репрессии ERCC1 при раке. МикроРНК let-7a обычно репрессирует ген HMGA2 , а в нормальных тканях взрослых белок HMGA2 практически отсутствует. [17] (См. также предшественник микроРНК Let-7 .) Уменьшение или отсутствие микроРНК let-7a обеспечивает высокую экспрессию белка HMGA2. Как показали Боррманн и др., [18] HMGA2 нацеливается и модифицирует архитектуру хроматина гена ERCC1, снижая его экспрессию. Эти авторы отметили, что репрессия ERCC1 (посредством HGMA2) может снижать репарацию ДНК, что приводит к увеличению нестабильности генома .

Экспрессия белка ERCC1 снижена или отсутствует в 84–100% случаев колоректального рака человека . [19] [20] Экспрессия белка ERCC1 также была снижена в мышиной модели рака толстой кишки, связанной с диетой. [21] Однако, как указано в статье ERCC1 , два других эпигенетических механизма репрессии ERCC1 также могут играть роль в снижении экспрессии ERCC1 ( метилирование ДНК промотора и репрессия микроРНК ).

Иммунопреципитация хроматина

[ редактировать ]

Полногеномный анализ генов-мишеней HMGA2 был выполнен методом иммунопреципитации хроматина в линии клеток желудка со сверхэкспрессируемым HMGA2, и 1366 генов были идентифицированы как потенциальные мишени. [22] Путями, которые они определили как связанные с прогрессированием злокачественной неоплазии, были путь адгезионного соединения , сигнальный путь MAPK , сигнальный путь Wnt , сигнальный путь p53 , VEGF сигнальный путь , сигнальный путь Notch и сигнальный путь TGF бета .

Репарация негомологичного конца ДНК

[ редактировать ]

Сверхэкспрессия HMGA2 задерживает высвобождение DNA-PKcs (необходимого для репарации негомологичных концов ДНК) из сайтов двухцепочечного разрыва. Сверхэкспрессии только HMGA2 было достаточно, чтобы вызвать хромосомные аберрации, что является признаком дефицита репарации ДНК, опосредованной NHEJ. Эти свойства указывают на то, что HMGA2 способствует нестабильности генома и онкогенезу. [23] показал, что

Базовый путь эксцизионной репарации

[ редактировать ]

Белок HMGA2 может расщеплять ДНК, содержащую апуриновые/апиримидиновые (AP) сайты (является AP-лиазой). Кроме того, этот белок также обладает родственной 5'-дезоксирибозилфосфат (dRP) лиазной активностью. взаимодействие между эндонуклеазой 1 AP Было продемонстрировано человека и HMGA2 в раковых клетках, что указывает на то, что HMGA2 может быть включен в механизм эксцизионного восстановления клеточных оснований (BER). Повышенная экспрессия HMGA2 увеличила BER и позволила клеткам с повышенным уровнем HMGA2 стать устойчивыми к гидроксимочевине , химиотерапевтическому агенту для лечения солидных опухолей. [24]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что HMGA2 взаимодействует с PIAS3. [25] и НФКБ1 . [26]

Транспорт HMGA2 в ядро ​​опосредован взаимодействием его второго AT-крючка и импортина-α2 . [10]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000149948 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056758 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ашар Х.Р., Черат Л., Пшибыш К.М., Чада К. (январь 1996 г.). «Геномная характеристика человеческого HMGIC, члена семейства дополнительных факторов транскрипции, обнаруженных в точках разрыва транслокации в липомах». Геномика . 31 (2): 207–14. дои : 10.1006/geno.1996.0033 . ПМИД   8824803 .
  6. ^ Ишвад К.С., Шрайвер, доктор медицинских наук, Лассидж Д.М., Феррелл Р.Э. (январь 1997 г.). «Ген IC группы высокой подвижности (HMGI-C): полиморфизм и генетическая локализация». Генетика человека . 99 (1): 103–5. дои : 10.1007/s004390050320 . ПМИД   9003504 . S2CID   42615999 .
  7. ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: группа высокой подвижности HMGA2 AT-крючок 2» .
  8. ^ Феделе М., Баттиста С., Кеньон Л., Бальдассар Г., Фиданса В., Кляйн-Сзанто А.Дж. и др. (май 2002 г.). «Сверхэкспрессия гена HMGA2 у трансгенных мышей приводит к возникновению аденомы гипофиза» . Онкоген . 21 (20): 3190–8. дои : 10.1038/sj.onc.1205428 . ПМИД   12082634 .
  9. ^ Перейти обратно: а б Дрёге П., Дэйви Калифорния (январь 2008 г.). «Определяют ли клетки, позволяющие-7, стволовость?» . Клеточная стволовая клетка . 2 (1): 8–9. дои : 10.1016/j.stem.2007.12.003 . ПМИД   18371414 .
  10. ^ Перейти обратно: а б Каттаруцци Г., Альтамура С., Тессари М.А., Рустиги А., Джанкотти В., Пучилло С., Манфиолетти Г. (2007). «Второй AT-крючок архитектурного фактора транскрипции HMGA2 является определяющим для ядерной локализации и функции» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (6): 1751–60. дои : 10.1093/nar/gkl1106 . ПМЦ   1874589 . ПМИД   17324944 .
  11. ^ Хаммонд С.М., Шарплес, штат Нью-Йорк (декабрь 2008 г.). «HMGA2, микроРНК и старение стволовых клеток» . Клетка . 135 (6): 1013–6. дои : 10.1016/j.cell.2008.11.026 . ПМЦ   3725266 . ПМИД   19070572 .
  12. ^ Перейти обратно: а б Майр С., Хеманн М.Т., Бартель Д.П. (март 2007 г.). «Нарушение спаривания между let-7 и Hmga2 усиливает онкогенную трансформацию» . Наука . 315 (5818): 1576–9. Бибкод : 2007Sci...315.1576M . дои : 10.1126/science.1137999 . ПМК   2556962 . ПМИД   17322030 .
  13. ^ Перейти обратно: а б Феделе М., Пьерантони ГМ, Визоне Р., Фуско А. (сентябрь 2006 г.). «Критическая роль гена HMGA2 в аденомах гипофиза» . Клеточный цикл . 5 (18): 2045–8. дои : 10.4161/cc.5.18.3211 . ПМИД   16969098 .
  14. ^ Мейер Б., Лешке С., Шульце А., Вейгель Т., Сандкамп М., Гольдманн Т. и др. (июль 2007 г.). «Сверхэкспрессия HMGA2 при немелкоклеточном раке легких». Молекулярный канцерогенез . 46 (7): 503–11. дои : 10.1002/mc.20235 . ПМИД   17477356 . S2CID   30541611 .
  15. ^ Перейти обратно: а б с Бу Л.М., Лин Х.Х., Чунг В., Чжоу Б., Луи С.Г., О'Рейли М.А. и др. (август 2005 г.). «Группа А2 с высокой подвижностью усиливает генотоксический стресс отчасти за счет модуляции базальной и зависимой от повреждения ДНК активации протеинкиназы, связанной с фосфатидилинозитол-3-киназой». Исследования рака . 65 (15): 6622–30. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-0086 . ПМИД   16061642 .
  16. ^ Шелл С., Парк С.М., Раджаби А.Р., Шикель Р., Кистнер Е.О., Джуэлл Д.А. и др. (июль 2007 г.). «Экспрессия Let-7 определяет две стадии дифференциации рака» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (27): 11400–5. Бибкод : 2007PNAS..10411400S . дои : 10.1073/pnas.0704372104 . ПМК   2040910 . ПМИД   17600087 .
  17. ^ Мотояма К., Иноуэ Х., Накамура Ю., Уэтаке Х., Сугихара К., Мори М. (апрель 2008 г.). «Клиническое значение группы A2 с высокой подвижностью при раке желудка человека и ее связь с семейством микроРНК let-7» . Клинические исследования рака . 14 (8): 2334–40. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-07-4667 . ПМИД   18413822 .
  18. ^ Боррманн Л., Шванбек Р., Хейдук Т., Зеебек Б., Рогалла П., Буллердик Дж., Вишневски Дж. Р. (декабрь 2003 г.). «Белок группы А2 с высокой подвижностью и его производные связывают конкретную область промотора гена репарации ДНК ERCC1 и модулируют его активность» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (23): 6841–51. дои : 10.1093/nar/gkg884 . ПМК   290254 . ПМИД   14627817 .
  19. ^ Фациста А., Нгуен Х., Льюис С., Прасад А.Р., Рэмси Л., Зайтлин Б. и др. (апрель 2012 г.). «Недостаточная экспрессия ферментов репарации ДНК на ранней стадии развития спорадического рака толстой кишки» . Целостность генома . 3 (1): 3. дои : 10.1186/2041-9414-3-3 . ПМК   3351028 . ПМИД   22494821 .
  20. ^ Смит Д.Х., Фин А.М., Фог Л., Кристенсен И.Дж., Хансен Т.П., Стенванг Дж. и др. (март 2014 г.). «Измерение экспрессии белка ERCC1 в образцах рака: проверка нового антитела» . Научные отчеты . 4 : 4313. Бибкод : 2014NatSR...4E4313S . дои : 10.1038/srep04313 . ПМЦ   3945488 . ПМИД   24603753 .
  21. ^ Прасад А.Р., Прасад С., Нгуен Х., Фациста А., Льюис С., Зайтлин Б. и др. (июль 2014 г.). «Новая модель рака толстой кишки на мышах, связанная с диетой, аналогична раку толстой кишки у человека» . Всемирный журнал желудочно-кишечной онкологии . 6 (7): 225–43. дои : 10.4251/wjgo.v6.i7.225 . ПМЦ   4092339 . ПМИД   25024814 .
  22. ^ Чжа Л, Ван З, Тан В, Чжан Н, Ляо Г, Хуан Цзи (май 2012 г.). «Полногеномный анализ сайтов связывания транскрипционного фактора HMGA2 с помощью ChIP на чипе в клетках карциномы желудка». Молекулярная и клеточная биохимия . 364 (1–2): 243–51. дои : 10.1007/s11010-012-1224-z . ПМИД   22246783 . S2CID   15777147 .
  23. ^ Ли А.Ю., Бу Л.М., Ван С.Ю., Линь Х.Х., Ван CC, Йен Ю и др. (июль 2009 г.). «Подавление репарации негомологичного соединения концов путем сверхэкспрессии HMGA2» . Исследования рака . 69 (14): 5699–706. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-08-4833 . ПМЦ   2737594 . ПМИД   19549901 .
  24. ^ Саммер Х., Ли О, Бао К., Жан Л., Питер С., Сатьянатан П. и др. (июль 2009 г.). «HMGA2 проявляет активность расщепления сайта dRP/AP и защищает раковые клетки от цитотоксичности, вызванной повреждением ДНК, во время химиотерапии» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (13): 4371–84. дои : 10.1093/нар/gkp375 . ПМЦ   2715238 . ПМИД   19465398 .
  25. ^ Центнер, доктор медицинских наук, Лин Х.Х., Дэн Х.Т., Ким К.Дж., Ши Х.М., Энн Д.К. (август 2001 г.). «Необходимость взаимодействия группового белка высокой подвижности HMGI-C с ингибитором STAT3 PIAS3 при репрессии транскрипции альфа-субъединицы эпителиального Na+-канала (альфа-ENaC) путем активации Ras в эпителиальных клетках слюны» . Журнал биологической химии . 276 (32): 29805–14. дои : 10.1074/jbc.M103153200 . ПМИД   11390395 .
  26. ^ Норо Б., Личери Б., Сгарра Р., Рустиги А., Тессари М.А., Чау К.Ю. и др. (апрель 2003 г.). «Молекулярное исследование архитектурного фактора транскрипции HMGA2». Биохимия . 42 (15): 4569–77. дои : 10.1021/bi026605k . ПМИД   12693954 . S2CID   39605320 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: ca97464597a88c91276d469841e6a4c5__1694178180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ca/c5/ca97464597a88c91276d469841e6a4c5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
HMGA2 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)