Коробка для вилки d1
| ФОКСД1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | FOXD1 , FKHL8, FREAC-4, FREAC4, вильчатая коробка D1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 601091 ; МГИ : 1347463 ; Гомологен : 3290 ; Генные карты : FOXD1 ; ОМА : FOXD1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Forkhead Box D1 — это белок , который у человека кодируется геном FOXD1 . [4] Forkhead d1 представляет собой карты транскрипционных факторов, экспрессируемых почками, на хромосоме 5 в положении 5q12—q13, идентифицированных в дрозофилы белке forkhead и транскрипционном факторе HNF3 млекопитающих. [5] Название произошло от двух шипастых структур головы у эмбрионов дрозофилы-мутанта вилкоголовой . [5] Он принадлежит к семейству транскрипционных факторов , которое демонстрирует замечательное функциональное разнообразие и участвует в широком спектре биологических процессов. [5] Наиболее часто используемые синонимы Forkhead D1: FOX D1, FREAC-4 и BF2. [5]
Структура
[ редактировать ]Домен Forkhead в FOXD1 отличается от других членов того же семейства, за исключением FREAC-9, также известного как FOXD2. [6] Аминокислотная последовательность ДНК-связывающего мотива FREAC-4 аналогична FREAC-9, за исключением того, что на уровне нуклеотидов присутствуют 12 замен. [6] ДНК -связывающий домен представляет собой крылатую спираль, состоящую примерно из 100 аминокислот, имеет четыре спирали и двухцепочечный бета-лист, последовательность простирается от нуклеотида 2521 до 4792. [7] По оценкам, этот ген имеет длину примерно 2,5 тысячи пар оснований и, скорее всего, меньше интронов. [7] Мотив в NH 2 -концевой части является очень кислым и богат пролинами на СООН-конце, это аналогично фактору транскрипции UBF и WT-1. [7] В экспериментах по котрансфекции показано, что ген-супрессор опухоли p53 и WT-1 являются потенциальными регуляторами FREAC-4. [7] FOXD1 экспрессируется двумя клетками почечной линии COS 7 и 293 . [7] Он также имеет высокую степень сходства последовательностей с FOXD1, обнаруженным с помощью клонированной кДНК мыши . [8]
Функции
[ редактировать ]Исследования ортологичного мышиного белка показывают, что он участвует в развитии почек, способствуя дифференцировке предшественников нефронов , а также участвует в развитии сетчатки и перекреста зрительных нервов . Он также может регулировать воспалительные реакции и предотвращать аутоиммунитет . [4]
FOXD1 и стромальные клетки выполняют важную функцию во время морфогенеза почек . [8] Плацентарный фактор роста (PIGF) является прямой и физиологически значимой мишенью транскрипции FOXD1 и, следовательно, он экспрессируется совместно с FOXD1 для развития стромы почки. [8] У человека обнаружены две изоформы PIGF: PIGF1 и PIGF2. В ходе эксперимента было обнаружено, что три гена были идентифицированы с помощью индуцированного FOXD1 при нозерн-блоттинге. Во-первых, PIGF инициирует стромальный сигнал, который регулирует дифференцировку эпителия, который действует как фактор роста в реактивном ангиогенезе во время заживления ран и онкогенеза . [8] Во-вторых, гепарин-связывающий эпидермальный фактор роста и, наконец, белок bHLH G0S8. [8]
Foxd1 также необходим для правильного формирования перекреста зрительных нервов . [9] Во время формирования перекреста зрительных нервов Foxd1 экспрессируется в сетчатке VT, а также в вентральном промежуточном мозге для развития сетчатки и морфогенеза хиазмы. [9] Во время развития зрительной системы аксоны ганглиозных клеток сетчатки (RGC) покидают сетчатку через диск зрительного нерва, пока не достигнут перекреста зрительных нервов. [9] Foxg1 и Foxd1 экспрессируются в соседних доменах нервной трубки во время эвагинации оптического пузырька. Неправильная экспрессия Foxd1 и Foxg1 в сетчатке кур создает ошибку проекции в аксонах сетчатки вдоль антизадней оси в тектуме , а также играет роль в спецификации контралатеральных RGCs. [9] Установлено, что Foxd1 необходим для правильного формирования перекреста зрительных нервов.
FOX D1 экспрессируется и действует в поведении клеток глиомы , он усиливает активность и напрямую коррелирует со степенью глиомы. [10] Замедленная экспрессия FOX D1 вызывает снижение роста клеток глиомы и уменьшение миграции клеток. Существует высокая вероятность того, что FOXD1 может служить новым регулятором поведения клеток глиобластомы, который может быть использован в качестве новой мишени для генно-таргетной терапии. [10] У мышей Foxd1 экспрессируется в мезенхиме, окружающей гипофиз, которая является важным источником сигнальных факторов, регулирующих органогенез гипофиза . Это предполагает, что Foxd1 косвенно участвует в экспрессии Lhb и формировании хряща . [11]
Болезнь
[ редактировать ]Хромосомная дупликация в области 5q12-13 хромосомы 5 вызывает диспластию почек и психические расстройства, что связано с распределением мРНК FREAC-4 в тканях. [5]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000251493 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «Коробка с вилкой FOX D1 D1» .
- ^ Jump up to: а б с д и Карлссон П., Махлапуу М. (2002). «Факторы транскрипции Forkhead: ключевые игроки в развитии и метаболизме» . Биология развития . 250 (1): 1–23. дои : 10.1006/dbio.2002.0780 . ПМИД 12297093 .
- ^ Jump up to: а б Эрнстссон С., Бетц Р., Лагеркранц С., Ларссон С., Эрикссон С., Седерберг А., Карлссон П., Энербек С. (1997). «Клонирование и характеристика Freac-9 (FKHL17), нового гена человека, экспрессируемого почками, который картируется на хромосоме 1p32-p34». Геномика . 46 (1): 78–85. дои : 10.1006/geno.1997.4986 . ПМИД 9403061 .
- ^ Jump up to: а б с д и Эрнстссон С., Пьерру С., Хуландер М., Седерберг А., Хеллквист М., Карлссон П., Энербек С. (1996). «Характеристика человеческого гена FREAC-4. Доказательства регуляции геном-супрессором опухоли Вильмса (WT-1) и p53» . Журнал биологической химии . 271 (35): 21094–9. дои : 10.1074/jbc.271.35.21094 . ПМИД 8702877 .
- ^ Jump up to: а б с д и Хатини В., Ха СО, Герцлингер Д., Соарес В.К., Лай Э. (1996). «Существенная роль стромальной мезенхимы в морфогенезе почек, выявленная путем целенаправленного разрушения транскрипционного фактора Winged Helix BF-2» . Гены и развитие . 10 (12): 1467–78. дои : 10.1101/gad.10.12.1467 . ПМИД 8666231 .
- ^ Jump up to: а б с д Эррера Э., Маркус Р., Ли С., Уильямс С.Э., Эрскин Л., Лай Э., Мейсон С. (2004). «Foxd1 необходим для правильного формирования перекреста зрительных нервов» . Разработка . 131 (22): 5727–39. дои : 10.1242/dev.01431 . ПМИД 15509772 .
- ^ Jump up to: а б Гао Ю.Ф., Чжу Т., Мао XY, Мао CX, Ли Л, Инь Цзюй, Чжоу Х.Х., Лю ZQ (2017). «Замалчивание Forkhead Box D1 ингибирует пролиферацию и миграцию клеток глиомы» . Отчеты онкологии . 37 (2): 1196–1202. дои : 10.3892/или.2017.5344 . ПМИД 28075458 .
- ^ Гамбель Дж.Х., Паттерсон Э.М., Овусу С.А., Кабат Б.Е., Юнг Д.О., Симмонс Дж., Хопкинс Т., Эллсуорт Б.С. (2012). «Транскрипционный фактор Foxd1 необходим для экспрессии лютеинизирующего гормона гипофиза у мышей» . ПЛОС ОДИН . 7 (12): е52156. Бибкод : 2012PLoSO...752156G . дои : 10.1371/journal.pone.0052156 . ПМЦ 3526578 . ПМИД 23284914 .