домен bZIP
| транскрипционный фактор bZIP | |||
|---|---|---|---|
 CREB (вверху) представляет собой фактор транскрипции , способный связывать ДНК через домен bZIP (внизу) и регулировать экспрессию генов . | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | bZIP_1 | ||
| Пфам | PF00170 | ||
| ИнтерПро | ИПР011616 | ||
| PROSITE | PDOC00036 | ||
| СКОП2 | 1ysa / SCOPe / СУПФАМ | ||
| CDD | cd14686 | ||
| Мембраном | 235 | ||
| |||
Основной домен лейциновой молнии ( домен bZIP ) обнаружен во многих ДНК- связывающих эукариотических белках. Одна часть домена содержит область, которая обеспечивает специфичные для последовательности свойства связывания ДНК, и лейциновую застежку , которая необходима для удержания вместе (димеризации) двух областей связывания ДНК. Область связывания ДНК содержит ряд основных аминокислот, таких как аргинин и лизин . Белки, содержащие этот домен, являются факторами транскрипции . [1] [2]
факторы транскрипции bZIP
[ редактировать ]Факторы транскрипции bZIP обнаружены у всех эукариот и образуют одно из крупнейших семейств димеризующихся ТФ. [3] Эволюционное исследование 2008 года показало, что 4 гена bZIP кодируются геномом самого недавнего общего предка всех растений. [4] Взаимодействия между факторами транскрипции bZIP многочисленны и сложны. [5] [6] [3] и играют важную роль в развитии рака [7] в эпителиальных тканях синтез стероидных гормонов клетками эндокринных тканей, [8] факторы, влияющие на репродуктивные функции, [9] и ряд других явлений, влияющих на здоровье человека.
Домен bZIP, содержащий белки
[ редактировать ]- Гетеродимер AP-1 fos / jun , образующий фактор транскрипции
- Jun-B Транскрипционный фактор
- CREB Фактор транскрипции элемента ответа цАМФ
- Транскрипционный фактор OPAQUE2 (O2) гена зеина массой 22 кДа, который кодирует класс запасных белков в эндосперме зерен кукурузы ( Zea mays ).
- НФЕ2Л2 или НРФ2
- Bzip Maf Факторы транскрипции
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]АТФ1 ; АТФ2 ; АТФ4 ; АТФ5 ; АТФ6 ; АТФ7 ; БАХ1 ; БАХ2 ; БАТФ ; БАТФ2 ; СЕБПА ; ЦЕБПБ ; ЦЕБПД ; ЦЕБПЭ ; ЦЕБПГ ; ЦЭБПЗ ; КРЕБ1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2 ; CREB3L3 ; CREB3L4 ; CREB5 ; КРЕБЛ1 ; КРЕМ ; Е4BP4 ; ФОСЛ1 ; ФОСЛ2 ; ИЮНЬ ; ДЖУНБ ; ЮНД ; МАФА ; МАФБ ; МАФФ ; МАФГ ; НРЛ; С-МАФ ; МАФК ; НФЕ2 ; НФЕ2L2 ; НФЕ2L3 ; СНФТ ; ХВР1
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Элленбергер Т (1994). «Освоение распознавания ДНК: структуры основной области лейциновой молнии и ДНК-связывающих доменов основной области спираль-петля-спираль». Курс. Мнение. Структура. Биол . 4 (1): 12–21. дои : 10.1016/S0959-440X(94)90054-X .
- ^ Херст ХК (1995). «Факторы транскрипции 1: белки bZIP». Белковый профиль . 2 (2): 101–68. ПМИД 7780801 .
- ^ Перейти обратно: а б Амуциас, Григорис Д.; Робертсон, Дэвид Л.; Ван де Пер, Ив; Оливер, Стивен Г. (1 мая 2008 г.). «Выберите своих партнеров: димеризация эукариотических факторов транскрипции». Тенденции биохимических наук . 33 (5): 220–229. дои : 10.1016/j.tibs.2008.02.002 . ISSN 0968-0004 . ПМИД 18406148 .
- ^ Корреа Л.Г., Рианьо-Пачон Д.М., Шраго К.Г., дос Сантос Р.В., Мюллер-Робер Б., Винцентц М. (2008). Шиу С.Х. (ред.). «Роль факторов транскрипции bZIP в эволюции зеленых растений: адаптивные особенности, возникающие из четырех генов-основателей» . ПЛОС ОДИН . 3 (8): e2944. Бибкод : 2008PLoSO...3.2944C . дои : 10.1371/journal.pone.0002944 . ПМК 2492810 . ПМИД 18698409 .
- ^ Винсон, Чарльз; Ачарья, Аша; Тапаровски, Элизабет Дж. (1 января 2006 г.). «Расшифровка взаимодействий транскрипционных факторов B-ZIP in vitro и in vivo» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1759 (1–2): 4–12. дои : 10.1016/j.bbaexp.2005.12.005 . ISSN 0006-3002 . ПМИД 16580748 .
- ^ Ньюман, Джон Р.С.; Китинг, Эми Э. (27 июня 2003 г.). «Комплексная идентификация взаимодействия человеческого bZIP с спиральными массивами» . Наука . 300 (5628): 2097–2101. Бибкод : 2003Sci...300.2097N . дои : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 12805554 . S2CID 36715183 .
- ^ Влахопулос С.А., Логотети С., Микас Д., Гиарика А., Горгулис В., Зумпурлис В. (апрель 2008 г.). «Роль АТФ-2 в онкогенезе». Биоэссе . 30 (4): 314–27. doi : 10.1002/bies.20734 . ПМИД 18348191 . S2CID 678541 .
- ^ Манна П.Р., Дайсон М.Т., Юбенк Д.В., Кларк Б.Дж., Лалли Э., Сассон-Корси П., Железник А.Дж., Стокко Д.М. (январь 2002 г.). «Регуляция стероидогенеза и стероидогенного острого регуляторного белка членом семейства белков, связывающих ответный элемент цАМФ» . Мол. Эндокринол . 16 (1): 184–99. дои : 10.1210/mend.16.1.0759 . ПМИД 11773448 .
- ^ Хоар С., Копленд Дж.А., Вуд Т.Г., Дженг Ю.Дж., Избан М.Г., Солофф М.С. (май 1999 г.). «Идентификация сайта связывания альфа/бета GABP, участвующего в индукции экспрессии гена рецептора окситоцина в клетках молочной железы человека, усиление с помощью c-Fos/c-Jun» . Эндокринология . 140 (5): 2268–79. дои : 10.1210/endo.140.5.6710 . ПМИД 10218980 .