Домен ДМ
| Домен ДМ | |||
|---|---|---|---|
 Drosophila melanogaster doublesex (dsx), ЯМР, 18 структур | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ДМ | ||
| Пфам | PF00751 | ||
| ИнтерПро | ИПР001275 | ||
| УМНЫЙ | SM00718 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1рвв / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
В молекулярной биологии домен DM представляет собой белковый домен, впервые обнаруженный в двуполых белках Drosophila melanogaster , а также обнаруженный в C. elegans и белках млекопитающих. [ 1 ] У D. melanogaster двойного пола ген контролирует соматическую половую дифференциацию путем производства альтернативно сплайсированных мРНК, кодирующих родственные пол-специфичные полипептиды . [ 2 ] эти белки Считается, что действуют как факторы транскрипции на нижестоящие гены детерминации пола, особенно на дифференцировку нейробластов и генов транскрипцию белка желтка . [ 3 ] [ 4 ]
Домен DM связывает ДНК в виде димера, позволяя распознавать псевдопалиндромные последовательности . [ 2 ] [ 5 ] [ 6 ] ЯМР-анализ домена DSX DM [ 6 ] выявили новый цинковый модуль, содержащий «переплетенные» центры связывания цинка CCHC и HCCC. Для распознавания ДНК необходим основной хвост на карбокси-конце, который контактирует с малой бороздкой целевой последовательности .
Белки с этим доменом
[ редактировать ]Белки с доменом DM обнаружены во многих модельных организмах. Многие C. elegans белки Mab содержат этот домен, наиболее известным из которых является mab-3. [ 1 ] Человеческие белки, содержащие этот домен, включают DMRT1 , DMRT2 , DMRT3 , DMRTA1 , DMRTA2 , DMRTB1 и DMRTC2 ; каждый из них имеет мышиный гомолог. [ 7 ]
| Dmrt1-специфичный | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Дмрт1 | ||
| Пфам | ПФ12374 | ||
| ИнтерПро | ИПР022114 | ||
| |||
Гомологи DMRT1 имеют дополнительный общий C-концевой домен по отношению к домену DM. Этот домен обнаружен только у костных позвоночных , и его структура и функция неизвестны. [ 8 ] : видовое дерево Jpred предсказывает, что человеческая версия секции будет состоять в основном из катушек; это также предполагает слабое сходство с PDB : 6BO4 от BLAST . [ 9 ]
| Мотив DMRTA | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | прямой доступ к памяти | ||
| Пфам | PF03474 | ||
| ИнтерПро | ИПР005173 | ||
| |||
Белки DMRTA имеют дополнительный мотив на С-конце. Этот мотив, повсеместно встречающийся у эукариот, имеет неизвестную функцию. По последовательности он похож на некоторые убиквитин -ассоциированные мотивы. [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Раймонд К.С., Шаму К.Э., Шен М.М., Зайферт К.Дж., Хирш Б., Ходжкин Дж., Зарковер Д. (февраль 1998 г.). «Доказательства эволюционной консервации генов, определяющих пол». Природа . 391 (6668): 691–5. Бибкод : 1998Natur.391..691R . дои : 10.1038/35618 . ПМИД 9490411 . S2CID 11414843 .
- ^ Jump up to: а б Эрдман С.Е., Чен Х.Дж., Буртис К.К. (декабрь 1996 г.). «Функциональная и генетическая характеристика свойств олигомеризации и связывания ДНК двуполых белков дрозофилы» . Генетика . 144 (4): 1639–52. дои : 10.1093/генетика/144.4.1639 . ПМК 1207715 . ПМИД 8978051 .
- ^ Бертис К.К., Косчигано К.Т., Бейкер Б.С. , Венсинк ПК (сентябрь 1991 г.). «Двуполые белки Drosophila melanogaster напрямую связываются с специфичным для пола усилителем гена белка желтка» . ЭМБО Дж . 10 (9): 2577–82. дои : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07798.x . ПМК 452955 . ПМИД 1907913 .
- ^ Шен М.М., Ходжкин Дж. (сентябрь 1988 г.). «mab-3, ген, необходимый для экспрессии белка желтка с учетом пола и мужской линии у C. elegans». Клетка . 54 (7): 1019–31. дои : 10.1016/0092-8674(88)90117-1 . ПМИД 3046751 . S2CID 1386352 .
- ^ Йи В., Зарковер Д. (февраль 1999 г.). «Сходство связывания ДНК и регуляции транскрипции Caenorhabditis elegans MAB-3 и Drosophila melanogaster DSX предполагает сохранение механизмов определения пола». Разработка . 126 (5): 873–81. дои : 10.1242/dev.126.5.873 . ПМИД 9927589 .
- ^ Jump up to: а б Чжу Л., Уилкен Дж., Филлипс Н.Б., Нарендра У., Чан Г., Страттон С.М., Кент С.Б., Вайс М.А. (июль 2000 г.). «Половой диморфизм у разнообразных многоклеточных животных регулируется новым классом переплетенных цинковых пальцев» . Генс Дев . 14 (14): 1750–64. дои : 10.1101/gad.14.14.1750 . ПМК 316782 . ПМИД 10898790 .
- ^ «Соответствующие белки: ДНК-связывающий домен DM (IPR001275), отфильтрованный по видам (Homo sapiens)» . ИнтерПро .
- ^ «Семейство: Dmrt1 (PF12374)» . Пфам .
- ^ «Результаты Jpred (MTECSGTSQPPPASVPTTAASEGRMVIQDIPAVTSRGHVENTPD)» . www.compbio.dundee.ac.uk . Архивировано из оригинала 10 апреля 2019 года . Проверено 10 апреля 2019 г.
- ^ «Виды: мотив DMRTA (IPR005173)» . ИнтерПро . Проверено 10 апреля 2019 г.