Простой инструмент исследования модульной архитектуры
 |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Схема идентификации белковых доменов . |
| Типы данных захвачен | Белковые домены |
| Организмы | все |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Европейская лаборатория молекулярной биологии |
| Первичное цитирование | ПМИД 18978020 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://smart.embl-heidelberg.de |
| Разнообразный | |
| Лицензия | Бесплатно для ученых, но не для коммерческих пользователей |
| Версия | 7 |
| Политика курирования | Да |
Инструмент исследования простой модульной архитектуры ( SMART ) — это биологическая база данных , которая используется для идентификации и анализа белковых доменов в белковых последовательностях. [ 1 ] [ 2 ] SMART использует модели Маркова со скрытым профилем, построенные на основе множественных выравниваний последовательностей, для обнаружения белковых доменов в белковых последовательностях. Самая последняя версия SMART содержит 1204 модели предметной области. [ 3 ] Данные SMART использовались при создании коллекции базы данных консервативных доменов , а также распространяются как часть базы данных InterPro . [ 4 ] База данных находится в Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шульц Дж., Милпец Ф., Борк П., Понтинг К.П. (май 1998 г.). «SMART, простой инструмент исследования модульной архитектуры: идентификация сигнальных доменов» (PDF) . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (11): 5857–64. Бибкод : 1998PNAS...95.5857S . дои : 10.1073/pnas.95.11.5857 . ПМК 34487 . ПМИД 9600884 .
- ^ Летунич И., Доркс Т., Борк П. (январь 2009 г.). «SMART 6: последние обновления и новые разработки» . Нуклеиновые кислоты Рез . 37 (Проблема с базой данных): D229–32. дои : 10.1093/нар/gkn808 . ПМЦ 2686533 . ПМИД 18978020 .
- ^ Летунич, Ивица; Доркс, Тобиас; Борк, Пер (январь 2015 г.). «SMART: последние обновления, новые разработки и статус в 2015 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Проблема с базой данных): D257–260. дои : 10.1093/nar/gku949 . ISSN 1362-4962 . ПМК 4384020 . ПМИД 25300481 .
- ^ Малдер Н.Дж., Апвейлер Р., Эттвуд Т.К. и др. (сентябрь 2002 г.). «InterPro: интегрированный ресурс документации по семействам белков, доменам и функциональным сайтам» . Краткий. Биоинформатика . 3 (3): 225–35. дои : 10.1093/нагрудник/3.3.225 . ПМИД 12230031 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
  | Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |