Домен BMC
БМК | |||
---|---|---|---|
![]() белок оболочки карбоксисомы ccmk2 | |||
Идентификаторы | |||
Символ | БМК | ||
Пфам | PF00936 | ||
ИнтерПро | IPR000249 | ||
PROSITE | PDOC00876 | ||
CDD | cd06169 | ||
|
В молекулярной биологии домен бактериального микрокомпартмента (BMC) представляет собой белковый домен, обнаруженный во множестве белков оболочки, включая CsoS1A, CsoS1B и CsoS1C Thiobacillus neapolitanus ( Halothiobacillus neapolitanus ) и их ортологов из других бактерий. Эти белки оболочки образуют полиэдрическую структуру карбоксисомы и родственных структур, которая играет метаболическую роль у бактерий. Домен BMC состоит примерно из 90 аминокислотных остатков, характеризующихся мотивом β-α-β, соединенным β-шпилькой .
Большинство белков оболочки состоят из одного домена BMC в каждой субъединице, образуя гексамерную структуру, которая собирается в плоские грани многогранной оболочки. [ 1 ] На сегодняшний день было обнаружено, что два белка оболочки состоят из тандемных доменов BMC, из которых образуется тримерная структура, придающая псевдогексамерный вид. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Керфельд К.А., Савая М.Р., Танака С., Нгуен К.В., Филлипс М., Биби М., Йейтс Т.О. (август 2005 г.). «Белковые структуры, образующие оболочку примитивных бактериальных органелл». Наука . 309 (5736): 936–8. CiteSeerX 10.1.1.1026.896 . дои : 10.1126/science.1113397 . ПМИД 16081736 . S2CID 24561197 .
- ^ Хелдт Д., Фрэнк С., Сейедараби А., Ладикис Д., Парсонс Дж.Б., Уоррен М.Дж., Пикерсгилл Р.В. (сентябрь 2009 г.). «Структура тримерного бактериального белка оболочки микрокамеры, EtuB, связанного с утилизацией этанола в Clostridium kluyveri». Биохимический журнал . 423 (2): 199–207. дои : 10.1042/BJ20090780 . ПМИД 19635047 . S2CID 22548122 .
- ^ Панг А., Уоррен М.Дж., Пикерсгилл Р.В. (февраль 2011 г.). «Структура PduT, тримерного бактериального микрокомпартментного белка с сайтом связывания кластера 4Fe-4S». Акта Кристаллографика Д. 67 (Часть 2): 91–6. дои : 10.1107/S0907444910050201 . ПМИД 21245529 .