HOXA5

HOXA5
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXA5 , HOX1, HOX1.3, HOX1C, гомеобокс A5
Внешние идентификаторы	Опустить : 142952 ; МГИ : 96177 ; Гомологен : 40726 ; Генные карты : HOXA5 ; OMA : HOXA5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	27,143,681 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	52,181,567 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	caput epididymis; ; corpus epididymis; ; renal medulla; ; left uterine tube; ; adrenal cortex; ; right adrenal cortex; ; left adrenal cortex; ; mucosa of transverse colon; ; mucosa of ileum; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	axial skeleton; ; human vertebral column; ; cervical vertebral column; ; thoracic vertebral column; ; efferent ductule; ; left lung lobe; ; migratory enteric neural crest cell; ; rib; ; right lung lobe; ; tail of embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Cellular component	nucleus;
Biological process	embryonic skeletal system morphogenesis; pattern specification process; skeletal system development; respiratory system process; regulation of transcription, DNA-templated; multicellular organism growth; lung development; trachea morphogenesis; bronchiole development; cell-cell signaling involved in mammary gland development; regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; mammary gland alveolus development; lung goblet cell differentiation; transcription, DNA-templated; mammary gland epithelial cell differentiation; negative regulation of erythrocyte differentiation; respiratory gaseous exchange by respiratory system; trachea cartilage morphogenesis; embryonic skeletal system development; morphogenesis of an epithelium; multicellular organism development; thyroid gland development; lobar bronchus epithelium development; mesenchymal-epithelial cell signaling; positive regulation of apoptotic process; intestinal epithelial cell maturation; negative regulation of angiogenesis; cartilage morphogenesis; lung alveolus development; lung-associated mesenchyme development; epithelial tube branching involved in lung morphogenesis; cell migration; positive regulation of myeloid cell differentiation; anterior/posterior pattern specification; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3202
	15402
	ENSG00000106004
	ENSMUSG00000038253
	P20719
	P09021
	НМ_019102
	НМ_010453
	НП_061975
	НП_034583
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомеобоксный белок Hox-A5 — это белок , который у человека кодируется HOXA5 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

У позвоночных гены, кодирующие класс транскрипционных факторов , называемых гомеобоксными генами, обнаружены в кластерах под названиями A, B, C и D на четырех отдельных хромосомах. Экспрессия этих белков пространственно и временно регулируется во время эмбрионального развития. Этот ген является частью кластера А на хромосоме 7 и кодирует ДНК-связывающий фактор транскрипции, который может регулировать экспрессию генов, морфогенез и дифференцировку. Метилирование этого гена может привести к потере его экспрессии, и, поскольку кодируемый белок усиливает супрессор опухоли р53 , этот белок может играть важную роль в онкогенезе . ^[7]

HoxA5 контролируется, по крайней мере частично, метилированием ДНК . ^[8] Было показано, что HoxA5 активирует опухолевый супрессор p53 и AKT1 за счет подавления PTEN . ^[9] Было показано, что подавление HoxA5 замедляет рост гемангиомы . ^[10] HoxA5 оказывает далеко идущее влияние на экспрессию генов, вызывая активацию около 300 генов при его индукции в клеточных линиях рака молочной железы. ^[11] Сверхэкспрессия домена трансдукции белка HoxA5 предотвращает воспаление, проявляющееся ингибированием TNFα -индуцируемого связывания моноцитов с HUVEC . ^[12]^[13]

Сравнение профиля метилирования промотора HoxA5 в типах клеток, от наименее дифференцированных (эмбриональные стволовые клетки человека) до наиболее эндотелиоподобных (эндотелиальные клетки пупочной вены человека, или HUVEC), показывает, что промотор HoxA5 обычно сильно метилирован в недифференцированных клетках. и становится деметилированным по мере того, как клетки дифференцируются вниз по эндотелиальной линии . ^[14] HoxA5 содержит элементы ответа C-Amp (CRE) в своем промоторе. ^[8] Связывание POL2 и CTCF обогащено CpG -плотным промотором HoxA5 в HUVEC, демонстрируя транскрипционную активность. ^[14]

Клиническое значение

HoxA5 подавляется при остром миелолейкозе (ОМЛ), а DNMT ингибитор децитабин для лечения этого заболевания используется (5Aza). Хотя известно, что HoxA5 гиперметилируется при ОМЛ, еще не было показано, воздействует ли децитабин непосредственно на эти гены для деметилирования. ^[15]^[16] HOXA5 также был номинирован как онкоген при глиобластоме . ^[17]

См. также

Гомеобокс

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106004 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038253 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .
^ Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXA5 А5» .
^ Jump up to: ^а ^б Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Поток-зависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042 . ПМЦ 4754957 . ПМИД 25953647 .
^ Ардериу Г, Куэвас И, Чен А, Каррио М, Ист Л, Будро, Нью-Джерси (2007). «HoxA5 стабилизирует слипчивые соединения за счет увеличения Akt1» . Адгезия и миграция клеток . 1 (4): 185–95. дои : 10.4161/cam.1.4.5448 . ПМК 2634105 . ПМИД 19262140 .
^ Чжу Ю., Куэвас И.С., Габриэль Р.А., Су Х., Нишимура С., Гао П., Филдс А., Хао К., Янг В.Л., Ян Г.И., Будро, Нью-Джерси (июнь 2009 г.). «Восстановление экспрессии транскрипционного фактора HoxA5 подавляет рост экспериментальных гемангиом головного мозга» . Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 68 (6): 626–32. doi : 10.1097/NEN.0b013e3181a491ce . ПМЦ 2728585 . ПМИД 19458547 .
^ Чен Х., Рубин Э., Чжан Х., Чунг С., Цзе CC, Гарретт Э., Бисвал С., Сукумар С. (май 2005 г.). «Идентификация транскрипционных мишеней HOXA5» . Журнал биологической химии . 280 (19): 19373–80. дои : 10.1074/jbc.M413528200 . ПМИД 15757903 .
^ Ли Дж.И., Пак К.С., Чо Э.Дж., Джу Х.К., Ли С.К., Ли С.Д., Пак Дж.Б., Чанг С.Дж., Чон Б.Х. (июль 2011 г.). «Человеческий гомеодомен HOXA5 усиливает трансдукцию белка и его применение при воспалении сосудов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 410 (2): 312–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2011.05.139 . ПМИД 21664342 .
^ Чен Ю, Горски Д.Х. (февраль 2008 г.). «Регуляция ангиогенеза с помощью микроРНК (миР-130а), которая подавляет антиангиогенные гомеобоксные гены GAX и HOXA5» . Кровь . 111 (3): 1217–26. дои : 10.1182/blood-2007-07-104133 . ПМК 2214763 . ПМИД 17957028 .
^ Jump up to: ^а ^б Данн Дж., Симмонс Р., Табет С., Джо Х. (октябрь 2015 г.). «Роль эпигенетики в реакции эндотелиальных клеток на стресс сдвига и атеросклерозе» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 67 : 167–76. doi : 10.1016/j.biocel.2015.05.001 . ПМЦ 4592147 . ПМИД 25979369 .
^ Стратди Дж., Сим А., Саутар Р., Холиок Т.Л., Браун Р. (февраль 2007 г.). «HOXA5 подвергается специфичному для клеточного типа метилированию CpG-островков в нормальных клетках и во время развития острого миелолейкоза» . Канцерогенез . 28 (2): 299–309. дои : 10.1093/carcin/bgl133 . ПМИД 16861263 .
^ Ким С.Ю., Хван Ш., Сон Э.Дж., Шин Х.Дж., Юнг Дж.С., Ли Э.Ю. (октябрь 2010 г.). «Уровень гиперметилирования HOXA5 при остром миелолейкозе связан с краткосрочным исходом» . Корейский журнал лабораторной медицины . 30 (5): 469–73. дои : 10.3343/kjlm.2010.30.5.469 . ПМИД 20890077 .
^ Чимино П.Дж., Ким Ю, Ву Х.Дж., Александр Дж., Виршинг Х.Г., Шульжевски Ф., Питтер К., Озава Т., Ван Дж., Васкес Дж., Арора С., Рабадан Р., Левин Р., Михор Ф., Холланд ЕС (2018). «Повышенная экспрессия HOXA5 обеспечивает селективное преимущество для увеличения всей хромосомы 7 при глиобластоме дикого типа IDH» . Гены и развитие . 32 (7–8): 512–523. дои : 10.1101/gad.312157.118 . ПМЦ 5959235 . ПМИД 29632085 .

Внешние ссылки

HOXA5+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106004 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038253 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1973146-5] Макэлпайн П.Дж., Показывает туберкулез (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . ПМИД 1973146 .

[pmid1358459-6] Скотт, член парламента (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура гомеобоксных генов позвоночных». Клетка . 71 (4): 551–3. дои : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . ПМИД 1358459 . S2CID 13370372 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: Гомеобокс HOXA5 А5» .

[ReferenceA-8] Jump up to: ^а ^б Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Поток-зависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе» . Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042 . ПМЦ 4754957 . ПМИД 25953647 .

[9] Ардериу Г, Куэвас И, Чен А, Каррио М, Ист Л, Будро, Нью-Джерси (2007). «HoxA5 стабилизирует слипчивые соединения за счет увеличения Akt1» . Адгезия и миграция клеток . 1 (4): 185–95. дои : 10.4161/cam.1.4.5448 . ПМК 2634105 . ПМИД 19262140 .

[10] Чжу Ю., Куэвас И.С., Габриэль Р.А., Су Х., Нишимура С., Гао П., Филдс А., Хао К., Янг В.Л., Ян Г.И., Будро, Нью-Джерси (июнь 2009 г.). «Восстановление экспрессии транскрипционного фактора HoxA5 подавляет рост экспериментальных гемангиом головного мозга» . Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 68 (6): 626–32. doi : 10.1097/NEN.0b013e3181a491ce . ПМЦ 2728585 . ПМИД 19458547 .

[11] Чен Х., Рубин Э., Чжан Х., Чунг С., Цзе CC, Гарретт Э., Бисвал С., Сукумар С. (май 2005 г.). «Идентификация транскрипционных мишеней HOXA5» . Журнал биологической химии . 280 (19): 19373–80. дои : 10.1074/jbc.M413528200 . ПМИД 15757903 .

[12] Ли Дж.И., Пак К.С., Чо Э.Дж., Джу Х.К., Ли С.К., Ли С.Д., Пак Дж.Б., Чанг С.Дж., Чон Б.Х. (июль 2011 г.). «Человеческий гомеодомен HOXA5 усиливает трансдукцию белка и его применение при воспалении сосудов». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 410 (2): 312–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2011.05.139 . ПМИД 21664342 .

[13] Чен Ю, Горски Д.Х. (февраль 2008 г.). «Регуляция ангиогенеза с помощью микроРНК (миР-130а), которая подавляет антиангиогенные гомеобоксные гены GAX и HOXA5» . Кровь . 111 (3): 1217–26. дои : 10.1182/blood-2007-07-104133 . ПМК 2214763 . ПМИД 17957028 .

[Dunn_2015-14] Jump up to: ^а ^б Данн Дж., Симмонс Р., Табет С., Джо Х. (октябрь 2015 г.). «Роль эпигенетики в реакции эндотелиальных клеток на стресс сдвига и атеросклерозе» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 67 : 167–76. doi : 10.1016/j.biocel.2015.05.001 . ПМЦ 4592147 . ПМИД 25979369 .

[15] Стратди Дж., Сим А., Саутар Р., Холиок Т.Л., Браун Р. (февраль 2007 г.). «HOXA5 подвергается специфичному для клеточного типа метилированию CpG-островков в нормальных клетках и во время развития острого миелолейкоза» . Канцерогенез . 28 (2): 299–309. дои : 10.1093/carcin/bgl133 . ПМИД 16861263 .

[16] Ким С.Ю., Хван Ш., Сон Э.Дж., Шин Х.Дж., Юнг Дж.С., Ли Э.Ю. (октябрь 2010 г.). «Уровень гиперметилирования HOXA5 при остром миелолейкозе связан с краткосрочным исходом» . Корейский журнал лабораторной медицины . 30 (5): 469–73. дои : 10.3343/kjlm.2010.30.5.469 . ПМИД 20890077 .

[17] Чимино П.Дж., Ким Ю, Ву Х.Дж., Александр Дж., Виршинг Х.Г., Шульжевски Ф., Питтер К., Озава Т., Ван Дж., Васкес Дж., Арора С., Рабадан Р., Левин Р., Михор Ф., Холланд ЕС (2018). «Повышенная экспрессия HOXA5 обеспечивает селективное преимущество для увеличения всей хромосомы 7 при глиобластоме дикого типа IDH» . Гены и развитие . 32 (7–8): 512–523. дои : 10.1101/gad.312157.118 . ПМЦ 5959235 . ПМИД 29632085 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]