АТФ4

АТФ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1CI6
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF4 , CREB-2, CREB2, TAXREB67, TXREB, активирующий фактор транскрипции 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 604064 ; МГИ : 88096 ; Гомологен : 1266 ; Генные карты : ATF4 ; ОМА : ATF4 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	39,522,683 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	80,141,742 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	muscle layer of sigmoid colon; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; body of stomach; ; subcutaneous adipose tissue; ; fundus; ; right coronary artery; ; body of pancreas; ; left coronary artery; ; Descending thoracic aorta;
	Top expressed in
	ankle joint; ; calvaria; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; granulocyte; ; lacrimal gland; ; plantaris muscle; ; temporal muscle; ; islet of Langerhans; ; triceps brachii muscle; ; muscle of thigh;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; transcription factor binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; core promoter sequence-specific DNA binding; protein C-terminus binding; protein binding; leucine zipper domain binding; protein heterodimerization activity; protein kinase binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; ATF1-ATF4 transcription factor complex; ATF4-CREB1 transcription factor complex; transcription regulator complex; dendrite membrane; nucleus; Lewy body core; nuclear periphery; membrane; plasma membrane; nucleoplasm; microtubule organizing center; neuron projection; cytoskeleton; CHOP-ATF4 complex; centrosome; protein-containing complex; RNA polymerase II transcription regulator complex;
Biological process	gamma-aminobutyric acid signaling pathway; gluconeogenesis; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of oxidative stress-induced neuron death; cellular response to amino acid starvation; mRNA transcription by RNA polymerase II; circadian regulation of gene expression; response to endoplasmic reticulum stress; PERK-mediated unfolded protein response; response to manganese-induced endoplasmic reticulum stress; positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of neuron apoptotic process; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; positive regulation of gene expression; positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; circadian rhythm; negative regulation of potassium ion transport; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance; cellular response to glucose starvation; negative regulation of translational initiation in response to stress; rhythmic process; cellular response to UV; positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress; cellular amino acid metabolic process; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; positive regulation of apoptotic process; positive regulation of vascular endothelial growth factor production; positive regulation of transcription by RNA polymerase I; cellular response to dopamine; response to toxic substance; neuron differentiation; cellular response to oxygen-glucose deprivation; positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; cellular calcium ion homeostasis; positive regulation of biomineral tissue development; negative regulation of cold-induced thermogenesis; positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process; positive regulation of sodium-dependent phosphate transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	468
	11911
	ENSG00000128272
	ENSMUSG00000042406
	P18848
	Q06507
	НМ_182810 ; НМ_001675
	НМ_001287180 ; НМ_009716
	НП_001666 ; НП_877962
	НП_001274109 ; НП_033846
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Активирующий фактор транскрипции 4 (налог-зависимый энхансерный элемент B67) , также известный как ATF4 , представляет собой белок , который у человека кодируется ATF4 геном . ^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует фактор транскрипции , который первоначально был идентифицирован как широко экспрессируемый белок, связывающий ДНК млекопитающих, который может связывать чувствительный к налогу энхансерный элемент в LTR HTLV-1. Кодируемый белок также был выделен и охарактеризован как белок 2, связывающий элемент ответа на цАМФ ( CREB-2 ).

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству ДНК-связывающих белков, которое включает семейство транскрипционных факторов AP-1 , белки, связывающие элемент ответа цАМФ ( CREB ) и CREB-подобные белки. Эти факторы транскрипции имеют общую область лейциновой молнии , которая участвует в белок-белковых взаимодействиях, расположена на С-конце участка основных аминокислот, который функционирует как ДНК-связывающий домен . Описаны два альтернативных транскрипта, кодирующие один и тот же белок. Два псевдогена расположены на Х-хромосоме в районе q28 в районе, содержащем большую инвертированную дупликацию. ^[7]

Известно также, что транскрипционный фактор ATF4 играет роль в дифференцировке остеобластов наряду с RUNX2 и osterix . ^[8] Терминальная дифференцировка остеобластов, представленная минерализацией матрикса, значительно ингибируется инактивацией JNK . Инактивация JNK подавляет экспрессию ATF-4 и, как следствие, минерализацию матрикса. ^[9] Белок IMPACT регулирует ATF4 у C. elegans, увеличивая продолжительность жизни. ^[10]

ATF4 также участвует в каннабиноиде Δ ⁹-тетрагидроканнабинол -индуцированный апоптоз в раковых клетках за счет проапоптотической роли стрессового белка p8 посредством его активации генов эндоплазматического ретикулума, связанных со стрессом ATF4, CHOP и TRB3. ^[11]^[12]

Перевод

Трансляция ATF4 зависит от вышестоящих открытых рамок считывания, расположенных в 5'UTR . ^[13] Местоположение второго uORF, удачно названного uORF2, совпадает с ATF4 рамкой открытого считывания . В нормальных условиях uORF1 транслируется, а затем трансляция uORF2 происходит только после повторного приобретения eIF2-TC. Трансляция uORF2 требует, чтобы рибосомы прошли мимо ORF ATF4 , стартовый кодон которого расположен внутри uORF2. Это приводит к его репрессиям. Однако в условиях стресса рибосома 40S будет обходить uORF2 из-за снижения концентрации eIF2-TC, что означает, что рибосома не успевает приобрести его для трансляции uORF2. Вместо этого ATF4 . транслируется ^[13]

См. также

Активирующий фактор транскрипции

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000128272 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042406 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Цудзимото А., Нюноя Х., Морита Т., Сато Т., Симотоно К. (март 1991 г.). «Выделение кДНК для ДНК-связывающих белков, которые специфически связываются с чувствительным к налогу энхансерным элементом в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Журнал вирусологии . 65 (3): 1420–1426. doi : 10.1128/JVI.65.3.1420-1426.1991 . ПМК 239921 . ПМИД 1847461 .
^ Карпински Б.А., Морле Г.Д., Хуггенвик Дж., Улер М.Д., Лейден Дж.М. (июнь 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого CREB-2: фактор транскрипции ATF/CREB, который может отрицательно регулировать транскрипцию с элемента ответа цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (11): 4820–4824. Бибкод : 1992PNAS...89.4820K . дои : 10.1073/pnas.89.11.4820 . ПМК 49179 . ПМИД 1534408 .
^ «Ген Энтрез: ATF4, активирующий транскрипционный фактор 4 (налог-зависимый энхансерный элемент B67)» .
^ Франчески RT, Ge C, Сяо G, Рока Х, Цзян Д (2009). «Транскрипционная регуляция остеобластов» . Клетки Ткани Органы . 189 (1–4): 144–152. дои : 10.1159/000151747 . ПМК 3512205 . ПМИД 18728356 .
^ Мацугути Т., Чиба Н., Бандоу К., Какимото К., Масуда А., Ониши Т. (март 2009 г.). «Активность JNK необходима для экспрессии Atf4 и дифференцировки остеобластов на поздней стадии». Журнал исследований костей и минералов . 24 (3): 398–410. дои : 10.1359/jbmr.081107 . ПМИД 19016586 . S2CID 13111270 .
^ Ферраз Р.К., Камара Х., Де-Соуза Э.А., Пинто С., Пинка А.П., Сильва Р.К. и др. (октябрь 2016 г.). «ИМПАКТ — это ингибитор GCN2, который ограничивает продолжительность жизни Caenorhabditis elegans» . БМК Биология . 14 (1): 87. дои : 10.1186/s12915-016-0301-2 . ПМК 5054600 . ПМИД 27717342 .
^ Карраседо А., Жиронелла М., Лоренте М., Гарсия С., Гусман М., Веласко Г., Йованна Х.Л. (июль 2006 г.). «Каннабиноиды индуцируют апоптоз опухолевых клеток поджелудочной железы посредством генов, связанных со стрессом эндоплазматической сети» . Исследования рака . 66 (13): 6748–6755. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-0169 . ПМИД 16818650 .
^ Карраседо А., Лоренте М., Эгиа А., Бласкес С., Гарсия С., Жиру В. и др. (апрель 2006 г.). «Стресс-регулируемый белок p8 опосредует индуцированный каннабиноидами апоптоз опухолевых клеток» . Раковая клетка . 9 (4): 301–312. дои : 10.1016/j.ccr.2006.03.005 . ПМИД 16616335 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Сомерс Дж., Пойри Т., Уиллис А.Е. (август 2013 г.). «Взгляд на функцию открытой рамки считывания млекопитающих вверх по течению» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 45 (8): 1690–1700. doi : 10.1016/j.biocel.2013.04.020 . ПМЦ 7172355 . ПМИД 23624144 .

Дальнейшее чтение

Рутковски Д.Т., Кауфман Р.Дж. (апрель 2003 г.). «Все дороги ведут к ATF4» . Развивающая клетка . 4 (4): 442–444. дои : 10.1016/S1534-5807(03)00100-X . ПМИД 12689582 .
Нисидзава М., Нагата С. (март 1992 г.). «Клоны кДНК, кодирующие белки лейциновой молнии, которые взаимодействуют с белком, связывающим элемент 1 промотора гена G-CSF». Письма ФЭБС . 299 (1): 36–38. Бибкод : 1992FEBSL.299...36N . дои : 10.1016/0014-5793(92)80094-W . ПМИД 1371974 . S2CID 34097395 .
Карпински Б.А., Морле Г.Д., Хуггенвик Дж., Улер М.Д., Лейден Дж.М. (июнь 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого CREB-2: фактор транскрипции ATF/CREB, который может отрицательно регулировать транскрипцию с элемента ответа цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (11): 4820–4824. Бибкод : 1992PNAS...89.4820K . дои : 10.1073/pnas.89.11.4820 . ПМК 49179 . ПМИД 1534408 .
Хай Т., Карран Т. (май 1991 г.). «Межсемейная димеризация факторов транскрипции Fos/Jun и ATF/CREB изменяет специфичность связывания ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (9): 3720–3724. Бибкод : 1991PNAS...88.3720H . дои : 10.1073/pnas.88.9.3720 . ПМК 51524 . ПМИД 1827203 .
Цудзимото А., Нюноя Х., Морита Т., Сато Т., Симотоно К. (март 1991 г.). «Выделение кДНК для ДНК-связывающих белков, которые специфически связываются с чувствительным к налогу энхансерным элементом в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Журнал вирусологии . 65 (3): 1420–1426. doi : 10.1128/JVI.65.3.1420-1426.1991 . ПМК 239921 . ПМИД 1847461 .
Хай Т.В., Лю Ф., Кукос В.Дж., Грин М.Р. (декабрь 1989 г.). «Клоны кДНК транскрипционного фактора ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Гены и развитие . 3 (12Б): 2083–2090. дои : 10.1101/gad.3.12b.2083 . ПМИД 2516827 .
Кокаме К., Като Х., Мията Т. (ноябрь 1996 г.). «Гомоцистеин-реактивные гены в сосудистых эндотелиальных клетках, идентифицированные с помощью дифференциального анализа дисплея. GRP78 / BiP и новые гены» . Журнал биологической химии . 271 (47): 29659–29665. дои : 10.1074/jbc.271.47.29659 . ПМИД 8939898 .
Редди Т.Р., Тан Х., Ли Икс, Вонг-Стаал Ф. (июнь 1997 г.). «Функциональное взаимодействие трансактиватора HTLV-1 Tax с активирующим фактором транскрипции-4 (ATF4)». Онкоген . 14 (23): 2785–2792. дои : 10.1038/sj.onc.1201119 . ПМИД 9190894 . S2CID 3199765 .
Лян Г., Хай Т. (сентябрь 1997 г.). «Характеристика человеческого активирующего фактора транскрипции 4, активатора транскрипции, который взаимодействует с несколькими доменами белка, связывающего цАМФ-чувствительный элемент (CREB)» . Журнал биологической химии . 272 (38): 24088–24095. дои : 10.1074/jbc.272.38.24088 . ПМИД 9295363 .
Каваи Т., Мацумото М., Такеда К., Сандзё Х., Акира С. (март 1998 г.). «ZIP-киназа, новая серин/треониновая киназа, опосредующая апоптоз» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1642–1651. дои : 10.1128/mcb.18.3.1642 . ПМЦ 108879 . ПМИД 9488481 .
Оутинен П.А., Суд С.К., Пфайфер С.И., Памиди С., Подор Т.Дж., Ли Дж. и др. (август 1999 г.). «Вызванный гомоцистеином стресс эндоплазматической сети и остановка роста приводят к специфическим изменениям в экспрессии генов в сосудистых эндотелиальных клетках человека». Кровь . 94 (3): 959–967. дои : 10.1182/blood.V94.3.959.415k20_959_967 . ПМИД 10419887 .
Подуст Л.М., Крезель А.М., Ким Й. (январь 2001 г.). «Кристаллическая структура CCAAT-бокса/энхансер-связывающего белка бета, активирующего фактор транскрипции-4, основной гетеродимер лейциновой застежки-молнии в отсутствие ДНК» . Журнал биологической химии . 276 (1): 505–513. дои : 10.1074/jbc.M005594200 . ПМИД 11018027 .
Мерфи П., Колстё А. (октябрь 2000 г.). «Экспрессия фактора транскрипции bZIP TCF11 и его потенциальных партнеров по димеризации во время развития». Механизмы развития . 97 (1–2): 141–148. дои : 10.1016/S0925-4773(00)00413-5 . ПМИД 11025215 . S2CID 17474070 .
Уайт Дж.Х., Макилхинни Р.А., Уайз А., Сируэла Ф., Чен Вайоминг, Эмсон ПК и др. (декабрь 2000 г.). «Рецептор GABAB напрямую взаимодействует с родственными факторами транскрипции CREB2 и ATFx» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (25): 13967–13972. Бибкод : 2000PNAS...9713967W . дои : 10.1073/pnas.240452197 . ПМК 17684 . ПМИД 11087824 .
Он CH, Гонг П, Ху Б, Стюарт Д, Чой МЭ, Чой А.М., Алам Дж (июнь 2001 г.). «Идентификация активирующего транскрипционного фактора 4 (ATF4) как белка, взаимодействующего с Nrf2. Значение для регуляции гена гемоксигеназы-1» . Журнал биологической химии . 276 (24): 20858–20865. дои : 10.1074/jbc.M101198200 . ПМИД 11274184 .
Сиу Ф., Бейн П.Дж., ЛеБлан-Чаффин Р., Чен Х., Килберг М.С. (июль 2002 г.). «ATF4 является медиатором пути реакции на восприятие питательных веществ, который активирует ген аспарагинсинтетазы человека» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24120–24127. дои : 10.1074/jbc.M201959200 . ПМИД 11960987 .
Бауэрс А.Дж., Скалли С., Бойлан Дж.Ф. (май 2003 г.). «SKIP3, новый ортолог триббла дрозофилы, сверхэкспрессируется в опухолях человека и регулируется гипоксией». Онкоген . 22 (18): 2823–2835. дои : 10.1038/sj.onc.1206367 . ПМИД 12743605 . S2CID 22769991 .
Со Дж., Фортуно Э.С., Су Дж.М., Стенесен Д., Тан В., Паркс Э.Дж. и др. (ноябрь 2009 г.). «Atf4 регулирует ожирение, гомеостаз глюкозы и расход энергии» . Диабет . 58 (11): 2565–2573. дои : 10.2337/db09-0335 . ПМЦ 2768187 . ПМИД 19690063 .
Эберт С.М., Буллард С.А., Басист Н., Маркотт Г.Р., Скопец З.П., Дирдорф Дж.М. и др. (февраль 2020 г.). «Активация фактора транскрипции 4 (ATF4) способствует атрофии скелетных мышц за счет образования гетеродимера с регулятором транскрипции C/EBPβ» . Журнал биологической химии . 295 (9): 2787–2803. дои : 10.1074/jbc.RA119.012095 . ПМК 7049960 . ПМИД 31953319 .

Внешние ссылки

ATF4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека ATF4 Расположение генома и страница сведений о гене ATF4 в браузере генома UCSC .
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого циклического AMP-зависимого транскрипционного фактора ATF-4.
ATF4 (активирующий фактор транскрипции 4)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000128272 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042406 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1847461-5] Цудзимото А., Нюноя Х., Морита Т., Сато Т., Симотоно К. (март 1991 г.). «Выделение кДНК для ДНК-связывающих белков, которые специфически связываются с чувствительным к налогу энхансерным элементом в длинном концевом повторе вируса Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Журнал вирусологии . 65 (3): 1420–1426. doi : 10.1128/JVI.65.3.1420-1426.1991 . ПМК 239921 . ПМИД 1847461 .

[pmid1534408-6] Карпински Б.А., Морле Г.Д., Хуггенвик Дж., Улер М.Д., Лейден Дж.М. (июнь 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого CREB-2: фактор транскрипции ATF/CREB, который может отрицательно регулировать транскрипцию с элемента ответа цАМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (11): 4820–4824. Бибкод : 1992PNAS...89.4820K . дои : 10.1073/pnas.89.11.4820 . ПМК 49179 . ПМИД 1534408 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: ATF4, активирующий транскрипционный фактор 4 (налог-зависимый энхансерный элемент B67)» .

[pmid18728356-8] Франчески RT, Ge C, Сяо G, Рока Х, Цзян Д (2009). «Транскрипционная регуляция остеобластов» . Клетки Ткани Органы . 189 (1–4): 144–152. дои : 10.1159/000151747 . ПМК 3512205 . ПМИД 18728356 .

[pmid19016586-9] Мацугути Т., Чиба Н., Бандоу К., Какимото К., Масуда А., Ониши Т. (март 2009 г.). «Активность JNK необходима для экспрессии Atf4 и дифференцировки остеобластов на поздней стадии». Журнал исследований костей и минералов . 24 (3): 398–410. дои : 10.1359/jbmr.081107 . ПМИД 19016586 . S2CID 13111270 .

[10] Ферраз Р.К., Камара Х., Де-Соуза Э.А., Пинто С., Пинка А.П., Сильва Р.К. и др. (октябрь 2016 г.). «ИМПАКТ — это ингибитор GCN2, который ограничивает продолжительность жизни Caenorhabditis elegans» . БМК Биология . 14 (1): 87. дои : 10.1186/s12915-016-0301-2 . ПМК 5054600 . ПМИД 27717342 .

[11] Карраседо А., Жиронелла М., Лоренте М., Гарсия С., Гусман М., Веласко Г., Йованна Х.Л. (июль 2006 г.). «Каннабиноиды индуцируют апоптоз опухолевых клеток поджелудочной железы посредством генов, связанных со стрессом эндоплазматической сети» . Исследования рака . 66 (13): 6748–6755. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-0169 . ПМИД 16818650 .

[12] Карраседо А., Лоренте М., Эгиа А., Бласкес С., Гарсия С., Жиру В. и др. (апрель 2006 г.). «Стресс-регулируемый белок p8 опосредует индуцированный каннабиноидами апоптоз опухолевых клеток» . Раковая клетка . 9 (4): 301–312. дои : 10.1016/j.ccr.2006.03.005 . ПМИД 16616335 .

[Somers_2013-13] Перейти обратно: ^а ^б Сомерс Дж., Пойри Т., Уиллис А.Е. (август 2013 г.). «Взгляд на функцию открытой рамки считывания млекопитающих вверх по течению» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 45 (8): 1690–1700. doi : 10.1016/j.biocel.2013.04.020 . ПМЦ 7172355 . ПМИД 23624144 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

v т и Регулом
Activates	Runx2, nrf1,Bip
Inhibits	ATF4, CHOP
Is activated by	not, PERK